MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_009512	TTG	2	6	483150	483155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545672
10003	NC_009512	GCA	2	6	483193	483198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10004	NC_009512	ATG	2	6	483201	483206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545672
10005	NC_009512	TCG	2	6	483210	483215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10006	NC_009512	AGC	2	6	483282	483287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10007	NC_009512	GC	3	6	483379	483384	0 %	0 %	50 %	50 %	148545672
10008	NC_009512	GTG	2	6	483449	483454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545672
10009	NC_009512	CAGC	2	8	483563	483570	25 %	0 %	25 %	50 %	148545672
10010	NC_009512	TTG	2	6	483597	483602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545672
10011	NC_009512	CGG	2	6	483628	483633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545672
10012	NC_009512	GGC	2	6	483821	483826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545672
10013	NC_009512	GCG	2	6	483953	483958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545672
10014	NC_009512	GGTTG	2	10	484070	484079	0 %	40 %	60 %	0 %	148545672
10015	NC_009512	GGC	2	6	484096	484101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545672
10016	NC_009512	CAG	2	6	484121	484126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10017	NC_009512	CAG	3	9	484148	484156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10018	NC_009512	TTC	2	6	484193	484198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545672
10019	NC_009512	GCT	3	9	484210	484218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10020	NC_009512	GCTG	2	8	484231	484238	0 %	25 %	50 %	25 %	148545672
10021	NC_009512	TGC	2	6	484324	484329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10022	NC_009512	CAG	2	6	484493	484498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10023	NC_009512	GCGA	2	8	484514	484521	25 %	0 %	50 %	25 %	148545672
10024	NC_009512	CTG	2	6	484541	484546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10025	NC_009512	TCC	2	6	484587	484592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545672
10026	NC_009512	ATC	2	6	484617	484622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545672
10027	NC_009512	CTGG	2	8	484636	484643	0 %	25 %	50 %	25 %	148545672
10028	NC_009512	TCC	2	6	484779	484784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545672
10029	NC_009512	GCT	2	6	484949	484954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10030	NC_009512	CGG	2	6	485004	485009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545672
10031	NC_009512	CAG	2	6	485072	485077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10032	NC_009512	CCCA	2	8	485112	485119	25 %	0 %	0 %	75 %	148545672
10033	NC_009512	TGC	2	6	485121	485126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10034	NC_009512	GCT	3	9	485144	485152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
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10036	NC_009512	GTG	2	6	485390	485395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545672
10037	NC_009512	GCA	2	6	485401	485406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
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10039	NC_009512	GCC	2	6	485480	485485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545672
10040	NC_009512	ATG	2	6	485565	485570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545672
10041	NC_009512	GCA	2	6	485575	485580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10042	NC_009512	GCT	2	6	485624	485629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
10043	NC_009512	GCT	2	6	485662	485667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545672
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10046	NC_009512	CAGC	2	8	485776	485783	25 %	0 %	25 %	50 %	148545672
10047	NC_009512	GTCAGG	2	12	485802	485813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545672
10048	NC_009512	GCCG	2	8	485816	485823	0 %	0 %	50 %	50 %	148545672
10049	NC_009512	GGT	2	6	485892	485897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_009512	TGC	2	6	485922	485927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_009512	TCA	2	6	486000	486005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545673
10052	NC_009512	TCG	2	6	486007	486012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10053	NC_009512	AGGA	2	8	486013	486020	50 %	0 %	50 %	0 %	148545673
10054	NC_009512	CTTCG	2	10	486066	486075	0 %	40 %	20 %	40 %	148545673
10055	NC_009512	GCA	2	6	486167	486172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10056	NC_009512	TCG	2	6	486301	486306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10057	NC_009512	GCA	2	6	486431	486436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545673
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10060	NC_009512	CCA	2	6	486543	486548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545673
10061	NC_009512	TCA	2	6	486605	486610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545673
10062	NC_009512	CTT	2	6	486666	486671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545673
10063	NC_009512	TTTC	2	8	486710	486717	0 %	75 %	0 %	25 %	148545673
10064	NC_009512	GCG	2	6	486723	486728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545673
10065	NC_009512	CGA	2	6	486830	486835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10066	NC_009512	GGC	2	6	486858	486863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545673
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10068	NC_009512	TGC	2	6	486997	487002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545673
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10070	NC_009512	TCG	2	6	487231	487236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10071	NC_009512	TTC	3	9	487251	487259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545673
10072	NC_009512	GTC	3	9	487260	487268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10073	NC_009512	CTTC	2	8	487274	487281	0 %	50 %	0 %	50 %	148545673
10074	NC_009512	CTT	2	6	487313	487318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545673
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10078	NC_009512	CAG	2	6	487515	487520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10079	NC_009512	GTCG	2	8	487560	487567	0 %	25 %	50 %	25 %	148545673
10080	NC_009512	GCC	2	6	487591	487596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545673
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10082	NC_009512	CTT	2	6	487610	487615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545673
10083	NC_009512	GCATCC	2	12	487657	487668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148545673
10084	NC_009512	GAT	2	6	487713	487718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545673
10085	NC_009512	CAGG	2	8	487751	487758	25 %	0 %	50 %	25 %	148545673
10086	NC_009512	CTG	2	6	487830	487835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545673
10087	NC_009512	A	6	6	487885	487890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_009512	CAG	2	6	487966	487971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545674
10089	NC_009512	GAG	2	6	487975	487980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545674
10090	NC_009512	T	6	6	487986	487991	0 %	100 %	0 %	0 %	148545674
10091	NC_009512	GTT	2	6	488031	488036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545674
10092	NC_009512	GGCG	2	8	488055	488062	0 %	0 %	75 %	25 %	148545674
10093	NC_009512	TGT	2	6	488090	488095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545674
10094	NC_009512	GCA	2	6	488142	488147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545674
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10096	NC_009512	TGCCA	2	10	488163	488172	20 %	20 %	20 %	40 %	148545674
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10098	NC_009512	GCTG	2	8	488241	488248	0 %	25 %	50 %	25 %	148545674
10099	NC_009512	TTC	2	6	488257	488262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545674
10100	NC_009512	TGGC	2	8	488273	488280	0 %	25 %	50 %	25 %	148545674
10101	NC_009512	TCC	2	6	488282	488287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545674
10102	NC_009512	TGCC	2	8	488292	488299	0 %	25 %	25 %	50 %	148545674
10103	NC_009512	GTGG	2	8	488304	488311	0 %	25 %	75 %	0 %	148545674
10104	NC_009512	GCA	2	6	488313	488318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545674
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10113	NC_009512	TGC	2	6	488580	488585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545674
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10117	NC_009512	GCCTT	2	10	488729	488738	0 %	40 %	20 %	40 %	148545674
10118	NC_009512	GAA	2	6	488776	488781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545674
10119	NC_009512	GCAC	2	8	488843	488850	25 %	0 %	25 %	50 %	148545674
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10122	NC_009512	GC	3	6	488936	488941	0 %	0 %	50 %	50 %	148545674
10123	NC_009512	GCC	2	6	488945	488950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545674
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10150	NC_009512	TCG	2	6	489995	490000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10241	NC_009512	GGC	2	6	494448	494453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545680
10242	NC_009512	GCC	2	6	494476	494481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545680
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10350	NC_009512	TCAG	2	8	499507	499514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10351	NC_009512	C	6	6	499555	499560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10352	NC_009512	CG	3	6	499717	499722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10355	NC_009512	GCC	2	6	499809	499814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545684
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10359	NC_009512	CGA	3	9	500012	500020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545684
10360	NC_009512	CTT	2	6	500027	500032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545684
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10391	NC_009512	G	8	8	501424	501431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10392	NC_009512	TGT	2	6	501432	501437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10476	NC_009512	GTTT	2	8	505381	505388	0 %	75 %	25 %	0 %	148545690
10477	NC_009512	TCG	2	6	505389	505394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10478	NC_009512	TTG	2	6	505545	505550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545690
10479	NC_009512	CTTTGC	2	12	505681	505692	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148545690
10480	NC_009512	GCTG	2	8	505754	505761	0 %	25 %	50 %	25 %	148545690
10481	NC_009512	CGA	2	6	505842	505847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10482	NC_009512	TTC	2	6	505902	505907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545690
10483	NC_009512	GC	3	6	505922	505927	0 %	0 %	50 %	50 %	148545690
10484	NC_009512	C	6	6	505955	505960	0 %	0 %	0 %	100 %	148545690
10485	NC_009512	CGC	2	6	506033	506038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545690
10486	NC_009512	CTG	2	6	506099	506104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10487	NC_009512	TCA	2	6	506197	506202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545690
10488	NC_009512	TGC	2	6	506226	506231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10489	NC_009512	GTC	2	6	506279	506284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10490	NC_009512	GCC	2	6	506306	506311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545690
10491	NC_009512	CAG	2	6	506360	506365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10492	NC_009512	CGT	2	6	506401	506406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10493	NC_009512	AGT	2	6	506425	506430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545690
10494	NC_009512	GCT	2	6	506459	506464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10495	NC_009512	ACG	2	6	506473	506478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10496	NC_009512	GTC	2	6	506504	506509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10497	NC_009512	TGT	2	6	506611	506616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545690
10498	NC_009512	TGC	2	6	506638	506643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545690
10499	NC_009512	GGT	2	6	506654	506659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545690
10500	NC_009512	GTAC	2	8	506660	506667	25 %	25 %	25 %	25 %	148545690

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