MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009512	GGCGG	2	10	341254	341263	0 %	0 %	80 %	20 %	148545552
7002	NC_009512	TGGC	2	8	341280	341287	0 %	25 %	50 %	25 %	148545552
7003	NC_009512	CTG	2	6	341300	341305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545552
7004	NC_009512	GCG	2	6	341343	341348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545552
7005	NC_009512	GAGG	2	8	341365	341372	25 %	0 %	75 %	0 %	148545552
7006	NC_009512	GCG	2	6	341382	341387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545552
7007	NC_009512	GCG	2	6	341439	341444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545552
7008	NC_009512	GGTG	2	8	341482	341489	0 %	25 %	75 %	0 %	148545552
7009	NC_009512	GTGG	2	8	341501	341508	0 %	25 %	75 %	0 %	148545552
7010	NC_009512	GTG	2	6	341529	341534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545552
7011	NC_009512	GGT	2	6	341605	341610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545552
7012	NC_009512	TG	3	6	341638	341643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_009512	TGT	2	6	341702	341707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_009512	GAA	2	6	341726	341731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_009512	GGCA	2	8	341755	341762	25 %	0 %	50 %	25 %	148545553
7016	NC_009512	CAGC	2	8	341771	341778	25 %	0 %	25 %	50 %	148545553
7017	NC_009512	CAG	2	6	341783	341788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545553
7018	NC_009512	GCG	2	6	341838	341843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545553
7019	NC_009512	AAG	2	6	341844	341849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545553
7020	NC_009512	AGGT	2	8	341862	341869	25 %	25 %	50 %	0 %	148545553
7021	NC_009512	GAT	2	6	341876	341881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545553
7022	NC_009512	CAG	2	6	341906	341911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545553
7023	NC_009512	GC	3	6	341984	341989	0 %	0 %	50 %	50 %	148545553
7024	NC_009512	GCA	2	6	341998	342003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545553
7025	NC_009512	GC	3	6	342082	342087	0 %	0 %	50 %	50 %	148545553
7026	NC_009512	AAC	2	6	342225	342230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545553
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7029	NC_009512	CG	3	6	342281	342286	0 %	0 %	50 %	50 %	148545553
7030	NC_009512	GAG	2	6	342303	342308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545553
7031	NC_009512	ATT	2	6	342432	342437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545553
7032	NC_009512	GCG	2	6	342458	342463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545554
7033	NC_009512	GGTCAC	2	12	342556	342567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545554
7034	NC_009512	TTC	2	6	342592	342597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545554
7035	NC_009512	TCA	2	6	342630	342635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545554
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7038	NC_009512	CAG	2	6	342928	342933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545554
7039	NC_009512	CGC	2	6	342942	342947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545554
7040	NC_009512	GCC	2	6	342967	342972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545554
7041	NC_009512	CAG	2	6	343039	343044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545554
7042	NC_009512	TCA	2	6	343071	343076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545554
7043	NC_009512	CAT	2	6	343087	343092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545554
7044	NC_009512	GC	3	6	343148	343153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_009512	GC	3	6	343161	343166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_009512	GTAC	2	8	343222	343229	25 %	25 %	25 %	25 %	148545555
7047	NC_009512	GTC	2	6	343264	343269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545555
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7049	NC_009512	GC	3	6	343514	343519	0 %	0 %	50 %	50 %	148545555
7050	NC_009512	TTG	2	6	343598	343603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545555
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7054	NC_009512	CTT	2	6	343681	343686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545555
7055	NC_009512	GAT	2	6	343702	343707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545555
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7065	NC_009512	TCG	2	6	344182	344187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545556
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7077	NC_009512	TGA	2	6	344911	344916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7080	NC_009512	GAT	2	6	345140	345145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7082	NC_009512	GC	3	6	345239	345244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7083	NC_009512	CCG	2	6	345262	345267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_009512	GC	3	6	345296	345301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7091	NC_009512	GGCT	2	8	345628	345635	0 %	25 %	50 %	25 %	148545557
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7101	NC_009512	GCCA	2	8	345901	345908	25 %	0 %	25 %	50 %	148545557
7102	NC_009512	ACC	2	6	345970	345975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545557
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7117	NC_009512	GGCT	2	8	346674	346681	0 %	25 %	50 %	25 %	148545557
7118	NC_009512	CGGG	2	8	346710	346717	0 %	0 %	75 %	25 %	148545557
7119	NC_009512	GCTG	2	8	346740	346747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7120	NC_009512	T	6	6	346783	346788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_009512	GGGCC	2	10	346832	346841	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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7123	NC_009512	CTG	2	6	346953	346958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545558
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7233	NC_009512	GC	3	6	351585	351590	0 %	0 %	50 %	50 %	148545562
7234	NC_009512	GTTG	2	8	351592	351599	0 %	50 %	50 %	0 %	148545562
7235	NC_009512	GGC	2	6	351635	351640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545562
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7239	NC_009512	GGCT	2	8	351804	351811	0 %	25 %	50 %	25 %	148545562
7240	NC_009512	TGA	2	6	351817	351822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545562
7241	NC_009512	GTT	2	6	351938	351943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545562
7242	NC_009512	GGT	2	6	351992	351997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545562
7243	NC_009512	GTGCCT	2	12	352018	352029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545562
7244	NC_009512	TCC	2	6	352077	352082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545562
7245	NC_009512	ACGT	2	8	352136	352143	25 %	25 %	25 %	25 %	148545562
7246	NC_009512	GCA	2	6	352165	352170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545562
7247	NC_009512	GAT	2	6	352409	352414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545562
7248	NC_009512	CAG	2	6	352415	352420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545562
7249	NC_009512	GGC	2	6	352498	352503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7250	NC_009512	TGC	2	6	352667	352672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7251	NC_009512	TGC	2	6	352677	352682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7252	NC_009512	CCCT	2	8	352707	352714	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7253	NC_009512	CGCC	2	8	352801	352808	0 %	0 %	25 %	75 %	148545563
7254	NC_009512	GCTG	2	8	352821	352828	0 %	25 %	50 %	25 %	148545563
7255	NC_009512	TTC	2	6	353024	353029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545563
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7257	NC_009512	GGCT	2	8	353063	353070	0 %	25 %	50 %	25 %	148545563
7258	NC_009512	TGC	2	6	353130	353135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545563
7259	NC_009512	TGGCT	2	10	353177	353186	0 %	40 %	40 %	20 %	148545563
7260	NC_009512	GGCCTG	2	12	353207	353218	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148545563
7261	NC_009512	CGG	3	9	353302	353310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545563
7262	NC_009512	GGC	2	6	353401	353406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545563
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7265	NC_009512	GGCTG	2	10	353477	353486	0 %	20 %	60 %	20 %	148545563
7266	NC_009512	GAA	2	6	353494	353499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545563
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7268	NC_009512	CTGG	2	8	353575	353582	0 %	25 %	50 %	25 %	148545563
7269	NC_009512	CGG	2	6	353601	353606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545563
7270	NC_009512	GCT	2	6	353635	353640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545563
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7272	NC_009512	CGC	2	6	353728	353733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545563
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7274	NC_009512	GGC	2	6	353768	353773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545563
7275	NC_009512	TTC	2	6	353777	353782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545563
7276	NC_009512	CTT	2	6	353830	353835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545563
7277	NC_009512	CAT	2	6	353917	353922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545563
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7280	NC_009512	CCAT	2	8	354000	354007	25 %	25 %	0 %	50 %	148545563
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7283	NC_009512	ACCT	2	8	354062	354069	25 %	25 %	0 %	50 %	148545563
7284	NC_009512	GCGG	2	8	354100	354107	0 %	0 %	75 %	25 %	148545563
7285	NC_009512	ATGAC	2	10	354114	354123	40 %	20 %	20 %	20 %	148545563
7286	NC_009512	CTG	2	6	354143	354148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545563
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7295	NC_009512	AGC	2	6	354515	354520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7297	NC_009512	CCAG	2	8	354556	354563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7298	NC_009512	CGCC	2	8	354798	354805	0 %	0 %	25 %	75 %	148545564
7299	NC_009512	GATC	2	8	354813	354820	25 %	25 %	25 %	25 %	148545564
7300	NC_009512	CGA	2	6	354852	354857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545564
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7319	NC_009512	TGCG	2	8	356224	356231	0 %	25 %	50 %	25 %	148545567
7320	NC_009512	CGA	2	6	356271	356276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545567
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7324	NC_009512	AGC	2	6	356510	356515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545567
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7326	NC_009512	TCG	2	6	356561	356566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545567
7327	NC_009512	TCG	2	6	356588	356593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545567
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7339	NC_009512	GGCG	2	8	357380	357387	0 %	0 %	75 %	25 %	148545568
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7351	NC_009512	CAC	2	6	357986	357991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545569
7352	NC_009512	CAG	2	6	358007	358012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545569
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7354	NC_009512	CGA	2	6	358216	358221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545569
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7360	NC_009512	GCT	2	6	358498	358503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545569
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7363	NC_009512	CCA	2	6	358555	358560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545569
7364	NC_009512	TCG	2	6	358572	358577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545569
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7366	NC_009512	CGA	2	6	358762	358767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545569
7367	NC_009512	GCAGC	2	10	358805	358814	20 %	0 %	40 %	40 %	148545569
7368	NC_009512	TTG	2	6	358866	358871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545569
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7370	NC_009512	CAG	2	6	358949	358954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545569
7371	NC_009512	CG	3	6	358966	358971	0 %	0 %	50 %	50 %	148545569
7372	NC_009512	TTG	2	6	358974	358979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545569
7373	NC_009512	GACGTC	2	12	358988	358999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545569
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7381	NC_009512	ATG	2	6	359207	359212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545570
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7386	NC_009512	GCG	2	6	359363	359368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545570
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7389	NC_009512	GCG	2	6	359513	359518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545570
7390	NC_009512	CAC	2	6	359542	359547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545570
7391	NC_009512	ACC	2	6	359552	359557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545570
7392	NC_009512	CAG	2	6	359620	359625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545570
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7394	NC_009512	GAA	2	6	359716	359721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545570
7395	NC_009512	CGA	2	6	359811	359816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545570
7396	NC_009512	ACG	2	6	359817	359822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545570
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7398	NC_009512	CCAGG	2	10	359976	359985	20 %	0 %	40 %	40 %	148545571
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7403	NC_009512	CAT	2	6	360100	360105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545571
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7420	NC_009512	CG	3	6	361118	361123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7421	NC_009512	GCG	2	6	361188	361193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7422	NC_009512	CTG	2	6	361194	361199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7423	NC_009512	GAT	2	6	361247	361252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7427	NC_009512	GTTC	2	8	361433	361440	0 %	50 %	25 %	25 %	148545572
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7434	NC_009512	CTG	2	6	361881	361886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545572
7435	NC_009512	GCAA	2	8	361894	361901	50 %	0 %	25 %	25 %	148545572
7436	NC_009512	TGA	2	6	361924	361929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545572
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7440	NC_009512	GCC	2	6	362070	362075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545572
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7443	NC_009512	CGG	2	6	362189	362194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545572
7444	NC_009512	GGCA	2	8	362225	362232	25 %	0 %	50 %	25 %	148545572
7445	NC_009512	CGG	2	6	362239	362244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545572
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7452	NC_009512	TGC	2	6	362552	362557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545572
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7455	NC_009512	TCG	2	6	362894	362899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7456	NC_009512	GAC	2	6	363023	363028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7459	NC_009512	TG	3	6	363206	363211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7460	NC_009512	CGT	2	6	363229	363234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545573
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7467	NC_009512	ATG	2	6	363759	363764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545573
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7471	NC_009512	TCG	2	6	363913	363918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545573
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7474	NC_009512	ATC	2	6	364101	364106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545573
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7476	NC_009512	ATG	2	6	364227	364232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545573
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7478	NC_009512	GGC	2	6	364277	364282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545573
7479	NC_009512	GTG	2	6	364396	364401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7480	NC_009512	GGGC	2	8	364410	364417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7481	NC_009512	CG	3	6	364456	364461	0 %	0 %	50 %	50 %	148545574
7482	NC_009512	TTG	2	6	364463	364468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545574
7483	NC_009512	TCG	2	6	364527	364532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545574
7484	NC_009512	CCA	2	6	364554	364559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545574
7485	NC_009512	CCGG	2	8	364634	364641	0 %	0 %	50 %	50 %	148545574
7486	NC_009512	CG	5	10	364653	364662	0 %	0 %	50 %	50 %	148545574
7487	NC_009512	GTC	2	6	364678	364683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545574
7488	NC_009512	ATCA	2	8	364687	364694	50 %	25 %	0 %	25 %	148545574
7489	NC_009512	GCAT	2	8	364700	364707	25 %	25 %	25 %	25 %	148545574
7490	NC_009512	TGT	2	6	364714	364719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7491	NC_009512	AG	3	6	364734	364739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7492	NC_009512	TGC	2	6	364740	364745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7493	NC_009512	GCC	2	6	364799	364804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7494	NC_009512	GCT	2	6	364808	364813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7495	NC_009512	GCAC	2	8	364859	364866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7496	NC_009512	GCTC	2	8	364926	364933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7497	NC_009512	GTT	2	6	365178	365183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545575
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7499	NC_009512	GAA	2	6	365280	365285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545575
7500	NC_009512	TTGA	2	8	365313	365320	25 %	50 %	25 %	0 %	148545575

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