MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009512	GCG	2	6	317033	317038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545529
6502	NC_009512	GGC	2	6	317085	317090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545529
6503	NC_009512	AC	3	6	317117	317122	50 %	0 %	0 %	50 %	148545529
6504	NC_009512	ACA	2	6	317165	317170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545529
6505	NC_009512	CAA	2	6	317184	317189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545529
6506	NC_009512	TGC	2	6	317231	317236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545529
6507	NC_009512	CTGA	2	8	317243	317250	25 %	25 %	25 %	25 %	148545529
6508	NC_009512	CCG	2	6	317397	317402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545530
6509	NC_009512	CTGG	2	8	317439	317446	0 %	25 %	50 %	25 %	148545530
6510	NC_009512	CCG	2	6	317476	317481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545530
6511	NC_009512	TCA	2	6	317507	317512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545530
6512	NC_009512	CAGCGA	2	12	317653	317664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545530
6513	NC_009512	ATC	2	6	317684	317689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545530
6514	NC_009512	CGC	2	6	317716	317721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545530
6515	NC_009512	GGT	2	6	317925	317930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545530
6516	NC_009512	CCAG	2	8	317931	317938	25 %	0 %	25 %	50 %	148545530
6517	NC_009512	CCAT	2	8	317972	317979	25 %	25 %	0 %	50 %	148545530
6518	NC_009512	CAG	2	6	317983	317988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545530
6519	NC_009512	GAA	2	6	318012	318017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545530
6520	NC_009512	GCC	2	6	318081	318086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_009512	GCC	2	6	318135	318140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545531
6522	NC_009512	TGG	2	6	318204	318209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545531
6523	NC_009512	TGA	2	6	318234	318239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545531
6524	NC_009512	TGG	2	6	318273	318278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545531
6525	NC_009512	GGC	2	6	318355	318360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545531
6526	NC_009512	GAA	2	6	318380	318385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545531
6527	NC_009512	AGA	2	6	318453	318458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545531
6528	NC_009512	GGT	2	6	318463	318468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545531
6529	NC_009512	CGA	2	6	318505	318510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545531
6530	NC_009512	GGC	2	6	318598	318603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545531
6531	NC_009512	CTG	2	6	318623	318628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545531
6532	NC_009512	GCT	2	6	318640	318645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545531
6533	NC_009512	AGGCG	2	10	318702	318711	20 %	0 %	60 %	20 %	148545532
6534	NC_009512	GC	3	6	318726	318731	0 %	0 %	50 %	50 %	148545532
6535	NC_009512	CAA	2	6	318747	318752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545532
6536	NC_009512	CGA	2	6	318756	318761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545532
6537	NC_009512	CCG	3	9	318773	318781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545532
6538	NC_009512	CTG	2	6	318814	318819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545532
6539	NC_009512	TGG	2	6	318898	318903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545532
6540	NC_009512	GGT	2	6	318990	318995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545532
6541	NC_009512	GTG	2	6	319003	319008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545532
6542	NC_009512	CCA	2	6	319016	319021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545532
6543	NC_009512	GCT	2	6	319028	319033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545532
6544	NC_009512	TGG	2	6	319038	319043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545532
6545	NC_009512	ACGCA	2	10	319101	319110	40 %	0 %	20 %	40 %	148545532
6546	NC_009512	GTG	2	6	319135	319140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545532
6547	NC_009512	GGCC	2	8	319182	319189	0 %	0 %	50 %	50 %	148545532
6548	NC_009512	GAGCTG	2	12	319207	319218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545532
6549	NC_009512	CTG	2	6	319310	319315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545532
6550	NC_009512	GTG	2	6	319327	319332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545532
6551	NC_009512	CG	3	6	319388	319393	0 %	0 %	50 %	50 %	148545532
6552	NC_009512	GCT	2	6	319398	319403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545532
6553	NC_009512	TGCC	2	8	319424	319431	0 %	25 %	25 %	50 %	148545532
6554	NC_009512	TGC	2	6	319434	319439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545532
6555	NC_009512	GGC	2	6	319535	319540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_009512	CCG	2	6	319652	319657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545533
6557	NC_009512	GCCC	2	8	319705	319712	0 %	0 %	25 %	75 %	148545533
6558	NC_009512	TGCCG	2	10	319779	319788	0 %	20 %	40 %	40 %	148545533
6559	NC_009512	CGCAGG	2	12	319858	319869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148545533
6560	NC_009512	CAGC	2	8	319872	319879	25 %	0 %	25 %	50 %	148545533
6561	NC_009512	CCA	2	6	319886	319891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545533
6562	NC_009512	CTG	2	6	319895	319900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545533
6563	NC_009512	GCC	2	6	319914	319919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545533
6564	NC_009512	GCC	2	6	319948	319953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545533
6565	NC_009512	TGC	3	9	319978	319986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545533
6566	NC_009512	CGC	2	6	320101	320106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545534
6567	NC_009512	GCC	2	6	320108	320113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545534
6568	NC_009512	CGG	2	6	320218	320223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545534
6569	NC_009512	GCT	2	6	320292	320297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545534
6570	NC_009512	CGG	2	6	320350	320355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545534
6571	NC_009512	GCA	3	9	320395	320403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545534
6572	NC_009512	GCG	2	6	320431	320436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545534
6573	NC_009512	TGGC	2	8	320451	320458	0 %	25 %	50 %	25 %	148545534
6574	NC_009512	AAC	2	6	320478	320483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545534
6575	NC_009512	GTC	2	6	320492	320497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545534
6576	NC_009512	GCG	2	6	320527	320532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545534
6577	NC_009512	CG	3	6	320558	320563	0 %	0 %	50 %	50 %	148545534
6578	NC_009512	TGG	2	6	320602	320607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545534
6579	NC_009512	ATG	2	6	320613	320618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545534
6580	NC_009512	GCC	2	6	320645	320650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545534
6581	NC_009512	ACC	2	6	320661	320666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545534
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6583	NC_009512	TCG	2	6	320724	320729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545534
6584	NC_009512	GCC	2	6	320741	320746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545534
6585	NC_009512	GC	3	6	320782	320787	0 %	0 %	50 %	50 %	148545534
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6588	NC_009512	CCA	2	6	320911	320916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545534
6589	NC_009512	GCA	2	6	320998	321003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545534
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6591	NC_009512	CAG	2	6	321218	321223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545534
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6593	NC_009512	ACC	2	6	321303	321308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545534
6594	NC_009512	TCG	2	6	321426	321431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545534
6595	NC_009512	GGT	2	6	321470	321475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545534
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6601	NC_009512	TGG	2	6	321651	321656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545535
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6606	NC_009512	GGC	2	6	321765	321770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545535
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6608	NC_009512	GCCT	2	8	321847	321854	0 %	25 %	25 %	50 %	148545535
6609	NC_009512	CGG	2	6	321908	321913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545535
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6621	NC_009512	GAT	2	6	322588	322593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545535
6622	NC_009512	GCT	2	6	322692	322697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545535
6623	NC_009512	ACC	2	6	322745	322750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545535
6624	NC_009512	CGA	2	6	322758	322763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545535
6625	NC_009512	AAG	2	6	322793	322798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545535
6626	NC_009512	GGT	2	6	322816	322821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545535
6627	NC_009512	GAA	2	6	322831	322836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545535
6628	NC_009512	GCCA	2	8	322849	322856	25 %	0 %	25 %	50 %	148545535
6629	NC_009512	CGA	2	6	322896	322901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545535
6630	NC_009512	GGC	2	6	322927	322932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545535
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6632	NC_009512	CTG	2	6	322981	322986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545535
6633	NC_009512	CACGC	2	10	323050	323059	20 %	0 %	20 %	60 %	148545535
6634	NC_009512	TCC	2	6	323168	323173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545535
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6640	NC_009512	GCT	2	6	323397	323402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545536
6641	NC_009512	GTC	2	6	323431	323436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545536
6642	NC_009512	GTA	2	6	323467	323472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545536
6643	NC_009512	GGT	2	6	323476	323481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545536
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6648	NC_009512	GAT	2	6	323836	323841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545536
6649	NC_009512	GAT	2	6	323866	323871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545536
6650	NC_009512	CG	3	6	323936	323941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6651	NC_009512	TGG	2	6	323973	323978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6652	NC_009512	TTC	2	6	324059	324064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6653	NC_009512	AT	4	8	324087	324094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6654	NC_009512	CCG	2	6	324202	324207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545537
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6660	NC_009512	CGG	2	6	324521	324526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545537
6661	NC_009512	CGA	2	6	324548	324553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6662	NC_009512	GCC	2	6	324561	324566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545537
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6680	NC_009512	AAG	2	6	325277	325282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6681	NC_009512	T	6	6	325303	325308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6682	NC_009512	GCA	2	6	325463	325468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545538
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6695	NC_009512	GAT	2	6	326165	326170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545539
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6700	NC_009512	GTT	2	6	326591	326596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545539
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6724	NC_009512	CAG	2	6	327740	327745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545539
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6726	NC_009512	GCT	2	6	328129	328134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6728	NC_009512	GCCC	2	8	328164	328171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6729	NC_009512	ACA	2	6	328260	328265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545540
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6732	NC_009512	AAG	2	6	328409	328414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545540
6733	NC_009512	CGA	2	6	328423	328428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545540
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6735	NC_009512	TGG	2	6	328537	328542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545540
6736	NC_009512	GGT	2	6	328556	328561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545540
6737	NC_009512	GGC	2	6	328562	328567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545540
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6739	NC_009512	ACC	2	6	328592	328597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545540
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6741	NC_009512	GTG	3	9	328638	328646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545540
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6985	NC_009512	GCT	2	6	340765	340770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6986	NC_009512	GCA	2	6	340777	340782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6987	NC_009512	GTC	2	6	340874	340879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6988	NC_009512	TGC	2	6	340932	340937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6989	NC_009512	GCG	2	6	340938	340943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545552
6990	NC_009512	AGC	2	6	340954	340959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6991	NC_009512	GCTG	2	8	340990	340997	0 %	25 %	50 %	25 %	148545552
6992	NC_009512	GCA	2	6	341005	341010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6993	NC_009512	GGCG	2	8	341071	341078	0 %	0 %	75 %	25 %	148545552
6994	NC_009512	GTGCT	2	10	341108	341117	0 %	40 %	40 %	20 %	148545552
6995	NC_009512	TGG	2	6	341127	341132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545552
6996	NC_009512	CGG	2	6	341149	341154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545552
6997	NC_009512	CGT	2	6	341167	341172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545552
6998	NC_009512	CAGG	2	8	341177	341184	25 %	0 %	50 %	25 %	148545552
6999	NC_009512	GCA	2	6	341203	341208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545552
7000	NC_009512	CCAG	2	8	341245	341252	25 %	0 %	25 %	50 %	148545552

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