MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009512	ATC	2	6	269617	269622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545486
5502	NC_009512	CTG	2	6	269659	269664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5503	NC_009512	GC	3	6	269673	269678	0 %	0 %	50 %	50 %	148545486
5504	NC_009512	TGC	2	6	269819	269824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5505	NC_009512	GAG	2	6	269836	269841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545486
5506	NC_009512	TGCC	2	8	269844	269851	0 %	25 %	25 %	50 %	148545486
5507	NC_009512	AGCC	2	8	269874	269881	25 %	0 %	25 %	50 %	148545486
5508	NC_009512	AGC	2	6	269897	269902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5509	NC_009512	CCG	2	6	269912	269917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545486
5510	NC_009512	GCT	2	6	269928	269933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5511	NC_009512	AGG	2	6	270002	270007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545486
5512	NC_009512	CGG	2	6	270029	270034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545486
5513	NC_009512	GCC	2	6	270046	270051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545486
5514	NC_009512	TGC	2	6	270092	270097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5515	NC_009512	AGCGC	2	10	270158	270167	20 %	0 %	40 %	40 %	148545486
5516	NC_009512	GC	3	6	270253	270258	0 %	0 %	50 %	50 %	148545486
5517	NC_009512	GTT	2	6	270281	270286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545486
5518	NC_009512	TGC	2	6	270299	270304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5519	NC_009512	CTGC	2	8	270333	270340	0 %	25 %	25 %	50 %	148545486
5520	NC_009512	GCA	2	6	270384	270389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545486
5521	NC_009512	GCG	2	6	270409	270414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545486
5522	NC_009512	TCGGC	2	10	270416	270425	0 %	20 %	40 %	40 %	148545486
5523	NC_009512	CTGG	2	8	270529	270536	0 %	25 %	50 %	25 %	148545486
5524	NC_009512	GC	3	6	270595	270600	0 %	0 %	50 %	50 %	148545486
5525	NC_009512	GAA	2	6	270670	270675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545486
5526	NC_009512	CCG	2	6	270676	270681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545486
5527	NC_009512	GCC	2	6	270802	270807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_009512	CTG	2	6	270949	270954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545487
5529	NC_009512	CCG	2	6	271041	271046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545487
5530	NC_009512	TTC	2	6	271051	271056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545487
5531	NC_009512	GCC	2	6	271057	271062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545487
5532	NC_009512	GCA	2	6	271122	271127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545487
5533	NC_009512	TGG	2	6	271142	271147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545487
5534	NC_009512	GTC	2	6	271174	271179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545487
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5536	NC_009512	GGT	2	6	271291	271296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545487
5537	NC_009512	GCT	2	6	271323	271328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545487
5538	NC_009512	TCT	2	6	271329	271334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545487
5539	NC_009512	TGC	2	6	271382	271387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545487
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5541	NC_009512	GTC	2	6	271513	271518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545487
5542	NC_009512	CATT	2	8	271538	271545	25 %	50 %	0 %	25 %	148545487
5543	NC_009512	CAGC	2	8	271551	271558	25 %	0 %	25 %	50 %	148545487
5544	NC_009512	GGC	2	6	271572	271577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545487
5545	NC_009512	CTCA	2	8	271690	271697	25 %	25 %	0 %	50 %	148545487
5546	NC_009512	GAG	2	6	271755	271760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545487
5547	NC_009512	CGG	2	6	271933	271938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_009512	TGC	2	6	271978	271983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545488
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5550	NC_009512	GC	3	6	272074	272079	0 %	0 %	50 %	50 %	148545488
5551	NC_009512	CTG	2	6	272086	272091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545488
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5553	NC_009512	CAG	2	6	272176	272181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545488
5554	NC_009512	CG	3	6	272190	272195	0 %	0 %	50 %	50 %	148545488
5555	NC_009512	AGC	2	6	272198	272203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545488
5556	NC_009512	CGG	2	6	272213	272218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545488
5557	NC_009512	GTT	2	6	272314	272319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545488
5558	NC_009512	GCCCA	2	10	272435	272444	20 %	0 %	20 %	60 %	148545488
5559	NC_009512	GTG	2	6	272494	272499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545488
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5563	NC_009512	TGG	2	6	272550	272555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545488
5564	NC_009512	CGG	2	6	272616	272621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545488
5565	NC_009512	CAT	2	6	272638	272643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545488
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5569	NC_009512	GTC	2	6	272875	272880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545488
5570	NC_009512	GTG	2	6	272899	272904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545488
5571	NC_009512	CGG	2	6	272916	272921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545488
5572	NC_009512	CAGCCA	2	12	272950	272961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148545488
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5575	NC_009512	TCA	2	6	273060	273065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545488
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5581	NC_009512	TGC	2	6	273424	273429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545489
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5583	NC_009512	TTGCG	2	10	273495	273504	0 %	40 %	40 %	20 %	148545489
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5587	NC_009512	TGGCC	2	10	273683	273692	0 %	20 %	40 %	40 %	148545489
5588	NC_009512	GAGTG	2	10	273732	273741	20 %	20 %	60 %	0 %	148545489
5589	NC_009512	TGA	2	6	273809	273814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545489
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5592	NC_009512	ACCG	2	8	273942	273949	25 %	0 %	25 %	50 %	148545489
5593	NC_009512	CAA	2	6	273980	273985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545489
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5600	NC_009512	TGC	2	6	274315	274320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545489
5601	NC_009512	CGCCCA	2	12	274397	274408	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148545489
5602	NC_009512	CCG	3	9	274423	274431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545489
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5608	NC_009512	GCTGGA	2	12	274781	274792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545489
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5615	NC_009512	AGC	2	6	275179	275184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_009512	CCG	2	6	275335	275340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545490
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5739	NC_009512	TGC	2	6	281470	281475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545495
5740	NC_009512	CGT	2	6	281596	281601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545495
5741	NC_009512	GCA	2	6	281620	281625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545495
5742	NC_009512	TTGGC	2	10	281664	281673	0 %	40 %	40 %	20 %	148545495
5743	NC_009512	TG	3	6	281796	281801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5744	NC_009512	GGT	2	6	281809	281814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5745	NC_009512	TA	3	6	281821	281826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5746	NC_009512	AACT	2	8	281853	281860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5849	NC_009512	TGT	2	6	287131	287136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545500
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5854	NC_009512	GTCGC	2	10	287294	287303	0 %	20 %	40 %	40 %	148545500
5855	NC_009512	GGC	2	6	287310	287315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545500
5856	NC_009512	TGA	2	6	287357	287362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545500
5857	NC_009512	GAT	2	6	287379	287384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545500
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5860	NC_009512	G	7	7	287561	287567	0 %	0 %	100 %	0 %	148545500
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5982	NC_009512	GC	3	6	294103	294108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5983	NC_009512	GAG	2	6	294113	294118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5984	NC_009512	AAT	2	6	294137	294142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5985	NC_009512	A	6	6	294157	294162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5986	NC_009512	AT	3	6	294175	294180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5987	NC_009512	AGC	2	6	294183	294188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5988	NC_009512	TCC	2	6	294199	294204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5989	NC_009512	GCA	2	6	294223	294228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5990	NC_009512	GTC	2	6	294235	294240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545507
5991	NC_009512	GGT	2	6	294247	294252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545507
5992	NC_009512	TGC	2	6	294281	294286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545507
5993	NC_009512	GTG	2	6	294328	294333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545507
5994	NC_009512	CCG	2	6	294356	294361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545507
5995	NC_009512	CTG	2	6	294367	294372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545507
5996	NC_009512	CAG	2	6	294409	294414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545507
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5998	NC_009512	CTTG	2	8	294489	294496	0 %	50 %	25 %	25 %	148545507
5999	NC_009512	CTG	2	6	294499	294504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545507
6000	NC_009512	GC	3	6	294510	294515	0 %	0 %	50 %	50 %	148545507

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