MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 126013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009512	AAC	2	6	221863	221868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4502	NC_009512	CGA	2	6	221906	221911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4503	NC_009512	CAA	2	6	222053	222058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4504	NC_009512	GC	3	6	222091	222096	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4505	NC_009512	ACG	2	6	222133	222138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4506	NC_009512	TGT	2	6	222167	222172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545445
4507	NC_009512	ACC	2	6	222240	222245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4508	NC_009512	CAA	2	6	222323	222328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4509	NC_009512	GCG	2	6	222354	222359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4510	NC_009512	ACC	2	6	222387	222392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4511	NC_009512	ATCG	2	8	222482	222489	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4512	NC_009512	CGA	2	6	222566	222571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4513	NC_009512	CAA	2	6	222713	222718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4514	NC_009512	GC	3	6	222751	222756	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4515	NC_009512	GCT	2	6	222768	222773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4516	NC_009512	ACG	2	6	222793	222798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4517	NC_009512	ACC	2	6	222900	222905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4518	NC_009512	GTG	2	6	222912	222917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4519	NC_009512	GGC	2	6	222951	222956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4520	NC_009512	CAA	2	6	222983	222988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4521	NC_009512	CAA	2	6	223004	223009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4522	NC_009512	TCA	2	6	223051	223056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4523	NC_009512	ATCG	2	8	223142	223149	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4524	NC_009512	AGC	2	6	223183	223188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4525	NC_009512	CGA	2	6	223226	223231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4526	NC_009512	GCA	2	6	223258	223263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4527	NC_009512	CTG	2	6	223294	223299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4528	NC_009512	CAA	2	6	223388	223393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4529	NC_009512	GC	3	6	223426	223431	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4530	NC_009512	ACG	2	6	223468	223473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4531	NC_009512	CGG	2	6	223501	223506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4532	NC_009512	ACC	2	6	223575	223580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4533	NC_009512	GTG	2	6	223587	223592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4534	NC_009512	GGT	2	6	223626	223631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4535	NC_009512	CAA	2	6	223658	223663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4536	NC_009512	CAA	2	6	223679	223684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4537	NC_009512	TCA	2	6	223726	223731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4538	NC_009512	ATCG	2	8	223817	223824	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4539	NC_009512	CGA	2	6	223901	223906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4540	NC_009512	GCA	2	6	223933	223938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4541	NC_009512	CTG	2	6	223969	223974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4542	NC_009512	CAA	2	6	224063	224068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4543	NC_009512	GC	3	6	224101	224106	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4544	NC_009512	GCT	2	6	224118	224123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4545	NC_009512	TGA	2	6	224129	224134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545445
4546	NC_009512	ACG	2	6	224143	224148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4547	NC_009512	CGG	2	6	224176	224181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4548	NC_009512	ACC	2	6	224250	224255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4549	NC_009512	GTG	2	6	224262	224267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4550	NC_009512	GGT	2	6	224301	224306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4551	NC_009512	CAA	2	6	224333	224338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4552	NC_009512	CAA	2	6	224354	224359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4553	NC_009512	TCA	2	6	224401	224406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4554	NC_009512	ATCG	2	8	224492	224499	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4555	NC_009512	AAC	2	6	224533	224538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4556	NC_009512	CGA	2	6	224576	224581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4557	NC_009512	CAA	2	6	224723	224728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4558	NC_009512	GC	3	6	224761	224766	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4559	NC_009512	GCT	2	6	224778	224783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4560	NC_009512	TGA	2	6	224789	224794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545445
4561	NC_009512	ACG	2	6	224803	224808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4562	NC_009512	CTG	2	6	224836	224841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4563	NC_009512	GGC	2	6	224880	224885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4564	NC_009512	TGAC	2	8	224902	224909	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4565	NC_009512	ACC	2	6	224910	224915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4566	NC_009512	AGT	2	6	224921	224926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545445
4567	NC_009512	CAA	2	6	224993	224998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4568	NC_009512	CAA	2	6	225014	225019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4569	NC_009512	TCA	2	6	225061	225066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4570	NC_009512	ATCG	2	8	225152	225159	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4571	NC_009512	AAC	2	6	225193	225198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4572	NC_009512	CGA	2	6	225236	225241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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4574	NC_009512	GC	3	6	225421	225426	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4575	NC_009512	CGG	2	6	225496	225501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
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4579	NC_009512	CAA	2	6	225653	225658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4580	NC_009512	CAA	2	6	225674	225679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4581	NC_009512	TCA	2	6	225721	225726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
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4583	NC_009512	AAC	2	6	225853	225858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
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4586	NC_009512	GC	3	6	226081	226086	0 %	0 %	50 %	50 %	148545445
4587	NC_009512	CGG	2	6	226156	226161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4588	NC_009512	ACC	2	6	226230	226235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
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4590	NC_009512	GGC	2	6	226281	226286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4591	NC_009512	CAA	2	6	226313	226318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4592	NC_009512	CAA	2	6	226334	226339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4593	NC_009512	TCA	2	6	226381	226386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4594	NC_009512	ATCG	2	8	226472	226479	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
4595	NC_009512	CGA	2	6	226556	226561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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4598	NC_009512	ACG	2	6	226788	226793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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4600	NC_009512	GCC	2	6	226860	226865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545445
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4602	NC_009512	AGC	2	6	226899	226904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4603	NC_009512	GAC	2	6	226916	226921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4604	NC_009512	ACC	2	6	226939	226944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4605	NC_009512	GGC	2	6	226959	226964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4606	NC_009512	GGA	2	6	226979	226984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545445
4607	NC_009512	CTGT	2	8	227046	227053	0 %	50 %	25 %	25 %	148545445
4608	NC_009512	GCC	2	6	227073	227078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545445
4609	NC_009512	TTC	2	6	227091	227096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545445
4610	NC_009512	GGT	2	6	227132	227137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4611	NC_009512	GTTC	2	8	227171	227178	0 %	50 %	25 %	25 %	148545445
4612	NC_009512	GGT	2	6	227211	227216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4613	NC_009512	AGTTCA	2	12	227251	227262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148545445
4614	NC_009512	GGC	2	6	227418	227423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4615	NC_009512	CAG	2	6	227483	227488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4616	NC_009512	CAC	2	6	227489	227494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4617	NC_009512	CGA	2	6	227600	227605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4618	NC_009512	CTA	2	6	227702	227707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4619	NC_009512	AGC	2	6	227796	227801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4620	NC_009512	CTA	2	6	227888	227893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4621	NC_009512	CACGGT	2	12	228047	228058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4622	NC_009512	CAG	2	6	228095	228100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4623	NC_009512	CCG	2	6	228114	228119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545445
4624	NC_009512	GGC	2	6	228177	228182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4625	NC_009512	CAC	2	6	228191	228196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
4626	NC_009512	CAT	2	6	228290	228295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4627	NC_009512	ACA	2	6	228340	228345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545445
4628	NC_009512	TGG	2	6	228574	228579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545445
4629	NC_009512	CTA	2	6	228584	228589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
4630	NC_009512	CTT	2	6	228635	228640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545445
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4632	NC_009512	ACTT	2	8	228684	228691	25 %	50 %	0 %	25 %	148545445
4633	NC_009512	TAT	2	6	228714	228719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545445
4634	NC_009512	CCA	2	6	228733	228738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545445
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4640	NC_009512	CCG	2	6	228893	228898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545445
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4644	NC_009512	GTC	2	6	229287	229292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4645	NC_009512	ACGT	2	8	229317	229324	25 %	25 %	25 %	25 %	148545445
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4648	NC_009512	GGC	2	6	229500	229505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545445
4649	NC_009512	CTG	2	6	229521	229526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4650	NC_009512	CGA	2	6	229565	229570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4651	NC_009512	ACG	2	6	229630	229635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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4653	NC_009512	CTG	2	6	229686	229691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545445
4654	NC_009512	GCA	2	6	229705	229710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545445
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4658	NC_009512	CAT	3	9	229889	229897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545445
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4660	NC_009512	GC	3	6	229993	229998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4661	NC_009512	TGC	2	6	230016	230021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4662	NC_009512	CAA	2	6	230029	230034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4663	NC_009512	GCAAC	2	10	230073	230082	40 %	0 %	20 %	40 %	148545446
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4669	NC_009512	GC	3	6	230306	230311	0 %	0 %	50 %	50 %	148545446
4670	NC_009512	GCT	2	6	230319	230324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545446
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4672	NC_009512	CAG	2	6	230352	230357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545446
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4675	NC_009512	GC	3	6	230564	230569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4676	NC_009512	GCC	2	6	230608	230613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545447
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4684	NC_009512	CACC	2	8	231231	231238	25 %	0 %	0 %	75 %	148545447
4685	NC_009512	GTGA	2	8	231265	231272	25 %	25 %	50 %	0 %	148545447
4686	NC_009512	CAC	2	6	231279	231284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545447
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4693	NC_009512	GCG	2	6	231453	231458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545447
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4732	NC_009512	GCC	2	6	232977	232982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545449
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4740	NC_009512	GAA	2	6	233190	233195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545449
4741	NC_009512	TGG	2	6	233200	233205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545449
4742	NC_009512	TGT	3	9	233221	233229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545449
4743	NC_009512	GC	3	6	233249	233254	0 %	0 %	50 %	50 %	148545449
4744	NC_009512	GCA	2	6	233521	233526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545450
4745	NC_009512	CTG	3	9	233606	233614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545450
4746	NC_009512	CTG	2	6	233831	233836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545450
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4749	NC_009512	TGGC	2	8	233964	233971	0 %	25 %	50 %	25 %	148545450
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4754	NC_009512	GGT	2	6	234196	234201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545450
4755	NC_009512	CTG	2	6	234215	234220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545450
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4758	NC_009512	GCT	2	6	234472	234477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545451
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4767	NC_009512	TCA	2	6	235124	235129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4768	NC_009512	CGT	2	6	235151	235156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4771	NC_009512	CTG	2	6	235301	235306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545452
4772	NC_009512	GGC	2	6	235471	235476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545452
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4786	NC_009512	TGC	2	6	235981	235986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4788	NC_009512	GC	3	6	236046	236051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4846	NC_009512	CACC	2	8	238590	238597	25 %	0 %	0 %	75 %	148545454
4847	NC_009512	TGC	2	6	238598	238603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545454
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4853	NC_009512	GTT	2	6	238844	238849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545455
4854	NC_009512	TGC	2	6	238870	238875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545455
4855	NC_009512	TGC	2	6	238909	238914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545455
4856	NC_009512	A	6	6	238919	238924	100 %	0 %	0 %	0 %	148545455
4857	NC_009512	CGC	2	6	238975	238980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545456
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4859	NC_009512	CTA	2	6	239005	239010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545456
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4861	NC_009512	TGG	2	6	239265	239270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545456
4862	NC_009512	CCG	2	6	239271	239276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545456
4863	NC_009512	GAA	2	6	239285	239290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545456
4864	NC_009512	GCCCGT	2	12	239306	239317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148545456
4865	NC_009512	GCTCA	2	10	239354	239363	20 %	20 %	20 %	40 %	148545456
4866	NC_009512	GGT	2	6	239377	239382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545456
4867	NC_009512	CG	3	6	239414	239419	0 %	0 %	50 %	50 %	148545456
4868	NC_009512	CCG	2	6	239442	239447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545456
4869	NC_009512	GCC	2	6	239448	239453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545456
4870	NC_009512	GGT	2	6	239464	239469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545456
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4874	NC_009512	ATC	2	6	239768	239773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545456
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4880	NC_009512	GGC	3	9	240030	240038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545457
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4889	NC_009512	GCTG	2	8	240684	240691	0 %	25 %	50 %	25 %	148545457
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4894	NC_009512	TGCG	2	8	241106	241113	0 %	25 %	50 %	25 %	148545457
4895	NC_009512	GGC	3	9	241119	241127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545457
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4897	NC_009512	G	6	6	241177	241182	0 %	0 %	100 %	0 %	148545457
4898	NC_009512	A	6	6	241290	241295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4899	NC_009512	CGA	2	6	241320	241325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545458
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4916	NC_009512	A	6	6	242156	242161	100 %	0 %	0 %	0 %	148545458
4917	NC_009512	GT	3	6	242199	242204	0 %	50 %	50 %	0 %	148545458
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4952	NC_009512	TGCTG	2	10	243852	243861	0 %	40 %	40 %	20 %	148545459
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4978	NC_009512	GCTC	2	8	244955	244962	0 %	25 %	25 %	50 %	148545461
4979	NC_009512	GGAT	2	8	244978	244985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4980	NC_009512	GGC	2	6	245007	245012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4981	NC_009512	ACT	2	6	245143	245148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545462
4982	NC_009512	ACA	2	6	245149	245154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545462
4983	NC_009512	GCCT	2	8	245182	245189	0 %	25 %	25 %	50 %	148545462
4984	NC_009512	GGC	2	6	245211	245216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545462
4985	NC_009512	CTG	2	6	245343	245348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545462
4986	NC_009512	GCT	2	6	245384	245389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545462
4987	NC_009512	CTGC	2	8	245415	245422	0 %	25 %	25 %	50 %	148545462
4988	NC_009512	GTCG	2	8	245456	245463	0 %	25 %	50 %	25 %	148545462
4989	NC_009512	CTG	2	6	245496	245501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545462
4990	NC_009512	AAG	2	6	245619	245624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545462
4991	NC_009512	TGC	2	6	245671	245676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545462
4992	NC_009512	GAT	2	6	245750	245755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545462
4993	NC_009512	AAC	2	6	245911	245916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545463
4994	NC_009512	GCA	2	6	245918	245923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545463
4995	NC_009512	GCGCCG	2	12	245931	245942	0 %	0 %	50 %	50 %	148545463
4996	NC_009512	ACC	2	6	245944	245949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545463
4997	NC_009512	CG	3	6	245958	245963	0 %	0 %	50 %	50 %	148545463
4998	NC_009512	GGTC	2	8	246153	246160	0 %	25 %	50 %	25 %	148545463
4999	NC_009512	ATG	2	6	246194	246199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545463
5000	NC_009512	CGG	2	6	246264	246269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545463

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