MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 124473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009439	GCG	2	6	164059	164064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305204
4002	NC_009439	CCA	2	6	164128	164133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305204
4003	NC_009439	CAG	2	6	164153	164158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4004	NC_009439	TGG	2	6	164176	164181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305204
4005	NC_009439	CAG	3	9	164198	164206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4006	NC_009439	GCC	2	6	164226	164231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305204
4007	NC_009439	TGC	2	6	164248	164253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4008	NC_009439	CGCTG	2	10	164264	164273	0 %	20 %	40 %	40 %	146305204
4009	NC_009439	GCC	2	6	164276	164281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305204
4010	NC_009439	GC	3	6	164291	164296	0 %	0 %	50 %	50 %	146305204
4011	NC_009439	TGG	2	6	164323	164328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305204
4012	NC_009439	TGA	2	6	164329	164334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305204
4013	NC_009439	G	6	6	164352	164357	0 %	0 %	100 %	0 %	146305204
4014	NC_009439	CAG	2	6	164393	164398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4015	NC_009439	GCGCC	2	10	164407	164416	0 %	0 %	40 %	60 %	146305204
4016	NC_009439	ACC	2	6	164433	164438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305204
4017	NC_009439	GCC	2	6	164444	164449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305204
4018	NC_009439	CCA	2	6	164454	164459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305204
4019	NC_009439	TGG	2	6	164482	164487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305204
4020	NC_009439	GAA	2	6	164534	164539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305204
4021	NC_009439	GCA	2	6	164557	164562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4022	NC_009439	GCCGC	2	10	164568	164577	0 %	0 %	40 %	60 %	146305204
4023	NC_009439	CGA	2	6	164578	164583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4024	NC_009439	GGC	2	6	164591	164596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305204
4025	NC_009439	CAG	2	6	164600	164605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4026	NC_009439	GGCC	2	8	164626	164633	0 %	0 %	50 %	50 %	146305204
4027	NC_009439	CGA	2	6	164641	164646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4028	NC_009439	CGA	2	6	164659	164664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305204
4029	NC_009439	GCC	2	6	164666	164671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305204
4030	NC_009439	AGA	2	6	164703	164708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305204
4031	NC_009439	TGT	2	6	164777	164782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009439	TG	3	6	164786	164791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009439	TTTC	2	8	164839	164846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_009439	GGT	2	6	164877	164882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009439	ACCTG	2	10	164917	164926	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4036	NC_009439	CGGC	2	8	164928	164935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_009439	CGC	2	6	165063	165068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305205
4038	NC_009439	GAA	2	6	165072	165077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305205
4039	NC_009439	CGCGC	2	10	165081	165090	0 %	0 %	40 %	60 %	146305205
4040	NC_009439	CGC	2	6	165105	165110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305205
4041	NC_009439	GC	3	6	165109	165114	0 %	0 %	50 %	50 %	146305205
4042	NC_009439	GCT	2	6	165117	165122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305205
4043	NC_009439	CTG	4	12	165136	165147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305205
4044	NC_009439	CG	3	6	165191	165196	0 %	0 %	50 %	50 %	146305205
4045	NC_009439	CGG	2	6	165213	165218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305205
4046	NC_009439	ATC	2	6	165220	165225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305205
4047	NC_009439	CGG	2	6	165323	165328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305205
4048	NC_009439	TGA	2	6	165356	165361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305205
4049	NC_009439	GCG	2	6	165424	165429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305205
4050	NC_009439	CTG	2	6	165442	165447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305205
4051	NC_009439	CGT	2	6	165452	165457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305205
4052	NC_009439	TGC	2	6	165515	165520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305205
4053	NC_009439	TGC	2	6	165542	165547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305205
4054	NC_009439	CTT	2	6	165603	165608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305206
4055	NC_009439	CGG	2	6	165629	165634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305206
4056	NC_009439	CGA	2	6	165644	165649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4057	NC_009439	GTG	2	6	165690	165695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305206
4058	NC_009439	CTG	2	6	165735	165740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4059	NC_009439	AGC	2	6	165756	165761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4060	NC_009439	CGC	2	6	165781	165786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305206
4061	NC_009439	TGG	2	6	165802	165807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305206
4062	NC_009439	CCG	2	6	165815	165820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305206
4063	NC_009439	TAC	2	6	165906	165911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305206
4064	NC_009439	CCGG	2	8	165918	165925	0 %	0 %	50 %	50 %	146305206
4065	NC_009439	TGC	2	6	165973	165978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4066	NC_009439	CCA	2	6	165998	166003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305206
4067	NC_009439	ATC	2	6	166020	166025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305206
4068	NC_009439	GGCT	2	8	166087	166094	0 %	25 %	50 %	25 %	146305206
4069	NC_009439	GCA	2	6	166139	166144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4070	NC_009439	AGC	2	6	166189	166194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4071	NC_009439	GCA	2	6	166199	166204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4072	NC_009439	GCC	2	6	166260	166265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305206
4073	NC_009439	GCT	2	6	166328	166333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305206
4074	NC_009439	CAG	2	6	166344	166349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305206
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4077	NC_009439	CGT	2	6	166374	166379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305207
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4079	NC_009439	CCGG	2	8	166513	166520	0 %	0 %	50 %	50 %	146305207
4080	NC_009439	CAG	2	6	166548	166553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305207
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4082	NC_009439	CGG	2	6	166649	166654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305207
4083	NC_009439	CTTG	2	8	166778	166785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_009439	GCC	2	6	166810	166815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_009439	GCG	2	6	166818	166823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_009439	CG	3	6	166908	166913	0 %	0 %	50 %	50 %	146305208
4087	NC_009439	TGC	2	6	166966	166971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305208
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4089	NC_009439	GTCGCG	2	12	167069	167080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146305208
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4094	NC_009439	GCG	2	6	167377	167382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305208
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4101	NC_009439	CCGCT	2	10	167587	167596	0 %	20 %	20 %	60 %	146305209
4102	NC_009439	TCC	2	6	167608	167613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305209
4103	NC_009439	GGC	2	6	167615	167620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305209
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4105	NC_009439	GC	3	6	167683	167688	0 %	0 %	50 %	50 %	146305209
4106	NC_009439	TCG	2	6	167692	167697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305209
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4109	NC_009439	TCA	2	6	167810	167815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305209
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4112	NC_009439	ACG	2	6	167926	167931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305209
4113	NC_009439	TCG	2	6	167932	167937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305209
4114	NC_009439	CT	3	6	167992	167997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_009439	GC	3	6	168004	168009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_009439	GCGG	2	8	168044	168051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_009439	GATA	2	8	168074	168081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009439	CGC	2	6	168149	168154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305210
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4242	NC_009439	GGT	2	6	172547	172552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305212
4243	NC_009439	CTG	2	6	172557	172562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305212
4244	NC_009439	AGG	2	6	172630	172635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305212
4245	NC_009439	GCG	3	9	172657	172665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305212
4246	NC_009439	GCCG	2	8	172679	172686	0 %	0 %	50 %	50 %	146305212
4247	NC_009439	GAG	2	6	172734	172739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305212
4248	NC_009439	TCGA	2	8	172761	172768	25 %	25 %	25 %	25 %	146305212
4249	NC_009439	GGCT	2	8	172807	172814	0 %	25 %	50 %	25 %	146305212
4250	NC_009439	GCC	2	6	172815	172820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305212
4251	NC_009439	CGGC	2	8	172849	172856	0 %	0 %	50 %	50 %	146305212
4252	NC_009439	CTG	2	6	172857	172862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305212
4253	NC_009439	CGG	2	6	172877	172882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305212
4254	NC_009439	CCG	2	6	172903	172908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305212
4255	NC_009439	GGC	2	6	172934	172939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305212
4256	NC_009439	GCT	2	6	172946	172951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305212
4257	NC_009439	CTG	3	9	172989	172997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305212
4258	NC_009439	TCG	2	6	173049	173054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4259	NC_009439	CTG	2	6	173072	173077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4260	NC_009439	CGA	2	6	173101	173106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
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4262	NC_009439	CGA	2	6	173134	173139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4263	NC_009439	ATC	2	6	173264	173269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305213
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4265	NC_009439	GCA	2	6	173370	173375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4266	NC_009439	TCG	2	6	173388	173393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305213
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4269	NC_009439	AGG	2	6	173460	173465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305213
4270	NC_009439	GAT	2	6	173656	173661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305213
4271	NC_009439	CGA	2	6	173668	173673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4272	NC_009439	GCC	2	6	173694	173699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305213
4273	NC_009439	CGA	2	6	173704	173709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4274	NC_009439	CGT	2	6	173791	173796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4275	NC_009439	TGA	2	6	173868	173873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305213
4276	NC_009439	CTG	2	6	173909	173914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4277	NC_009439	GGC	2	6	173936	173941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305213
4278	NC_009439	CAG	2	6	173962	173967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4279	NC_009439	GGGCAT	2	12	174004	174015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146305213
4280	NC_009439	GCTCGG	2	12	174085	174096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146305213
4281	NC_009439	TCA	2	6	174102	174107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305213
4282	NC_009439	AGC	2	6	174149	174154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305213
4283	NC_009439	CCGCG	2	10	174191	174200	0 %	0 %	40 %	60 %	146305213
4284	NC_009439	AGGC	2	8	174252	174259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4285	NC_009439	T	6	6	174298	174303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4286	NC_009439	CTG	2	6	174362	174367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4287	NC_009439	CGGC	2	8	174460	174467	0 %	0 %	50 %	50 %	146305214
4288	NC_009439	CCG	2	6	174481	174486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305214
4289	NC_009439	AGC	2	6	174532	174537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305214
4290	NC_009439	CCG	2	6	174563	174568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305214
4291	NC_009439	CGA	2	6	174602	174607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305214
4292	NC_009439	CGC	2	6	174649	174654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305214
4293	NC_009439	CTG	2	6	174708	174713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305215
4294	NC_009439	CTG	2	6	174777	174782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305215
4295	NC_009439	CTG	2	6	174819	174824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305215
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4300	NC_009439	GCCG	2	8	175023	175030	0 %	0 %	50 %	50 %	146305216
4301	NC_009439	GC	3	6	175054	175059	0 %	0 %	50 %	50 %	146305216
4302	NC_009439	CTG	2	6	175060	175065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4306	NC_009439	GC	3	6	175300	175305	0 %	0 %	50 %	50 %	146305216
4307	NC_009439	CTG	2	6	175306	175311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4312	NC_009439	GCA	2	6	175482	175487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4314	NC_009439	GCC	2	6	175621	175626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305216
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4317	NC_009439	CGT	2	6	175878	175883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4324	NC_009439	CAG	2	6	176074	176079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4330	NC_009439	GAC	2	6	176224	176229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4332	NC_009439	CAG	2	6	176245	176250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305216
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4345	NC_009439	GCT	2	6	176879	176884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305217
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4348	NC_009439	GAT	2	6	176930	176935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305217
4349	NC_009439	GC	3	6	176940	176945	0 %	0 %	50 %	50 %	146305217
4350	NC_009439	GCG	2	6	177000	177005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4351	NC_009439	GGC	2	6	177034	177039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4352	NC_009439	GCG	2	6	177109	177114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305217
4353	NC_009439	TGA	2	6	177127	177132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305217
4354	NC_009439	CAG	2	6	177146	177151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4355	NC_009439	TGG	2	6	177199	177204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305217
4356	NC_009439	CGA	2	6	177208	177213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
4357	NC_009439	CGGCG	2	10	177223	177232	0 %	0 %	60 %	40 %	146305217
4358	NC_009439	GCA	2	6	177280	177285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305217
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4485	NC_009439	TGG	2	6	182837	182842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305221
4486	NC_009439	GC	3	6	182903	182908	0 %	0 %	50 %	50 %	146305221
4487	NC_009439	CGC	2	6	183005	183010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305221
4488	NC_009439	GCC	2	6	183031	183036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305221
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4490	NC_009439	ACC	2	6	183212	183217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305221
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4493	NC_009439	GCT	2	6	183336	183341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305221
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