MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri A1501 chromosome

Total Repeats: 108047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_009434	CCG	2	6	644018	644023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280968
16003	NC_009434	GCC	2	6	644080	644085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280968
16004	NC_009434	GAT	2	6	644181	644186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280968
16005	NC_009434	TTGG	2	8	644203	644210	0 %	50 %	50 %	0 %	146280968
16006	NC_009434	CAA	2	6	644271	644276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280968
16007	NC_009434	GGT	2	6	644349	644354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280968
16008	NC_009434	CAC	2	6	644412	644417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280968
16009	NC_009434	GCC	2	6	644443	644448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280968
16010	NC_009434	GCA	2	6	644449	644454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280968
16011	NC_009434	GAT	2	6	644473	644478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280968
16012	NC_009434	GCG	2	6	644637	644642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280968
16013	NC_009434	GAT	2	6	644709	644714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280968
16014	NC_009434	CCG	2	6	644721	644726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280968
16015	NC_009434	CTG	2	6	644863	644868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280968
16016	NC_009434	AC	3	6	644986	644991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_009434	CAA	2	6	645094	645099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_009434	TGT	2	6	645102	645107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_009434	GCG	3	9	645266	645274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280969
16020	NC_009434	GCA	2	6	645312	645317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280969
16021	NC_009434	CCA	2	6	645318	645323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280969
16022	NC_009434	GCT	2	6	645340	645345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280969
16023	NC_009434	AAG	2	6	645419	645424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280969
16024	NC_009434	CCG	2	6	645516	645521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280969
16025	NC_009434	CAG	2	6	645601	645606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280969
16026	NC_009434	ACC	2	6	645671	645676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280969
16027	NC_009434	TCCA	2	8	645862	645869	25 %	25 %	0 %	50 %	146280969
16028	NC_009434	CAAAA	2	10	645904	645913	80 %	0 %	0 %	20 %	146280969
16029	NC_009434	TTG	2	6	645944	645949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280969
16030	NC_009434	GAA	2	6	645984	645989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280969
16031	NC_009434	TGG	2	6	646014	646019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280969
16032	NC_009434	GCC	2	6	646066	646071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280969
16033	NC_009434	CGC	2	6	646075	646080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280969
16034	NC_009434	GGA	2	6	646177	646182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_009434	AGC	2	6	646210	646215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_009434	TCAT	2	8	646231	646238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16037	NC_009434	GCT	2	6	646244	646249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_009434	GCAT	2	8	646349	646356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16039	NC_009434	GCCC	2	8	646361	646368	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16040	NC_009434	CAC	2	6	646491	646496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16041	NC_009434	CAT	2	6	646509	646514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_009434	AGT	2	6	646545	646550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_009434	TGC	2	6	646571	646576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280970
16044	NC_009434	GTTG	2	8	646605	646612	0 %	50 %	50 %	0 %	146280970
16045	NC_009434	CAG	2	6	646653	646658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280970
16046	NC_009434	GCT	2	6	646758	646763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280970
16047	NC_009434	TTGA	2	8	646840	646847	25 %	50 %	25 %	0 %	146280970
16048	NC_009434	CG	3	6	646942	646947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16049	NC_009434	GTT	2	6	646958	646963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_009434	GCC	2	6	646975	646980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16051	NC_009434	TTA	2	6	646989	646994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_009434	CAC	2	6	647051	647056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16053	NC_009434	CGG	2	6	647071	647076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_009434	CCAC	2	8	647088	647095	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16055	NC_009434	ATG	2	6	647120	647125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280971
16056	NC_009434	GCC	2	6	647207	647212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280971
16057	NC_009434	CTG	2	6	647254	647259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280971
16058	NC_009434	GC	3	6	647266	647271	0 %	0 %	50 %	50 %	146280971
16059	NC_009434	GTTG	2	8	647303	647310	0 %	50 %	50 %	0 %	146280971
16060	NC_009434	CGT	2	6	647356	647361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280971
16061	NC_009434	GGGC	2	8	647362	647369	0 %	0 %	75 %	25 %	146280971
16062	NC_009434	AG	3	6	647413	647418	50 %	0 %	50 %	0 %	146280971
16063	NC_009434	TTC	2	6	647526	647531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280971
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16065	NC_009434	GCG	2	6	647620	647625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_009434	GCA	2	6	647836	647841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280972
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16069	NC_009434	AGC	2	6	647915	647920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280972
16070	NC_009434	TGGG	2	8	647976	647983	0 %	25 %	75 %	0 %	146280972
16071	NC_009434	TCA	2	6	648058	648063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280972
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16091	NC_009434	TGA	2	6	649005	649010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280973
16092	NC_009434	TGC	2	6	649026	649031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280973
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16099	NC_009434	ATGA	2	8	649290	649297	50 %	25 %	25 %	0 %	146280974
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16102	NC_009434	CAA	2	6	649424	649429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280974
16103	NC_009434	TTC	2	6	649458	649463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280974
16104	NC_009434	CACC	2	8	649539	649546	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16105	NC_009434	CGCCGA	2	12	649574	649585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16106	NC_009434	GCAAGC	2	12	649594	649605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_009434	GTT	2	6	649619	649624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_009434	GTG	2	6	649644	649649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_009434	ACTC	2	8	649742	649749	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16110	NC_009434	CAGG	2	8	649794	649801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16111	NC_009434	CGAAG	2	10	649842	649851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16112	NC_009434	GTC	2	6	649854	649859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_009434	CAG	2	6	649961	649966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280975
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16117	NC_009434	CGG	2	6	650065	650070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280975
16118	NC_009434	GCC	2	6	650125	650130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280975
16119	NC_009434	GCT	2	6	650147	650152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280975
16120	NC_009434	AGCC	2	8	650172	650179	25 %	0 %	25 %	50 %	146280975
16121	NC_009434	GTG	2	6	650241	650246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280975
16122	NC_009434	TCG	2	6	650281	650286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280975
16123	NC_009434	GCG	2	6	650326	650331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280975
16124	NC_009434	TCG	2	6	650353	650358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280975
16125	NC_009434	GCA	2	6	650405	650410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280975
16126	NC_009434	CGG	2	6	650456	650461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280975
16127	NC_009434	GTG	2	6	650475	650480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280975
16128	NC_009434	GGT	2	6	650576	650581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280975
16129	NC_009434	GGCGCG	2	12	650585	650596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280975
16130	NC_009434	CG	3	6	650602	650607	0 %	0 %	50 %	50 %	146280975
16131	NC_009434	GGT	2	6	650636	650641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280975
16132	NC_009434	CGC	2	6	650657	650662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280975
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16140	NC_009434	G	6	6	650980	650985	0 %	0 %	100 %	0 %	146280975
16141	NC_009434	GGCA	2	8	651012	651019	25 %	0 %	50 %	25 %	146280975
16142	NC_009434	CGC	2	6	651073	651078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280975
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16145	NC_009434	GCA	2	6	651161	651166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280975
16146	NC_009434	GCCT	2	8	651177	651184	0 %	25 %	25 %	50 %	146280975
16147	NC_009434	GTGC	2	8	651259	651266	0 %	25 %	50 %	25 %	146280975
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16154	NC_009434	CTG	2	6	651530	651535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280976
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16157	NC_009434	CG	3	6	651642	651647	0 %	0 %	50 %	50 %	146280976
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16173	NC_009434	GCC	2	6	652478	652483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16175	NC_009434	GTC	2	6	652525	652530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16179	NC_009434	GCC	2	6	652702	652707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16229	NC_009434	GCA	2	6	655088	655093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280977
16230	NC_009434	TGAAG	2	10	655101	655110	40 %	20 %	40 %	0 %	146280977
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16232	NC_009434	GAC	2	6	655229	655234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16233	NC_009434	TGC	2	6	655242	655247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16234	NC_009434	TGT	3	9	655250	655258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16235	NC_009434	CA	3	6	655278	655283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16236	NC_009434	AGGT	2	8	655285	655292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16237	NC_009434	GTG	2	6	655352	655357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16238	NC_009434	ATG	2	6	655386	655391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16239	NC_009434	TCA	2	6	655422	655427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16240	NC_009434	CGC	2	6	655447	655452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16241	NC_009434	TCT	2	6	655462	655467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280978
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16243	NC_009434	GTT	2	6	655493	655498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280978
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16364	NC_009434	CATC	2	8	662016	662023	25 %	25 %	0 %	50 %	146280981
16365	NC_009434	CCTT	2	8	662031	662038	0 %	50 %	0 %	50 %	146280981
16366	NC_009434	CGC	2	6	662061	662066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280981
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16372	NC_009434	GCT	2	6	662385	662390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280981
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16383	NC_009434	AGC	2	6	662930	662935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280982
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16387	NC_009434	TAGG	2	8	663002	663009	25 %	25 %	50 %	0 %	146280982
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16397	NC_009434	AGGC	2	8	663670	663677	25 %	0 %	50 %	25 %	146280982
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16402	NC_009434	GTC	2	6	663793	663798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280982
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16421	NC_009434	A	7	7	665029	665035	100 %	0 %	0 %	0 %	146280983
16422	NC_009434	CTG	2	6	665154	665159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280983
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16425	NC_009434	GATG	2	8	665362	665369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16426	NC_009434	CGT	2	6	665424	665429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280984
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16470	NC_009434	ACG	2	6	667673	667678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280986
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16484	NC_009434	CCG	2	6	668229	668234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280986
16485	NC_009434	CCACTT	2	12	668257	668268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146280986
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