MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri A1501 chromosome

Total Repeats: 108047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_009434	GC	4	8	4243035	4243042	0 %	0 %	50 %	50 %	146284223
100003	NC_009434	TCC	2	6	4243061	4243066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146284223
100004	NC_009434	GCG	2	6	4243082	4243087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284223
100005	NC_009434	GAA	2	6	4243117	4243122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146284223
100006	NC_009434	CAG	2	6	4243132	4243137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100007	NC_009434	TGC	2	6	4243154	4243159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100008	NC_009434	AGC	2	6	4243172	4243177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100009	NC_009434	GCA	2	6	4243182	4243187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100010	NC_009434	CAG	2	6	4243264	4243269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100011	NC_009434	CACG	2	8	4243275	4243282	25 %	0 %	25 %	50 %	146284223
100012	NC_009434	GTA	2	6	4243318	4243323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146284223
100013	NC_009434	CTG	2	6	4243327	4243332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100014	NC_009434	GCT	2	6	4243335	4243340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100015	NC_009434	TGGC	3	12	4243377	4243388	0 %	25 %	50 %	25 %	146284223
100016	NC_009434	CGCGG	2	10	4243453	4243462	0 %	0 %	60 %	40 %	146284223
100017	NC_009434	GCA	2	6	4243545	4243550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284223
100018	NC_009434	TCCA	2	8	4243568	4243575	25 %	25 %	0 %	50 %	146284223
100019	NC_009434	CAT	2	6	4243614	4243619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100020	NC_009434	CTGC	2	8	4243780	4243787	0 %	25 %	25 %	50 %	146284224
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100022	NC_009434	ATC	2	6	4243827	4243832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146284224
100023	NC_009434	CG	3	6	4243873	4243878	0 %	0 %	50 %	50 %	146284224
100024	NC_009434	TTCCTC	2	12	4243898	4243909	0 %	50 %	0 %	50 %	146284224
100025	NC_009434	CAG	2	6	4243922	4243927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284224
100026	NC_009434	GCA	2	6	4243993	4243998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284224
100027	NC_009434	GCC	2	6	4244060	4244065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284224
100028	NC_009434	ATGG	2	8	4244111	4244118	25 %	25 %	50 %	0 %	146284224
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100030	NC_009434	GC	3	6	4244166	4244171	0 %	0 %	50 %	50 %	146284224
100031	NC_009434	CAG	2	6	4244195	4244200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284224
100032	NC_009434	CAG	2	6	4244228	4244233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284224
100033	NC_009434	TGA	2	6	4244277	4244282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100034	NC_009434	GGC	2	6	4244292	4244297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100035	NC_009434	GGCTCT	2	12	4244371	4244382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284225
100036	NC_009434	GAC	2	6	4244444	4244449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284225
100037	NC_009434	GC	4	8	4244491	4244498	0 %	0 %	50 %	50 %	146284225
100038	NC_009434	GTC	2	6	4244513	4244518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284225
100039	NC_009434	CAG	3	9	4244531	4244539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284225
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100042	NC_009434	AGC	2	6	4244657	4244662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284225
100043	NC_009434	AATT	2	8	4244684	4244691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100044	NC_009434	TAA	2	6	4244698	4244703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100045	NC_009434	CCAG	2	8	4244721	4244728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100046	NC_009434	TAG	2	6	4244862	4244867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146284226
100047	NC_009434	CGA	2	6	4244878	4244883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284226
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100049	NC_009434	CTC	2	6	4244957	4244962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146284226
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100051	NC_009434	GCAGCT	2	12	4245106	4245117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146284226
100052	NC_009434	CTG	2	6	4245128	4245133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284226
100053	NC_009434	CGA	2	6	4245169	4245174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284226
100054	NC_009434	GCG	2	6	4245271	4245276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284226
100055	NC_009434	CGT	2	6	4245322	4245327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284226
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100057	NC_009434	GC	3	6	4245455	4245460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100058	NC_009434	CG	3	6	4245502	4245507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100059	NC_009434	GCG	2	6	4245514	4245519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100060	NC_009434	GCG	2	6	4245526	4245531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100061	NC_009434	CAG	2	6	4245553	4245558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100062	NC_009434	ACG	2	6	4245569	4245574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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100064	NC_009434	GCA	2	6	4245655	4245660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100065	NC_009434	CAT	2	6	4245681	4245686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146284227
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100099	NC_009434	TGA	2	6	4247381	4247386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146284229
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100110	NC_009434	CCAGGC	2	12	4247880	4247891	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100111	NC_009434	GCC	2	6	4247966	4247971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100112	NC_009434	GCC	2	6	4248013	4248018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100113	NC_009434	GCCC	2	8	4248023	4248030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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100115	NC_009434	GCA	2	6	4248071	4248076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284230
100116	NC_009434	CGA	2	6	4248086	4248091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284230
100117	NC_009434	CCA	2	6	4248106	4248111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146284230
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100120	NC_009434	GTC	3	9	4248354	4248362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284230
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100124	NC_009434	CGA	2	6	4248629	4248634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284230
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100145	NC_009434	AGC	2	6	4249784	4249789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284231
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100152	NC_009434	CGC	2	6	4249936	4249941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284231
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100156	NC_009434	GCA	2	6	4250226	4250231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284231
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100158	NC_009434	GATGG	2	10	4250358	4250367	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100159	NC_009434	TCG	2	6	4250389	4250394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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100169	NC_009434	GCT	2	6	4250601	4250606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284232
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100171	NC_009434	CGG	2	6	4250691	4250696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284232
100172	NC_009434	GATCAG	2	12	4250731	4250742	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146284232
100173	NC_009434	TTC	2	6	4250762	4250767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146284232
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100184	NC_009434	CCA	2	6	4251207	4251212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146284232
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100207	NC_009434	TTC	2	6	4252130	4252135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146284232
100208	NC_009434	GCA	2	6	4252170	4252175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284232
100209	NC_009434	GGT	2	6	4252263	4252268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146284232
100210	NC_009434	GCTC	2	8	4252373	4252380	0 %	25 %	25 %	50 %	146284232
100211	NC_009434	ACG	2	6	4252381	4252386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284232
100212	NC_009434	GGC	2	6	4252430	4252435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100213	NC_009434	TGCCC	2	10	4252509	4252518	0 %	20 %	20 %	60 %	146284233
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100215	NC_009434	GCA	2	6	4252641	4252646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284233
100216	NC_009434	GCG	3	9	4252715	4252723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284233
100217	NC_009434	CTG	2	6	4252759	4252764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284233
100218	NC_009434	CCGC	2	8	4252779	4252786	0 %	0 %	25 %	75 %	146284233
100219	NC_009434	CAGC	2	8	4252798	4252805	25 %	0 %	25 %	50 %	146284233
100220	NC_009434	GCC	2	6	4252806	4252811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284233
100221	NC_009434	CG	3	6	4252824	4252829	0 %	0 %	50 %	50 %	146284233
100222	NC_009434	GGAT	2	8	4252832	4252839	25 %	25 %	50 %	0 %	146284233
100223	NC_009434	TGC	2	6	4252859	4252864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284233
100224	NC_009434	AGC	2	6	4252886	4252891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284233
100225	NC_009434	CGG	2	6	4252947	4252952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284233
100226	NC_009434	GCC	2	6	4252957	4252962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284233
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100228	NC_009434	AGC	2	6	4253090	4253095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284233
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100237	NC_009434	T	6	6	4253456	4253461	0 %	100 %	0 %	0 %	146284234
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100339	NC_009434	CGC	3	9	4257325	4257333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284238
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100342	NC_009434	ATC	2	6	4257491	4257496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100343	NC_009434	GCC	2	6	4257497	4257502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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100456	NC_009434	GAT	2	6	4262260	4262265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146284243
100457	NC_009434	CGC	2	6	4262415	4262420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284243
100458	NC_009434	GCT	2	6	4262450	4262455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284243
100459	NC_009434	GGC	2	6	4262456	4262461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284243
100460	NC_009434	CAG	2	6	4262479	4262484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284243
100461	NC_009434	GTCTG	2	10	4262495	4262504	0 %	40 %	40 %	20 %	146284243
100462	NC_009434	GGCA	2	8	4262512	4262519	25 %	0 %	50 %	25 %	146284243
100463	NC_009434	GGCA	2	8	4262555	4262562	25 %	0 %	50 %	25 %	146284243
100464	NC_009434	GGCC	2	8	4262571	4262578	0 %	0 %	50 %	50 %	146284243
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100471	NC_009434	GCC	2	6	4262745	4262750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284243
100472	NC_009434	AGC	2	6	4262751	4262756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284243
100473	NC_009434	CGC	2	6	4262772	4262777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146284243
100474	NC_009434	TTC	2	6	4262845	4262850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146284243
100475	NC_009434	CG	3	6	4262851	4262856	0 %	0 %	50 %	50 %	146284243
100476	NC_009434	AAC	2	6	4262954	4262959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100477	NC_009434	CTG	2	6	4263001	4263006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284244
100478	NC_009434	GTC	2	6	4263019	4263024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284244
100479	NC_009434	GCT	2	6	4263030	4263035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284244
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100482	NC_009434	GCA	2	6	4263099	4263104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284244
100483	NC_009434	GCA	2	6	4263129	4263134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284244
100484	NC_009434	GCC	2	6	4263355	4263360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100485	NC_009434	GAC	2	6	4263424	4263429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284245
100486	NC_009434	GTC	2	6	4263455	4263460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284245
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100489	NC_009434	CG	3	6	4263542	4263547	0 %	0 %	50 %	50 %	146284245
100490	NC_009434	TGC	2	6	4263578	4263583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284245
100491	NC_009434	TCG	2	6	4263602	4263607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146284245
100492	NC_009434	GGC	2	6	4263613	4263618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146284245
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100494	NC_009434	GCA	2	6	4263660	4263665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284245
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100497	NC_009434	CAG	3	9	4263760	4263768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146284245
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100500	NC_009434	GTGATA	2	12	4263978	4263989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146284246

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