MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1 chromosome

Total Repeats: 40692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009379	GCC	2	6	2	7	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009379	TCC	2	6	21	26	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009379	C	6	6	51	56	0 %	0 %	0 %	100 %	145588190
4	NC_009379	ATTAAT	2	12	291	302	50 %	50 %	0 %	0 %	145588190
5	NC_009379	ATT	2	6	402	407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588190
6	NC_009379	G	7	7	570	576	0 %	0 %	100 %	0 %	145588190
7	NC_009379	TGGGC	2	10	578	587	0 %	20 %	60 %	20 %	145588190
8	NC_009379	TTA	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588190
9	NC_009379	TA	3	6	654	659	50 %	50 %	0 %	0 %	145588190
10	NC_009379	CGT	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588190
11	NC_009379	CAA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145588190
12	NC_009379	CTA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588190
13	NC_009379	CTCG	2	8	737	744	0 %	25 %	25 %	50 %	145588190
14	NC_009379	CTA	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588190
15	NC_009379	TGA	2	6	758	763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588190
16	NC_009379	T	6	6	771	776	0 %	100 %	0 %	0 %	145588190
17	NC_009379	T	7	7	804	810	0 %	100 %	0 %	0 %	145588190
18	NC_009379	ATT	2	6	849	854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588190
19	NC_009379	TACC	2	8	863	870	25 %	25 %	0 %	50 %	145588190
20	NC_009379	TGA	2	6	890	895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588190
21	NC_009379	TGA	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588190
22	NC_009379	A	6	6	978	983	100 %	0 %	0 %	0 %	145588190
23	NC_009379	AGA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588190
24	NC_009379	T	6	6	1023	1028	0 %	100 %	0 %	0 %	145588190
25	NC_009379	CTT	2	6	1152	1157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145588190
26	NC_009379	TCCA	2	8	1158	1165	25 %	25 %	0 %	50 %	145588190
27	NC_009379	GAA	2	6	1244	1249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588190
28	NC_009379	CA	3	6	1356	1361	50 %	0 %	0 %	50 %	145588190
29	NC_009379	T	6	6	1617	1622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009379	TTA	2	6	1681	1686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009379	TAC	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009379	AT	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009379	CG	3	6	1743	1748	0 %	0 %	50 %	50 %	145588191
34	NC_009379	TTA	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588191
35	NC_009379	GGT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145588191
36	NC_009379	TTG	2	6	1785	1790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588191
37	NC_009379	AC	4	8	1798	1805	50 %	0 %	0 %	50 %	145588191
38	NC_009379	AAG	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588191
39	NC_009379	TGC	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588191
40	NC_009379	ATT	2	6	1948	1953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588191
41	NC_009379	TTTAAA	2	12	1990	2001	50 %	50 %	0 %	0 %	145588191
42	NC_009379	CTG	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588191
43	NC_009379	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	145588191
44	NC_009379	AATT	2	8	2136	2143	50 %	50 %	0 %	0 %	145588191
45	NC_009379	CAG	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145588191
46	NC_009379	TGT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588191
47	NC_009379	ATT	3	9	2315	2323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588191
48	NC_009379	AGA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588191
49	NC_009379	TGA	2	6	2368	2373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588191
50	NC_009379	AGC	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145588191
51	NC_009379	ACT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588191
52	NC_009379	CTA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588191
53	NC_009379	AAG	3	9	2634	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588191
54	NC_009379	GCG	2	6	2670	2675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145588191
55	NC_009379	TTAT	2	8	2704	2711	25 %	75 %	0 %	0 %	145588191
56	NC_009379	A	6	6	2739	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	145588191
57	NC_009379	AGT	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588191
58	NC_009379	ATTTA	2	10	2834	2843	40 %	60 %	0 %	0 %	145588191
59	NC_009379	A	7	7	2845	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	145588192
60	NC_009379	GAA	2	6	2857	2862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588192
61	NC_009379	A	8	8	2861	2868	100 %	0 %	0 %	0 %	145588192
62	NC_009379	GTA	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588192
63	NC_009379	TGC	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
64	NC_009379	TCA	2	6	2976	2981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588192
65	NC_009379	TGA	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588192
66	NC_009379	GTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588192
67	NC_009379	TTCAAT	2	12	3069	3080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	145588192
68	NC_009379	GCG	2	6	3095	3100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145588192
69	NC_009379	ACG	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145588192
70	NC_009379	TGC	2	6	3147	3152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
71	NC_009379	TGG	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145588192
72	NC_009379	TCG	2	6	3282	3287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
73	NC_009379	GC	3	6	3316	3321	0 %	0 %	50 %	50 %	145588192
74	NC_009379	TGT	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588192
75	NC_009379	AAT	2	6	3505	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145588192
76	NC_009379	TTGA	2	8	3526	3533	25 %	50 %	25 %	0 %	145588192
77	NC_009379	AAG	3	9	3548	3556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588192
78	NC_009379	AT	3	6	3594	3599	50 %	50 %	0 %	0 %	145588192
79	NC_009379	T	6	6	3632	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	145588192
80	NC_009379	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145588192
81	NC_009379	TGC	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
82	NC_009379	TCA	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588192
83	NC_009379	TGA	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588192
84	NC_009379	CAAA	2	8	3931	3938	75 %	0 %	0 %	25 %	145588192
85	NC_009379	AGA	2	6	3975	3980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588192
86	NC_009379	TTG	2	6	3983	3988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588192
87	NC_009379	GCA	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145588192
88	NC_009379	GC	3	6	4081	4086	0 %	0 %	50 %	50 %	145588192
89	NC_009379	CCAA	2	8	4171	4178	50 %	0 %	0 %	50 %	145588192
90	NC_009379	GGC	2	6	4213	4218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145588192
91	NC_009379	TCG	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
92	NC_009379	TTC	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145588192
93	NC_009379	GGT	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145588192
94	NC_009379	GAA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588192
95	NC_009379	ATC	3	9	4405	4413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588192
96	NC_009379	TTGA	2	8	4489	4496	25 %	50 %	25 %	0 %	145588192
97	NC_009379	ACC	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145588192
98	NC_009379	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	145588192
99	NC_009379	GTT	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588192
100	NC_009379	CTT	2	6	4619	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145588192
101	NC_009379	TTG	2	6	4703	4708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588192
102	NC_009379	CGAT	2	8	4724	4731	25 %	25 %	25 %	25 %	145588192
103	NC_009379	C	6	6	4854	4859	0 %	0 %	0 %	100 %	145588192
104	NC_009379	TTG	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588192
105	NC_009379	CGC	2	6	4915	4920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145588192
106	NC_009379	GAT	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588192
107	NC_009379	CGT	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
108	NC_009379	GTC	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
109	NC_009379	TGC	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
110	NC_009379	TGC	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
111	NC_009379	ACA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145588192
112	NC_009379	TGA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145588192
113	NC_009379	TCG	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145588192
114	NC_009379	CG	3	6	5299	5304	0 %	0 %	50 %	50 %	145588192
115	NC_009379	ATTG	2	8	5322	5329	25 %	50 %	25 %	0 %	145588192
116	NC_009379	A	6	6	5361	5366	100 %	0 %	0 %	0 %	145588193
117	NC_009379	ACC	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145588193
118	NC_009379	TCT	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145588193
119	NC_009379	TTG	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588193
120	NC_009379	ATT	2	6	5469	5474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145588193
121	NC_009379	AGA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145588193
122	NC_009379	GGC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145588193
123	NC_009379	GC	3	6	5610	5615	0 %	0 %	50 %	50 %	145588193
124	NC_009379	TTTA	2	8	5685	5692	25 %	75 %	0 %	0 %	145588193
125	NC_009379	GAG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145588193
126	NC_009379	ACT	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145588193
127	NC_009379	CAAA	2	8	5765	5772	75 %	0 %	0 %	25 %	145588193
128	NC_009379	A	6	6	5775	5780	100 %	0 %	0 %	0 %	145588193
129	NC_009379	A	6	6	5804	5809	100 %	0 %	0 %	0 %	145588193
130	NC_009379	ATAA	2	8	5839	5846	75 %	25 %	0 %	0 %	145588193
131	NC_009379	TGT	2	6	5856	5861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145588194
132	NC_009379	ATTA	2	8	5891	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	145588194
133	NC_009379	AGTC	2	8	5906	5913	25 %	25 %	25 %	25 %	145588194
134	NC_009379	GAG	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145588194
135	NC_009379	GCA	2	6	5954	5959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145588194
136	NC_009379	CAAAC	2	10	6063	6072	60 %	0 %	0 %	40 %	145588194
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