MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 46818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009073	GTC	2	6	176139	176144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458808
4003	NC_009073	ACC	2	6	176169	176174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458809
4004	NC_009073	CTT	2	6	176183	176188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458809
4005	NC_009073	ACC	2	6	176197	176202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458809
4006	NC_009073	GGC	2	6	176240	176245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458809
4007	NC_009073	CGG	3	9	176261	176269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458809
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4009	NC_009073	GGC	2	6	176393	176398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458809
4010	NC_009073	CGGG	2	8	176461	176468	0 %	0 %	75 %	25 %	126458809
4011	NC_009073	CAG	2	6	176600	176605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458809
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4013	NC_009073	CTC	2	6	176627	176632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458809
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4015	NC_009073	CCG	2	6	176683	176688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458809
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4018	NC_009073	A	6	6	176854	176859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_009073	AGAC	2	8	176915	176922	50 %	0 %	25 %	25 %	126458810
4020	NC_009073	GCC	3	9	176993	177001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458810
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4054	NC_009073	GAG	2	6	178075	178080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458811
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4057	NC_009073	GAC	2	6	178238	178243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_009073	CCGG	2	8	178300	178307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4102	NC_009073	C	6	6	180207	180212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4103	NC_009073	AACA	2	8	180219	180226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_009073	TCG	2	6	180278	180283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4107	NC_009073	CCA	2	6	180587	180592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4109	NC_009073	TG	3	6	180723	180728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_009073	GCG	2	6	180733	180738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_009073	GCG	2	6	180769	180774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_009073	GGT	2	6	180782	180787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_009073	GCC	2	6	181117	181122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458813
4126	NC_009073	AGG	2	6	181136	181141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458813
4127	NC_009073	CGG	2	6	181142	181147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458813
4128	NC_009073	GA	3	6	181164	181169	50 %	0 %	50 %	0 %	126458813
4129	NC_009073	ACA	2	6	181188	181193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458813
4130	NC_009073	CGT	2	6	181225	181230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_009073	GGC	2	6	181240	181245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009073	GAT	2	6	181345	181350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_009073	ACCC	2	8	181394	181401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4134	NC_009073	ACAG	2	8	181418	181425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_009073	ACG	2	6	181490	181495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_009073	CTAAG	2	10	181499	181508	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4137	NC_009073	CT	3	6	181541	181546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_009073	CTC	2	6	181646	181651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_009073	GCG	2	6	181698	181703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_009073	TA	3	6	181721	181726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_009073	C	6	6	181924	181929	0 %	0 %	0 %	100 %	126458814
4142	NC_009073	GCG	2	6	181957	181962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458814
4143	NC_009073	CGC	2	6	182000	182005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458814
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4147	NC_009073	CGGCTG	2	12	182333	182344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126458814
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4151	NC_009073	GCG	2	6	182493	182498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458814
4152	NC_009073	GTTGC	2	10	182537	182546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4153	NC_009073	TAC	2	6	182568	182573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_009073	CTG	2	6	182574	182579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_009073	GGCC	2	8	182631	182638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4156	NC_009073	GC	3	6	182669	182674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4157	NC_009073	GCGTT	2	10	182724	182733	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4158	NC_009073	G	6	6	182774	182779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_009073	TGGC	2	8	182800	182807	0 %	25 %	50 %	25 %	126458815
4160	NC_009073	ATG	2	6	182853	182858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458815
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4163	NC_009073	TCG	2	6	183091	183096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458815
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4165	NC_009073	GCCG	2	8	183163	183170	0 %	0 %	50 %	50 %	126458815
4166	NC_009073	AG	3	6	183173	183178	50 %	0 %	50 %	0 %	126458815
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4185	NC_009073	CCGC	2	8	183966	183973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4186	NC_009073	AC	3	6	184006	184011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4187	NC_009073	GCCTA	2	10	184076	184085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4188	NC_009073	CGC	2	6	184088	184093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4189	NC_009073	CCG	2	6	184137	184142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4210	NC_009073	CTAGA	2	10	185421	185430	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4217	NC_009073	AGGCC	2	10	185645	185654	20 %	0 %	40 %	40 %	126458817
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4241	NC_009073	CCT	2	6	187619	187624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458817
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4243	NC_009073	AG	3	6	187774	187779	50 %	0 %	50 %	0 %	126458817
4244	NC_009073	TC	3	6	187822	187827	0 %	50 %	0 %	50 %	126458817
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4249	NC_009073	GAG	2	6	188055	188060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458817
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4251	NC_009073	ACATC	2	10	188114	188123	40 %	20 %	0 %	40 %	126458817
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4254	NC_009073	GTA	2	6	188169	188174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458817
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4292	NC_009073	ATA	2	6	189849	189854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4293	NC_009073	CCA	2	6	189865	189870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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