MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 46818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009073	CAC	2	6	132906	132911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458762
3002	NC_009073	CGC	2	6	132993	132998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458762
3003	NC_009073	GCC	2	6	133010	133015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458762
3004	NC_009073	GCC	2	6	133035	133040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458762
3005	NC_009073	GTA	2	6	133041	133046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458762
3006	NC_009073	CGG	2	6	133059	133064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458762
3007	NC_009073	GCC	2	6	133099	133104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458762
3008	NC_009073	CGC	2	6	133110	133115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458762
3009	NC_009073	ACG	2	6	133120	133125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458762
3010	NC_009073	CAA	2	6	133151	133156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458762
3011	NC_009073	CGC	2	6	133203	133208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458762
3012	NC_009073	CGT	2	6	133229	133234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458762
3013	NC_009073	CGA	2	6	133235	133240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458762
3014	NC_009073	CAC	2	6	133257	133262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458762
3015	NC_009073	CGCCT	2	10	133277	133286	0 %	20 %	20 %	60 %	126458762
3016	NC_009073	GCC	2	6	133368	133373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458763
3017	NC_009073	ACGG	2	8	133454	133461	25 %	0 %	50 %	25 %	126458763
3018	NC_009073	GAG	2	6	133529	133534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458763
3019	NC_009073	CTC	2	6	133553	133558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458763
3020	NC_009073	CCT	2	6	133562	133567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458763
3021	NC_009073	CCA	3	9	133657	133665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458763
3022	NC_009073	CCG	2	6	133720	133725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458763
3023	NC_009073	CGC	2	6	133792	133797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458763
3024	NC_009073	C	6	6	133797	133802	0 %	0 %	0 %	100 %	126458763
3025	NC_009073	CCT	2	6	133835	133840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458763
3026	NC_009073	TCG	2	6	133902	133907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458763
3027	NC_009073	CTC	3	9	133913	133921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458763
3028	NC_009073	CAC	2	6	133985	133990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458763
3029	NC_009073	TCCA	2	8	134003	134010	25 %	25 %	0 %	50 %	126458763
3030	NC_009073	CAAG	2	8	134015	134022	50 %	0 %	25 %	25 %	126458763
3031	NC_009073	CAG	2	6	134035	134040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458763
3032	NC_009073	TA	3	6	134062	134067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009073	TTG	2	6	134168	134173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458764
3034	NC_009073	GGC	2	6	134185	134190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458764
3035	NC_009073	AGG	3	9	134229	134237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458764
3036	NC_009073	CATA	2	8	134304	134311	50 %	25 %	0 %	25 %	126458764
3037	NC_009073	C	6	6	134348	134353	0 %	0 %	0 %	100 %	126458764
3038	NC_009073	GAC	2	6	134474	134479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458764
3039	NC_009073	CGC	2	6	134557	134562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458764
3040	NC_009073	AG	3	6	134579	134584	50 %	0 %	50 %	0 %	126458764
3041	NC_009073	GCC	2	6	134621	134626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458764
3042	NC_009073	CAT	2	6	134632	134637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458764
3043	NC_009073	CAA	2	6	134659	134664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458764
3044	NC_009073	GCG	2	6	134669	134674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458764
3045	NC_009073	GCG	2	6	134737	134742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458764
3046	NC_009073	ACT	2	6	134775	134780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458764
3047	NC_009073	CTC	2	6	134846	134851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458764
3048	NC_009073	AG	3	6	134885	134890	50 %	0 %	50 %	0 %	126458764
3049	NC_009073	GGT	2	6	134964	134969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458764
3050	NC_009073	ACG	2	6	135009	135014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458764
3051	NC_009073	TAC	2	6	135017	135022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458764
3052	NC_009073	GT	3	6	135023	135028	0 %	50 %	50 %	0 %	126458764
3053	NC_009073	GTG	2	6	135044	135049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458764
3054	NC_009073	CAGA	2	8	135080	135087	50 %	0 %	25 %	25 %	126458764
3055	NC_009073	CGA	2	6	135124	135129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458764
3056	NC_009073	CGC	2	6	135135	135140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458764
3057	NC_009073	AAG	2	6	135266	135271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458764
3058	NC_009073	TAC	2	6	135309	135314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458764
3059	NC_009073	CCA	2	6	135321	135326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458764
3060	NC_009073	ACT	2	6	135349	135354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458764
3061	NC_009073	AGA	2	6	135379	135384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458764
3062	NC_009073	TGG	2	6	135395	135400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458764
3063	NC_009073	CAA	2	6	135424	135429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458764
3064	NC_009073	GCC	2	6	135519	135524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458764
3065	NC_009073	CCTC	2	8	135532	135539	0 %	25 %	0 %	75 %	126458764
3066	NC_009073	GGA	2	6	135746	135751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458765
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3068	NC_009073	GAC	2	6	135765	135770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458765
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3070	NC_009073	CGG	2	6	135841	135846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458765
3071	NC_009073	GGC	2	6	135863	135868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458765
3072	NC_009073	GAC	2	6	135879	135884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458765
3073	NC_009073	GGC	2	6	135912	135917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458765
3074	NC_009073	GGC	2	6	135963	135968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458765
3075	NC_009073	TCCCC	2	10	135971	135980	0 %	20 %	0 %	80 %	126458765
3076	NC_009073	GAG	2	6	135998	136003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458765
3077	NC_009073	CCTCG	2	10	136004	136013	0 %	20 %	20 %	60 %	126458765
3078	NC_009073	CCA	2	6	136024	136029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458765
3079	NC_009073	CAC	2	6	136059	136064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458765
3080	NC_009073	CGC	2	6	136106	136111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458765
3081	NC_009073	CATAGA	2	12	136171	136182	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126458766
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3083	NC_009073	GAG	2	6	136213	136218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458766
3084	NC_009073	G	6	6	136218	136223	0 %	0 %	100 %	0 %	126458766
3085	NC_009073	G	6	6	136364	136369	0 %	0 %	100 %	0 %	126458766
3086	NC_009073	GCG	2	6	136383	136388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458766
3087	NC_009073	GA	3	6	136393	136398	50 %	0 %	50 %	0 %	126458766
3088	NC_009073	GTG	2	6	136442	136447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458766
3089	NC_009073	GCC	2	6	136506	136511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458766
3090	NC_009073	CCTC	2	8	136518	136525	0 %	25 %	0 %	75 %	126458766
3091	NC_009073	GGTGT	2	10	136538	136547	0 %	40 %	60 %	0 %	126458766
3092	NC_009073	TGG	2	6	136629	136634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458766
3093	NC_009073	GTGGAG	2	12	136643	136654	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126458766
3094	NC_009073	CGGGG	2	10	136660	136669	0 %	0 %	80 %	20 %	126458766
3095	NC_009073	CTA	2	6	136720	136725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458766
3096	NC_009073	ACT	2	6	136850	136855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458767
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3098	NC_009073	T	6	6	136879	136884	0 %	100 %	0 %	0 %	126458767
3099	NC_009073	CCT	2	6	136947	136952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458767
3100	NC_009073	GAT	2	6	136984	136989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458767
3101	NC_009073	CT	3	6	136992	136997	0 %	50 %	0 %	50 %	126458767
3102	NC_009073	CTC	2	6	137005	137010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458767
3103	NC_009073	GGC	2	6	137041	137046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458767
3104	NC_009073	GTC	2	6	137269	137274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458767
3105	NC_009073	CTC	2	6	137284	137289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458767
3106	NC_009073	TGT	2	6	137301	137306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458767
3107	NC_009073	CGT	2	6	137313	137318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458767
3108	NC_009073	CTT	2	6	137359	137364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458767
3109	NC_009073	CT	3	6	137371	137376	0 %	50 %	0 %	50 %	126458767
3110	NC_009073	ATG	3	9	137387	137395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458767
3111	NC_009073	GCC	2	6	137420	137425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458767
3112	NC_009073	TCC	2	6	137447	137452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458767
3113	NC_009073	GCG	2	6	137469	137474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458767
3114	NC_009073	CT	3	6	137485	137490	0 %	50 %	0 %	50 %	126458767
3115	NC_009073	TCTT	2	8	137520	137527	0 %	75 %	0 %	25 %	126458767
3116	NC_009073	TGG	2	6	137558	137563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458767
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3118	NC_009073	GT	3	6	137582	137587	0 %	50 %	50 %	0 %	126458767
3119	NC_009073	ATC	2	6	137588	137593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458767
3120	NC_009073	CT	4	8	137608	137615	0 %	50 %	0 %	50 %	126458767
3121	NC_009073	TCG	2	6	137642	137647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458767
3122	NC_009073	CCA	2	6	137658	137663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458767
3123	NC_009073	TCGCCT	2	12	137721	137732	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126458767
3124	NC_009073	CTC	2	6	137776	137781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458767
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3141	NC_009073	TCC	2	6	138520	138525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458768
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3209	NC_009073	CTCC	2	8	141695	141702	0 %	25 %	0 %	75 %	126458773
3210	NC_009073	CTC	2	6	141705	141710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458773
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3232	NC_009073	CCG	2	6	142568	142573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458775
3233	NC_009073	TCC	2	6	142602	142607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458775
3234	NC_009073	TC	3	6	142612	142617	0 %	50 %	0 %	50 %	126458775
3235	NC_009073	CGG	2	6	142633	142638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458775
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3237	NC_009073	GTC	2	6	142717	142722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458775
3238	NC_009073	GGA	2	6	142770	142775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458775
3239	NC_009073	CTCC	2	8	142828	142835	0 %	25 %	0 %	75 %	126458775
3240	NC_009073	GCC	2	6	142868	142873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458775
3241	NC_009073	CTC	2	6	142891	142896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458775
3242	NC_009073	AG	3	6	142922	142927	50 %	0 %	50 %	0 %	126458775
3243	NC_009073	G	6	6	142950	142955	0 %	0 %	100 %	0 %	126458775
3244	NC_009073	CCCCG	2	10	142993	143002	0 %	0 %	20 %	80 %	126458775
3245	NC_009073	GCCT	2	8	143015	143022	0 %	25 %	25 %	50 %	126458775
3246	NC_009073	GGTA	2	8	143064	143071	25 %	25 %	50 %	0 %	126458775
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3361	NC_009073	CTC	2	6	147261	147266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3363	NC_009073	CTCG	2	8	147363	147370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3367	NC_009073	CG	3	6	147540	147545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3368	NC_009073	GGT	2	6	147564	147569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3371	NC_009073	ACG	2	6	147689	147694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458779
3372	NC_009073	GGC	2	6	147814	147819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458779
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3374	NC_009073	GTA	2	6	147862	147867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458779
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3431	NC_009073	TA	4	8	150714	150721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_009073	AAG	2	6	150809	150814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458781
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3440	NC_009073	CT	3	6	151192	151197	0 %	50 %	0 %	50 %	126458781
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3488	NC_009073	GCCC	2	8	153295	153302	0 %	0 %	25 %	75 %	126458785
3489	NC_009073	CCT	2	6	153315	153320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458785
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3491	NC_009073	TC	3	6	153404	153409	0 %	50 %	0 %	50 %	126458785
3492	NC_009073	TCC	2	6	153431	153436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458785
3493	NC_009073	GTC	2	6	153502	153507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458785
3494	NC_009073	CCG	2	6	153551	153556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458785
3495	NC_009073	CCTC	2	8	153586	153593	0 %	25 %	0 %	75 %	126458785
3496	NC_009073	CCG	2	6	153602	153607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458785
3497	NC_009073	GCC	2	6	153629	153634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458785
3498	NC_009073	CCA	2	6	153645	153650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458785
3499	NC_009073	C	6	6	153654	153659	0 %	0 %	0 %	100 %	126458785
3500	NC_009073	GTA	2	6	153757	153762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458785

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