MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 46818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009073	CCG	2	6	22998	23003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458658
502	NC_009073	TAT	2	6	23024	23029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126458658
503	NC_009073	GGCT	2	8	23033	23040	0 %	25 %	50 %	25 %	126458658
504	NC_009073	TATCC	2	10	23072	23081	20 %	40 %	0 %	40 %	126458658
505	NC_009073	TTC	2	6	23153	23158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458658
506	NC_009073	CCTC	2	8	23256	23263	0 %	25 %	0 %	75 %	126458658
507	NC_009073	CAT	2	6	23264	23269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458658
508	NC_009073	CGG	2	6	23393	23398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458658
509	NC_009073	CGT	2	6	23404	23409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458658
510	NC_009073	TGT	2	6	23521	23526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458658
511	NC_009073	CGT	2	6	23581	23586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458658
512	NC_009073	CCT	2	6	23623	23628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458658
513	NC_009073	TG	3	6	23645	23650	0 %	50 %	50 %	0 %	126458658
514	NC_009073	AT	3	6	23651	23656	50 %	50 %	0 %	0 %	126458658
515	NC_009073	C	6	6	23694	23699	0 %	0 %	0 %	100 %	126458658
516	NC_009073	ACA	2	6	23797	23802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458658
517	NC_009073	GCGT	2	8	23832	23839	0 %	25 %	50 %	25 %	126458658
518	NC_009073	ACG	2	6	23844	23849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458658
519	NC_009073	CCG	2	6	23988	23993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458658
520	NC_009073	TC	3	6	24056	24061	0 %	50 %	0 %	50 %	126458658
521	NC_009073	CTCC	2	8	24068	24075	0 %	25 %	0 %	75 %	126458658
522	NC_009073	CGC	2	6	24139	24144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458658
523	NC_009073	CGC	2	6	24154	24159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458658
524	NC_009073	GCC	2	6	24204	24209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458658
525	NC_009073	C	6	6	24223	24228	0 %	0 %	0 %	100 %	126458658
526	NC_009073	GA	3	6	24240	24245	50 %	0 %	50 %	0 %	126458658
527	NC_009073	ACC	2	6	24276	24281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458658
528	NC_009073	CAGG	2	8	24331	24338	25 %	0 %	50 %	25 %	126458658
529	NC_009073	TCG	2	6	24348	24353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458658
530	NC_009073	ACC	2	6	24363	24368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458658
531	NC_009073	GA	3	6	24486	24491	50 %	0 %	50 %	0 %	126458658
532	NC_009073	CCG	2	6	24568	24573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_009073	AC	3	6	24585	24590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_009073	CCT	2	6	24647	24652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_009073	AG	3	6	24726	24731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009073	ACG	2	6	24741	24746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_009073	ACCT	2	8	24769	24776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_009073	CGA	2	6	24791	24796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_009073	CGG	2	6	24819	24824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458659
540	NC_009073	CT	3	6	24887	24892	0 %	50 %	0 %	50 %	126458659
541	NC_009073	CCT	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458659
542	NC_009073	CCT	2	6	24973	24978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458659
543	NC_009073	CCTC	2	8	24985	24992	0 %	25 %	0 %	75 %	126458659
544	NC_009073	TTC	2	6	25056	25061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458659
545	NC_009073	ATG	2	6	25095	25100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458659
546	NC_009073	GTC	2	6	25148	25153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458659
547	NC_009073	CGC	2	6	25172	25177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458659
548	NC_009073	CT	3	6	25202	25207	0 %	50 %	0 %	50 %	126458659
549	NC_009073	TCC	2	6	25278	25283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458659
550	NC_009073	GAG	2	6	25292	25297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458659
551	NC_009073	ACA	2	6	25375	25380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458659
552	NC_009073	TCT	2	6	25420	25425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458659
553	NC_009073	C	6	6	25426	25431	0 %	0 %	0 %	100 %	126458659
554	NC_009073	TCTCGT	2	12	25507	25518	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126458659
555	NC_009073	GCC	2	6	25541	25546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458659
556	NC_009073	CAC	2	6	25589	25594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458659
557	NC_009073	CCA	2	6	25640	25645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458659
558	NC_009073	CAGGCT	2	12	25702	25713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126458659
559	NC_009073	CTC	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458659
560	NC_009073	AG	3	6	25754	25759	50 %	0 %	50 %	0 %	126458659
561	NC_009073	GTC	2	6	25862	25867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458659
562	NC_009073	GTAGGC	2	12	25889	25900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126458659
563	NC_009073	GAA	2	6	25931	25936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458659
564	NC_009073	CCTC	2	8	25960	25967	0 %	25 %	0 %	75 %	126458659
565	NC_009073	CTC	2	6	25994	25999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458659
566	NC_009073	GAT	2	6	26012	26017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458659
567	NC_009073	AGA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458659
568	NC_009073	ACGTGG	2	12	26124	26135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126458659
569	NC_009073	CTC	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458659
570	NC_009073	TAA	2	6	26251	26256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009073	A	6	6	26255	26260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009073	GA	3	6	26276	26281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009073	CGG	2	6	26306	26311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009073	TCCCT	2	10	26313	26322	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
575	NC_009073	GTA	2	6	26353	26358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009073	GCC	2	6	26381	26386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_009073	CCT	2	6	26412	26417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458660
578	NC_009073	AGG	2	6	26419	26424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
579	NC_009073	CT	3	6	26502	26507	0 %	50 %	0 %	50 %	126458660
580	NC_009073	CAA	2	6	26528	26533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458660
581	NC_009073	GCC	2	6	26542	26547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458660
582	NC_009073	TCC	2	6	26590	26595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458660
583	NC_009073	CT	3	6	26624	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	126458660
584	NC_009073	GAG	2	6	26631	26636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
585	NC_009073	GTA	2	6	26643	26648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458660
586	NC_009073	G	6	6	26661	26666	0 %	0 %	100 %	0 %	126458660
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591	NC_009073	C	6	6	26835	26840	0 %	0 %	0 %	100 %	126458660
592	NC_009073	GAG	2	6	26841	26846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
593	NC_009073	GAG	2	6	26856	26861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
594	NC_009073	GGAG	2	8	26891	26898	25 %	0 %	75 %	0 %	126458660
595	NC_009073	CG	3	6	26986	26991	0 %	0 %	50 %	50 %	126458660
596	NC_009073	CAC	2	6	27036	27041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458660
597	NC_009073	AG	3	6	27051	27056	50 %	0 %	50 %	0 %	126458660
598	NC_009073	CGGC	2	8	27095	27102	0 %	0 %	50 %	50 %	126458660
599	NC_009073	CAC	2	6	27114	27119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458660
600	NC_009073	GAG	2	6	27147	27152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
601	NC_009073	GAC	2	6	27189	27194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458660
602	NC_009073	TGT	2	6	27195	27200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458660
603	NC_009073	GAG	2	6	27388	27393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
604	NC_009073	TGGGC	2	10	27410	27419	0 %	20 %	60 %	20 %	126458660
605	NC_009073	CCA	2	6	27422	27427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458660
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609	NC_009073	ACG	2	6	27544	27549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458660
610	NC_009073	C	6	6	27601	27606	0 %	0 %	0 %	100 %	126458660
611	NC_009073	AGG	2	6	27683	27688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
612	NC_009073	GCC	2	6	27785	27790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458660
613	NC_009073	AC	3	6	27834	27839	50 %	0 %	0 %	50 %	126458660
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615	NC_009073	GAG	2	6	27897	27902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458660
616	NC_009073	CCG	3	9	27932	27940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458660
617	NC_009073	C	6	6	28003	28008	0 %	0 %	0 %	100 %	126458660
618	NC_009073	GC	3	6	28028	28033	0 %	0 %	50 %	50 %	126458660
619	NC_009073	CGG	3	9	28044	28052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458660
620	NC_009073	AGGAG	2	10	28053	28062	40 %	0 %	60 %	0 %	126458660
621	NC_009073	CCA	2	6	28085	28090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458660
622	NC_009073	CGC	2	6	28103	28108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458660
623	NC_009073	CAC	3	9	28140	28148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458660
624	NC_009073	CT	3	6	28202	28207	0 %	50 %	0 %	50 %	126458660
625	NC_009073	TC	3	6	28209	28214	0 %	50 %	0 %	50 %	126458660
626	NC_009073	CGC	2	6	28247	28252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458660
627	NC_009073	CGC	2	6	28262	28267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458660
628	NC_009073	TCCA	2	8	28275	28282	25 %	25 %	0 %	50 %	126458660
629	NC_009073	GGC	2	6	28287	28292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458660
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631	NC_009073	CAA	2	6	28319	28324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458660
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876	NC_009073	GTT	2	6	40608	40613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458664
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880	NC_009073	GAA	2	6	40815	40820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458664
881	NC_009073	TCC	2	6	40898	40903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458664
882	NC_009073	GAGGGC	2	12	40917	40928	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126458664
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