MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 46818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009073	CGC	3	9	263051	263059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458894
6002	NC_009073	GCT	2	6	263080	263085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458894
6003	NC_009073	TAT	2	6	263091	263096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126458894
6004	NC_009073	CGC	2	6	263102	263107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458894
6005	NC_009073	TAT	2	6	263148	263153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126458894
6006	NC_009073	TTC	2	6	263154	263159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458894
6007	NC_009073	TCC	2	6	263179	263184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458894
6008	NC_009073	CCAGC	2	10	263219	263228	20 %	0 %	20 %	60 %	126458894
6009	NC_009073	CGG	2	6	263259	263264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458894
6010	NC_009073	CTC	2	6	263319	263324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458894
6011	NC_009073	CGC	2	6	263423	263428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458894
6012	NC_009073	ACCTCG	2	12	263449	263460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126458894
6013	NC_009073	C	6	6	263496	263501	0 %	0 %	0 %	100 %	126458894
6014	NC_009073	CG	3	6	263516	263521	0 %	0 %	50 %	50 %	126458894
6015	NC_009073	AGA	2	6	263522	263527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458894
6016	NC_009073	GGAGAT	2	12	263556	263567	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126458894
6017	NC_009073	CGC	2	6	263576	263581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458894
6018	NC_009073	ACGT	2	8	263587	263594	25 %	25 %	25 %	25 %	126458894
6019	NC_009073	GAA	2	6	263604	263609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126458894
6020	NC_009073	ACC	2	6	263636	263641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458894
6021	NC_009073	GTC	2	6	263661	263666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458894
6022	NC_009073	GCC	2	6	263697	263702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458894
6023	NC_009073	CCT	2	6	263753	263758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458894
6024	NC_009073	GGA	2	6	263792	263797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458894
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6026	NC_009073	CCG	2	6	263960	263965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_009073	GCC	2	6	263969	263974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_009073	C	6	6	263979	263984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6029	NC_009073	CTC	2	6	264033	264038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_009073	AC	3	6	264061	264066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_009073	CCG	2	6	264112	264117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_009073	CTG	2	6	264137	264142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_009073	GC	3	6	264143	264148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_009073	AAT	2	6	264179	264184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_009073	GGC	2	6	264244	264249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_009073	GT	3	6	264269	264274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009073	CGT	2	6	264316	264321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_009073	CTA	2	6	264322	264327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_009073	GA	4	8	264380	264387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_009073	CAT	2	6	264407	264412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_009073	GAT	2	6	264447	264452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_009073	CCTG	2	8	264473	264480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_009073	CCCTC	2	10	264497	264506	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6044	NC_009073	CTC	2	6	264656	264661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_009073	GC	3	6	264688	264693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_009073	CTA	2	6	264706	264711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_009073	CG	3	6	264726	264731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_009073	GAA	2	6	264775	264780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_009073	TGTA	2	8	264814	264821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_009073	A	6	6	264874	264879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009073	CGA	2	6	265005	265010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_009073	T	6	6	265011	265016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_009073	GA	4	8	265038	265045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009073	TCT	2	6	265073	265078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_009073	CT	3	6	265217	265222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_009073	CT	4	8	265394	265401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_009073	AGG	2	6	265429	265434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458895
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6059	NC_009073	CT	3	6	265492	265497	0 %	50 %	0 %	50 %	126458895
6060	NC_009073	GTA	2	6	265535	265540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458895
6061	NC_009073	GC	3	6	265543	265548	0 %	0 %	50 %	50 %	126458895
6062	NC_009073	G	6	6	265618	265623	0 %	0 %	100 %	0 %	126458895
6063	NC_009073	AGT	2	6	265636	265641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458895
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6070	NC_009073	CGA	2	6	265795	265800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458895
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6074	NC_009073	GTA	2	6	265838	265843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458895
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6091	NC_009073	GCC	3	9	266421	266429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458895
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6110	NC_009073	TAGG	2	8	267007	267014	25 %	25 %	50 %	0 %	126458896
6111	NC_009073	CT	3	6	267019	267024	0 %	50 %	0 %	50 %	126458896
6112	NC_009073	GTA	2	6	267052	267057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458896
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6114	NC_009073	GGC	2	6	267151	267156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458896
6115	NC_009073	GGA	2	6	267193	267198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458896
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6370	NC_009073	TACA	2	8	277991	277998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6498	NC_009073	AG	3	6	282725	282730	50 %	0 %	50 %	0 %	126458911
6499	NC_009073	ACG	2	6	282755	282760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458911
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