MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 46818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009073	TAC	2	6	221478	221483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458844
5002	NC_009073	GCCC	2	8	221491	221498	0 %	0 %	25 %	75 %	126458844
5003	NC_009073	G	6	6	221515	221520	0 %	0 %	100 %	0 %	126458844
5004	NC_009073	AGG	2	6	221584	221589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458844
5005	NC_009073	TCCT	2	8	221695	221702	0 %	50 %	0 %	50 %	126458845
5006	NC_009073	CGG	2	6	221721	221726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458845
5007	NC_009073	TAC	2	6	221812	221817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458845
5008	NC_009073	GGC	2	6	221979	221984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458845
5009	NC_009073	CTGG	2	8	222003	222010	0 %	25 %	50 %	25 %	126458845
5010	NC_009073	CCG	2	6	222014	222019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458845
5011	NC_009073	CCG	2	6	222089	222094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458845
5012	NC_009073	CTA	2	6	222117	222122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458845
5013	NC_009073	CCTA	2	8	222146	222153	25 %	25 %	0 %	50 %	126458845
5014	NC_009073	GTG	2	6	222160	222165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458845
5015	NC_009073	GCC	2	6	222196	222201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458845
5016	NC_009073	ACT	2	6	222215	222220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458845
5017	NC_009073	ACA	2	6	222309	222314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458845
5018	NC_009073	GTA	2	6	222315	222320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458845
5019	NC_009073	CCT	2	6	222332	222337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_009073	CGC	2	6	222340	222345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_009073	CGA	2	6	222407	222412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_009073	CGG	2	6	222426	222431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458846
5023	NC_009073	CGC	2	6	222434	222439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458846
5024	NC_009073	CAA	2	6	222449	222454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458846
5025	NC_009073	GTA	2	6	222474	222479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458846
5026	NC_009073	GGA	2	6	222560	222565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458846
5027	NC_009073	TC	3	6	222566	222571	0 %	50 %	0 %	50 %	126458846
5028	NC_009073	CCA	2	6	222587	222592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458846
5029	NC_009073	CTC	2	6	222603	222608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458846
5030	NC_009073	CA	3	6	222682	222687	50 %	0 %	0 %	50 %	126458846
5031	NC_009073	GA	3	6	222748	222753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_009073	AG	3	6	222785	222790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009073	GGAG	2	8	222824	222831	25 %	0 %	75 %	0 %	126458847
5034	NC_009073	GGT	2	6	222855	222860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458847
5035	NC_009073	G	6	6	222895	222900	0 %	0 %	100 %	0 %	126458847
5036	NC_009073	GCC	2	6	222933	222938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458847
5037	NC_009073	GGC	2	6	222955	222960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5038	NC_009073	GAG	2	6	222961	222966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458847
5039	NC_009073	GGC	2	6	223017	223022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5040	NC_009073	GTG	2	6	223036	223041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458847
5041	NC_009073	GGA	2	6	223062	223067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458847
5042	NC_009073	GGC	2	6	223081	223086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5043	NC_009073	GGC	2	6	223131	223136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5044	NC_009073	CCT	2	6	223148	223153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458847
5045	NC_009073	TGT	2	6	223155	223160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458847
5046	NC_009073	GAG	2	6	223179	223184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458847
5047	NC_009073	C	6	6	223211	223216	0 %	0 %	0 %	100 %	126458847
5048	NC_009073	CT	3	6	223219	223224	0 %	50 %	0 %	50 %	126458847
5049	NC_009073	CAGA	2	8	223244	223251	50 %	0 %	25 %	25 %	126458847
5050	NC_009073	TC	3	6	223278	223283	0 %	50 %	0 %	50 %	126458847
5051	NC_009073	GCG	2	6	223295	223300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5052	NC_009073	GGC	2	6	223326	223331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5053	NC_009073	ACG	2	6	223400	223405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458847
5054	NC_009073	GA	3	6	223429	223434	50 %	0 %	50 %	0 %	126458847
5055	NC_009073	GGC	2	6	223438	223443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5056	NC_009073	GGC	2	6	223446	223451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5057	NC_009073	AGG	2	6	223466	223471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458847
5058	NC_009073	A	6	6	223594	223599	100 %	0 %	0 %	0 %	126458847
5059	NC_009073	GCG	2	6	223631	223636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5060	NC_009073	TCT	2	6	223637	223642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458847
5061	NC_009073	GCG	2	6	223704	223709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5062	NC_009073	GTG	2	6	223735	223740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458847
5063	NC_009073	GCG	2	6	223813	223818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5064	NC_009073	GCCC	2	8	223824	223831	0 %	0 %	25 %	75 %	126458847
5065	NC_009073	CTT	2	6	223908	223913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458847
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5068	NC_009073	CGG	2	6	224000	224005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5069	NC_009073	CTT	2	6	224022	224027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458847
5070	NC_009073	CCT	2	6	224054	224059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458847
5071	NC_009073	GCG	2	6	224144	224149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5072	NC_009073	CA	3	6	224170	224175	50 %	0 %	0 %	50 %	126458847
5073	NC_009073	GCG	2	6	224198	224203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5074	NC_009073	CGC	2	6	224238	224243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458847
5075	NC_009073	GTGGAG	2	12	224329	224340	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126458847
5076	NC_009073	GGGC	2	8	224344	224351	0 %	0 %	75 %	25 %	126458847
5077	NC_009073	TA	3	6	224388	224393	50 %	50 %	0 %	0 %	126458847
5078	NC_009073	GGC	2	6	224394	224399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458847
5079	NC_009073	GT	3	6	224400	224405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_009073	AT	3	6	224442	224447	50 %	50 %	0 %	0 %	126458848
5081	NC_009073	ACC	2	6	224469	224474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458848
5082	NC_009073	GA	3	6	224514	224519	50 %	0 %	50 %	0 %	126458848
5083	NC_009073	CT	3	6	224570	224575	0 %	50 %	0 %	50 %	126458848
5084	NC_009073	CTTCGT	2	12	224612	224623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	126458848
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5086	NC_009073	TAGTGG	2	12	224683	224694	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	126458848
5087	NC_009073	GTC	2	6	224702	224707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458848
5088	NC_009073	TGG	2	6	224785	224790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458848
5089	NC_009073	GAG	3	9	224799	224807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458848
5090	NC_009073	GCG	2	6	224882	224887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458848
5091	NC_009073	GCC	2	6	224911	224916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458848
5092	NC_009073	TAC	2	6	224925	224930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458848
5093	NC_009073	GCCG	2	8	224987	224994	0 %	0 %	50 %	50 %	126458848
5094	NC_009073	GGC	2	6	225000	225005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458848
5095	NC_009073	GGC	2	6	225078	225083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458848
5096	NC_009073	GCC	2	6	225108	225113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458848
5097	NC_009073	TGT	2	6	225212	225217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458848
5098	NC_009073	TC	3	6	225264	225269	0 %	50 %	0 %	50 %	126458848
5099	NC_009073	TCC	2	6	225331	225336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458848
5100	NC_009073	GTT	2	6	225404	225409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458848
5101	NC_009073	GTG	2	6	225456	225461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458848
5102	NC_009073	CGG	2	6	225504	225509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458848
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5105	NC_009073	TGG	2	6	225676	225681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458849
5106	NC_009073	G	6	6	225734	225739	0 %	0 %	100 %	0 %	126458849
5107	NC_009073	CGC	3	9	225740	225748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458849
5108	NC_009073	AGG	2	6	225758	225763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458849
5109	NC_009073	CGT	2	6	225764	225769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458849
5110	NC_009073	CCG	2	6	225811	225816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458849
5111	NC_009073	AGG	2	6	225828	225833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458849
5112	NC_009073	GAGG	2	8	225836	225843	25 %	0 %	75 %	0 %	126458849
5113	NC_009073	CCTC	2	8	225847	225854	0 %	25 %	0 %	75 %	126458849
5114	NC_009073	CCT	2	6	225980	225985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458849
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5118	NC_009073	GCT	2	6	226292	226297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458849
5119	NC_009073	C	6	6	226379	226384	0 %	0 %	0 %	100 %	126458849
5120	NC_009073	CTA	3	9	226419	226427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458849
5121	NC_009073	GCG	2	6	226441	226446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458849
5122	NC_009073	GTG	2	6	226464	226469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458849
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5124	NC_009073	CCT	2	6	226496	226501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458849
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5247	NC_009073	CGC	2	6	231703	231708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458857
5248	NC_009073	CAC	2	6	231739	231744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458857
5249	NC_009073	ACC	2	6	231779	231784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458857
5250	NC_009073	GTT	2	6	231796	231801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458857
5251	NC_009073	GTT	3	9	231838	231846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458857
5252	NC_009073	CTTG	2	8	231882	231889	0 %	50 %	25 %	25 %	126458857
5253	NC_009073	GCCAC	2	10	232056	232065	20 %	0 %	20 %	60 %	126458857
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5260	NC_009073	GTA	2	6	232502	232507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458858
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5275	NC_009073	CCTC	2	8	232933	232940	0 %	25 %	0 %	75 %	126458858
5276	NC_009073	CGT	2	6	232978	232983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458858
5277	NC_009073	CTT	2	6	233087	233092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458858
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5287	NC_009073	CCA	2	6	233366	233371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5288	NC_009073	TTG	2	6	233419	233424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_009073	GTA	2	6	233447	233452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458859
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5328	NC_009073	GCG	2	6	234824	234829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5329	NC_009073	G	6	6	234847	234852	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5352	NC_009073	CCTC	2	8	235948	235955	0 %	25 %	0 %	75 %	126458862
5353	NC_009073	GCC	2	6	235962	235967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458862
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5355	NC_009073	CTCCG	2	10	236042	236051	0 %	20 %	20 %	60 %	126458862
5356	NC_009073	GTA	2	6	236063	236068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458862
5357	NC_009073	CATA	2	8	236095	236102	50 %	25 %	0 %	25 %	126458862
5358	NC_009073	CT	3	6	236103	236108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5359	NC_009073	TA	3	6	236123	236128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_009073	TAC	2	6	236180	236185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458863
5361	NC_009073	G	6	6	236205	236210	0 %	0 %	100 %	0 %	126458863
5362	NC_009073	CG	3	6	236226	236231	0 %	0 %	50 %	50 %	126458863
5363	NC_009073	GT	3	6	236232	236237	0 %	50 %	50 %	0 %	126458863
5364	NC_009073	CTC	2	6	236279	236284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458863
5365	NC_009073	CAT	2	6	236287	236292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458863
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5367	NC_009073	ACG	2	6	236358	236363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458863
5368	NC_009073	TCC	2	6	236466	236471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458863
5369	NC_009073	GCG	2	6	236472	236477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458863
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