MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 46818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009073	CGG	2	6	198647	198652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458824
4502	NC_009073	G	7	7	198651	198657	0 %	0 %	100 %	0 %	126458824
4503	NC_009073	TGG	2	6	198658	198663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458824
4504	NC_009073	GGA	2	6	198686	198691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458824
4505	NC_009073	GTT	2	6	198722	198727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458824
4506	NC_009073	AGG	2	6	198732	198737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458824
4507	NC_009073	GGA	2	6	198833	198838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458824
4508	NC_009073	CGG	2	6	198863	198868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458824
4509	NC_009073	GCGCG	2	10	198931	198940	0 %	0 %	60 %	40 %	126458824
4510	NC_009073	CTC	2	6	198945	198950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458824
4511	NC_009073	GTG	2	6	198981	198986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458824
4512	NC_009073	GGC	2	6	199055	199060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458824
4513	NC_009073	GGC	2	6	199079	199084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458824
4514	NC_009073	G	6	6	199108	199113	0 %	0 %	100 %	0 %	126458824
4515	NC_009073	GGC	2	6	199218	199223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458824
4516	NC_009073	CCT	2	6	199259	199264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458824
4517	NC_009073	CTA	2	6	199277	199282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458824
4518	NC_009073	CGT	2	6	199334	199339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458824
4519	NC_009073	GA	3	6	199343	199348	50 %	0 %	50 %	0 %	126458824
4520	NC_009073	TG	3	6	199352	199357	0 %	50 %	50 %	0 %	126458824
4521	NC_009073	AG	3	6	199439	199444	50 %	0 %	50 %	0 %	126458825
4522	NC_009073	CTC	2	6	199454	199459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458825
4523	NC_009073	GGA	2	6	199525	199530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458825
4524	NC_009073	GGT	2	6	199570	199575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458825
4525	NC_009073	CCG	3	9	199704	199712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458825
4526	NC_009073	AGGG	2	8	199823	199830	25 %	0 %	75 %	0 %	126458825
4527	NC_009073	GGCC	2	8	199833	199840	0 %	0 %	50 %	50 %	126458825
4528	NC_009073	CGC	2	6	199857	199862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458825
4529	NC_009073	TCA	2	6	199887	199892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458825
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4532	NC_009073	GTG	3	9	199961	199969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458825
4533	NC_009073	CTA	2	6	200041	200046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458825
4534	NC_009073	G	6	6	200056	200061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009073	CCT	2	6	200176	200181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458826
4536	NC_009073	GAC	2	6	200198	200203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458826
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4541	NC_009073	TGG	2	6	200403	200408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458826
4542	NC_009073	GA	3	6	200438	200443	50 %	0 %	50 %	0 %	126458826
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4544	NC_009073	GGC	2	6	200461	200466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458826
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4548	NC_009073	GTG	2	6	200701	200706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458827
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4552	NC_009073	GCC	2	6	200836	200841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458827
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4554	NC_009073	GGC	2	6	200994	200999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458827
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4556	NC_009073	GAGG	2	8	201054	201061	25 %	0 %	75 %	0 %	126458827
4557	NC_009073	ACG	2	6	201095	201100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458827
4558	NC_009073	CGA	2	6	201144	201149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458827
4559	NC_009073	ACTGC	2	10	201218	201227	20 %	20 %	20 %	40 %	126458827
4560	NC_009073	CGC	2	6	201236	201241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458827
4561	NC_009073	CGAG	2	8	201368	201375	25 %	0 %	50 %	25 %	126458828
4562	NC_009073	ACG	2	6	201427	201432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458828
4563	NC_009073	ACG	2	6	201445	201450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458828
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4588	NC_009073	AGG	2	6	202795	202800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458829
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4591	NC_009073	G	6	6	202848	202853	0 %	0 %	100 %	0 %	126458829
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4594	NC_009073	CTT	2	6	202971	202976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126458829
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4600	NC_009073	GTGGG	2	10	203227	203236	0 %	20 %	80 %	0 %	126458829
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4603	NC_009073	G	6	6	203438	203443	0 %	0 %	100 %	0 %	126458829
4604	NC_009073	G	6	6	203493	203498	0 %	0 %	100 %	0 %	126458829
4605	NC_009073	TC	3	6	203508	203513	0 %	50 %	0 %	50 %	126458829
4606	NC_009073	GAG	2	6	203515	203520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458829
4607	NC_009073	ATT	2	6	203533	203538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126458829
4608	NC_009073	C	6	6	203573	203578	0 %	0 %	0 %	100 %	126458829
4609	NC_009073	GA	3	6	203661	203666	50 %	0 %	50 %	0 %	126458829
4610	NC_009073	TAC	2	6	203836	203841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458829
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4613	NC_009073	CTC	3	9	204011	204019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458830
4614	NC_009073	GTA	2	6	204023	204028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458830
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4616	NC_009073	GCCC	2	8	204131	204138	0 %	0 %	25 %	75 %	126458830
4617	NC_009073	CG	3	6	204197	204202	0 %	0 %	50 %	50 %	126458830
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4993	NC_009073	GCG	2	6	221263	221268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458844
4994	NC_009073	ACG	2	6	221283	221288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458844
4995	NC_009073	GGA	2	6	221297	221302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458844
4996	NC_009073	GCG	2	6	221307	221312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458844
4997	NC_009073	CGTGGT	2	12	221321	221332	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126458844
4998	NC_009073	AGT	2	6	221348	221353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458844
4999	NC_009073	CGC	2	6	221362	221367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458844
5000	NC_009073	CGT	2	6	221402	221407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458844

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