MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008781	TCAG	2	8	157126	157133	25 %	25 %	25 %	25 %	121603063
4002	NC_008781	CGT	2	6	157242	157247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603063
4003	NC_008781	CGCGCC	2	12	157269	157280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603063
4004	NC_008781	GGC	2	6	157290	157295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603063
4005	NC_008781	CAGAAT	2	12	157334	157345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	121603063
4006	NC_008781	TCA	2	6	157483	157488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603063
4007	NC_008781	GCC	2	6	157489	157494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603063
4008	NC_008781	TGCCAG	2	12	157527	157538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121603063
4009	NC_008781	A	6	6	157575	157580	100 %	0 %	0 %	0 %	121603063
4010	NC_008781	CCCA	2	8	157599	157606	25 %	0 %	0 %	75 %	121603063
4011	NC_008781	GGA	2	6	157692	157697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121603063
4012	NC_008781	T	6	6	157805	157810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008781	T	7	7	157843	157849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008781	AGA	2	6	157868	157873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_008781	A	6	6	157873	157878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_008781	GCC	2	6	157917	157922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_008781	GC	3	6	157938	157943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_008781	GGCA	2	8	157944	157951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_008781	CG	4	8	157965	157972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_008781	CAGCGT	2	12	157974	157985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008781	CTTCA	2	10	158061	158070	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4022	NC_008781	CAG	2	6	158102	158107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603064
4023	NC_008781	TGGA	2	8	158140	158147	25 %	25 %	50 %	0 %	121603064
4024	NC_008781	GCG	2	6	158213	158218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603064
4025	NC_008781	CGG	2	6	158253	158258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603064
4026	NC_008781	CGC	2	6	158339	158344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603064
4027	NC_008781	GTG	2	6	158371	158376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603064
4028	NC_008781	CCGC	2	8	158406	158413	0 %	0 %	25 %	75 %	121603064
4029	NC_008781	CCAT	2	8	158462	158469	25 %	25 %	0 %	50 %	121603064
4030	NC_008781	CGC	2	6	158478	158483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603064
4031	NC_008781	CAG	2	6	158544	158549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603064
4032	NC_008781	CCA	2	6	158559	158564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603064
4033	NC_008781	CGA	2	6	158640	158645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603064
4034	NC_008781	ACG	2	6	158651	158656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603064
4035	NC_008781	GCT	3	9	158661	158669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603064
4036	NC_008781	GC	3	6	158759	158764	0 %	0 %	50 %	50 %	121603064
4037	NC_008781	CGA	2	6	158862	158867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603064
4038	NC_008781	TCT	2	6	158873	158878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603064
4039	NC_008781	CG	3	6	158942	158947	0 %	0 %	50 %	50 %	121603064
4040	NC_008781	GGC	2	6	158970	158975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603064
4041	NC_008781	CTT	2	6	158976	158981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603064
4042	NC_008781	CCT	2	6	159014	159019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603064
4043	NC_008781	AAG	2	6	159058	159063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008781	ATC	2	6	159079	159084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603065
4045	NC_008781	CTG	2	6	159095	159100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603065
4046	NC_008781	ACC	2	6	159114	159119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603065
4047	NC_008781	GCCCCA	2	12	159135	159146	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	121603065
4048	NC_008781	GC	3	6	159197	159202	0 %	0 %	50 %	50 %	121603065
4049	NC_008781	GCG	2	6	159228	159233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603065
4050	NC_008781	C	6	6	159314	159319	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4051	NC_008781	CTGG	2	8	159366	159373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_008781	GCG	2	6	159388	159393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008781	AGC	2	6	159401	159406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4054	NC_008781	GCT	2	6	159478	159483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4055	NC_008781	GC	3	6	159497	159502	0 %	0 %	50 %	50 %	121603066
4056	NC_008781	GTGG	2	8	159532	159539	0 %	25 %	75 %	0 %	121603066
4057	NC_008781	GGC	2	6	159599	159604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603066
4058	NC_008781	GC	3	6	159617	159622	0 %	0 %	50 %	50 %	121603066
4059	NC_008781	TGC	2	6	159669	159674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4060	NC_008781	TGC	2	6	159696	159701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4061	NC_008781	GC	3	6	159746	159751	0 %	0 %	50 %	50 %	121603066
4062	NC_008781	CTG	2	6	159758	159763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4063	NC_008781	GCC	2	6	159793	159798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603066
4064	NC_008781	TGG	2	6	159801	159806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603066
4065	NC_008781	GCG	2	6	159825	159830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603066
4066	NC_008781	GCG	2	6	159872	159877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603066
4067	NC_008781	GGC	2	6	159917	159922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603066
4068	NC_008781	CGGCC	2	10	159952	159961	0 %	0 %	40 %	60 %	121603066
4069	NC_008781	GC	3	6	159974	159979	0 %	0 %	50 %	50 %	121603066
4070	NC_008781	CGC	2	6	159994	159999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603066
4071	NC_008781	GGT	2	6	160015	160020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603066
4072	NC_008781	GCT	2	6	160021	160026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4073	NC_008781	CGA	2	6	160054	160059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4074	NC_008781	GCC	2	6	160064	160069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603066
4075	NC_008781	GGCGCT	2	12	160132	160143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121603066
4076	NC_008781	CGC	2	6	160147	160152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603066
4077	NC_008781	GCA	2	6	160158	160163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4078	NC_008781	TCG	2	6	160235	160240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4079	NC_008781	CGC	3	9	160254	160262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603066
4080	NC_008781	GC	3	6	160274	160279	0 %	0 %	50 %	50 %	121603066
4081	NC_008781	GCC	2	6	160312	160317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603066
4082	NC_008781	GC	3	6	160326	160331	0 %	0 %	50 %	50 %	121603066
4083	NC_008781	GCA	2	6	160390	160395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4084	NC_008781	TGC	2	6	160398	160403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603066
4085	NC_008781	TTC	2	6	160411	160416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603066
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4087	NC_008781	T	6	6	160554	160559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008781	TGT	2	6	160571	160576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_008781	GCC	3	9	160673	160681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603067
4090	NC_008781	GGGCC	2	10	160682	160691	0 %	0 %	60 %	40 %	121603067
4091	NC_008781	AATG	2	8	160711	160718	50 %	25 %	25 %	0 %	121603067
4092	NC_008781	CGC	3	9	160722	160730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603067
4093	NC_008781	ACGC	2	8	160747	160754	25 %	0 %	25 %	50 %	121603067
4094	NC_008781	GCC	2	6	160756	160761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603067
4095	NC_008781	CGC	2	6	160806	160811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603067
4096	NC_008781	CGCT	2	8	160817	160824	0 %	25 %	25 %	50 %	121603067
4097	NC_008781	CGGC	2	8	160872	160879	0 %	0 %	50 %	50 %	121603067
4098	NC_008781	GCA	2	6	161013	161018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603067
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4100	NC_008781	CGG	2	6	161112	161117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603067
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4102	NC_008781	TGC	2	6	161223	161228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603067
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4104	NC_008781	GC	3	6	161293	161298	0 %	0 %	50 %	50 %	121603067
4105	NC_008781	GCG	2	6	161301	161306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603067
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4107	NC_008781	CGG	2	6	161373	161378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603067
4108	NC_008781	GCGCC	2	10	161389	161398	0 %	0 %	40 %	60 %	121603067
4109	NC_008781	TCG	2	6	161411	161416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603067
4110	NC_008781	CGC	2	6	161469	161474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603067
4111	NC_008781	CGG	2	6	161575	161580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603067
4112	NC_008781	CGG	2	6	161599	161604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603067
4113	NC_008781	GCA	3	9	161619	161627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603067
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4119	NC_008781	CCA	2	6	161796	161801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603067
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4121	NC_008781	CAGC	2	8	161832	161839	25 %	0 %	25 %	50 %	121603067
4122	NC_008781	TGCT	2	8	161882	161889	0 %	50 %	25 %	25 %	121603067
4123	NC_008781	TGC	2	6	161907	161912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603068
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4491	NC_008781	AGC	2	6	176215	176220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_008781	TTG	2	6	176239	176244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_008781	ATC	2	6	176261	176266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4494	NC_008781	ACG	2	6	176270	176275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4495	NC_008781	GTG	2	6	176341	176346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_008781	ATT	2	6	176365	176370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_008781	A	7	7	176408	176414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_008781	TG	3	6	176479	176484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_008781	AAT	2	6	176491	176496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_008781	CGC	2	6	176506	176511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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