MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008781	ACG	2	6	139255	139260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603043
3502	NC_008781	GCCA	2	8	139290	139297	25 %	0 %	25 %	50 %	121603043
3503	NC_008781	GCG	2	6	139300	139305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603043
3504	NC_008781	GCA	2	6	139313	139318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603043
3505	NC_008781	GGCC	2	8	139328	139335	0 %	0 %	50 %	50 %	121603043
3506	NC_008781	GGC	2	6	139362	139367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603043
3507	NC_008781	GCA	2	6	139375	139380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603043
3508	NC_008781	GCG	2	6	139381	139386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603043
3509	NC_008781	CAG	2	6	139394	139399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603043
3510	NC_008781	GGC	2	6	139404	139409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603043
3511	NC_008781	GGC	2	6	139416	139421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603043
3512	NC_008781	GCA	2	6	139430	139435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603043
3513	NC_008781	ACA	2	6	139468	139473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603043
3514	NC_008781	GGC	2	6	139519	139524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_008781	GCC	2	6	139530	139535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_008781	T	7	7	139536	139542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_008781	CCGG	2	8	139551	139558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_008781	CGG	2	6	139572	139577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_008781	T	6	6	139598	139603	0 %	100 %	0 %	0 %	121603044
3520	NC_008781	GCT	2	6	139606	139611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3521	NC_008781	CCA	2	6	139691	139696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603044
3522	NC_008781	CAG	2	6	139701	139706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3523	NC_008781	TTG	2	6	139734	139739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603044
3524	NC_008781	TTG	3	9	139764	139772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603044
3525	NC_008781	GTT	2	6	139781	139786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603044
3526	NC_008781	TGA	2	6	139801	139806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603044
3527	NC_008781	CCGA	2	8	139815	139822	25 %	0 %	25 %	50 %	121603044
3528	NC_008781	CGAC	2	8	139825	139832	25 %	0 %	25 %	50 %	121603044
3529	NC_008781	GTG	2	6	139878	139883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603044
3530	NC_008781	GCCA	2	8	139916	139923	25 %	0 %	25 %	50 %	121603044
3531	NC_008781	GGC	2	6	139931	139936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603044
3532	NC_008781	GC	3	6	140002	140007	0 %	0 %	50 %	50 %	121603044
3533	NC_008781	TGC	2	6	140016	140021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3534	NC_008781	AGC	2	6	140022	140027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3535	NC_008781	TGA	2	6	140119	140124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603044
3536	NC_008781	CCG	2	6	140134	140139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603044
3537	NC_008781	TTG	2	6	140145	140150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603044
3538	NC_008781	CCT	2	6	140182	140187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603044
3539	NC_008781	GAA	2	6	140189	140194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603044
3540	NC_008781	ACC	2	6	140211	140216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603044
3541	NC_008781	CAC	2	6	140225	140230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603044
3542	NC_008781	GTC	2	6	140234	140239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3543	NC_008781	GCG	2	6	140319	140324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603044
3544	NC_008781	CAG	2	6	140330	140335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3545	NC_008781	CGG	2	6	140336	140341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603044
3546	NC_008781	TGG	3	9	140371	140379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603044
3547	NC_008781	CAT	2	6	140384	140389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603044
3548	NC_008781	GTT	2	6	140390	140395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603044
3549	NC_008781	AGT	2	6	140404	140409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603044
3550	NC_008781	GCCC	2	8	140413	140420	0 %	0 %	25 %	75 %	121603044
3551	NC_008781	CGA	2	6	140422	140427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3552	NC_008781	GAT	2	6	140438	140443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603044
3553	NC_008781	CTG	2	6	140513	140518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3554	NC_008781	GCG	2	6	140553	140558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603044
3555	NC_008781	GGC	2	6	140576	140581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603044
3556	NC_008781	AGC	2	6	140592	140597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603044
3557	NC_008781	TCC	2	6	140634	140639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_008781	T	6	6	140651	140656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008781	TAC	2	6	140716	140721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_008781	GCC	2	6	140748	140753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603045
3561	NC_008781	GCG	2	6	140797	140802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603045
3562	NC_008781	TGC	2	6	140869	140874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603045
3563	NC_008781	CAG	2	6	140876	140881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603045
3564	NC_008781	GCC	2	6	140922	140927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603045
3565	NC_008781	CAT	2	6	140951	140956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603045
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3569	NC_008781	GCC	2	6	141098	141103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603045
3570	NC_008781	GCG	2	6	141109	141114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603045
3571	NC_008781	GC	3	6	141200	141205	0 %	0 %	50 %	50 %	121603045
3572	NC_008781	CCG	2	6	141277	141282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_008781	GCC	2	6	141284	141289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_008781	G	6	6	141311	141316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008781	TAT	2	6	141350	141355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121603046
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3578	NC_008781	CAG	2	6	141415	141420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
3579	NC_008781	GCG	2	6	141426	141431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603046
3580	NC_008781	GGC	2	6	141439	141444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603046
3581	NC_008781	GCG	3	9	141452	141460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603046
3582	NC_008781	GCCG	2	8	141508	141515	0 %	0 %	50 %	50 %	121603046
3583	NC_008781	CAG	2	6	141577	141582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
3584	NC_008781	GCCG	2	8	141592	141599	0 %	0 %	50 %	50 %	121603046
3585	NC_008781	GCCGG	2	10	141608	141617	0 %	0 %	60 %	40 %	121603046
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3589	NC_008781	GCA	2	6	141726	141731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
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3592	NC_008781	CGG	2	6	141780	141785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603046
3593	NC_008781	CAG	3	9	141850	141858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
3594	NC_008781	GCG	2	6	141872	141877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603046
3595	NC_008781	CAG	3	9	141892	141900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
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3599	NC_008781	CAC	2	6	141955	141960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603046
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3601	NC_008781	CAG	2	6	142018	142023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
3602	NC_008781	CAG	2	6	142075	142080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
3603	NC_008781	CAG	2	6	142093	142098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603046
3604	NC_008781	CCA	2	6	142159	142164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603046
3605	NC_008781	GC	3	6	142197	142202	0 %	0 %	50 %	50 %	121603046
3606	NC_008781	CG	3	6	142234	142239	0 %	0 %	50 %	50 %	121603046
3607	NC_008781	GCCA	2	8	142252	142259	25 %	0 %	25 %	50 %	121603046
3608	NC_008781	CCA	2	6	142367	142372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603047
3609	NC_008781	TGC	2	6	142522	142527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603047
3610	NC_008781	AGC	2	6	142528	142533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603047
3611	NC_008781	CAC	2	6	142545	142550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603047
3612	NC_008781	GCC	2	6	142557	142562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603047
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3614	NC_008781	TGA	2	6	142610	142615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603047
3615	NC_008781	CCGCAT	2	12	142683	142694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121603047
3616	NC_008781	CGG	2	6	142712	142717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603047
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3620	NC_008781	CGT	2	6	142836	142841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603047
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3622	NC_008781	GCA	2	6	142907	142912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603047
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3991	NC_008781	GC	3	6	156268	156273	0 %	0 %	50 %	50 %	121603062
3992	NC_008781	GC	3	6	156297	156302	0 %	0 %	50 %	50 %	121603062
3993	NC_008781	CGG	2	6	156431	156436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603062
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