MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008781	GCC	2	6	59397	59402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602975
1502	NC_008781	TGTCGG	2	12	59422	59433	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121602975
1503	NC_008781	CCG	2	6	59455	59460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602975
1504	NC_008781	GCC	2	6	59466	59471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602975
1505	NC_008781	GCT	2	6	59512	59517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602975
1506	NC_008781	GCG	2	6	59530	59535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602975
1507	NC_008781	CAG	2	6	59573	59578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602975
1508	NC_008781	TGG	2	6	59619	59624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602975
1509	NC_008781	GCA	2	6	59671	59676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602975
1510	NC_008781	G	8	8	59691	59698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008781	T	7	7	59722	59728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008781	GCGT	2	8	59738	59745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_008781	GCAAG	2	10	59766	59775	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1514	NC_008781	CGA	2	6	59833	59838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008781	T	6	6	59839	59844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008781	CG	3	6	59866	59871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_008781	TTTG	2	8	59888	59895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_008781	CGG	2	6	59904	59909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_008781	GCCA	2	8	60020	60027	25 %	0 %	25 %	50 %	121602976
1520	NC_008781	GCCA	2	8	60029	60036	25 %	0 %	25 %	50 %	121602976
1521	NC_008781	CTG	2	6	60091	60096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602976
1522	NC_008781	CGC	2	6	60107	60112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602976
1523	NC_008781	GGCT	2	8	60178	60185	0 %	25 %	50 %	25 %	121602976
1524	NC_008781	T	6	6	60260	60265	0 %	100 %	0 %	0 %	121602976
1525	NC_008781	GC	3	6	60305	60310	0 %	0 %	50 %	50 %	121602976
1526	NC_008781	GTC	2	6	60381	60386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602976
1527	NC_008781	CGAC	2	8	60434	60441	25 %	0 %	25 %	50 %	121602976
1528	NC_008781	GCTG	2	8	60509	60516	0 %	25 %	50 %	25 %	121602976
1529	NC_008781	GCT	2	6	60540	60545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602976
1530	NC_008781	GCT	2	6	60693	60698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602976
1531	NC_008781	GGCT	2	8	60776	60783	0 %	25 %	50 %	25 %	121602976
1532	NC_008781	GCCA	2	8	60821	60828	25 %	0 %	25 %	50 %	121602976
1533	NC_008781	GC	3	6	60871	60876	0 %	0 %	50 %	50 %	121602976
1534	NC_008781	GGCT	2	8	60877	60884	0 %	25 %	50 %	25 %	121602976
1535	NC_008781	GTC	2	6	60912	60917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602976
1536	NC_008781	GCTG	2	8	60963	60970	0 %	25 %	50 %	25 %	121602976
1537	NC_008781	A	7	7	61112	61118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008781	A	7	7	61149	61155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008781	GCT	2	6	61184	61189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1540	NC_008781	TGA	2	6	61315	61320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602977
1541	NC_008781	TTGC	2	8	61401	61408	0 %	50 %	25 %	25 %	121602977
1542	NC_008781	GCT	2	6	61409	61414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1543	NC_008781	GC	3	6	61494	61499	0 %	0 %	50 %	50 %	121602977
1544	NC_008781	GAA	2	6	61583	61588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602977
1545	NC_008781	CCA	2	6	61624	61629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602977
1546	NC_008781	TGC	2	6	61699	61704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1547	NC_008781	AGC	2	6	61728	61733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1548	NC_008781	GCA	2	6	61770	61775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1549	NC_008781	CCTG	2	8	61777	61784	0 %	25 %	25 %	50 %	121602977
1550	NC_008781	GC	3	6	61828	61833	0 %	0 %	50 %	50 %	121602977
1551	NC_008781	GGC	2	6	61898	61903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602977
1552	NC_008781	GGT	2	6	61976	61981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602977
1553	NC_008781	CGC	2	6	62032	62037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602977
1554	NC_008781	CGT	2	6	62068	62073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1555	NC_008781	GCA	2	6	62091	62096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1556	NC_008781	GGC	2	6	62108	62113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602977
1557	NC_008781	TCG	2	6	62133	62138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1558	NC_008781	G	6	6	62312	62317	0 %	0 %	100 %	0 %	121602977
1559	NC_008781	TGT	2	6	62380	62385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602977
1560	NC_008781	GCC	2	6	62411	62416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602977
1561	NC_008781	CGT	2	6	62479	62484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1562	NC_008781	TGC	2	6	62527	62532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1563	NC_008781	GTC	2	6	62564	62569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1564	NC_008781	TGC	2	6	62629	62634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1565	NC_008781	CCG	2	6	62703	62708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602977
1566	NC_008781	GAG	2	6	62711	62716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121602977
1567	NC_008781	CGG	2	6	62728	62733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602977
1568	NC_008781	GTA	2	6	62808	62813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602977
1569	NC_008781	GGC	2	6	62831	62836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602977
1570	NC_008781	CCA	2	6	62890	62895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602977
1571	NC_008781	TGG	2	6	62914	62919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602977
1572	NC_008781	GTC	2	6	62946	62951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1573	NC_008781	TGG	2	6	63007	63012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602977
1574	NC_008781	CCG	2	6	63018	63023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602977
1575	NC_008781	GCG	3	9	63036	63044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602977
1576	NC_008781	AGCC	2	8	63124	63131	25 %	0 %	25 %	50 %	121602977
1577	NC_008781	TCG	2	6	63159	63164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1578	NC_008781	TGG	2	6	63169	63174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602977
1579	NC_008781	GTT	2	6	63248	63253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602977
1580	NC_008781	GCA	2	6	63271	63276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602977
1581	NC_008781	CTTG	2	8	63283	63290	0 %	50 %	25 %	25 %	121602977
1582	NC_008781	G	6	6	63379	63384	0 %	0 %	100 %	0 %	121602977
1583	NC_008781	CCG	2	6	63411	63416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602977
1584	NC_008781	TAA	2	6	63427	63432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121602977
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1587	NC_008781	TTG	2	6	63484	63489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008781	TAA	2	6	63551	63556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_008781	A	7	7	63555	63561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008781	ATT	2	6	63578	63583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008781	TAGCG	2	10	63673	63682	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1592	NC_008781	CGC	2	6	63721	63726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602978
1593	NC_008781	GCC	3	9	63736	63744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602978
1594	NC_008781	CG	3	6	63897	63902	0 %	0 %	50 %	50 %	121602978
1595	NC_008781	GCG	2	6	63920	63925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602978
1596	NC_008781	T	6	6	63976	63981	0 %	100 %	0 %	0 %	121602978
1597	NC_008781	CG	3	6	64080	64085	0 %	0 %	50 %	50 %	121602978
1598	NC_008781	CGT	2	6	64128	64133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602978
1599	NC_008781	TCG	2	6	64235	64240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602978
1600	NC_008781	CTC	2	6	64363	64368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121602978
1601	NC_008781	GGC	2	6	64387	64392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602978
1602	NC_008781	ACC	2	6	64451	64456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602978
1603	NC_008781	GC	4	8	64483	64490	0 %	0 %	50 %	50 %	121602978
1604	NC_008781	GCC	3	9	64540	64548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602978
1605	NC_008781	CTGG	2	8	64582	64589	0 %	25 %	50 %	25 %	121602978
1606	NC_008781	GAT	2	6	64594	64599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602978
1607	NC_008781	GCC	2	6	64660	64665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602978
1608	NC_008781	CG	3	6	64680	64685	0 %	0 %	50 %	50 %	121602978
1609	NC_008781	GAC	2	6	64714	64719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602978
1610	NC_008781	GC	4	8	64763	64770	0 %	0 %	50 %	50 %	121602978
1611	NC_008781	ACGA	2	8	64780	64787	50 %	0 %	25 %	25 %	121602978
1612	NC_008781	GCG	2	6	64809	64814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602978
1613	NC_008781	GCC	2	6	64828	64833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602978
1614	NC_008781	ACT	3	9	64868	64876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602978
1615	NC_008781	CGC	2	6	65038	65043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_008781	CAG	2	6	65044	65049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008781	GCT	2	6	65070	65075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_008781	GCA	2	6	65078	65083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008781	GCCG	2	8	65253	65260	0 %	0 %	50 %	50 %	121602979
1620	NC_008781	ATCC	2	8	65293	65300	25 %	25 %	0 %	50 %	121602979
1621	NC_008781	GCT	2	6	65385	65390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602980
1622	NC_008781	TTC	2	6	65397	65402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121602980
1623	NC_008781	ACG	2	6	65438	65443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602980
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1626	NC_008781	GGC	2	6	65484	65489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602980
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1628	NC_008781	GTATGC	2	12	65559	65570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121602980
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