MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008781	GCC	3	9	652725	652733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603528
16002	NC_008781	GCCA	2	8	652878	652885	25 %	0 %	25 %	50 %	121603528
16003	NC_008781	GC	3	6	652934	652939	0 %	0 %	50 %	50 %	121603528
16004	NC_008781	CGC	2	6	652964	652969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603528
16005	NC_008781	CGA	2	6	653002	653007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603528
16006	NC_008781	GCA	2	6	653201	653206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603528
16007	NC_008781	ATTC	2	8	653339	653346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_008781	TCA	2	6	653376	653381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603529
16009	NC_008781	TCA	2	6	653389	653394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603529
16010	NC_008781	TGC	2	6	653449	653454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603529
16011	NC_008781	GCT	2	6	653464	653469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603529
16012	NC_008781	GC	3	6	653472	653477	0 %	0 %	50 %	50 %	121603529
16013	NC_008781	CGGC	3	12	653514	653525	0 %	0 %	50 %	50 %	121603529
16014	NC_008781	TCT	2	6	653586	653591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603529
16015	NC_008781	GAA	2	6	653609	653614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603529
16016	NC_008781	GCT	2	6	653653	653658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603529
16017	NC_008781	AGC	2	6	653694	653699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603529
16018	NC_008781	TGC	2	6	653706	653711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603529
16019	NC_008781	CCG	2	6	653712	653717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603529
16020	NC_008781	CAT	3	9	653752	653760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603529
16021	NC_008781	GCG	2	6	653773	653778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603529
16022	NC_008781	ACG	2	6	653829	653834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603529
16023	NC_008781	CGG	2	6	653874	653879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603529
16024	NC_008781	CG	3	6	653925	653930	0 %	0 %	50 %	50 %	121603529
16025	NC_008781	GAA	2	6	653948	653953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603529
16026	NC_008781	CAC	2	6	653995	654000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603529
16027	NC_008781	GAT	2	6	654010	654015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603529
16028	NC_008781	CAC	2	6	654055	654060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603529
16029	NC_008781	GCG	2	6	654099	654104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603529
16030	NC_008781	CTG	2	6	654257	654262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_008781	GC	3	6	654278	654283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16032	NC_008781	GTG	2	6	654298	654303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603530
16033	NC_008781	GC	3	6	654346	654351	0 %	0 %	50 %	50 %	121603530
16034	NC_008781	GCC	2	6	654403	654408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16035	NC_008781	CCT	2	6	654423	654428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603530
16036	NC_008781	GGC	2	6	654523	654528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16037	NC_008781	CGG	2	6	654600	654605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16038	NC_008781	GC	3	6	654649	654654	0 %	0 %	50 %	50 %	121603530
16039	NC_008781	CGC	2	6	654663	654668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16040	NC_008781	GTA	2	6	654721	654726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603530
16041	NC_008781	CGT	2	6	654768	654773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603530
16042	NC_008781	ATG	2	6	654872	654877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603530
16043	NC_008781	GGT	2	6	654916	654921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603530
16044	NC_008781	GCCC	2	8	654954	654961	0 %	0 %	25 %	75 %	121603530
16045	NC_008781	GCTGC	2	10	655006	655015	0 %	20 %	40 %	40 %	121603530
16046	NC_008781	GTT	2	6	655072	655077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603530
16047	NC_008781	CTT	2	6	655096	655101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603530
16048	NC_008781	CGC	2	6	655116	655121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16049	NC_008781	TGCT	2	8	655127	655134	0 %	50 %	25 %	25 %	121603530
16050	NC_008781	TGC	2	6	655142	655147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603530
16051	NC_008781	ACC	2	6	655217	655222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603530
16052	NC_008781	GCA	2	6	655233	655238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603530
16053	NC_008781	CAC	2	6	655258	655263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603530
16054	NC_008781	CGC	2	6	655282	655287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16055	NC_008781	TCG	2	6	655289	655294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603530
16056	NC_008781	AGT	2	6	655326	655331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603530
16057	NC_008781	CCAG	2	8	655359	655366	25 %	0 %	25 %	50 %	121603530
16058	NC_008781	GTC	2	6	655402	655407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603530
16059	NC_008781	GAT	2	6	655510	655515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603530
16060	NC_008781	GC	4	8	655543	655550	0 %	0 %	50 %	50 %	121603530
16061	NC_008781	GCC	2	6	655561	655566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16062	NC_008781	GCC	3	9	655570	655578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16063	NC_008781	TCC	2	6	655622	655627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603530
16064	NC_008781	GGC	2	6	655632	655637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16065	NC_008781	GCC	2	6	655653	655658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603530
16066	NC_008781	CTT	2	6	655702	655707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603530
16067	NC_008781	TTC	2	6	655708	655713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603530
16068	NC_008781	CAG	2	6	655741	655746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603530
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16070	NC_008781	CGG	2	6	655797	655802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16071	NC_008781	CCTCGC	2	12	655848	655859	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	121603530
16072	NC_008781	GTG	2	6	655880	655885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603530
16073	NC_008781	GGC	2	6	655894	655899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16074	NC_008781	GGC	2	6	655978	655983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16075	NC_008781	GCG	2	6	656027	656032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603530
16076	NC_008781	TCG	2	6	656060	656065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603530
16077	NC_008781	GC	3	6	656100	656105	0 %	0 %	50 %	50 %	121603530
16078	NC_008781	TGTCT	2	10	656124	656133	0 %	60 %	20 %	20 %	121603530
16079	NC_008781	CCG	2	6	656284	656289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16080	NC_008781	CGGGC	2	10	656331	656340	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16081	NC_008781	GCCG	2	8	656376	656383	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16082	NC_008781	CGC	2	6	656384	656389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603531
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16084	NC_008781	GCG	2	6	656463	656468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603531
16085	NC_008781	CGC	2	6	656469	656474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603531
16086	NC_008781	GTGG	2	8	656490	656497	0 %	25 %	75 %	0 %	121603531
16087	NC_008781	TGC	2	6	656506	656511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603531
16088	NC_008781	GCC	2	6	656521	656526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603531
16089	NC_008781	GGCT	2	8	656553	656560	0 %	25 %	50 %	25 %	121603531
16090	NC_008781	TGCCGA	2	12	656562	656573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121603531
16091	NC_008781	GGCGC	2	10	656582	656591	0 %	0 %	60 %	40 %	121603531
16092	NC_008781	GTC	2	6	656613	656618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603531
16093	NC_008781	GC	3	6	656649	656654	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
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16095	NC_008781	GC	4	8	656716	656723	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16096	NC_008781	CG	3	6	656762	656767	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16097	NC_008781	GC	3	6	656781	656786	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16098	NC_008781	CAGC	2	8	656790	656797	25 %	0 %	25 %	50 %	121603531
16099	NC_008781	GCG	2	6	656819	656824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603531
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16101	NC_008781	GC	3	6	656837	656842	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16102	NC_008781	GGC	2	6	656913	656918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603531
16103	NC_008781	CACCGG	2	12	656934	656945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121603531
16104	NC_008781	GCA	2	6	656963	656968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603531
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16107	NC_008781	GCC	2	6	657048	657053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603531
16108	NC_008781	CCT	2	6	657059	657064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603531
16109	NC_008781	GCTC	2	8	657128	657135	0 %	25 %	25 %	50 %	121603531
16110	NC_008781	CGC	2	6	657156	657161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603531
16111	NC_008781	GGCC	2	8	657181	657188	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16112	NC_008781	CGC	2	6	657197	657202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603531
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16116	NC_008781	CG	3	6	657295	657300	0 %	0 %	50 %	50 %	121603531
16117	NC_008781	GCG	2	6	657344	657349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603531
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16483	NC_008781	GGC	2	6	672963	672968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603545
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