MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008781	CCT	2	6	631758	631763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603510
15502	NC_008781	CGG	2	6	631893	631898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603510
15503	NC_008781	TGG	2	6	631944	631949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603510
15504	NC_008781	TCGT	2	8	632006	632013	0 %	50 %	25 %	25 %	121603510
15505	NC_008781	GC	3	6	632024	632029	0 %	0 %	50 %	50 %	121603510
15506	NC_008781	GCC	2	6	632035	632040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603510
15507	NC_008781	GGAA	2	8	632069	632076	50 %	0 %	50 %	0 %	121603510
15508	NC_008781	CAG	2	6	632098	632103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15509	NC_008781	ACG	2	6	632108	632113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15510	NC_008781	GC	3	6	632118	632123	0 %	0 %	50 %	50 %	121603510
15511	NC_008781	AAC	2	6	632171	632176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603510
15512	NC_008781	GCC	2	6	632179	632184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603510
15513	NC_008781	GCA	2	6	632190	632195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15514	NC_008781	GCGCCG	2	12	632198	632209	0 %	0 %	50 %	50 %	121603510
15515	NC_008781	GAC	2	6	632210	632215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15516	NC_008781	CCA	2	6	632253	632258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603510
15517	NC_008781	ACG	2	6	632294	632299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15518	NC_008781	AGA	2	6	632409	632414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603510
15519	NC_008781	GCC	2	6	632464	632469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603510
15520	NC_008781	C	6	6	632474	632479	0 %	0 %	0 %	100 %	121603510
15521	NC_008781	TTG	2	6	632480	632485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603510
15522	NC_008781	ACG	2	6	632489	632494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15523	NC_008781	TGC	2	6	632522	632527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15524	NC_008781	CGA	2	6	632529	632534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603510
15525	NC_008781	GCC	2	6	632557	632562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603510
15526	NC_008781	ACC	2	6	632576	632581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603510
15527	NC_008781	CGG	2	6	632610	632615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603510
15528	NC_008781	GCG	3	9	632645	632653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603510
15529	NC_008781	GGGTTC	2	12	632707	632718	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121603511
15530	NC_008781	GCT	2	6	632797	632802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603511
15531	NC_008781	TTC	2	6	632804	632809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603511
15532	NC_008781	TTC	2	6	632813	632818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603511
15533	NC_008781	GTC	2	6	632841	632846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603511
15534	NC_008781	ACC	3	9	632865	632873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603511
15535	NC_008781	GAT	2	6	632894	632899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603511
15536	NC_008781	CCA	2	6	632926	632931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603511
15537	NC_008781	GAT	2	6	633017	633022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603511
15538	NC_008781	CGCA	2	8	633036	633043	25 %	0 %	25 %	50 %	121603511
15539	NC_008781	CGC	2	6	633151	633156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603511
15540	NC_008781	GGGC	2	8	633201	633208	0 %	0 %	75 %	25 %	121603511
15541	NC_008781	GGGCC	2	10	633220	633229	0 %	0 %	60 %	40 %	121603511
15542	NC_008781	GTC	2	6	633240	633245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603511
15543	NC_008781	GC	3	6	633274	633279	0 %	0 %	50 %	50 %	121603511
15544	NC_008781	TGG	2	6	633346	633351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603511
15545	NC_008781	ATG	2	6	633354	633359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603511
15546	NC_008781	GAA	2	6	633375	633380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_008781	CGG	2	6	633405	633410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603512
15548	NC_008781	GCCA	2	8	633416	633423	25 %	0 %	25 %	50 %	121603512
15549	NC_008781	GC	3	6	633477	633482	0 %	0 %	50 %	50 %	121603512
15550	NC_008781	GAC	2	6	633520	633525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603512
15551	NC_008781	GCGAG	2	10	633540	633549	20 %	0 %	60 %	20 %	121603512
15552	NC_008781	CGT	2	6	633561	633566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603512
15553	NC_008781	CGC	2	6	633581	633586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603512
15554	NC_008781	GCC	2	6	633811	633816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603512
15555	NC_008781	GC	3	6	633818	633823	0 %	0 %	50 %	50 %	121603512
15556	NC_008781	TTC	2	6	633841	633846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603512
15557	NC_008781	GCG	2	6	633870	633875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603512
15558	NC_008781	ATG	2	6	633905	633910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603512
15559	NC_008781	CGT	2	6	633930	633935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603512
15560	NC_008781	GGC	2	6	633943	633948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603512
15561	NC_008781	CACG	2	8	634063	634070	25 %	0 %	25 %	50 %	121603512
15562	NC_008781	CGC	2	6	634150	634155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603512
15563	NC_008781	GCC	2	6	634196	634201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603512
15564	NC_008781	AAATA	2	10	634292	634301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_008781	AGT	2	6	634359	634364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_008781	ATT	2	6	634367	634372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_008781	ATT	2	6	634378	634383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_008781	AC	5	10	634447	634456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15569	NC_008781	GCA	2	6	634465	634470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603513
15570	NC_008781	TGC	2	6	634707	634712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603513
15571	NC_008781	GGC	2	6	634735	634740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603513
15572	NC_008781	CG	3	6	634743	634748	0 %	0 %	50 %	50 %	121603513
15573	NC_008781	CGA	2	6	634753	634758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603513
15574	NC_008781	CGGC	2	8	634765	634772	0 %	0 %	50 %	50 %	121603513
15575	NC_008781	GAG	2	6	634787	634792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121603513
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15577	NC_008781	GCT	2	6	634870	634875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603513
15578	NC_008781	TGC	2	6	634879	634884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603513
15579	NC_008781	CGC	2	6	634890	634895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603513
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15581	NC_008781	CAT	2	6	634991	634996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603513
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15583	NC_008781	CG	3	6	635022	635027	0 %	0 %	50 %	50 %	121603513
15584	NC_008781	CG	3	6	635038	635043	0 %	0 %	50 %	50 %	121603513
15585	NC_008781	ACC	2	6	635076	635081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603513
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15588	NC_008781	GCCC	2	8	635128	635135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15589	NC_008781	CGG	2	6	635146	635151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15590	NC_008781	TCT	2	6	635168	635173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603514
15591	NC_008781	GCA	2	6	635174	635179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603514
15592	NC_008781	GCG	2	6	635218	635223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603514
15593	NC_008781	CGG	2	6	635300	635305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603514
15594	NC_008781	CGG	2	6	635308	635313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603514
15595	NC_008781	GCGG	2	8	635324	635331	0 %	0 %	75 %	25 %	121603514
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15600	NC_008781	CG	3	6	635526	635531	0 %	0 %	50 %	50 %	121603514
15601	NC_008781	CGG	2	6	635585	635590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603514
15602	NC_008781	GGC	2	6	635625	635630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_008781	GCC	2	6	635636	635641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15604	NC_008781	AGC	2	6	635659	635664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_008781	GCT	2	6	635723	635728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15608	NC_008781	TTTC	2	8	635911	635918	0 %	75 %	0 %	25 %	121603515
15609	NC_008781	GCC	2	6	635934	635939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603515
15610	NC_008781	CGC	2	6	636124	636129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603515
15611	NC_008781	GCC	2	6	636155	636160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603515
15612	NC_008781	AGC	2	6	636234	636239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603515
15613	NC_008781	GC	3	6	636238	636243	0 %	0 %	50 %	50 %	121603515
15614	NC_008781	CAG	2	6	636245	636250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603515
15615	NC_008781	TTGGCC	2	12	636300	636311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603515
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15618	NC_008781	GCCC	2	8	636532	636539	0 %	0 %	25 %	75 %	121603515
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15860	NC_008781	GCG	2	6	647213	647218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15861	NC_008781	CTTGCG	2	12	647285	647296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603524
15862	NC_008781	GCT	2	6	647325	647330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603524
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15892	NC_008781	AGAT	2	8	648560	648567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15981	NC_008781	TGC	2	6	651831	651836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603527
15982	NC_008781	CTG	2	6	651866	651871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603527
15983	NC_008781	GCC	2	6	651908	651913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603527
15984	NC_008781	CCTGC	2	10	651940	651949	0 %	20 %	20 %	60 %	121603527
15985	NC_008781	TCA	2	6	651954	651959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603527
15986	NC_008781	CGT	2	6	651961	651966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603527
15987	NC_008781	GCG	2	6	651995	652000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603527
15988	NC_008781	TGC	2	6	652029	652034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603527
15989	NC_008781	TGC	3	9	652089	652097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603527
15990	NC_008781	GCT	2	6	652165	652170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603527
15991	NC_008781	T	6	6	652215	652220	0 %	100 %	0 %	0 %	121603527
15992	NC_008781	ACG	2	6	652250	652255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603528
15993	NC_008781	AGCC	2	8	652470	652477	25 %	0 %	25 %	50 %	121603528
15994	NC_008781	CCGG	2	8	652493	652500	0 %	0 %	50 %	50 %	121603528
15995	NC_008781	GC	3	6	652535	652540	0 %	0 %	50 %	50 %	121603528
15996	NC_008781	CTG	2	6	652560	652565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603528
15997	NC_008781	GGC	2	6	652586	652591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603528
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15999	NC_008781	CTG	2	6	652626	652631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603528
16000	NC_008781	ACT	2	6	652666	652671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603528

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