MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008781	CCA	2	6	612231	612236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15002	NC_008781	ACA	2	6	612269	612274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603488
15003	NC_008781	TGC	2	6	612291	612296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15004	NC_008781	GTG	2	6	612309	612314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603488
15005	NC_008781	GCAGGC	2	12	612319	612330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121603488
15006	NC_008781	CAGC	2	8	612332	612339	25 %	0 %	25 %	50 %	121603488
15007	NC_008781	GGA	2	6	612391	612396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121603488
15008	NC_008781	CCG	2	6	612453	612458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603488
15009	NC_008781	CGG	2	6	612498	612503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603488
15010	NC_008781	CGG	2	6	612613	612618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603488
15011	NC_008781	GCC	2	6	612658	612663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603488
15012	NC_008781	CCGA	2	8	612689	612696	25 %	0 %	25 %	50 %	121603488
15013	NC_008781	CCAG	2	8	612804	612811	25 %	0 %	25 %	50 %	121603488
15014	NC_008781	CAG	2	6	612820	612825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15015	NC_008781	GGCCTG	2	12	613010	613021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121603488
15016	NC_008781	CAA	2	6	613081	613086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603488
15017	NC_008781	CG	3	6	613091	613096	0 %	0 %	50 %	50 %	121603488
15018	NC_008781	CAATGG	2	12	613126	613137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121603488
15019	NC_008781	CAA	2	6	613141	613146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603488
15020	NC_008781	ACA	3	9	613152	613160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603488
15021	NC_008781	GCC	2	6	613179	613184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603488
15022	NC_008781	CAG	2	6	613210	613215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15023	NC_008781	GGC	2	6	613238	613243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603488
15024	NC_008781	CTA	2	6	613246	613251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603488
15025	NC_008781	CAC	2	6	613282	613287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603488
15026	NC_008781	CCA	2	6	613290	613295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603488
15027	NC_008781	CCG	2	6	613296	613301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603488
15028	NC_008781	CCA	2	6	613302	613307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603488
15029	NC_008781	GCT	2	6	613399	613404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15030	NC_008781	GCA	2	6	613504	613509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15031	NC_008781	GAC	2	6	613520	613525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15032	NC_008781	GTC	2	6	613592	613597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15033	NC_008781	CAC	2	6	613615	613620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603488
15034	NC_008781	T	6	6	613637	613642	0 %	100 %	0 %	0 %	121603488
15035	NC_008781	ACC	2	6	613649	613654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603488
15036	NC_008781	CGG	2	6	613693	613698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603488
15037	NC_008781	CGG	2	6	613710	613715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603488
15038	NC_008781	CGGC	2	8	613718	613725	0 %	0 %	50 %	50 %	121603488
15039	NC_008781	CTG	2	6	613748	613753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603488
15040	NC_008781	C	7	7	613769	613775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15041	NC_008781	ATTCA	2	10	613812	613821	40 %	40 %	0 %	20 %	121603489
15042	NC_008781	GGC	2	6	613864	613869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603489
15043	NC_008781	CG	3	6	613876	613881	0 %	0 %	50 %	50 %	121603489
15044	NC_008781	CAC	2	6	613893	613898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603489
15045	NC_008781	CGG	2	6	613929	613934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603489
15046	NC_008781	GCA	2	6	614002	614007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15047	NC_008781	CCGGC	2	10	614045	614054	0 %	0 %	40 %	60 %	121603489
15048	NC_008781	CTG	2	6	614080	614085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15049	NC_008781	TCG	2	6	614120	614125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15050	NC_008781	CTG	2	6	614155	614160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15051	NC_008781	GTG	2	6	614188	614193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603489
15052	NC_008781	GTCG	2	8	614217	614224	0 %	25 %	50 %	25 %	121603489
15053	NC_008781	CAT	2	6	614334	614339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603489
15054	NC_008781	CGA	2	6	614352	614357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15055	NC_008781	CT	3	6	614367	614372	0 %	50 %	0 %	50 %	121603489
15056	NC_008781	GC	3	6	614422	614427	0 %	0 %	50 %	50 %	121603489
15057	NC_008781	CGA	2	6	614457	614462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15058	NC_008781	AGC	2	6	614510	614515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15059	NC_008781	ACA	2	6	614642	614647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603489
15060	NC_008781	GCT	2	6	614694	614699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15061	NC_008781	GAC	2	6	614701	614706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603489
15062	NC_008781	TAC	2	6	614707	614712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603489
15063	NC_008781	GGC	2	6	614715	614720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603489
15064	NC_008781	CAA	2	6	614724	614729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603489
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15066	NC_008781	CAA	2	6	614808	614813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603489
15067	NC_008781	ACT	2	6	614840	614845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603489
15068	NC_008781	CGG	2	6	614861	614866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603489
15069	NC_008781	CCG	2	6	614975	614980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603490
15070	NC_008781	GCC	2	6	615049	615054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603490
15071	NC_008781	GGCC	2	8	615057	615064	0 %	0 %	50 %	50 %	121603490
15072	NC_008781	GCT	3	9	615081	615089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603490
15073	NC_008781	TGG	2	6	615124	615129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603490
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15076	NC_008781	CG	4	8	615249	615256	0 %	0 %	50 %	50 %	121603490
15077	NC_008781	CTG	2	6	615268	615273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603490
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15079	NC_008781	TGC	2	6	615293	615298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603490
15080	NC_008781	GCT	2	6	615393	615398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603490
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15083	NC_008781	GGT	2	6	615453	615458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603490
15084	NC_008781	CGGG	2	8	615522	615529	0 %	0 %	75 %	25 %	121603490
15085	NC_008781	CCG	2	6	615558	615563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603490
15086	NC_008781	TGC	2	6	615569	615574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603490
15087	NC_008781	CCG	3	9	615575	615583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603490
15088	NC_008781	GCT	2	6	615651	615656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603490
15089	NC_008781	GGGCT	2	10	615670	615679	0 %	20 %	60 %	20 %	121603490
15090	NC_008781	CGCT	2	8	615697	615704	0 %	25 %	25 %	50 %	121603490
15091	NC_008781	CCG	2	6	615868	615873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603491
15092	NC_008781	GCC	2	6	616001	616006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603491
15093	NC_008781	GC	3	6	616108	616113	0 %	0 %	50 %	50 %	121603491
15094	NC_008781	GGCA	2	8	616115	616122	25 %	0 %	50 %	25 %	121603491
15095	NC_008781	GC	3	6	616132	616137	0 %	0 %	50 %	50 %	121603491
15096	NC_008781	CG	3	6	616190	616195	0 %	0 %	50 %	50 %	121603491
15097	NC_008781	GCT	2	6	616223	616228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603491
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15102	NC_008781	GCG	2	6	616324	616329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603491
15103	NC_008781	TTC	2	6	616386	616391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603491
15104	NC_008781	GCCG	2	8	616403	616410	0 %	0 %	50 %	50 %	121603491
15105	NC_008781	CTGG	2	8	616457	616464	0 %	25 %	50 %	25 %	121603491
15106	NC_008781	CCA	2	6	616465	616470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603491
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15113	NC_008781	GC	3	6	616653	616658	0 %	0 %	50 %	50 %	121603491
15114	NC_008781	GCC	2	6	616662	616667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15115	NC_008781	CTT	2	6	616668	616673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_008781	T	6	6	616700	616705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_008781	AAG	2	6	616708	616713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_008781	CAA	2	6	616756	616761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603492
15119	NC_008781	CCGGC	2	10	616819	616828	0 %	0 %	40 %	60 %	121603492
15120	NC_008781	TCA	2	6	616833	616838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603492
15121	NC_008781	TCG	2	6	616842	616847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603492
15122	NC_008781	GCT	2	6	616873	616878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603492
15123	NC_008781	CTG	2	6	616883	616888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603492
15124	NC_008781	CTG	2	6	616922	616927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603492
15125	NC_008781	GGC	2	6	617053	617058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603492
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15127	NC_008781	CCTACC	2	12	617118	617129	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	121603492
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15130	NC_008781	TGC	3	9	617193	617201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603492
15131	NC_008781	CGA	2	6	617203	617208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603492
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15135	NC_008781	TCG	2	6	617382	617387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603492
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15137	NC_008781	CG	3	6	617406	617411	0 %	0 %	50 %	50 %	121603492
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15141	NC_008781	CCGC	2	8	617524	617531	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15142	NC_008781	TCAACC	2	12	617548	617559	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15144	NC_008781	CTT	2	6	617594	617599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603493
15145	NC_008781	GC	3	6	617629	617634	0 %	0 %	50 %	50 %	121603493
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15167	NC_008781	T	6	6	618402	618407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15238	NC_008781	CCAGC	2	10	621392	621401	20 %	0 %	20 %	60 %	121603497
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15482	NC_008781	TCA	2	6	630834	630839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603509
15483	NC_008781	GTT	2	6	630878	630883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603509
15484	NC_008781	GAC	2	6	630978	630983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603509
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15490	NC_008781	CGT	2	6	631229	631234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603509
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15492	NC_008781	GCG	2	6	631278	631283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603509
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15494	NC_008781	ACT	2	6	631381	631386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603509
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15497	NC_008781	CGA	2	6	631463	631468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603509
15498	NC_008781	GTC	2	6	631482	631487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603509
15499	NC_008781	C	7	7	631552	631558	0 %	0 %	0 %	100 %	121603509
15500	NC_008781	TGG	2	6	631680	631685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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