MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_008781	G	6	6	535459	535464	0 %	0 %	100 %	0 %	121603418
13003	NC_008781	CGG	2	6	535507	535512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603418
13004	NC_008781	GCG	2	6	535525	535530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603418
13005	NC_008781	CAG	3	9	535559	535567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603418
13006	NC_008781	GGC	2	6	535600	535605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603418
13007	NC_008781	GGACA	2	10	535625	535634	40 %	0 %	40 %	20 %	121603418
13008	NC_008781	GGC	2	6	535838	535843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_008781	CGA	2	6	535982	535987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603419
13010	NC_008781	GTG	2	6	536106	536111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603419
13011	NC_008781	CAA	2	6	536114	536119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603419
13012	NC_008781	CGCC	2	8	536214	536221	0 %	0 %	25 %	75 %	121603419
13013	NC_008781	GCCAG	2	10	536266	536275	20 %	0 %	40 %	40 %	121603419
13014	NC_008781	ACA	2	6	536311	536316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603419
13015	NC_008781	GC	4	8	536338	536345	0 %	0 %	50 %	50 %	121603419
13016	NC_008781	GC	3	6	536379	536384	0 %	0 %	50 %	50 %	121603419
13017	NC_008781	ATG	2	6	536385	536390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603419
13018	NC_008781	GGCC	2	8	536420	536427	0 %	0 %	50 %	50 %	121603419
13019	NC_008781	CGG	2	6	536507	536512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603419
13020	NC_008781	GCA	2	6	536552	536557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603419
13021	NC_008781	GCT	2	6	536597	536602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603419
13022	NC_008781	AAC	2	6	536643	536648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603419
13023	NC_008781	GCT	2	6	536732	536737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603419
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13026	NC_008781	CG	3	6	536837	536842	0 %	0 %	50 %	50 %	121603419
13027	NC_008781	CCG	2	6	536851	536856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603419
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13030	NC_008781	TCA	2	6	536884	536889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603419
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13035	NC_008781	GC	3	6	536959	536964	0 %	0 %	50 %	50 %	121603419
13036	NC_008781	GGC	2	6	536972	536977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603419
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13043	NC_008781	TGC	2	6	537161	537166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603420
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13052	NC_008781	GCGCC	2	10	537449	537458	0 %	0 %	40 %	60 %	121603420
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13055	NC_008781	GCT	2	6	537644	537649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13079	NC_008781	AGGT	2	8	538814	538821	25 %	25 %	50 %	0 %	121603422
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13087	NC_008781	GTT	2	6	539116	539121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603422
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13091	NC_008781	GCT	2	6	539228	539233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13104	NC_008781	GGCGCT	2	12	539736	539747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121603423
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13107	NC_008781	GAA	2	6	539863	539868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603424
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13109	NC_008781	GC	3	6	539986	539991	0 %	0 %	50 %	50 %	121603424
13110	NC_008781	CAT	2	6	540102	540107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603424
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13112	NC_008781	AAG	2	6	540226	540231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603424
13113	NC_008781	AATG	2	8	540238	540245	50 %	25 %	25 %	0 %	121603424
13114	NC_008781	T	6	6	540391	540396	0 %	100 %	0 %	0 %	121603424
13115	NC_008781	TGG	2	6	540437	540442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603424
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13118	NC_008781	A	6	6	540670	540675	100 %	0 %	0 %	0 %	121603424
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13120	NC_008781	TTA	2	6	540727	540732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121603424
13121	NC_008781	CGA	2	6	540767	540772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603425
13122	NC_008781	GCC	2	6	540791	540796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603425
13123	NC_008781	GCC	2	6	540816	540821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603425
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13125	NC_008781	CGA	2	6	540875	540880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603425
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13127	NC_008781	AGC	2	6	540907	540912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603425
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13155	NC_008781	CGC	2	6	541732	541737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603425
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13158	NC_008781	A	6	6	541887	541892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13159	NC_008781	T	6	6	541946	541951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13160	NC_008781	CCTG	2	8	541971	541978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13161	NC_008781	CGCGC	2	10	542015	542024	0 %	0 %	40 %	60 %	121603426
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13170	NC_008781	TGGC	2	8	542304	542311	0 %	25 %	50 %	25 %	121603426
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13193	NC_008781	GCAC	2	8	542971	542978	25 %	0 %	25 %	50 %	121603426
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13198	NC_008781	GGTGG	2	10	543214	543223	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13199	NC_008781	GGT	2	6	543227	543232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603427
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13202	NC_008781	CGT	2	6	543268	543273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603427
13203	NC_008781	TCG	2	6	543282	543287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603427
13204	NC_008781	CTG	2	6	543329	543334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603427
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13219	NC_008781	CGG	2	6	543700	543705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603427
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13224	NC_008781	GGC	2	6	543790	543795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603427
13225	NC_008781	GGT	2	6	543851	543856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603427
13226	NC_008781	GAT	2	6	543875	543880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603427
13227	NC_008781	G	6	6	543933	543938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13228	NC_008781	CGT	2	6	544061	544066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603428
13229	NC_008781	ACC	2	6	544087	544092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603428
13230	NC_008781	GTC	2	6	544099	544104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603428
13231	NC_008781	CAG	2	6	544116	544121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603428
13232	NC_008781	CGC	2	6	544188	544193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603428
13233	NC_008781	GCC	3	9	544203	544211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603428
13234	NC_008781	CGT	2	6	544244	544249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603428
13235	NC_008781	GCGCG	2	10	544314	544323	0 %	0 %	60 %	40 %	121603428
13236	NC_008781	GC	3	6	544362	544367	0 %	0 %	50 %	50 %	121603428
13237	NC_008781	CGT	2	6	544382	544387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603428
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13239	NC_008781	CTG	2	6	544404	544409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603428
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13352	NC_008781	CCAGC	2	10	548886	548895	20 %	0 %	20 %	60 %	121603434
13353	NC_008781	GCT	2	6	548961	548966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603434
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13358	NC_008781	CGGG	2	8	549098	549105	0 %	0 %	75 %	25 %	121603434
13359	NC_008781	GCC	2	6	549130	549135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603434
13360	NC_008781	TGCG	2	8	549137	549144	0 %	25 %	50 %	25 %	121603434
13361	NC_008781	TGC	2	6	549167	549172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603434
13362	NC_008781	GCT	2	6	549240	549245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603434
13363	NC_008781	CTG	2	6	549286	549291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603434
13364	NC_008781	TGCG	2	8	549292	549299	0 %	25 %	50 %	25 %	121603434
13365	NC_008781	CGA	2	6	549309	549314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603434
13366	NC_008781	GC	3	6	549362	549367	0 %	0 %	50 %	50 %	121603434
13367	NC_008781	TGG	2	6	549419	549424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603434
13368	NC_008781	TGGCGC	2	12	549437	549448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121603434
13369	NC_008781	TGC	2	6	549449	549454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603434
13370	NC_008781	GC	3	6	549526	549531	0 %	0 %	50 %	50 %	121603434
13371	NC_008781	CCA	2	6	549536	549541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603434
13372	NC_008781	CTGC	2	8	549583	549590	0 %	25 %	25 %	50 %	121603434
13373	NC_008781	GCT	2	6	549670	549675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603435
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13376	NC_008781	CAGC	2	8	549790	549797	25 %	0 %	25 %	50 %	121603435
13377	NC_008781	AATA	2	8	549817	549824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13378	NC_008781	ATT	2	6	549890	549895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13379	NC_008781	AAT	2	6	549904	549909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13380	NC_008781	ACA	2	6	549990	549995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603436
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13384	NC_008781	TGC	2	6	550074	550079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603436
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13402	NC_008781	GCATG	2	10	551116	551125	20 %	20 %	40 %	20 %	121603436
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13407	NC_008781	GGCCG	2	10	551277	551286	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13408	NC_008781	T	7	7	551289	551295	0 %	100 %	0 %	0 %	121603437
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13414	NC_008781	CGT	2	6	551453	551458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603437
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13477	NC_008781	CG	3	6	553939	553944	0 %	0 %	50 %	50 %	121603438
13478	NC_008781	CAG	2	6	553967	553972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603438
13479	NC_008781	GCG	2	6	553981	553986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603438
13480	NC_008781	GGT	2	6	554032	554037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603438
13481	NC_008781	TGC	2	6	554038	554043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603438
13482	NC_008781	GCGCG	2	10	554105	554114	0 %	0 %	60 %	40 %	121603438
13483	NC_008781	GCG	2	6	554182	554187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603438
13484	NC_008781	GCA	2	6	554239	554244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603438
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13489	NC_008781	CG	3	6	554392	554397	0 %	0 %	50 %	50 %	121603438
13490	NC_008781	GC	3	6	554407	554412	0 %	0 %	50 %	50 %	121603438
13491	NC_008781	CAGCGA	2	12	554438	554449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603438
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