MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008781	GCG	2	6	514342	514347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12502	NC_008781	GCGCA	2	10	514350	514359	20 %	0 %	40 %	40 %	121603401
12503	NC_008781	CGA	2	6	514420	514425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12504	NC_008781	CG	3	6	514438	514443	0 %	0 %	50 %	50 %	121603401
12505	NC_008781	AGCG	2	8	514479	514486	25 %	0 %	50 %	25 %	121603401
12506	NC_008781	TGG	3	9	514498	514506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603401
12507	NC_008781	ATG	2	6	514513	514518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603401
12508	NC_008781	CGC	2	6	514530	514535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603401
12509	NC_008781	ACA	2	6	514540	514545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603401
12510	NC_008781	GCG	2	6	514576	514581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12511	NC_008781	TGG	2	6	514588	514593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603401
12512	NC_008781	CGG	2	6	514603	514608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12513	NC_008781	GC	3	6	514680	514685	0 %	0 %	50 %	50 %	121603401
12514	NC_008781	CAGG	2	8	514784	514791	25 %	0 %	50 %	25 %	121603401
12515	NC_008781	AGCCGC	2	12	514817	514828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121603401
12516	NC_008781	CGC	3	9	514859	514867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603401
12517	NC_008781	GTC	2	6	514893	514898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12518	NC_008781	GC	3	6	514998	515003	0 %	0 %	50 %	50 %	121603401
12519	NC_008781	TGC	2	6	515008	515013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12520	NC_008781	CGA	2	6	515069	515074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12521	NC_008781	CGT	2	6	515126	515131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12522	NC_008781	GC	6	12	515247	515258	0 %	0 %	50 %	50 %	121603401
12523	NC_008781	GC	4	8	515389	515396	0 %	0 %	50 %	50 %	121603401
12524	NC_008781	GCTG	2	8	515411	515418	0 %	25 %	50 %	25 %	121603401
12525	NC_008781	CGC	2	6	515486	515491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603401
12526	NC_008781	GCG	2	6	515581	515586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12527	NC_008781	GCGCA	2	10	515589	515598	20 %	0 %	40 %	40 %	121603401
12528	NC_008781	CGA	2	6	515630	515635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12529	NC_008781	CGA	2	6	515681	515686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12530	NC_008781	TGC	2	6	515734	515739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603401
12531	NC_008781	CGG	2	6	515753	515758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12532	NC_008781	CGG	2	6	515834	515839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12533	NC_008781	CGGG	2	8	515845	515852	0 %	0 %	75 %	25 %	121603401
12534	NC_008781	TGG	3	9	515854	515862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603401
12535	NC_008781	CGC	2	6	515869	515874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603401
12536	NC_008781	GTG	2	6	515883	515888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603401
12537	NC_008781	GGC	2	6	515918	515923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603401
12538	NC_008781	GC	3	6	515931	515936	0 %	0 %	50 %	50 %	121603401
12539	NC_008781	ATA	2	6	515966	515971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_008781	GCT	2	6	515972	515977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_008781	A	7	7	516015	516021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_008781	GC	3	6	516060	516065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12543	NC_008781	GGC	2	6	516165	516170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_008781	GAG	2	6	516177	516182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_008781	GTGA	2	8	516262	516269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_008781	CAT	2	6	516386	516391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603402
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12548	NC_008781	CGC	2	6	516482	516487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603402
12549	NC_008781	GC	4	8	516505	516512	0 %	0 %	50 %	50 %	121603402
12550	NC_008781	TCT	2	6	516607	516612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603402
12551	NC_008781	GCC	3	9	516627	516635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603402
12552	NC_008781	ACT	2	6	516691	516696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603402
12553	NC_008781	GAA	2	6	516747	516752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603402
12554	NC_008781	GAC	2	6	516771	516776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603402
12555	NC_008781	GGC	2	6	516777	516782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603402
12556	NC_008781	GAA	2	6	516858	516863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603402
12557	NC_008781	CCTG	2	8	516865	516872	0 %	25 %	25 %	50 %	121603402
12558	NC_008781	GCC	3	9	516919	516927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603402
12559	NC_008781	CAT	2	6	516935	516940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603402
12560	NC_008781	ACC	3	9	516957	516965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603402
12561	NC_008781	TGC	2	6	516970	516975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603402
12562	NC_008781	TCAACG	2	12	517021	517032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	121603402
12563	NC_008781	CCAAGT	2	12	517042	517053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	121603402
12564	NC_008781	GC	3	6	517100	517105	0 %	0 %	50 %	50 %	121603402
12565	NC_008781	TGA	2	6	517114	517119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603402
12566	NC_008781	GTG	2	6	517137	517142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603402
12567	NC_008781	GC	4	8	517184	517191	0 %	0 %	50 %	50 %	121603402
12568	NC_008781	CGC	2	6	517280	517285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603402
12569	NC_008781	CAA	2	6	517319	517324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603402
12570	NC_008781	TCA	2	6	517330	517335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603402
12571	NC_008781	GGC	2	6	517349	517354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603402
12572	NC_008781	CAT	2	6	517487	517492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603402
12573	NC_008781	GTC	2	6	517556	517561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603402
12574	NC_008781	TGC	2	6	517639	517644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603402
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12576	NC_008781	CGA	2	6	517715	517720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603402
12577	NC_008781	GCAG	2	8	517721	517728	25 %	0 %	50 %	25 %	121603402
12578	NC_008781	TACC	2	8	517769	517776	25 %	25 %	0 %	50 %	121603402
12579	NC_008781	T	6	6	517822	517827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_008781	AGC	2	6	517866	517871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12582	NC_008781	TTG	2	6	517946	517951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603403
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12584	NC_008781	A	6	6	518038	518043	100 %	0 %	0 %	0 %	121603403
12585	NC_008781	ACC	2	6	518098	518103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603403
12586	NC_008781	CG	3	6	518120	518125	0 %	0 %	50 %	50 %	121603403
12587	NC_008781	GC	3	6	518144	518149	0 %	0 %	50 %	50 %	121603403
12588	NC_008781	TGACG	2	10	518166	518175	20 %	20 %	40 %	20 %	121603403
12589	NC_008781	CGG	2	6	518208	518213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603403
12590	NC_008781	CTG	2	6	518227	518232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603403
12591	NC_008781	GC	3	6	518295	518300	0 %	0 %	50 %	50 %	121603403
12592	NC_008781	CGA	2	6	518301	518306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603403
12593	NC_008781	GAC	2	6	518353	518358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603403
12594	NC_008781	CCG	2	6	518373	518378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603403
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12596	NC_008781	GAA	2	6	518404	518409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603403
12597	NC_008781	GAC	2	6	518434	518439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603403
12598	NC_008781	GAA	2	6	518443	518448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603403
12599	NC_008781	TGGA	2	8	518477	518484	25 %	25 %	50 %	0 %	121603403
12600	NC_008781	CGG	2	6	518493	518498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603403
12601	NC_008781	TTCAT	2	10	518539	518548	20 %	60 %	0 %	20 %	121603403
12602	NC_008781	TGC	2	6	518558	518563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603403
12603	NC_008781	CCG	2	6	518564	518569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603403
12604	NC_008781	GCT	2	6	518577	518582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603403
12605	NC_008781	GGC	2	6	518653	518658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603403
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12608	NC_008781	TTC	2	6	518785	518790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603403
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12611	NC_008781	GCAG	2	8	518928	518935	25 %	0 %	50 %	25 %	121603403
12612	NC_008781	GC	3	6	518950	518955	0 %	0 %	50 %	50 %	121603403
12613	NC_008781	GCG	2	6	518961	518966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603403
12614	NC_008781	CGA	2	6	518979	518984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603403
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12616	NC_008781	C	7	7	519042	519048	0 %	0 %	0 %	100 %	121603404
12617	NC_008781	GGC	2	6	519139	519144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603404
12618	NC_008781	AGG	2	6	519152	519157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121603404
12619	NC_008781	GCC	3	9	519199	519207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603404
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12621	NC_008781	GC	3	6	519260	519265	0 %	0 %	50 %	50 %	121603404
12622	NC_008781	TGG	2	6	519290	519295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603404
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12624	NC_008781	GCG	2	6	519332	519337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603404
12625	NC_008781	TGG	2	6	519359	519364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603404
12626	NC_008781	CGC	2	6	519408	519413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603404
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12650	NC_008781	GCC	2	6	520281	520286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603405
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12700	NC_008781	CTG	2	6	522601	522606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603407
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12727	NC_008781	TGA	2	6	523910	523915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603409
12728	NC_008781	TCGGTG	2	12	523960	523971	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121603409
12729	NC_008781	CAGC	2	8	524007	524014	25 %	0 %	25 %	50 %	121603409
12730	NC_008781	CGGC	2	8	524017	524024	0 %	0 %	50 %	50 %	121603409
12731	NC_008781	TTCAT	2	10	524167	524176	20 %	60 %	0 %	20 %	121603409
12732	NC_008781	GC	3	6	524200	524205	0 %	0 %	50 %	50 %	121603409
12733	NC_008781	GGC	2	6	524215	524220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603409
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12737	NC_008781	GCT	2	6	524285	524290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603409
12738	NC_008781	TCGG	2	8	524317	524324	0 %	25 %	50 %	25 %	121603409
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12740	NC_008781	GCA	2	6	524450	524455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603409
12741	NC_008781	CAG	2	6	524469	524474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603409
12742	NC_008781	GGC	2	6	524508	524513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603409
12743	NC_008781	TGC	2	6	524523	524528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603409
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12745	NC_008781	GCT	2	6	524572	524577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603409
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12847	NC_008781	ACTGA	2	10	528907	528916	40 %	20 %	20 %	20 %	121603412
12848	NC_008781	TGA	2	6	528974	528979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603412
12849	NC_008781	GAA	2	6	529045	529050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12850	NC_008781	TTC	2	6	529080	529085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12851	NC_008781	ACC	2	6	529183	529188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12852	NC_008781	TCA	2	6	529199	529204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12853	NC_008781	TGACG	2	10	529291	529300	20 %	20 %	40 %	20 %	121603413
12854	NC_008781	CGAC	2	8	529323	529330	25 %	0 %	25 %	50 %	121603413
12855	NC_008781	TCA	3	9	529428	529436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603413
12856	NC_008781	CGAC	2	8	529470	529477	25 %	0 %	25 %	50 %	121603413
12857	NC_008781	TAC	2	6	529484	529489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603413
12858	NC_008781	GGC	2	6	529508	529513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603413
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12982	NC_008781	CGC	2	6	534671	534676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603418
12983	NC_008781	GC	3	6	534696	534701	0 %	0 %	50 %	50 %	121603418
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12985	NC_008781	GCT	2	6	534740	534745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603418
12986	NC_008781	CG	3	6	534779	534784	0 %	0 %	50 %	50 %	121603418
12987	NC_008781	GTA	2	6	534809	534814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603418
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12990	NC_008781	GTCG	2	8	535007	535014	0 %	25 %	50 %	25 %	121603418
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