MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008781	GTG	2	6	21092	21097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602941
502	NC_008781	CGC	2	6	21103	21108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602941
503	NC_008781	GCCG	2	8	21178	21185	0 %	0 %	50 %	50 %	121602941
504	NC_008781	CGC	2	6	21205	21210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602941
505	NC_008781	GCA	2	6	21222	21227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602941
506	NC_008781	GC	3	6	21237	21242	0 %	0 %	50 %	50 %	121602941
507	NC_008781	TCA	2	6	21249	21254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602941
508	NC_008781	GCC	2	6	21278	21283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602941
509	NC_008781	GCAC	2	8	21372	21379	25 %	0 %	25 %	50 %	121602941
510	NC_008781	GCCG	2	8	21382	21389	0 %	0 %	50 %	50 %	121602941
511	NC_008781	GC	4	8	21395	21402	0 %	0 %	50 %	50 %	121602941
512	NC_008781	CGA	2	6	21447	21452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602941
513	NC_008781	GCCGT	2	10	21515	21524	0 %	20 %	40 %	40 %	121602941
514	NC_008781	GGT	2	6	21529	21534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602941
515	NC_008781	GGC	2	6	21542	21547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602941
516	NC_008781	GCG	2	6	21582	21587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602941
517	NC_008781	TGGCG	2	10	21592	21601	0 %	20 %	60 %	20 %	121602941
518	NC_008781	GGC	2	6	21622	21627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602941
519	NC_008781	GCA	2	6	21634	21639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602941
520	NC_008781	GGC	2	6	21640	21645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602941
521	NC_008781	TCCAC	2	10	21852	21861	20 %	20 %	0 %	60 %	121602942
522	NC_008781	CTGT	2	8	21899	21906	0 %	50 %	25 %	25 %	121602942
523	NC_008781	GGTT	2	8	22000	22007	0 %	50 %	50 %	0 %	121602942
524	NC_008781	GTGGC	2	10	22012	22021	0 %	20 %	60 %	20 %	121602942
525	NC_008781	TAC	2	6	22023	22028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602942
526	NC_008781	TTG	2	6	22075	22080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602942
527	NC_008781	TGA	2	6	22114	22119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602942
528	NC_008781	T	6	6	22136	22141	0 %	100 %	0 %	0 %	121602942
529	NC_008781	GTG	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602942
530	NC_008781	TTGC	2	8	22170	22177	0 %	50 %	25 %	25 %	121602942
531	NC_008781	TTGGCT	2	12	22258	22269	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	121602942
532	NC_008781	GCT	2	6	22435	22440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602943
533	NC_008781	GC	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
534	NC_008781	TGCG	2	8	22476	22483	0 %	25 %	50 %	25 %	121602943
535	NC_008781	GCA	2	6	22540	22545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602943
536	NC_008781	GGC	2	6	22547	22552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
537	NC_008781	GGC	2	6	22559	22564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
538	NC_008781	GGC	2	6	22591	22596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
539	NC_008781	CGC	2	6	22613	22618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
540	NC_008781	GC	3	6	22733	22738	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
541	NC_008781	TCG	2	6	22749	22754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602943
542	NC_008781	CAG	2	6	22763	22768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602943
543	NC_008781	GCT	2	6	22777	22782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602943
544	NC_008781	GCGCC	2	10	22797	22806	0 %	0 %	40 %	60 %	121602943
545	NC_008781	CGGCC	2	10	22807	22816	0 %	0 %	40 %	60 %	121602943
546	NC_008781	CCGG	2	8	22819	22826	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
547	NC_008781	GCG	2	6	22848	22853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
548	NC_008781	GCC	2	6	22874	22879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
549	NC_008781	CGG	2	6	22903	22908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
550	NC_008781	GC	4	8	22917	22924	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
551	NC_008781	CAGC	2	8	22925	22932	25 %	0 %	25 %	50 %	121602943
552	NC_008781	GC	3	6	22973	22978	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
553	NC_008781	GCG	2	6	23029	23034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
554	NC_008781	CGC	2	6	23047	23052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
555	NC_008781	GCAGGC	2	12	23170	23181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121602943
556	NC_008781	GCC	2	6	23186	23191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
557	NC_008781	TCGACC	2	12	23289	23300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121602943
558	NC_008781	CGC	2	6	23305	23310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
559	NC_008781	GC	3	6	23338	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
560	NC_008781	GC	3	6	23345	23350	0 %	0 %	50 %	50 %	121602943
561	NC_008781	GCCAG	2	10	23374	23383	20 %	0 %	40 %	40 %	121602943
562	NC_008781	CGC	2	6	23402	23407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
563	NC_008781	GCCA	2	8	23433	23440	25 %	0 %	25 %	50 %	121602943
564	NC_008781	GCA	2	6	23458	23463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602943
565	NC_008781	GCG	2	6	23530	23535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602943
566	NC_008781	CCA	3	9	23566	23574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602943
567	NC_008781	GCC	2	6	23577	23582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602943
568	NC_008781	ATG	2	6	23684	23689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602944
569	NC_008781	GCC	2	6	23728	23733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602944
570	NC_008781	GCC	3	9	23770	23778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602944
571	NC_008781	AGC	2	6	23796	23801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602944
572	NC_008781	GCT	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602944
573	NC_008781	AGCCC	2	10	23853	23862	20 %	0 %	20 %	60 %	121602944
574	NC_008781	GCA	2	6	23886	23891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602944
575	NC_008781	TGC	2	6	23910	23915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602944
576	NC_008781	GCA	2	6	23916	23921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602944
577	NC_008781	GCCG	2	8	23931	23938	0 %	0 %	50 %	50 %	121602944
578	NC_008781	GCT	2	6	23982	23987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602944
579	NC_008781	GGC	2	6	24084	24089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602944
580	NC_008781	CGG	3	9	24096	24104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602944
581	NC_008781	GCA	3	9	24123	24131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602944
582	NC_008781	GCA	2	6	24150	24155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602944
583	NC_008781	TGA	2	6	24162	24167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602944
584	NC_008781	CCT	2	6	24189	24194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_008781	TCA	2	6	24205	24210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602945
586	NC_008781	CGC	2	6	24223	24228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602945
587	NC_008781	GCC	2	6	24234	24239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602945
588	NC_008781	CCA	2	6	24244	24249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602945
589	NC_008781	GCC	2	6	24251	24256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602945
590	NC_008781	CGG	2	6	24285	24290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602945
591	NC_008781	CCA	2	6	24291	24296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602945
592	NC_008781	CCAGCA	2	12	24324	24335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	121602945
593	NC_008781	CGG	2	6	24342	24347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602945
594	NC_008781	CCAG	2	8	24417	24424	25 %	0 %	25 %	50 %	121602945
595	NC_008781	CGA	2	6	24453	24458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
596	NC_008781	TGGC	2	8	24509	24516	0 %	25 %	50 %	25 %	121602945
597	NC_008781	CAG	3	9	24517	24525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
598	NC_008781	GGCT	2	8	24531	24538	0 %	25 %	50 %	25 %	121602945
599	NC_008781	TGA	2	6	24546	24551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602945
600	NC_008781	CAG	2	6	24589	24594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
601	NC_008781	CGA	2	6	24618	24623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
602	NC_008781	GC	3	6	24627	24632	0 %	0 %	50 %	50 %	121602945
603	NC_008781	CGCC	2	8	24639	24646	0 %	0 %	25 %	75 %	121602945
604	NC_008781	A	6	6	24650	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	121602945
605	NC_008781	CGG	2	6	24666	24671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602945
606	NC_008781	CAG	2	6	24688	24693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
607	NC_008781	GCG	2	6	24725	24730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602945
608	NC_008781	GGC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602945
609	NC_008781	GCCAGC	2	12	24749	24760	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121602945
610	NC_008781	GCAGCC	2	12	24789	24800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121602945
611	NC_008781	CCA	2	6	24810	24815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602945
612	NC_008781	GCC	2	6	24827	24832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602945
613	NC_008781	CAG	2	6	24838	24843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
614	NC_008781	GTC	2	6	24853	24858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602945
615	NC_008781	CAG	3	9	24916	24924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602945
616	NC_008781	AGCC	2	8	24932	24939	25 %	0 %	25 %	50 %	121602945
617	NC_008781	ACC	2	6	25036	25041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602945
618	NC_008781	GCGG	2	8	25141	25148	0 %	0 %	75 %	25 %	121602946
619	NC_008781	CG	3	6	25164	25169	0 %	0 %	50 %	50 %	121602946
620	NC_008781	CGCGC	2	10	25182	25191	0 %	0 %	40 %	60 %	121602946
621	NC_008781	CAG	2	6	25192	25197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602946
622	NC_008781	CAG	2	6	25210	25215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602946
623	NC_008781	GCG	2	6	25262	25267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602946
624	NC_008781	GCG	2	6	25314	25319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602946
625	NC_008781	CAC	2	6	25363	25368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602946
626	NC_008781	CAG	2	6	25402	25407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602946
627	NC_008781	CGC	2	6	25452	25457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602946
628	NC_008781	AGCGC	2	10	25512	25521	20 %	0 %	40 %	40 %	121602946
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1000	NC_008781	ACC	2	6	39604	39609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602956

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