MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008781	CGC	2	6	215509	215514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603120
5502	NC_008781	AACC	2	8	215526	215533	50 %	0 %	0 %	50 %	121603120
5503	NC_008781	TCA	2	6	215649	215654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603121
5504	NC_008781	CGCC	2	8	215679	215686	0 %	0 %	25 %	75 %	121603121
5505	NC_008781	AAG	2	6	215734	215739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603121
5506	NC_008781	TGA	2	6	215832	215837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603121
5507	NC_008781	CAA	2	6	215856	215861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603121
5508	NC_008781	GC	3	6	215905	215910	0 %	0 %	50 %	50 %	121603121
5509	NC_008781	GCC	2	6	215915	215920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603121
5510	NC_008781	TGA	2	6	216027	216032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603121
5511	NC_008781	GTT	2	6	216073	216078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603121
5512	NC_008781	CCAAA	2	10	216188	216197	60 %	0 %	0 %	40 %	121603122
5513	NC_008781	GCC	2	6	216208	216213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603122
5514	NC_008781	GAT	2	6	216257	216262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603122
5515	NC_008781	GCC	2	6	216418	216423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603122
5516	NC_008781	CGC	2	6	216588	216593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603123
5517	NC_008781	AAC	3	9	216626	216634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603123
5518	NC_008781	GGC	2	6	216659	216664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603123
5519	NC_008781	CAC	2	6	216674	216679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603123
5520	NC_008781	CAA	2	6	216703	216708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603123
5521	NC_008781	CAT	2	6	216805	216810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603123
5522	NC_008781	CCA	2	6	216912	216917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603123
5523	NC_008781	GC	3	6	216948	216953	0 %	0 %	50 %	50 %	121603123
5524	NC_008781	CCG	2	6	216966	216971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603123
5525	NC_008781	GCT	2	6	216985	216990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603123
5526	NC_008781	CCA	2	6	217065	217070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603123
5527	NC_008781	GCC	2	6	217104	217109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603123
5528	NC_008781	GGC	2	6	217196	217201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603123
5529	NC_008781	CAA	3	9	217273	217281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603123
5530	NC_008781	TGA	2	6	217293	217298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603123
5531	NC_008781	AAG	2	6	217313	217318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603123
5532	NC_008781	A	6	6	217347	217352	100 %	0 %	0 %	0 %	121603124
5533	NC_008781	CAT	2	6	217368	217373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603124
5534	NC_008781	CGC	2	6	217437	217442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603124
5535	NC_008781	AGC	2	6	217495	217500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603124
5536	NC_008781	A	6	6	217590	217595	100 %	0 %	0 %	0 %	121603124
5537	NC_008781	GTCG	2	8	217655	217662	0 %	25 %	50 %	25 %	121603125
5538	NC_008781	A	6	6	217740	217745	100 %	0 %	0 %	0 %	121603125
5539	NC_008781	GCT	2	6	217746	217751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603125
5540	NC_008781	ATC	2	6	217755	217760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603125
5541	NC_008781	AAG	2	6	217761	217766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603125
5542	NC_008781	ACG	2	6	217801	217806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603125
5543	NC_008781	CGA	2	6	217817	217822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603125
5544	NC_008781	CG	4	8	217877	217884	0 %	0 %	50 %	50 %	121603125
5545	NC_008781	GCA	2	6	217952	217957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_008781	A	6	6	217969	217974	100 %	0 %	0 %	0 %	121603126
5547	NC_008781	CAACC	2	10	217976	217985	40 %	0 %	0 %	60 %	121603126
5548	NC_008781	CAA	2	6	218033	218038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603126
5549	NC_008781	GAA	3	9	218090	218098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603126
5550	NC_008781	CG	3	6	218119	218124	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5551	NC_008781	CGT	2	6	218183	218188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5552	NC_008781	A	6	6	218196	218201	100 %	0 %	0 %	0 %	121603126
5553	NC_008781	AAG	2	6	218223	218228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603126
5554	NC_008781	GCC	2	6	218236	218241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603126
5555	NC_008781	GAA	2	6	218271	218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603126
5556	NC_008781	CAG	2	6	218325	218330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5557	NC_008781	CAT	2	6	218342	218347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603126
5558	NC_008781	CCG	2	6	218351	218356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603126
5559	NC_008781	GC	3	6	218366	218371	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5560	NC_008781	GTC	2	6	218417	218422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5561	NC_008781	GC	3	6	218495	218500	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5562	NC_008781	ACC	2	6	218532	218537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603126
5563	NC_008781	CAT	2	6	218543	218548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603126
5564	NC_008781	GAT	2	6	218612	218617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603126
5565	NC_008781	CGA	2	6	218627	218632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603126
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5567	NC_008781	GC	3	6	218692	218697	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5568	NC_008781	CG	3	6	218710	218715	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5569	NC_008781	CG	3	6	218719	218724	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5570	NC_008781	ACA	3	9	218779	218787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603126
5571	NC_008781	GCA	2	6	218820	218825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5572	NC_008781	TAA	2	6	218856	218861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008781	TGC	2	6	218875	218880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603127
5574	NC_008781	ACCG	2	8	218982	218989	25 %	0 %	25 %	50 %	121603127
5575	NC_008781	CGTCA	2	10	219039	219048	20 %	20 %	20 %	40 %	121603127
5576	NC_008781	GGC	2	6	219054	219059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603127
5577	NC_008781	CTG	2	6	219106	219111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603127
5578	NC_008781	TAC	2	6	219147	219152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603127
5579	NC_008781	GAA	2	6	219204	219209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603127
5580	NC_008781	ACG	2	6	219258	219263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603127
5581	NC_008781	GAA	2	6	219301	219306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008781	ACT	2	6	219313	219318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603128
5583	NC_008781	GCA	2	6	219408	219413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603128
5584	NC_008781	CAAG	2	8	219492	219499	50 %	0 %	25 %	25 %	121603128
5585	NC_008781	AAT	2	6	219506	219511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121603128
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5587	NC_008781	GGT	2	6	219554	219559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603129
5588	NC_008781	GC	3	6	219569	219574	0 %	0 %	50 %	50 %	121603129
5589	NC_008781	CGC	2	6	219600	219605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603129
5590	NC_008781	CCAAGA	2	12	219724	219735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	121603129
5591	NC_008781	GGC	2	6	219794	219799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_008781	CA	3	6	219818	219823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_008781	T	6	6	219831	219836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008781	TGC	2	6	219916	219921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_008781	GTCGAA	2	12	220011	220022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121603130
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5597	NC_008781	GCA	2	6	220351	220356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603130
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5599	NC_008781	C	10	10	220474	220483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5600	NC_008781	A	6	6	220494	220499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008781	GGC	2	6	220518	220523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_008781	T	6	6	220524	220529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008781	GTA	2	6	220584	220589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603131
5604	NC_008781	GTC	2	6	220644	220649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603131
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5606	NC_008781	GC	3	6	220686	220691	0 %	0 %	50 %	50 %	121603131
5607	NC_008781	TGC	2	6	220701	220706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603131
5608	NC_008781	CAGC	2	8	220709	220716	25 %	0 %	25 %	50 %	121603131
5609	NC_008781	GCG	2	6	220734	220739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603131
5610	NC_008781	TTTCA	2	10	220764	220773	20 %	60 %	0 %	20 %	121603131
5611	NC_008781	GCG	2	6	220774	220779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603131
5612	NC_008781	GC	4	8	220802	220809	0 %	0 %	50 %	50 %	121603131
5613	NC_008781	GCA	2	6	220815	220820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603131
5614	NC_008781	CCA	2	6	220838	220843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603131
5615	NC_008781	CCG	2	6	220861	220866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603131
5616	NC_008781	CAGCT	2	10	220896	220905	20 %	20 %	20 %	40 %	121603131
5617	NC_008781	GGC	2	6	220971	220976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603131
5618	NC_008781	TGA	2	6	221000	221005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603131
5619	NC_008781	TGG	2	6	221012	221017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603131
5620	NC_008781	A	6	6	221041	221046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008781	AGC	2	6	221146	221151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
5622	NC_008781	GTC	2	6	221175	221180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603132
5623	NC_008781	AGGC	2	8	221186	221193	25 %	0 %	50 %	25 %	121603132
5624	NC_008781	CAC	2	6	221199	221204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603132
5625	NC_008781	GCA	2	6	221222	221227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
5626	NC_008781	CCA	2	6	221234	221239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603132
5627	NC_008781	GCA	2	6	221252	221257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
5628	NC_008781	GCA	3	9	221282	221290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
5629	NC_008781	TCA	2	6	221395	221400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603132
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5631	NC_008781	CAG	3	9	221601	221609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
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5635	NC_008781	T	6	6	221786	221791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5636	NC_008781	CAA	2	6	221911	221916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5637	NC_008781	CAA	2	6	221947	221952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5638	NC_008781	TGC	2	6	221987	221992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603133
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5640	NC_008781	GCC	2	6	222103	222108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603133
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5643	NC_008781	GCTG	2	8	222317	222324	0 %	25 %	50 %	25 %	121603133
5644	NC_008781	CGG	2	6	222376	222381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603133
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5648	NC_008781	GCT	2	6	222461	222466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5649	NC_008781	T	7	7	222515	222521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5650	NC_008781	A	6	6	222527	222532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5653	NC_008781	TTG	2	6	222638	222643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603134
5654	NC_008781	GTC	2	6	222653	222658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603134
5655	NC_008781	GAC	2	6	222751	222756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603134
5656	NC_008781	TTG	2	6	222818	222823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603134
5657	NC_008781	GAT	2	6	222832	222837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603134
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5679	NC_008781	T	6	6	223867	223872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5680	NC_008781	CGG	2	6	223912	223917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603136
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5682	NC_008781	CCA	2	6	223935	223940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603136
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5693	NC_008781	CGC	2	6	224295	224300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603136
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5742	NC_008781	GCT	2	6	226438	226443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603138
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5862	NC_008781	GTT	2	6	231533	231538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603142
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