MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008781	GCT	2	6	176512	176517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_008781	TCA	2	6	176562	176567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_008781	AGA	2	6	176568	176573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008781	CG	3	6	176574	176579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_008781	TGT	2	6	176616	176621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603083
4506	NC_008781	CAA	2	6	176624	176629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603083
4507	NC_008781	TTG	2	6	176729	176734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603083
4508	NC_008781	CGG	2	6	176873	176878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603083
4509	NC_008781	GCA	2	6	176938	176943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4510	NC_008781	CTA	2	6	177013	177018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603083
4511	NC_008781	GTG	2	6	177137	177142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603083
4512	NC_008781	CCA	2	6	177304	177309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603083
4513	NC_008781	GTC	2	6	177440	177445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4514	NC_008781	GAT	2	6	177452	177457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603083
4515	NC_008781	TGA	2	6	177489	177494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603083
4516	NC_008781	TCG	2	6	177576	177581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4517	NC_008781	GAT	2	6	177601	177606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603083
4518	NC_008781	GGC	2	6	177608	177613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603083
4519	NC_008781	CTT	2	6	177803	177808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603083
4520	NC_008781	CTG	2	6	177905	177910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4521	NC_008781	CG	3	6	177918	177923	0 %	0 %	50 %	50 %	121603083
4522	NC_008781	ATC	2	6	177980	177985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603083
4523	NC_008781	GC	3	6	178051	178056	0 %	0 %	50 %	50 %	121603083
4524	NC_008781	GCT	2	6	178078	178083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4525	NC_008781	CTG	2	6	178091	178096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4526	NC_008781	CTG	2	6	178148	178153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4527	NC_008781	GCG	2	6	178160	178165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603083
4528	NC_008781	CAG	3	9	178213	178221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4529	NC_008781	CTG	2	6	178226	178231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4530	NC_008781	GAC	2	6	178291	178296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603083
4531	NC_008781	GCGA	2	8	178299	178306	25 %	0 %	50 %	25 %	121603083
4532	NC_008781	CTCCCG	2	12	178386	178397	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	121603083
4533	NC_008781	GGT	2	6	178548	178553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603084
4534	NC_008781	GCC	2	6	178560	178565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603084
4535	NC_008781	CCA	2	6	178603	178608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603084
4536	NC_008781	GGT	2	6	178624	178629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603084
4537	NC_008781	GCC	3	9	178663	178671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603084
4538	NC_008781	GCA	2	6	178697	178702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603084
4539	NC_008781	G	6	6	178780	178785	0 %	0 %	100 %	0 %	121603084
4540	NC_008781	CAA	2	6	178819	178824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603084
4541	NC_008781	TTC	2	6	178865	178870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603084
4542	NC_008781	TTG	2	6	178871	178876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603084
4543	NC_008781	CA	3	6	178926	178931	50 %	0 %	0 %	50 %	121603084
4544	NC_008781	CGC	3	9	178950	178958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603084
4545	NC_008781	GCC	2	6	178970	178975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603084
4546	NC_008781	GCC	2	6	179012	179017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603084
4547	NC_008781	CTC	2	6	179023	179028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121603084
4548	NC_008781	CGA	2	6	179032	179037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603084
4549	NC_008781	AGC	2	6	179052	179057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603084
4550	NC_008781	TGA	2	6	179058	179063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603084
4551	NC_008781	CGA	2	6	179154	179159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603084
4552	NC_008781	CGG	2	6	179274	179279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603084
4553	NC_008781	GGC	2	6	179353	179358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603084
4554	NC_008781	ACG	2	6	179417	179422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_008781	TGC	2	6	179511	179516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603085
4556	NC_008781	GGCC	2	8	179539	179546	0 %	0 %	50 %	50 %	121603085
4557	NC_008781	CGA	2	6	179581	179586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603085
4558	NC_008781	GC	3	6	179621	179626	0 %	0 %	50 %	50 %	121603085
4559	NC_008781	GAG	2	6	179639	179644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121603085
4560	NC_008781	CAGCG	2	10	179645	179654	20 %	0 %	40 %	40 %	121603085
4561	NC_008781	CGGCC	2	10	179677	179686	0 %	0 %	40 %	60 %	121603085
4562	NC_008781	GCC	3	9	179705	179713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603085
4563	NC_008781	GGC	2	6	179792	179797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603085
4564	NC_008781	TCG	2	6	179835	179840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603085
4565	NC_008781	CCG	2	6	179853	179858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603085
4566	NC_008781	CCG	2	6	179862	179867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603085
4567	NC_008781	GCC	2	6	179894	179899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603085
4568	NC_008781	CGC	2	6	179907	179912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603085
4569	NC_008781	TGC	2	6	180045	180050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603085
4570	NC_008781	GCG	2	6	180084	180089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603085
4571	NC_008781	GGCCT	2	10	180212	180221	0 %	20 %	40 %	40 %	121603086
4572	NC_008781	GCG	3	9	180228	180236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603086
4573	NC_008781	CCG	2	6	180237	180242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603086
4574	NC_008781	TG	3	6	180263	180268	0 %	50 %	50 %	0 %	121603086
4575	NC_008781	CGCA	2	8	180323	180330	25 %	0 %	25 %	50 %	121603086
4576	NC_008781	CAGG	2	8	180418	180425	25 %	0 %	50 %	25 %	121603086
4577	NC_008781	CCG	2	6	180426	180431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603086
4578	NC_008781	TGC	3	9	180477	180485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603086
4579	NC_008781	CTG	2	6	180530	180535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603086
4580	NC_008781	CGA	2	6	180541	180546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603086
4581	NC_008781	TCA	2	6	180549	180554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603086
4582	NC_008781	GAA	2	6	180671	180676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603086
4583	NC_008781	GCA	2	6	180697	180702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603086
4584	NC_008781	CAGGAA	2	12	180719	180730	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121603086
4585	NC_008781	A	7	7	180729	180735	100 %	0 %	0 %	0 %	121603086
4586	NC_008781	GAA	2	6	180758	180763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603086
4587	NC_008781	AGC	2	6	180777	180782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603086
4588	NC_008781	CCG	2	6	180800	180805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603086
4589	NC_008781	CCGGC	2	10	180808	180817	0 %	0 %	40 %	60 %	121603086
4590	NC_008781	T	6	6	180848	180853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_008781	GGGC	2	8	180881	180888	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_008781	T	6	6	180947	180952	0 %	100 %	0 %	0 %	121603087
4593	NC_008781	CAG	2	6	180956	180961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603087
4594	NC_008781	TGG	2	6	180994	180999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603087
4595	NC_008781	TGGCC	2	10	181006	181015	0 %	20 %	40 %	40 %	121603087
4596	NC_008781	GCC	2	6	181077	181082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603087
4597	NC_008781	GAT	2	6	181094	181099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603087
4598	NC_008781	GCG	2	6	181206	181211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603087
4599	NC_008781	TTG	2	6	181212	181217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603087
4600	NC_008781	GC	3	6	181264	181269	0 %	0 %	50 %	50 %	121603087
4601	NC_008781	TCGA	2	8	181284	181291	25 %	25 %	25 %	25 %	121603087
4602	NC_008781	TTC	2	6	181295	181300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603087
4603	NC_008781	GGC	2	6	181309	181314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603087
4604	NC_008781	GCC	2	6	181389	181394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603087
4605	NC_008781	GC	3	6	181457	181462	0 %	0 %	50 %	50 %	121603087
4606	NC_008781	CG	3	6	181471	181476	0 %	0 %	50 %	50 %	121603087
4607	NC_008781	GCG	2	6	181531	181536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603087
4608	NC_008781	CGG	2	6	181567	181572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603087
4609	NC_008781	TGC	2	6	181582	181587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603087
4610	NC_008781	TGC	2	6	181591	181596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603087
4611	NC_008781	CTG	2	6	181634	181639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603087
4612	NC_008781	CTG	2	6	181697	181702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603087
4613	NC_008781	GCG	2	6	181736	181741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603087
4614	NC_008781	CGG	2	6	181876	181881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603087
4615	NC_008781	CAG	2	6	181913	181918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603087
4616	NC_008781	TCT	2	6	181989	181994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121603087
4617	NC_008781	GCAC	2	8	182004	182011	25 %	0 %	25 %	50 %	121603087
4618	NC_008781	T	6	6	182024	182029	0 %	100 %	0 %	0 %	121603087
4619	NC_008781	GAA	2	6	182042	182047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603087
4620	NC_008781	CGC	2	6	182056	182061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603087
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4622	NC_008781	T	6	6	182146	182151	0 %	100 %	0 %	0 %	121603087
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4991	NC_008781	CTG	2	6	195871	195876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603099
4992	NC_008781	TGC	2	6	195893	195898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603099
4993	NC_008781	CTG	2	6	195901	195906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603099
4994	NC_008781	GCT	3	9	195912	195920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603099
4995	NC_008781	GCA	2	6	195948	195953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603099
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