MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 106278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008781	A	6	6	12	17	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008781	T	8	8	22	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008781	GT	3	6	49	54	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008781	T	6	6	54	59	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008781	A	6	6	153	158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008781	AAG	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008781	CAG	2	6	227	232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008781	GCA	2	6	266	271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008781	CCA	2	6	289	294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008781	ACCC	2	8	449	456	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_008781	CTGGA	2	10	516	525	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008781	TGC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008781	TCC	2	6	675	680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008781	CAT	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008781	AGG	2	6	874	879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008781	G	7	7	905	911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008781	ACG	2	6	943	948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008781	AAC	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008781	TGT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008781	GCTG	2	8	1263	1270	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008781	GCTTG	2	10	1304	1313	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008781	CAT	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008781	CGG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008781	GCA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008781	CTT	2	6	1381	1386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008781	GGC	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008781	AGC	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008781	GGTC	2	8	1505	1512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008781	CAGC	3	12	1621	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008781	ACA	2	6	1654	1659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008781	CACT	2	8	1670	1677	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008781	GCA	2	6	1765	1770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008781	ACA	2	6	1804	1809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008781	AC	3	6	1821	1826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008781	TTA	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008781	GC	3	6	2065	2070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008781	CTTG	2	8	2134	2141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008781	TGC	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008781	CGC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008781	G	6	6	2364	2369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008781	TTC	2	6	2431	2436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008781	GGA	2	6	2444	2449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008781	GAA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008781	GCTC	2	8	2481	2488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008781	CGA	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008781	CGG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008781	GTCA	2	8	2593	2600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008781	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008781	TTG	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008781	A	6	6	2748	2753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008781	CTGC	2	8	2778	2785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008781	GAA	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602920
53	NC_008781	TCG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
54	NC_008781	CAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602920
55	NC_008781	GCTG	2	8	2929	2936	0 %	25 %	50 %	25 %	121602920
56	NC_008781	TGC	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
57	NC_008781	GGC	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602920
58	NC_008781	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602920
59	NC_008781	CGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
60	NC_008781	ACCC	2	8	3152	3159	25 %	0 %	0 %	75 %	121602920
61	NC_008781	A	6	6	3195	3200	100 %	0 %	0 %	0 %	121602920
62	NC_008781	GGA	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121602920
63	NC_008781	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602920
64	NC_008781	TTG	2	6	3337	3342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602920
65	NC_008781	ACG	2	6	3412	3417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602920
66	NC_008781	ACC	2	6	3468	3473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602920
67	NC_008781	TTTCG	2	10	3494	3503	0 %	60 %	20 %	20 %	121602920
68	NC_008781	GTCG	2	8	3724	3731	0 %	25 %	50 %	25 %	121602921
69	NC_008781	CG	3	6	3730	3735	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
70	NC_008781	GCT	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
71	NC_008781	GC	3	6	3772	3777	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
72	NC_008781	GC	3	6	3788	3793	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
73	NC_008781	T	7	7	3841	3847	0 %	100 %	0 %	0 %	121602921
74	NC_008781	CGT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
75	NC_008781	GTTGCA	2	12	3900	3911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121602921
76	NC_008781	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
77	NC_008781	GCC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602921
78	NC_008781	GTG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602921
79	NC_008781	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
80	NC_008781	GATC	2	8	3992	3999	25 %	25 %	25 %	25 %	121602921
81	NC_008781	GCG	2	6	4011	4016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
82	NC_008781	CAC	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602921
83	NC_008781	GCTG	2	8	4140	4147	0 %	25 %	50 %	25 %	121602921
84	NC_008781	A	6	6	4217	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	121602921
85	NC_008781	CAG	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602921
86	NC_008781	GCG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
87	NC_008781	CATG	2	8	4315	4322	25 %	25 %	25 %	25 %	121602921
88	NC_008781	TGC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
89	NC_008781	AAGC	2	8	4369	4376	50 %	0 %	25 %	25 %	121602921
90	NC_008781	GCCG	2	8	4442	4449	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
91	NC_008781	T	6	6	4482	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	121602921
92	NC_008781	ATC	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602921
93	NC_008781	A	7	7	4494	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	121602921
94	NC_008781	GCC	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008781	GCG	2	6	4587	4592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008781	CAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008781	T	7	7	4651	4657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008781	CAT	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602922
99	NC_008781	CAA	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602922
100	NC_008781	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602922
101	NC_008781	CAA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602922
102	NC_008781	GCA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602922
103	NC_008781	CAGTCG	2	12	4909	4920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121602922
104	NC_008781	AAT	2	6	4967	4972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008781	TCT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008781	TGGC	2	8	5098	5105	0 %	25 %	50 %	25 %	121602923
107	NC_008781	TGGT	2	8	5169	5176	0 %	50 %	50 %	0 %	121602923
108	NC_008781	GCA	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602923
109	NC_008781	GTG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602923
110	NC_008781	GCC	2	6	5236	5241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602923
111	NC_008781	CTGGC	2	10	5258	5267	0 %	20 %	40 %	40 %	121602923
112	NC_008781	GGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602923
113	NC_008781	CTG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602923
114	NC_008781	TGC	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602923
115	NC_008781	CG	3	6	5456	5461	0 %	0 %	50 %	50 %	121602923
116	NC_008781	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602923
117	NC_008781	GCC	2	6	5546	5551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602923
118	NC_008781	GCT	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008781	AC	3	6	5758	5763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008781	CTT	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008781	TCCC	2	8	5879	5886	0 %	25 %	0 %	75 %	121602924
122	NC_008781	AGC	3	9	5898	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602924
123	NC_008781	TTCC	2	8	5922	5929	0 %	50 %	0 %	50 %	121602924
124	NC_008781	CGG	2	6	5977	5982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
125	NC_008781	GGCGTG	2	12	6059	6070	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	121602924
126	NC_008781	GGC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
127	NC_008781	GCAG	2	8	6122	6129	25 %	0 %	50 %	25 %	121602924
128	NC_008781	AGC	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602924
129	NC_008781	GGC	2	6	6175	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
130	NC_008781	GGTG	2	8	6190	6197	0 %	25 %	75 %	0 %	121602924
131	NC_008781	GGC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
132	NC_008781	CGG	2	6	6286	6291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
133	NC_008781	GCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
134	NC_008781	GC	3	6	6313	6318	0 %	0 %	50 %	50 %	121602924
135	NC_008781	GCG	2	6	6360	6365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
136	NC_008781	GCC	2	6	6371	6376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602924
137	NC_008781	GCG	2	6	6390	6395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
138	NC_008781	GGCC	2	8	6475	6482	0 %	0 %	50 %	50 %	121602924
139	NC_008781	A	6	6	6586	6591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008781	GCA	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008781	GCT	3	9	6612	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008781	T	7	7	6620	6626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008781	A	6	6	6631	6636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008781	CCGGC	2	10	6639	6648	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_008781	TTGATG	2	12	6735	6746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	121602925
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147	NC_008781	T	7	7	6871	6877	0 %	100 %	0 %	0 %	121602925
148	NC_008781	AGGA	2	8	6891	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	121602925
149	NC_008781	T	6	6	6916	6921	0 %	100 %	0 %	0 %	121602926
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352	NC_008781	A	7	7	14811	14817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_008781	A	7	7	14845	14851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_008781	CGG	3	9	16433	16441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_008781	CGC	2	6	16455	16460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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395	NC_008781	CAC	2	6	16639	16644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_008781	TGG	2	6	16811	16816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602937
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402	NC_008781	GCG	2	6	16934	16939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602937
403	NC_008781	CAG	2	6	16983	16988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602937
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