MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP05

Total Repeats: 1219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008761	CT	3	6	43	48	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008761	GCC	2	6	60	65	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008761	CTTT	2	8	76	83	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008761	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008761	GTG	2	6	143	148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008761	ACG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008761	TGC	2	6	229	234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008761	GCA	2	6	262	267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008761	CAGT	2	8	319	326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008761	CA	3	6	366	371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008761	TGT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008761	CG	3	6	482	487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008761	TG	3	6	501	506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008761	AGG	2	6	512	517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008761	GTT	2	6	522	527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008761	CGG	2	6	649	654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008761	AAT	2	6	679	684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008761	TGA	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008761	GTG	2	6	709	714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008761	AGC	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008761	G	6	6	787	792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008761	GATG	2	8	800	807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008761	GAA	2	6	847	852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008761	GA	3	6	869	874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008761	TGA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008761	A	7	7	992	998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008761	GGT	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008761	CCT	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008761	AAGA	2	8	1124	1131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008761	GGCCAT	2	12	1154	1165	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121583485
31	NC_008761	T	8	8	1247	1254	0 %	100 %	0 %	0 %	121583485
32	NC_008761	TTC	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583485
33	NC_008761	CG	3	6	1272	1277	0 %	0 %	50 %	50 %	121583485
34	NC_008761	GCC	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583485
35	NC_008761	CTC	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583485
36	NC_008761	CCGC	2	8	1372	1379	0 %	0 %	25 %	75 %	121583485
37	NC_008761	CGC	4	12	1377	1388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583485
38	NC_008761	GCAC	2	8	1402	1409	25 %	0 %	25 %	50 %	121583485
39	NC_008761	TGG	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583485
40	NC_008761	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	121583485
41	NC_008761	CGC	2	6	1503	1508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583485
42	NC_008761	GCCG	2	8	1517	1524	0 %	0 %	50 %	50 %	121583485
43	NC_008761	GCGG	2	8	1535	1542	0 %	0 %	75 %	25 %	121583485
44	NC_008761	GCC	2	6	1547	1552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583485
45	NC_008761	GCC	2	6	1692	1697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583486
46	NC_008761	GCC	2	6	1701	1706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583486
47	NC_008761	CG	3	6	1714	1719	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
48	NC_008761	CCG	2	6	1720	1725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583486
49	NC_008761	GCCA	2	8	1778	1785	25 %	0 %	25 %	50 %	121583486
50	NC_008761	GC	3	6	1836	1841	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
51	NC_008761	GCC	2	6	1848	1853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583486
52	NC_008761	CGG	2	6	1873	1878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583486
53	NC_008761	CTG	2	6	1892	1897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583486
54	NC_008761	GC	3	6	1898	1903	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
55	NC_008761	CTG	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583486
56	NC_008761	GCGCG	2	10	1921	1930	0 %	0 %	60 %	40 %	121583486
57	NC_008761	GC	4	8	1983	1990	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
58	NC_008761	CGC	2	6	2003	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583486
59	NC_008761	CGG	2	6	2020	2025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583486
60	NC_008761	CGG	2	6	2032	2037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583486
61	NC_008761	CTCGGC	2	12	2042	2053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121583486
62	NC_008761	CCT	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583486
63	NC_008761	GCGAG	2	10	2076	2085	20 %	0 %	60 %	20 %	121583486
64	NC_008761	GCCTGC	2	12	2088	2099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121583486
65	NC_008761	CGG	3	9	2140	2148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583486
66	NC_008761	TCG	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583486
67	NC_008761	GC	3	6	2193	2198	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
68	NC_008761	GCG	2	6	2211	2216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583486
69	NC_008761	GC	3	6	2264	2269	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
70	NC_008761	CAC	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583486
71	NC_008761	AGC	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583486
72	NC_008761	CG	3	6	2387	2392	0 %	0 %	50 %	50 %	121583486
73	NC_008761	CGG	2	6	2398	2403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583486
74	NC_008761	GCC	2	6	2418	2423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583486
75	NC_008761	ATG	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583486
76	NC_008761	TAT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008761	GAT	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008761	GGC	2	6	2542	2547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008761	A	6	6	2550	2555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008761	AGGCG	2	10	2592	2601	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008761	A	7	7	2621	2627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008761	CGG	2	6	2652	2657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008761	TCG	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008761	GAC	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008761	GT	3	6	2832	2837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008761	T	6	6	2837	2842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008761	GAA	2	6	2847	2852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008761	A	7	7	2851	2857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008761	AGG	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008761	GC	3	6	2871	2876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008761	CTG	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008761	CCT	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_008761	CTGG	2	8	3183	3190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008761	GAG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008761	TCCC	2	8	3223	3230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_008761	TGCT	2	8	3261	3268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008761	AGG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008761	CGCC	2	8	3345	3352	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_008761	GTG	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008761	GCAA	2	8	3419	3426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008761	GGGA	2	8	3449	3456	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008761	TGCA	4	16	3505	3520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008761	CATG	2	8	3527	3534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008761	CCGG	2	8	3538	3545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008761	TAT	2	6	3551	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008761	GCAA	2	8	3567	3574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008761	CG	3	6	3692	3697	0 %	0 %	50 %	50 %	121583487
108	NC_008761	CG	3	6	3739	3744	0 %	0 %	50 %	50 %	121583487
109	NC_008761	AGC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583487
110	NC_008761	CGG	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008761	CCG	2	6	4015	4020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008761	CCG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008761	GCT	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583488
114	NC_008761	AG	3	6	4131	4136	50 %	0 %	50 %	0 %	121583488
115	NC_008761	GCCA	2	8	4158	4165	25 %	0 %	25 %	50 %	121583488
116	NC_008761	TTG	2	6	4196	4201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583488
117	NC_008761	CGC	2	6	4259	4264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583488
118	NC_008761	CAG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583488
119	NC_008761	AGC	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583488
120	NC_008761	TTG	2	6	4341	4346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583488
121	NC_008761	CCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583488
122	NC_008761	ATG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583488
123	NC_008761	CAT	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583488
124	NC_008761	GATG	2	8	4483	4490	25 %	25 %	50 %	0 %	121583488
125	NC_008761	GCT	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583488
126	NC_008761	GATC	2	8	4540	4547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008761	ATTC	2	8	4567	4574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008761	TGA	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583489
129	NC_008761	CG	3	6	4640	4645	0 %	0 %	50 %	50 %	121583489
130	NC_008761	GCA	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583489
131	NC_008761	CAG	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583489
132	NC_008761	GGC	2	6	4911	4916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583489
133	NC_008761	ACG	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583489
134	NC_008761	CG	3	6	5116	5121	0 %	0 %	50 %	50 %	121583490
135	NC_008761	TGC	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583490
136	NC_008761	GC	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	121583490
137	NC_008761	TCG	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583490
138	NC_008761	CATGGC	2	12	5243	5254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121583490
139	NC_008761	GT	3	6	5322	5327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008761	CGG	2	6	5358	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008761	GAA	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583491
142	NC_008761	GCC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583491
143	NC_008761	CTT	2	6	5653	5658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583491
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272	NC_008761	TCA	2	6	12367	12372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583499
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405	NC_008761	GCCC	2	8	17982	17989	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
406	NC_008761	CGC	2	6	18060	18065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583505
407	NC_008761	GCC	2	6	18076	18081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583505
408	NC_008761	CGG	2	6	18135	18140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583505
409	NC_008761	ACC	2	6	18179	18184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583505
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