MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP05

Total Repeats: 1219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008761	GTG	2	6	22000	22005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583507
502	NC_008761	GAA	2	6	22011	22016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583507
503	NC_008761	GCT	2	6	22026	22031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583507
504	NC_008761	TCA	2	6	22040	22045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583507
505	NC_008761	GGA	2	6	22086	22091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583507
506	NC_008761	TGG	2	6	22094	22099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583507
507	NC_008761	AGG	2	6	22118	22123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583507
508	NC_008761	CCA	2	6	22187	22192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583507
509	NC_008761	AAG	2	6	22231	22236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583507
510	NC_008761	GC	3	6	22305	22310	0 %	0 %	50 %	50 %	121583507
511	NC_008761	CCCG	2	8	22356	22363	0 %	0 %	25 %	75 %	121583507
512	NC_008761	GCG	2	6	22375	22380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583507
513	NC_008761	TGC	2	6	22391	22396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583507
514	NC_008761	GCAGGC	2	12	22398	22409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121583507
515	NC_008761	GAT	2	6	22425	22430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583507
516	NC_008761	GTC	2	6	22437	22442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008761	C	6	6	22454	22459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
518	NC_008761	AGC	2	6	22474	22479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008761	TA	3	6	22506	22511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008761	CTG	2	6	22539	22544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008761	ATC	2	6	22732	22737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583508
522	NC_008761	TGA	2	6	22759	22764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583508
523	NC_008761	TCG	2	6	22773	22778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583508
524	NC_008761	AGT	2	6	22920	22925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583508
525	NC_008761	CTT	2	6	22965	22970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583508
526	NC_008761	CAC	2	6	22996	23001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583508
527	NC_008761	AAAG	2	8	23351	23358	75 %	0 %	25 %	0 %	121583508
528	NC_008761	TGC	2	6	23434	23439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583508
529	NC_008761	A	6	6	23507	23512	100 %	0 %	0 %	0 %	121583508
530	NC_008761	GC	3	6	23513	23518	0 %	0 %	50 %	50 %	121583508
531	NC_008761	CAC	2	6	23530	23535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583508
532	NC_008761	TGG	2	6	23588	23593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583508
533	NC_008761	A	7	7	23666	23672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008761	GTT	2	6	23739	23744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008761	TTC	2	6	23831	23836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583509
536	NC_008761	ATCC	2	8	23996	24003	25 %	25 %	0 %	50 %	121583509
537	NC_008761	ATTT	2	8	24037	24044	25 %	75 %	0 %	0 %	121583509
538	NC_008761	GCA	2	6	24135	24140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583510
539	NC_008761	CTT	2	6	24234	24239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583510
540	NC_008761	CAG	2	6	24257	24262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583510
541	NC_008761	ACA	2	6	24263	24268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583510
542	NC_008761	C	6	6	24315	24320	0 %	0 %	0 %	100 %	121583510
543	NC_008761	ATCA	2	8	24336	24343	50 %	25 %	0 %	25 %	121583510
544	NC_008761	GGA	2	6	24412	24417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583511
545	NC_008761	GC	3	6	24707	24712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_008761	GC	3	6	24751	24756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
547	NC_008761	GCC	2	6	24851	24856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_008761	C	6	6	24863	24868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
549	NC_008761	CAAT	2	8	24928	24935	50 %	25 %	0 %	25 %	121583512
550	NC_008761	GCT	2	6	24982	24987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583512
551	NC_008761	CACGA	2	10	24991	25000	40 %	0 %	20 %	40 %	121583512
552	NC_008761	ATC	2	6	25099	25104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583512
553	NC_008761	TC	3	6	25126	25131	0 %	50 %	0 %	50 %	121583512
554	NC_008761	GC	3	6	25134	25139	0 %	0 %	50 %	50 %	121583512
555	NC_008761	TCA	2	6	25160	25165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583512
556	NC_008761	TCA	2	6	25241	25246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583512
557	NC_008761	GCC	2	6	25251	25256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583512
558	NC_008761	GC	3	6	25259	25264	0 %	0 %	50 %	50 %	121583512
559	NC_008761	AGCG	2	8	25287	25294	25 %	0 %	50 %	25 %	121583512
560	NC_008761	GCCA	2	8	25316	25323	25 %	0 %	25 %	50 %	121583512
561	NC_008761	CAG	2	6	25354	25359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583512
562	NC_008761	GC	3	6	25430	25435	0 %	0 %	50 %	50 %	121583512
563	NC_008761	GGC	2	6	25477	25482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583512
564	NC_008761	CAG	2	6	25537	25542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583512
565	NC_008761	TCA	2	6	25553	25558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583512
566	NC_008761	TGG	2	6	25584	25589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583512
567	NC_008761	GC	3	6	25604	25609	0 %	0 %	50 %	50 %	121583512
568	NC_008761	GTTC	2	8	25653	25660	0 %	50 %	25 %	25 %	121583512
569	NC_008761	CTGTC	2	10	25666	25675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
570	NC_008761	GTTTG	2	10	25678	25687	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008761	GT	3	6	25698	25703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008761	AAT	2	6	25712	25717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583513
573	NC_008761	TGT	2	6	25730	25735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583513
574	NC_008761	GC	3	6	25748	25753	0 %	0 %	50 %	50 %	121583513
575	NC_008761	TGG	2	6	25763	25768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583513
576	NC_008761	GGTA	2	8	25820	25827	25 %	25 %	50 %	0 %	121583513
577	NC_008761	GCC	2	6	25858	25863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583513
578	NC_008761	CAC	2	6	25962	25967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583513
579	NC_008761	GTG	3	9	26065	26073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583513
580	NC_008761	GGA	2	6	26121	26126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583513
581	NC_008761	GC	3	6	26152	26157	0 %	0 %	50 %	50 %	121583513
582	NC_008761	GGT	2	6	26166	26171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583513
583	NC_008761	GTA	2	6	26196	26201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583513
584	NC_008761	GCT	2	6	26306	26311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583513
585	NC_008761	GC	3	6	26350	26355	0 %	0 %	50 %	50 %	121583513
586	NC_008761	AGC	2	6	26374	26379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583513
587	NC_008761	GAA	2	6	26409	26414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583513
588	NC_008761	TGC	2	6	26505	26510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583513
589	NC_008761	CAG	2	6	26511	26516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583513
590	NC_008761	GCG	2	6	26533	26538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583513
591	NC_008761	TTC	2	6	26541	26546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583513
592	NC_008761	GTT	2	6	26556	26561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583513
593	NC_008761	CAC	2	6	26630	26635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583513
594	NC_008761	GC	3	6	26688	26693	0 %	0 %	50 %	50 %	121583513
595	NC_008761	ATCA	2	8	26775	26782	50 %	25 %	0 %	25 %	121583513
596	NC_008761	CAA	2	6	26807	26812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583513
597	NC_008761	TCC	2	6	26932	26937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583513
598	NC_008761	CAG	2	6	26940	26945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583513
599	NC_008761	GT	3	6	26977	26982	0 %	50 %	50 %	0 %	121583513
600	NC_008761	TGCAGG	2	12	27184	27195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121583513
601	NC_008761	GTTG	2	8	27231	27238	0 %	50 %	50 %	0 %	121583513
602	NC_008761	C	6	6	27303	27308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
603	NC_008761	TGC	2	6	27467	27472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008761	TATG	2	8	27478	27485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008761	AAC	2	6	27599	27604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008761	GCC	2	6	27755	27760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583514
607	NC_008761	GAC	2	6	27839	27844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583514
608	NC_008761	AGA	2	6	27864	27869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583514
609	NC_008761	GGA	2	6	27976	27981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583514
610	NC_008761	ATC	2	6	28064	28069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583514
611	NC_008761	CAGG	2	8	28185	28192	25 %	0 %	50 %	25 %	121583514
612	NC_008761	AC	3	6	28205	28210	50 %	0 %	0 %	50 %	121583515
613	NC_008761	GGC	2	6	28230	28235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583515
614	NC_008761	CGC	2	6	28245	28250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583515
615	NC_008761	AAG	2	6	28292	28297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583515
616	NC_008761	TCA	2	6	28438	28443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583515
617	NC_008761	AAC	2	6	28469	28474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583515
618	NC_008761	AAG	2	6	28531	28536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583515
619	NC_008761	CAGA	2	8	28537	28544	50 %	0 %	25 %	25 %	121583515
620	NC_008761	AGA	2	6	28599	28604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583515
621	NC_008761	TCA	2	6	28631	28636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583516
622	NC_008761	TTG	2	6	28758	28763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583516
623	NC_008761	CAT	2	6	28780	28785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583516
624	NC_008761	ATG	2	6	28806	28811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583516
625	NC_008761	GAC	2	6	28812	28817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583516
626	NC_008761	AGG	2	6	28890	28895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583516
627	NC_008761	CCTA	2	8	28970	28977	25 %	25 %	0 %	50 %	121583516
628	NC_008761	AAG	2	6	29146	29151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583516
629	NC_008761	CGG	2	6	29224	29229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583516
630	NC_008761	CAGC	2	8	29262	29269	25 %	0 %	25 %	50 %	121583516
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634	NC_008761	TGA	2	6	29590	29595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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760	NC_008761	GGA	2	6	36309	36314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583520
761	NC_008761	GAA	2	6	36325	36330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583520
762	NC_008761	CGTA	2	8	36361	36368	25 %	25 %	25 %	25 %	121583520
763	NC_008761	CTG	2	6	36370	36375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583520
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886	NC_008761	TCGG	2	8	41733	41740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
887	NC_008761	CGG	2	6	41783	41788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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