MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP04

Total Repeats: 3004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008760	GCT	2	6	154	159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008760	TG	3	6	205	210	0 %	50 %	50 %	0 %	121583344
3	NC_008760	GAT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583344
4	NC_008760	CTC	2	6	302	307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583344
5	NC_008760	GCT	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
6	NC_008760	GCG	2	6	339	344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583344
7	NC_008760	CGAC	2	8	408	415	25 %	0 %	25 %	50 %	121583344
8	NC_008760	CGT	2	6	499	504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
9	NC_008760	GCC	2	6	509	514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583344
10	NC_008760	CTG	2	6	548	553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
11	NC_008760	CG	4	8	646	653	0 %	0 %	50 %	50 %	121583344
12	NC_008760	CAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583344
13	NC_008760	AGC	2	6	702	707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583344
14	NC_008760	GCC	2	6	713	718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583344
15	NC_008760	ACG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583344
16	NC_008760	GCT	2	6	817	822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
17	NC_008760	GC	3	6	843	848	0 %	0 %	50 %	50 %	121583344
18	NC_008760	CGG	2	6	868	873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583344
19	NC_008760	AGGC	2	8	924	931	25 %	0 %	50 %	25 %	121583344
20	NC_008760	CG	3	6	963	968	0 %	0 %	50 %	50 %	121583344
21	NC_008760	CCG	2	6	1023	1028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583344
22	NC_008760	CTGG	2	8	1033	1040	0 %	25 %	50 %	25 %	121583344
23	NC_008760	GTC	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583344
24	NC_008760	CG	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	121583344
25	NC_008760	GGC	2	6	1183	1188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583344
26	NC_008760	GC	3	6	1231	1236	0 %	0 %	50 %	50 %	121583344
27	NC_008760	CCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583345
28	NC_008760	CG	3	6	1359	1364	0 %	0 %	50 %	50 %	121583345
29	NC_008760	TCG	2	6	1367	1372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583345
30	NC_008760	GCTT	2	8	1378	1385	0 %	50 %	25 %	25 %	121583345
31	NC_008760	GGC	3	9	1392	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583345
32	NC_008760	TGA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583345
33	NC_008760	GCG	2	6	1432	1437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008760	GAAATT	2	12	1580	1591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008760	GTGCA	2	10	1604	1613	20 %	20 %	40 %	20 %	121583346
36	NC_008760	GCC	2	6	1659	1664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583346
37	NC_008760	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	121583346
38	NC_008760	GC	3	6	1737	1742	0 %	0 %	50 %	50 %	121583346
39	NC_008760	GCCG	2	8	1778	1785	0 %	0 %	50 %	50 %	121583346
40	NC_008760	TGCCC	2	10	1825	1834	0 %	20 %	20 %	60 %	121583346
41	NC_008760	GCGCC	2	10	1840	1849	0 %	0 %	40 %	60 %	121583346
42	NC_008760	GC	3	6	1989	1994	0 %	0 %	50 %	50 %	121583346
43	NC_008760	CCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583346
44	NC_008760	CAGC	2	8	2234	2241	25 %	0 %	25 %	50 %	121583346
45	NC_008760	GAAG	2	8	2249	2256	50 %	0 %	50 %	0 %	121583346
46	NC_008760	GC	3	6	2257	2262	0 %	0 %	50 %	50 %	121583346
47	NC_008760	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583346
48	NC_008760	GCCA	2	8	2352	2359	25 %	0 %	25 %	50 %	121583346
49	NC_008760	GCG	2	6	2389	2394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583346
50	NC_008760	TCC	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583346
51	NC_008760	CTG	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583346
52	NC_008760	GGC	2	6	2480	2485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583346
53	NC_008760	ATA	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583346
54	NC_008760	CA	3	6	2631	2636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008760	CTT	2	6	2723	2728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583347
56	NC_008760	GCTGC	2	10	2736	2745	0 %	20 %	40 %	40 %	121583347
57	NC_008760	AGA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583347
58	NC_008760	GCC	2	6	2901	2906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
59	NC_008760	GGC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
60	NC_008760	CTG	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
61	NC_008760	GCCGC	2	10	2934	2943	0 %	0 %	40 %	60 %	121583347
62	NC_008760	CCG	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
63	NC_008760	GCT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
64	NC_008760	GGC	2	6	3039	3044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
65	NC_008760	GCA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583347
66	NC_008760	GCTT	2	8	3091	3098	0 %	50 %	25 %	25 %	121583347
67	NC_008760	GCCA	2	8	3099	3106	25 %	0 %	25 %	50 %	121583347
68	NC_008760	GC	4	8	3141	3148	0 %	0 %	50 %	50 %	121583347
69	NC_008760	A	6	6	3273	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	121583347
70	NC_008760	GGT	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583347
71	NC_008760	TGC	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
72	NC_008760	GGCCG	2	10	3348	3357	0 %	0 %	60 %	40 %	121583347
73	NC_008760	CCG	3	9	3355	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
74	NC_008760	TCG	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
75	NC_008760	CTG	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
76	NC_008760	GCC	2	6	3429	3434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
77	NC_008760	TCG	2	6	3457	3462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583347
78	NC_008760	TGTT	2	8	3496	3503	0 %	75 %	25 %	0 %	121583347
79	NC_008760	GGC	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
80	NC_008760	GC	3	6	3526	3531	0 %	0 %	50 %	50 %	121583347
81	NC_008760	GGC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
82	NC_008760	T	6	6	3585	3590	0 %	100 %	0 %	0 %	121583347
83	NC_008760	GGC	2	6	3743	3748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
84	NC_008760	GGT	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583347
85	NC_008760	CATCTG	2	12	3810	3821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121583347
86	NC_008760	GCC	3	9	3858	3866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583347
87	NC_008760	TGCC	2	8	3867	3874	0 %	25 %	25 %	50 %	121583347
88	NC_008760	GGCC	2	8	3877	3884	0 %	0 %	50 %	50 %	121583347
89	NC_008760	GGGCC	2	10	3905	3914	0 %	0 %	60 %	40 %	121583347
90	NC_008760	AGC	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583347
91	NC_008760	GAC	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583347
92	NC_008760	CGG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583347
93	NC_008760	CG	3	6	4007	4012	0 %	0 %	50 %	50 %	121583347
94	NC_008760	CTT	2	6	4036	4041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583347
95	NC_008760	T	7	7	4044	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008760	CCAC	2	8	4059	4066	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_008760	GCA	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008760	CCG	3	9	4102	4110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
99	NC_008760	GCC	2	6	4161	4166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
100	NC_008760	TTCCC	2	10	4195	4204	0 %	40 %	0 %	60 %	121583348
101	NC_008760	GACG	2	8	4217	4224	25 %	0 %	50 %	25 %	121583348
102	NC_008760	TGG	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583348
103	NC_008760	GCC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
104	NC_008760	CAT	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583348
105	NC_008760	ACG	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583348
106	NC_008760	CTG	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
107	NC_008760	CAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583348
108	NC_008760	TCG	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
109	NC_008760	CCG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
110	NC_008760	CAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583348
111	NC_008760	CAC	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583348
112	NC_008760	GACC	2	8	4646	4653	25 %	0 %	25 %	50 %	121583348
113	NC_008760	GGGC	2	8	4658	4665	0 %	0 %	75 %	25 %	121583348
114	NC_008760	GCC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
115	NC_008760	CAC	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583348
116	NC_008760	GCT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
117	NC_008760	TCG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583348
118	NC_008760	CGC	2	6	4837	4842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
119	NC_008760	GCC	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583348
120	NC_008760	GC	3	6	5003	5008	0 %	0 %	50 %	50 %	121583348
121	NC_008760	GGC	2	6	5081	5086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008760	GCC	2	6	5092	5097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008760	GGC	2	6	5098	5103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008760	CGCC	2	8	5136	5143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_008760	CTG	2	6	5144	5149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008760	GGC	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008760	CGGC	2	8	5205	5212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008760	TGGCGC	2	12	5256	5267	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008760	TGC	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008760	CTCGC	2	10	5368	5377	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_008760	TGGC	2	8	5392	5399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008760	GC	3	6	5407	5412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008760	GCG	2	6	5534	5539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008760	TGC	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008760	CTG	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008760	GC	3	6	5581	5586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008760	CGG	2	6	5625	5630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008760	GCA	2	6	5634	5639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008760	GC	3	6	5643	5648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008760	GCG	2	6	5658	5663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008760	GCGG	2	8	5676	5683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008760	CGG	2	6	5694	5699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008760	GGC	3	9	5715	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008760	GCG	2	6	5750	5755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008760	GCAGCG	2	12	5756	5767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_008760	A	7	7	11113	11119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008760	ACGA	2	8	11139	11146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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270	NC_008760	CAGCA	2	10	12008	12017	40 %	0 %	20 %	40 %	121583355
271	NC_008760	GCG	2	6	12091	12096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583355
272	NC_008760	CG	3	6	12223	12228	0 %	0 %	50 %	50 %	121583355
273	NC_008760	CGC	2	6	12246	12251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583355
274	NC_008760	GAG	2	6	12343	12348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583355
275	NC_008760	TCA	2	6	12356	12361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583355
276	NC_008760	GC	3	6	12390	12395	0 %	0 %	50 %	50 %	121583356
277	NC_008760	AC	3	6	12397	12402	50 %	0 %	0 %	50 %	121583356
278	NC_008760	GGT	2	6	12451	12456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583356
279	NC_008760	CAG	2	6	12470	12475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583356
280	NC_008760	GC	3	6	12593	12598	0 %	0 %	50 %	50 %	121583356
281	NC_008760	TTC	2	6	12669	12674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583356
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286	NC_008760	GGCC	2	8	12837	12844	0 %	0 %	50 %	50 %	121583356
287	NC_008760	TCG	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583356
288	NC_008760	CGGTGC	2	12	12902	12913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121583356
289	NC_008760	ACA	2	6	12940	12945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583356
290	NC_008760	GGA	2	6	13033	13038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583356
291	NC_008760	CGT	3	9	13054	13062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583356
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293	NC_008760	GGCT	2	8	13084	13091	0 %	25 %	50 %	25 %	121583356
294	NC_008760	TCC	2	6	13092	13097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583356
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301	NC_008760	GCTC	2	8	13615	13622	0 %	25 %	25 %	50 %	121583357
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387	NC_008760	GCCG	2	8	18586	18593	0 %	0 %	50 %	50 %	121583362
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392	NC_008760	GTG	2	6	18814	18819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583362
393	NC_008760	GCC	2	6	18837	18842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583362
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397	NC_008760	GGCG	2	8	19027	19034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
398	NC_008760	TCA	2	6	19046	19051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_008760	TCC	2	6	19077	19082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
400	NC_008760	T	7	7	19127	19133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_008760	GAGC	2	8	19140	19147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
402	NC_008760	AAG	2	6	19148	19153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
403	NC_008760	ATAG	2	8	19226	19233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
404	NC_008760	CAT	2	6	19253	19258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_008760	CAG	2	6	19262	19267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_008760	CGC	2	6	19325	19330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
407	NC_008760	TTGG	2	8	19370	19377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
408	NC_008760	GAA	2	6	19386	19391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_008760	GAATG	2	10	19479	19488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
410	NC_008760	CGA	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_008760	CGT	2	6	19640	19645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_008760	AACC	2	8	19679	19686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
413	NC_008760	GTT	2	6	19705	19710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
414	NC_008760	TG	3	6	19801	19806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
415	NC_008760	GA	3	6	19808	19813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
416	NC_008760	ACTT	2	8	19835	19842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
417	NC_008760	TCAA	2	8	19878	19885	50 %	25 %	0 %	25 %	121583363
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420	NC_008760	CAT	2	6	19984	19989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583363
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425	NC_008760	CGG	2	6	20151	20156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583363
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434	NC_008760	GAA	2	6	20474	20479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583363
435	NC_008760	ACA	2	6	20514	20519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583363
436	NC_008760	TGC	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583363
437	NC_008760	CGG	2	6	20584	20589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583363
438	NC_008760	GC	3	6	20608	20613	0 %	0 %	50 %	50 %	121583363
439	NC_008760	CTGG	2	8	20931	20938	0 %	25 %	50 %	25 %	121583364
440	NC_008760	TG	3	6	20941	20946	0 %	50 %	50 %	0 %	121583364
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454	NC_008760	ACC	2	6	21636	21641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
455	NC_008760	A	7	7	21815	21821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_008760	CAG	2	6	21899	21904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_008760	GCG	2	6	22234	22239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_008760	GTG	2	6	22312	22317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
464	NC_008760	TGCA	2	8	22492	22499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_008760	AGC	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_008760	GC	3	6	22599	22604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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471	NC_008760	TCG	2	6	22722	22727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_008760	T	6	6	23297	23302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_008760	GCG	2	6	23810	23815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_008760	GCCC	2	8	23910	23917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_008760	CCGT	2	8	23918	23925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_008760	GCTT	2	8	24258	24265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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