MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008758	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008758	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008758	TG	3	6	90	95	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008758	A	6	6	118	123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008758	ATG	2	6	133	138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008758	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008758	GAA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008758	ATTG	2	8	407	414	25 %	50 %	25 %	0 %	121583018
9	NC_008758	T	6	6	422	427	0 %	100 %	0 %	0 %	121583018
10	NC_008758	GCC	2	6	492	497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583018
11	NC_008758	ATT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121583018
12	NC_008758	CTTG	2	8	627	634	0 %	50 %	25 %	25 %	121583018
13	NC_008758	ATT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008758	T	6	6	728	733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008758	ATCA	2	8	740	747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008758	CA	3	6	758	763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008758	A	6	6	763	768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008758	ACC	2	6	829	834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008758	A	6	6	840	845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008758	TGG	2	6	911	916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583019
21	NC_008758	CGT	2	6	935	940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583019
22	NC_008758	CAT	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583019
23	NC_008758	AGC	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583019
24	NC_008758	TGC	2	6	1040	1045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583019
25	NC_008758	CG	3	6	1055	1060	0 %	0 %	50 %	50 %	121583019
26	NC_008758	GTTC	2	8	1095	1102	0 %	50 %	25 %	25 %	121583019
27	NC_008758	CGG	2	6	1136	1141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583019
28	NC_008758	GC	3	6	1150	1155	0 %	0 %	50 %	50 %	121583019
29	NC_008758	GCC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583019
30	NC_008758	CGGC	2	8	1266	1273	0 %	0 %	50 %	50 %	121583019
31	NC_008758	CGGC	2	8	1347	1354	0 %	0 %	50 %	50 %	121583019
32	NC_008758	GAC	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583019
33	NC_008758	GAT	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583019
34	NC_008758	GC	3	6	1502	1507	0 %	0 %	50 %	50 %	121583019
35	NC_008758	GCT	2	6	1602	1607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583019
36	NC_008758	GAA	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583019
37	NC_008758	GCCGC	2	10	1740	1749	0 %	0 %	40 %	60 %	121583019
38	NC_008758	CAT	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583019
39	NC_008758	GAG	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583019
40	NC_008758	AGC	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583019
41	NC_008758	AGC	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583019
42	NC_008758	CTG	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583019
43	NC_008758	CCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583019
44	NC_008758	ACC	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583019
45	NC_008758	CCA	2	6	2064	2069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583019
46	NC_008758	CTG	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583019
47	NC_008758	GCT	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583020
48	NC_008758	T	6	6	2213	2218	0 %	100 %	0 %	0 %	121583020
49	NC_008758	GAC	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583020
50	NC_008758	CAG	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583020
51	NC_008758	CTGG	2	8	2474	2481	0 %	25 %	50 %	25 %	121583020
52	NC_008758	GCT	2	6	2504	2509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583020
53	NC_008758	CTG	2	6	2523	2528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583020
54	NC_008758	AGC	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583020
55	NC_008758	GCT	2	6	2570	2575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583020
56	NC_008758	AGC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583020
57	NC_008758	CGG	2	6	2638	2643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583020
58	NC_008758	CAGC	2	8	2683	2690	25 %	0 %	25 %	50 %	121583020
59	NC_008758	GAA	2	6	2697	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583020
60	NC_008758	ACC	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583020
61	NC_008758	CCA	2	6	2722	2727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583020
62	NC_008758	AGG	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583020
63	NC_008758	AAC	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583021
64	NC_008758	CTG	2	6	2879	2884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
65	NC_008758	GCG	2	6	2896	2901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583021
66	NC_008758	AAC	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583021
67	NC_008758	CTG	2	6	2972	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
68	NC_008758	ACG	2	6	2993	2998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
69	NC_008758	GTG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583021
70	NC_008758	GAC	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
71	NC_008758	CAG	2	6	3113	3118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
72	NC_008758	CGC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583021
73	NC_008758	GCCA	2	8	3260	3267	25 %	0 %	25 %	50 %	121583021
74	NC_008758	CGC	2	6	3359	3364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583021
75	NC_008758	GC	3	6	3463	3468	0 %	0 %	50 %	50 %	121583021
76	NC_008758	ATG	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583021
77	NC_008758	CAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
78	NC_008758	GCT	2	6	3523	3528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
79	NC_008758	CAG	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
80	NC_008758	CAG	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
81	NC_008758	ACA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583021
82	NC_008758	CGCCAG	2	12	3689	3700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121583021
83	NC_008758	AGC	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
84	NC_008758	TGCC	2	8	3757	3764	0 %	25 %	25 %	50 %	121583021
85	NC_008758	GC	3	6	3765	3770	0 %	0 %	50 %	50 %	121583021
86	NC_008758	GGA	3	9	3775	3783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583021
87	NC_008758	GCC	2	6	3801	3806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583021
88	NC_008758	AGC	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
89	NC_008758	CTG	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
90	NC_008758	CAG	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
91	NC_008758	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583021
92	NC_008758	TGC	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
93	NC_008758	GCTG	2	8	4059	4066	0 %	25 %	50 %	25 %	121583021
94	NC_008758	GGC	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583021
95	NC_008758	CGC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583021
96	NC_008758	CAG	2	6	4196	4201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
97	NC_008758	GCA	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
98	NC_008758	GGC	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583021
99	NC_008758	AGA	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583021
100	NC_008758	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583021
101	NC_008758	GGA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583021
102	NC_008758	CAC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583021
103	NC_008758	CGA	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
104	NC_008758	CTGG	2	8	4573	4580	0 %	25 %	50 %	25 %	121583021
105	NC_008758	ACC	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583021
106	NC_008758	GGGC	2	8	4699	4706	0 %	0 %	75 %	25 %	121583021
107	NC_008758	CGG	2	6	4726	4731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583021
108	NC_008758	CAT	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583021
109	NC_008758	CGC	2	6	4765	4770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583021
110	NC_008758	AGG	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583021
111	NC_008758	GGT	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583021
112	NC_008758	AGC	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
113	NC_008758	TCA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583021
114	NC_008758	GCG	2	6	5016	5021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583021
115	NC_008758	CGC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583021
116	NC_008758	AGGCG	2	10	5101	5110	20 %	0 %	60 %	20 %	121583021
117	NC_008758	CG	3	6	5109	5114	0 %	0 %	50 %	50 %	121583021
118	NC_008758	CTGC	2	8	5116	5123	0 %	25 %	25 %	50 %	121583021
119	NC_008758	TTTC	2	8	5134	5141	0 %	75 %	0 %	25 %	121583021
120	NC_008758	TCG	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
121	NC_008758	AGG	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583021
122	NC_008758	GCT	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583021
123	NC_008758	GC	3	6	5414	5419	0 %	0 %	50 %	50 %	121583021
124	NC_008758	CAG	2	6	5437	5442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
125	NC_008758	GGA	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583021
126	NC_008758	GCA	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583021
127	NC_008758	ATG	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583021
128	NC_008758	GGC	3	9	5589	5597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583022
129	NC_008758	GCT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583022
130	NC_008758	GCCAG	2	10	5648	5657	20 %	0 %	40 %	40 %	121583022
131	NC_008758	CG	3	6	5680	5685	0 %	0 %	50 %	50 %	121583022
132	NC_008758	GC	3	6	5698	5703	0 %	0 %	50 %	50 %	121583022
133	NC_008758	GC	3	6	5711	5716	0 %	0 %	50 %	50 %	121583022
134	NC_008758	TCA	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583022
135	NC_008758	ACC	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583022
136	NC_008758	GC	3	6	5838	5843	0 %	0 %	50 %	50 %	121583022
137	NC_008758	GCA	3	9	5864	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583022
138	NC_008758	CTG	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583022
139	NC_008758	CGGAGG	2	12	5954	5965	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	121583022
140	NC_008758	CGGC	2	8	6026	6033	0 %	0 %	50 %	50 %	121583022
141	NC_008758	GAC	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583022
142	NC_008758	CTGG	2	8	6087	6094	0 %	25 %	50 %	25 %	121583022
143	NC_008758	CCT	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583022
144	NC_008758	GCT	2	6	6186	6191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583022
145	NC_008758	TGGC	2	8	6196	6203	0 %	25 %	50 %	25 %	121583022
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148	NC_008758	GCAT	2	8	6587	6594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008758	CTTT	2	8	6617	6624	0 %	75 %	0 %	25 %	121583023
150	NC_008758	ATG	2	6	6737	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583023
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152	NC_008758	AGTC	2	8	6879	6886	25 %	25 %	25 %	25 %	121583023
153	NC_008758	GAA	2	6	6942	6947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008758	GGA	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008758	AGAA	2	8	6974	6981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008758	GTTT	2	8	7025	7032	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008758	GGA	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008758	ATCA	2	8	7146	7153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_008758	AAT	2	6	7161	7166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008758	A	7	7	7171	7177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008758	A	7	7	7217	7223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008758	A	6	6	7250	7255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008758	TGA	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583024
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192	NC_008758	CA	3	6	8829	8834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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254	NC_008758	GCA	2	6	11607	11612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_008758	GGT	2	6	11810	11815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008758	CG	3	6	11853	11858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
257	NC_008758	AGT	2	6	11874	11879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_008758	GTT	2	6	11955	11960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_008758	CCT	2	6	12021	12026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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266	NC_008758	ATG	2	6	12241	12246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583028
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269	NC_008758	CAC	2	6	12473	12478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_008758	TCCAT	2	10	12479	12488	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
271	NC_008758	CAA	2	6	12493	12498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_008758	GC	3	6	12508	12513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_008758	CAT	2	6	12640	12645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_008758	TCT	2	6	12654	12659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_008758	ATTA	2	8	12756	12763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_008758	GAA	2	6	12825	12830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583029
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279	NC_008758	TGC	2	6	13010	13015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583030
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283	NC_008758	CGTT	2	8	13325	13332	0 %	50 %	25 %	25 %	121583030
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288	NC_008758	CTG	2	6	13627	13632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583030
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297	NC_008758	GGC	2	6	13989	13994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583031
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303	NC_008758	GC	3	6	14435	14440	0 %	0 %	50 %	50 %	121583032
304	NC_008758	GCAGTG	2	12	14454	14465	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121583032
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344	NC_008758	CAG	2	6	16745	16750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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361	NC_008758	CACC	2	8	18030	18037	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
362	NC_008758	CCA	2	6	18073	18078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
363	NC_008758	CAT	2	6	18085	18090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583034
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386	NC_008758	GAG	2	6	19176	19181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
387	NC_008758	CAA	2	6	19286	19291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_008758	TGA	2	6	19305	19310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
389	NC_008758	AGC	2	6	19364	19369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583036
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395	NC_008758	TCA	2	6	19704	19709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583036
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397	NC_008758	GCA	2	6	19796	19801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583036
398	NC_008758	TTG	2	6	19906	19911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
399	NC_008758	A	6	6	20121	20126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_008758	GCT	2	6	20147	20152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583037
401	NC_008758	GTC	2	6	20154	20159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583037
402	NC_008758	CTT	2	6	20179	20184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583037
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451	NC_008758	A	7	7	22670	22676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008758	TGG	2	6	22781	22786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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