MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008758	CCA	2	6	142839	142844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583147
3002	NC_008758	GCG	2	6	142871	142876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583147
3003	NC_008758	AAG	2	6	142892	142897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583147
3004	NC_008758	GGCG	2	8	142990	142997	0 %	0 %	75 %	25 %	121583147
3005	NC_008758	GCAGG	2	10	143048	143057	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3006	NC_008758	GCA	2	6	143058	143063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_008758	GGC	2	6	143078	143083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_008758	TGCA	2	8	143101	143108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_008758	A	8	8	143127	143134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008758	GCT	2	6	143230	143235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_008758	CG	3	6	143240	143245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_008758	TGT	2	6	143285	143290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008758	GCA	2	6	143348	143353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008758	GGTT	2	8	143358	143365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008758	CAGC	3	12	143439	143450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_008758	GCT	2	6	143579	143584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008758	GC	3	6	143585	143590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_008758	GC	3	6	143611	143616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_008758	TCGG	2	8	143647	143654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_008758	CGG	2	6	143687	143692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_008758	ATG	2	6	143737	143742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008758	CG	3	6	143748	143753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_008758	GGGTGC	2	12	143773	143784	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3024	NC_008758	GT	4	8	143845	143852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008758	TTTTGT	2	12	143875	143886	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008758	GAG	2	6	143894	143899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008758	CAA	2	6	143912	143917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583148
3028	NC_008758	GCA	2	6	143963	143968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583148
3029	NC_008758	ATG	2	6	144009	144014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583148
3030	NC_008758	GGCTTT	2	12	144039	144050	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	121583148
3031	NC_008758	ACG	2	6	144064	144069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583148
3032	NC_008758	CAAGCG	2	12	144072	144083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583148
3033	NC_008758	GGGC	2	8	144113	144120	0 %	0 %	75 %	25 %	121583148
3034	NC_008758	GCA	2	6	144121	144126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583148
3035	NC_008758	TCC	2	6	144161	144166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583148
3036	NC_008758	CGG	2	6	144173	144178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3037	NC_008758	CGG	2	6	144182	144187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3038	NC_008758	GGC	2	6	144189	144194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3039	NC_008758	TGG	2	6	144224	144229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583148
3040	NC_008758	TGGCGG	2	12	144242	144253	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	121583148
3041	NC_008758	GGC	3	9	144261	144269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3042	NC_008758	CGG	2	6	144290	144295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3043	NC_008758	GGC	2	6	144309	144314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3044	NC_008758	GGT	5	15	144324	144338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583148
3045	NC_008758	CGG	2	6	144341	144346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583148
3046	NC_008758	CTA	2	6	144347	144352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583148
3047	NC_008758	T	6	6	144598	144603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008758	TGAT	2	8	144616	144623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008758	CA	3	6	144669	144674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_008758	C	6	6	144682	144687	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3051	NC_008758	CAGC	2	8	144768	144775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_008758	CAA	2	6	144830	144835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008758	TCC	3	9	144876	144884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583149
3054	NC_008758	CGC	2	6	144892	144897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583149
3055	NC_008758	CTG	2	6	145065	145070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583149
3056	NC_008758	ACG	2	6	145096	145101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583149
3057	NC_008758	TGG	2	6	145183	145188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583149
3058	NC_008758	TTC	2	6	145267	145272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583149
3059	NC_008758	GC	3	6	145289	145294	0 %	0 %	50 %	50 %	121583149
3060	NC_008758	GC	3	6	145330	145335	0 %	0 %	50 %	50 %	121583149
3061	NC_008758	CAA	2	6	145378	145383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583149
3062	NC_008758	CGAT	2	8	145396	145403	25 %	25 %	25 %	25 %	121583149
3063	NC_008758	TCGCC	2	10	145448	145457	0 %	20 %	20 %	60 %	121583149
3064	NC_008758	TGC	2	6	145588	145593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583149
3065	NC_008758	GC	3	6	145660	145665	0 %	0 %	50 %	50 %	121583149
3066	NC_008758	GCCGC	2	10	145731	145740	0 %	0 %	40 %	60 %	121583149
3067	NC_008758	GTCCA	2	10	145759	145768	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3068	NC_008758	CGCGC	2	10	145828	145837	0 %	0 %	40 %	60 %	121583150
3069	NC_008758	GCC	2	6	146030	146035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583150
3070	NC_008758	CAC	2	6	146045	146050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583150
3071	NC_008758	CTG	2	6	146106	146111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583150
3072	NC_008758	GCA	2	6	146225	146230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583150
3073	NC_008758	GGT	2	6	146312	146317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583150
3074	NC_008758	AAC	2	6	146359	146364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583150
3075	NC_008758	TGTC	2	8	146413	146420	0 %	50 %	25 %	25 %	121583150
3076	NC_008758	GCCTT	2	10	146475	146484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3077	NC_008758	AGC	2	6	146534	146539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_008758	A	6	6	146587	146592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008758	TTC	2	6	146671	146676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583151
3080	NC_008758	TCA	2	6	146753	146758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583151
3081	NC_008758	ATC	2	6	146784	146789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583151
3082	NC_008758	TGG	2	6	146822	146827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583151
3083	NC_008758	GAT	2	6	146961	146966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583151
3084	NC_008758	CAC	2	6	146967	146972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583151
3085	NC_008758	CATGG	2	10	147012	147021	20 %	20 %	40 %	20 %	121583151
3086	NC_008758	GAC	2	6	147022	147027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583151
3087	NC_008758	GGAA	2	8	147218	147225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008758	ATT	2	6	147249	147254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008758	TCA	2	6	147369	147374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_008758	CT	3	6	147387	147392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_008758	ACTGT	2	10	147428	147437	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3092	NC_008758	T	7	7	147437	147443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008758	ATG	2	6	147500	147505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583152
3094	NC_008758	CAT	2	6	147613	147618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583152
3095	NC_008758	GCT	2	6	147653	147658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583152
3096	NC_008758	TGG	2	6	147678	147683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583152
3097	NC_008758	GAC	2	6	147728	147733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583152
3098	NC_008758	TGG	2	6	147833	147838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583152
3099	NC_008758	ACA	2	6	147863	147868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583152
3100	NC_008758	T	6	6	147903	147908	0 %	100 %	0 %	0 %	121583152
3101	NC_008758	GAA	2	6	147914	147919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583152
3102	NC_008758	CG	3	6	147943	147948	0 %	0 %	50 %	50 %	121583152
3103	NC_008758	CT	3	6	147971	147976	0 %	50 %	0 %	50 %	121583152
3104	NC_008758	GAA	2	6	148094	148099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583152
3105	NC_008758	TACG	2	8	148159	148166	25 %	25 %	25 %	25 %	121583152
3106	NC_008758	GAC	2	6	148304	148309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583152
3107	NC_008758	GGAC	2	8	148332	148339	25 %	0 %	50 %	25 %	121583152
3108	NC_008758	CCG	2	6	148341	148346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583152
3109	NC_008758	GAT	2	6	148399	148404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583152
3110	NC_008758	CATTGA	2	12	148484	148495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	121583153
3111	NC_008758	AT	3	6	148523	148528	50 %	50 %	0 %	0 %	121583153
3112	NC_008758	GCAA	2	8	148567	148574	50 %	0 %	25 %	25 %	121583153
3113	NC_008758	TGGAC	2	10	148605	148614	20 %	20 %	40 %	20 %	121583153
3114	NC_008758	CGG	2	6	148619	148624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583153
3115	NC_008758	G	6	6	148623	148628	0 %	0 %	100 %	0 %	121583153
3116	NC_008758	CAAG	2	8	148669	148676	50 %	0 %	25 %	25 %	121583153
3117	NC_008758	GGCT	2	8	148755	148762	0 %	25 %	50 %	25 %	121583153
3118	NC_008758	GAA	2	6	148845	148850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583153
3119	NC_008758	A	9	9	148849	148857	100 %	0 %	0 %	0 %	121583153
3120	NC_008758	ATC	3	9	148926	148934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583153
3121	NC_008758	CTT	2	6	148991	148996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583153
3122	NC_008758	GC	3	6	149019	149024	0 %	0 %	50 %	50 %	121583153
3123	NC_008758	CGG	2	6	149026	149031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583153
3124	NC_008758	TCG	3	9	149038	149046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583153
3125	NC_008758	ACGCG	2	10	149077	149086	20 %	0 %	40 %	40 %	121583153
3126	NC_008758	GCGA	2	8	149157	149164	25 %	0 %	50 %	25 %	121583153
3127	NC_008758	AGT	2	6	149168	149173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583153
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3243	NC_008758	GCCT	2	8	155893	155900	0 %	25 %	25 %	50 %	121583156
3244	NC_008758	CAAG	2	8	155910	155917	50 %	0 %	25 %	25 %	121583156
3245	NC_008758	TCC	2	6	156020	156025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583156
3246	NC_008758	CGC	2	6	156037	156042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583156
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3248	NC_008758	CGA	2	6	156211	156216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583156
3249	NC_008758	GCT	2	6	156294	156299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583156
3250	NC_008758	CTT	2	6	156320	156325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583156
3251	NC_008758	TCG	2	6	156367	156372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583156
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3253	NC_008758	TCA	2	6	156455	156460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583156
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3255	NC_008758	TCA	2	6	156574	156579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583156
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3257	NC_008758	ATTT	2	8	156635	156642	25 %	75 %	0 %	0 %	121583156
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3259	NC_008758	TCTT	2	8	156778	156785	0 %	75 %	0 %	25 %	121583156
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3363	NC_008758	TGA	2	6	161616	161621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583157
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3367	NC_008758	CTG	2	6	161788	161793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583157
3368	NC_008758	A	6	6	161816	161821	100 %	0 %	0 %	0 %	121583157
3369	NC_008758	GTCA	2	8	161950	161957	25 %	25 %	25 %	25 %	121583157
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3371	NC_008758	CGA	2	6	162225	162230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583157
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3391	NC_008758	TAGC	2	8	163226	163233	25 %	25 %	25 %	25 %	121583158
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3491	NC_008758	A	7	7	169229	169235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_008758	GAT	2	6	169269	169274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3495	NC_008758	ATT	2	6	169496	169501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_008758	ATCT	2	8	169582	169589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3497	NC_008758	GTT	2	6	169594	169599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_008758	ACGT	2	8	169685	169692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3499	NC_008758	TTTC	2	8	169731	169738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3500	NC_008758	T	7	7	169797	169803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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