MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008758	GCA	2	6	119387	119392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2502	NC_008758	TTC	2	6	119397	119402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583126
2503	NC_008758	CGT	2	6	119453	119458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2504	NC_008758	GCGGT	2	10	119461	119470	0 %	20 %	60 %	20 %	121583126
2505	NC_008758	CAGC	2	8	119537	119544	25 %	0 %	25 %	50 %	121583126
2506	NC_008758	GC	4	8	119622	119629	0 %	0 %	50 %	50 %	121583126
2507	NC_008758	CCA	2	6	119687	119692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583126
2508	NC_008758	CCGG	2	8	119721	119728	0 %	0 %	50 %	50 %	121583126
2509	NC_008758	GCT	2	6	119738	119743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2510	NC_008758	GC	3	6	119745	119750	0 %	0 %	50 %	50 %	121583126
2511	NC_008758	GCT	2	6	119768	119773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2512	NC_008758	GGC	2	6	119796	119801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583126
2513	NC_008758	CAG	2	6	119877	119882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2514	NC_008758	TTC	2	6	119892	119897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583126
2515	NC_008758	GCTG	2	8	119918	119925	0 %	25 %	50 %	25 %	121583126
2516	NC_008758	GCTGC	2	10	119933	119942	0 %	20 %	40 %	40 %	121583126
2517	NC_008758	TTG	2	6	119983	119988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583126
2518	NC_008758	CTG	2	6	120000	120005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2519	NC_008758	GCGCC	2	10	120009	120018	0 %	0 %	40 %	60 %	121583126
2520	NC_008758	GC	3	6	120035	120040	0 %	0 %	50 %	50 %	121583126
2521	NC_008758	CTG	2	6	120072	120077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2522	NC_008758	GCA	2	6	120194	120199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2523	NC_008758	CAA	2	6	120201	120206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583126
2524	NC_008758	CAGTTC	2	12	120237	120248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	121583126
2525	NC_008758	CCG	2	6	120353	120358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583126
2526	NC_008758	GCCAGT	2	12	120367	120378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2527	NC_008758	GCAA	2	8	120409	120416	50 %	0 %	25 %	25 %	121583126
2528	NC_008758	TGC	2	6	120448	120453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2529	NC_008758	CGG	2	6	120575	120580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583126
2530	NC_008758	GGCG	2	8	120625	120632	0 %	0 %	75 %	25 %	121583127
2531	NC_008758	CTGG	2	8	120676	120683	0 %	25 %	50 %	25 %	121583127
2532	NC_008758	CTT	2	6	120684	120689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583127
2533	NC_008758	GC	3	6	120698	120703	0 %	0 %	50 %	50 %	121583127
2534	NC_008758	TTTC	2	8	120735	120742	0 %	75 %	0 %	25 %	121583127
2535	NC_008758	T	6	6	120753	120758	0 %	100 %	0 %	0 %	121583127
2536	NC_008758	GGTA	2	8	120770	120777	25 %	25 %	50 %	0 %	121583127
2537	NC_008758	GC	3	6	120864	120869	0 %	0 %	50 %	50 %	121583127
2538	NC_008758	GGC	2	6	120892	120897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583127
2539	NC_008758	CAG	2	6	120898	120903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583127
2540	NC_008758	GAAT	2	8	120935	120942	50 %	25 %	25 %	0 %	121583127
2541	NC_008758	CAAG	2	8	120972	120979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_008758	CAT	2	6	121007	121012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_008758	GCA	2	6	121044	121049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_008758	GGT	2	6	121087	121092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583128
2545	NC_008758	CTG	2	6	121247	121252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583128
2546	NC_008758	TCC	2	6	121263	121268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583128
2547	NC_008758	TTG	2	6	121304	121309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583128
2548	NC_008758	CAC	2	6	121311	121316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583128
2549	NC_008758	GCC	2	6	121345	121350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583128
2550	NC_008758	TGC	3	9	121387	121395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583128
2551	NC_008758	ACC	2	6	121411	121416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583128
2552	NC_008758	GTTT	2	8	121526	121533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_008758	TA	3	6	121534	121539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_008758	GCG	2	6	121545	121550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_008758	GCC	2	6	121634	121639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_008758	GCA	2	6	121647	121652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_008758	ACAA	2	8	121669	121676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_008758	CTGT	2	8	121758	121765	0 %	50 %	25 %	25 %	121583129
2559	NC_008758	CAT	2	6	121772	121777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583129
2560	NC_008758	GGC	2	6	121801	121806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583129
2561	NC_008758	CAA	2	6	121942	121947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583129
2562	NC_008758	TC	3	6	122138	122143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_008758	GCT	2	6	122149	122154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_008758	GCA	3	9	122164	122172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_008758	T	6	6	122201	122206	0 %	100 %	0 %	0 %	121583130
2566	NC_008758	GTT	2	6	122227	122232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583130
2567	NC_008758	AC	3	6	122243	122248	50 %	0 %	0 %	50 %	121583130
2568	NC_008758	GC	3	6	122252	122257	0 %	0 %	50 %	50 %	121583130
2569	NC_008758	CCA	2	6	122266	122271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583130
2570	NC_008758	ATG	2	6	122281	122286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583130
2571	NC_008758	GCC	2	6	122316	122321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583130
2572	NC_008758	TG	3	6	122369	122374	0 %	50 %	50 %	0 %	121583130
2573	NC_008758	ATG	2	6	122379	122384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583130
2574	NC_008758	GAC	2	6	122409	122414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583130
2575	NC_008758	CAA	2	6	122448	122453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583130
2576	NC_008758	TGGAAT	2	12	122462	122473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583130
2577	NC_008758	GC	3	6	122512	122517	0 %	0 %	50 %	50 %	121583130
2578	NC_008758	CCG	2	6	122526	122531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583130
2579	NC_008758	CTC	2	6	122580	122585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583130
2580	NC_008758	CAG	2	6	122589	122594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583130
2581	NC_008758	CT	3	6	122622	122627	0 %	50 %	0 %	50 %	121583130
2582	NC_008758	TTC	2	6	122724	122729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583130
2583	NC_008758	CAGCT	2	10	122754	122763	20 %	20 %	20 %	40 %	121583130
2584	NC_008758	TTC	2	6	122795	122800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583130
2585	NC_008758	CGA	2	6	122940	122945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583130
2586	NC_008758	GGC	2	6	122982	122987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583130
2587	NC_008758	GC	3	6	123024	123029	0 %	0 %	50 %	50 %	121583130
2588	NC_008758	GAG	4	12	123054	123065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583130
2589	NC_008758	GGT	2	6	123084	123089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583130
2590	NC_008758	AAAG	2	8	123133	123140	75 %	0 %	25 %	0 %	121583130
2591	NC_008758	GTA	2	6	123141	123146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583130
2592	NC_008758	CAA	2	6	123191	123196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583130
2593	NC_008758	CGC	2	6	123203	123208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583130
2594	NC_008758	CTG	2	6	123273	123278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583130
2595	NC_008758	ACA	2	6	123416	123421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583130
2596	NC_008758	GCA	3	9	123425	123433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583130
2597	NC_008758	CCG	2	6	123514	123519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583130
2598	NC_008758	A	6	6	123534	123539	100 %	0 %	0 %	0 %	121583130
2599	NC_008758	CGC	2	6	123643	123648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583131
2600	NC_008758	GTC	2	6	123668	123673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583131
2601	NC_008758	TCG	2	6	123681	123686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583131
2602	NC_008758	GC	3	6	123693	123698	0 %	0 %	50 %	50 %	121583131
2603	NC_008758	GCC	2	6	123700	123705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583131
2604	NC_008758	CGCC	2	8	123790	123797	0 %	0 %	25 %	75 %	121583131
2605	NC_008758	GC	3	6	123858	123863	0 %	0 %	50 %	50 %	121583131
2606	NC_008758	GC	3	6	123951	123956	0 %	0 %	50 %	50 %	121583131
2607	NC_008758	ATC	2	6	124001	124006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583131
2608	NC_008758	GTC	2	6	124034	124039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583131
2609	NC_008758	GCA	2	6	124126	124131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583131
2610	NC_008758	CCG	2	6	124168	124173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583131
2611	NC_008758	CCGT	2	8	124182	124189	0 %	25 %	25 %	50 %	121583131
2612	NC_008758	AAT	2	6	124243	124248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583131
2613	NC_008758	CCTTG	2	10	124296	124305	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2614	NC_008758	GCC	2	6	124343	124348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_008758	GCT	2	6	124392	124397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_008758	TGC	2	6	124484	124489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583132
2617	NC_008758	GGC	2	6	124647	124652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583132
2618	NC_008758	CGAG	2	8	124667	124674	25 %	0 %	50 %	25 %	121583132
2619	NC_008758	CCG	2	6	124808	124813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583132
2620	NC_008758	CGC	2	6	124887	124892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583133
2621	NC_008758	TTG	2	6	124897	124902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583133
2622	NC_008758	GGC	2	6	124926	124931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583133
2623	NC_008758	CAC	2	6	124959	124964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583133
2624	NC_008758	GGC	2	6	125097	125102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583133
2625	NC_008758	TGG	2	6	125177	125182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583133
2626	NC_008758	GAC	2	6	125184	125189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583133
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2630	NC_008758	ACC	2	6	125267	125272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_008758	ATC	2	6	125278	125283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_008758	CCTG	2	8	125471	125478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2633	NC_008758	ATG	2	6	125497	125502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2635	NC_008758	GC	3	6	125543	125548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2638	NC_008758	GCATG	2	10	125655	125664	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2692	NC_008758	GTT	2	6	129569	129574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2734	NC_008758	A	6	6	131284	131289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2743	NC_008758	CGTGG	2	10	131581	131590	0 %	20 %	60 %	20 %	121583138
2744	NC_008758	ACG	2	6	131602	131607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583138
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2746	NC_008758	GC	3	6	131728	131733	0 %	0 %	50 %	50 %	121583138
2747	NC_008758	GAA	2	6	131745	131750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583138
2748	NC_008758	GCT	2	6	131790	131795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583138
2749	NC_008758	CGAAT	2	10	131822	131831	40 %	20 %	20 %	20 %	121583138
2750	NC_008758	CCGGG	2	10	131835	131844	0 %	0 %	60 %	40 %	121583138
2751	NC_008758	CAG	3	9	131875	131883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583139
2752	NC_008758	GCC	2	6	131886	131891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583139
2753	NC_008758	TTG	2	6	131904	131909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583139
2754	NC_008758	GGT	2	6	131949	131954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583139
2755	NC_008758	GTC	2	6	132117	132122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583139
2756	NC_008758	CGG	2	6	132137	132142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583139
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2758	NC_008758	CCGG	2	8	132163	132170	0 %	0 %	50 %	50 %	121583139
2759	NC_008758	CG	3	6	132184	132189	0 %	0 %	50 %	50 %	121583139
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2773	NC_008758	GGC	2	6	132627	132632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583139
2774	NC_008758	CGCT	2	8	132666	132673	0 %	25 %	25 %	50 %	121583139
2775	NC_008758	GGCGC	2	10	132711	132720	0 %	0 %	60 %	40 %	121583139
2776	NC_008758	TCAG	2	8	132721	132728	25 %	25 %	25 %	25 %	121583139
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2779	NC_008758	TG	3	6	132836	132841	0 %	50 %	50 %	0 %	121583139
2780	NC_008758	GC	3	6	132870	132875	0 %	0 %	50 %	50 %	121583139
2781	NC_008758	CA	3	6	132950	132955	50 %	0 %	0 %	50 %	121583139
2782	NC_008758	ATC	2	6	133048	133053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583140
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2822	NC_008758	GCT	2	6	134697	134702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583140
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2825	NC_008758	CAAG	2	8	134778	134785	50 %	0 %	25 %	25 %	121583140
2826	NC_008758	CACG	2	8	134796	134803	25 %	0 %	25 %	50 %	121583140
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2833	NC_008758	TCG	2	6	135287	135292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583140
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2837	NC_008758	CGT	2	6	135504	135509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583140
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2843	NC_008758	GCT	2	6	135666	135671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583140
2844	NC_008758	GGC	2	6	135747	135752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583140
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2847	NC_008758	CTG	2	6	135940	135945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583140
2848	NC_008758	CGGTGG	2	12	135983	135994	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	121583140
2849	NC_008758	TCT	2	6	135998	136003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583140
2850	NC_008758	GCT	2	6	136023	136028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583140
2851	NC_008758	GAC	2	6	136093	136098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583140
2852	NC_008758	ATCA	2	8	136123	136130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2853	NC_008758	TCAC	2	8	136159	136166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2854	NC_008758	GCGCTT	2	12	136204	136215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583141
2855	NC_008758	ACT	2	6	136219	136224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583141
2856	NC_008758	G	7	7	136276	136282	0 %	0 %	100 %	0 %	121583141
2857	NC_008758	TGG	2	6	136283	136288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583141
2858	NC_008758	AGG	2	6	136424	136429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121583141
2859	NC_008758	TCA	2	6	136528	136533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583141
2860	NC_008758	AAGT	2	8	136552	136559	50 %	25 %	25 %	0 %	121583141
2861	NC_008758	GT	3	6	136585	136590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2862	NC_008758	CGGC	2	8	136666	136673	0 %	0 %	50 %	50 %	121583142
2863	NC_008758	CTC	2	6	136688	136693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583142
2864	NC_008758	CGT	2	6	136756	136761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583142
2865	NC_008758	CGG	2	6	136773	136778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583142
2866	NC_008758	GCA	2	6	136831	136836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583142
2867	NC_008758	GC	3	6	136839	136844	0 %	0 %	50 %	50 %	121583142
2868	NC_008758	GCT	2	6	136888	136893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583142
2869	NC_008758	CTT	2	6	136906	136911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583142
2870	NC_008758	CAGGG	2	10	136985	136994	20 %	0 %	60 %	20 %	121583142
2871	NC_008758	AGC	2	6	137019	137024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583142
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2873	NC_008758	CGGGCG	2	12	137138	137149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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