MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008758	TGCT	2	8	95870	95877	0 %	50 %	25 %	25 %	121583099
2002	NC_008758	CTA	2	6	95887	95892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583099
2003	NC_008758	CGC	2	6	95971	95976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583099
2004	NC_008758	CT	3	6	96009	96014	0 %	50 %	0 %	50 %	121583099
2005	NC_008758	GCA	2	6	96177	96182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583099
2006	NC_008758	GGC	2	6	96422	96427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583100
2007	NC_008758	CTC	2	6	96489	96494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121583100
2008	NC_008758	TGCCG	2	10	96625	96634	0 %	20 %	40 %	40 %	121583100
2009	NC_008758	CG	3	6	96732	96737	0 %	0 %	50 %	50 %	121583100
2010	NC_008758	CAT	2	6	96745	96750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583100
2011	NC_008758	CGAT	2	8	96786	96793	25 %	25 %	25 %	25 %	121583100
2012	NC_008758	GTG	2	6	96795	96800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583100
2013	NC_008758	TCGA	2	8	96914	96921	25 %	25 %	25 %	25 %	121583100
2014	NC_008758	GC	3	6	97061	97066	0 %	0 %	50 %	50 %	121583100
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2018	NC_008758	CG	3	6	97293	97298	0 %	0 %	50 %	50 %	121583100
2019	NC_008758	GAT	2	6	97306	97311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583100
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2021	NC_008758	CAT	2	6	97400	97405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583100
2022	NC_008758	CTG	2	6	97497	97502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583100
2023	NC_008758	CG	3	6	97527	97532	0 %	0 %	50 %	50 %	121583100
2024	NC_008758	ATC	2	6	97535	97540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583100
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2061	NC_008758	GCT	2	6	99212	99217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583101
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2107	NC_008758	GAT	2	6	101554	101559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_008758	GTCCG	2	10	101587	101596	0 %	20 %	40 %	40 %	121583104
2109	NC_008758	CAT	3	9	101604	101612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583104
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2111	NC_008758	CAG	2	6	101803	101808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_008758	T	7	7	101846	101852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2118	NC_008758	GTT	2	6	102147	102152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583106
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2121	NC_008758	GC	3	6	102256	102261	0 %	0 %	50 %	50 %	121583106
2122	NC_008758	TGC	2	6	102293	102298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583106
2123	NC_008758	GC	4	8	102346	102353	0 %	0 %	50 %	50 %	121583106
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2125	NC_008758	CTG	2	6	102544	102549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583106
2126	NC_008758	GGCCTG	2	12	102657	102668	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121583107
2127	NC_008758	CTGGG	2	10	102729	102738	0 %	20 %	60 %	20 %	121583107
2128	NC_008758	CGAGG	2	10	102798	102807	20 %	0 %	60 %	20 %	121583107
2129	NC_008758	CGT	2	6	102812	102817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583107
2130	NC_008758	AGC	2	6	102832	102837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583107
2131	NC_008758	GCT	2	6	102845	102850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583107
2132	NC_008758	GCG	2	6	102888	102893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583107
2133	NC_008758	GCG	2	6	102906	102911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583107
2134	NC_008758	TCA	2	6	102982	102987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_008758	CTG	2	6	103010	103015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583108
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2143	NC_008758	GAC	2	6	103261	103266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583108
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2172	NC_008758	CTCC	2	8	104161	104168	0 %	25 %	0 %	75 %	121583108
2173	NC_008758	ACAGC	2	10	104193	104202	40 %	0 %	20 %	40 %	121583108
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2185	NC_008758	T	6	6	104704	104709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2186	NC_008758	CTGG	2	8	104738	104745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2187	NC_008758	T	6	6	104766	104771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2193	NC_008758	TGC	2	6	104954	104959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2239	NC_008758	CATGG	2	10	107095	107104	20 %	20 %	40 %	20 %	121583112
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2241	NC_008758	T	6	6	107185	107190	0 %	100 %	0 %	0 %	121583112
2242	NC_008758	GT	3	6	107195	107200	0 %	50 %	50 %	0 %	121583112
2243	NC_008758	T	6	6	107200	107205	0 %	100 %	0 %	0 %	121583112
2244	NC_008758	CGAT	2	8	107217	107224	25 %	25 %	25 %	25 %	121583112
2245	NC_008758	GGC	2	6	107273	107278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_008758	TGC	2	6	107418	107423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583113
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2248	NC_008758	CTG	2	6	107482	107487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583113
2249	NC_008758	CAA	2	6	107579	107584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583113
2250	NC_008758	CTT	2	6	107696	107701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583114
2251	NC_008758	GCC	2	6	107745	107750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583114
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2253	NC_008758	TCG	2	6	107767	107772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583114
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2352	NC_008758	GGCT	2	8	112118	112125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2353	NC_008758	TGATTG	2	12	112130	112141	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2354	NC_008758	CTA	2	6	112161	112166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2355	NC_008758	TAG	2	6	112169	112174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2356	NC_008758	GCA	2	6	112446	112451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583120
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2360	NC_008758	GGT	2	6	112806	112811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583120
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2362	NC_008758	GCG	2	6	112882	112887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583120
2363	NC_008758	GTT	2	6	112899	112904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583120
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2366	NC_008758	GCT	2	6	112977	112982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583120
2367	NC_008758	CGG	2	6	113021	113026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583120
2368	NC_008758	GCT	2	6	113037	113042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583120
2369	NC_008758	CCGC	2	8	113060	113067	0 %	0 %	25 %	75 %	121583120
2370	NC_008758	CATGTG	2	12	113110	113121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121583120
2371	NC_008758	TGC	2	6	113129	113134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583120
2372	NC_008758	GCGT	2	8	113135	113142	0 %	25 %	50 %	25 %	121583120
2373	NC_008758	CGT	2	6	113169	113174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583120
2374	NC_008758	GCG	2	6	113279	113284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583120
2375	NC_008758	AGCG	2	8	113299	113306	25 %	0 %	50 %	25 %	121583120
2376	NC_008758	CGA	3	9	113315	113323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583120
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2378	NC_008758	GTG	2	6	113395	113400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583120
2379	NC_008758	TCA	2	6	113516	113521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583120
2380	NC_008758	GCG	2	6	113582	113587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583120
2381	NC_008758	GCG	2	6	113614	113619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583120
2382	NC_008758	TCA	2	6	113651	113656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583120
2383	NC_008758	GCC	2	6	113684	113689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583120
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2385	NC_008758	GCC	2	6	113749	113754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583120
2386	NC_008758	GC	3	6	113799	113804	0 %	0 %	50 %	50 %	121583120
2387	NC_008758	GCC	2	6	114004	114009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583120
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2390	NC_008758	TGG	2	6	114209	114214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583120
2391	NC_008758	AAG	2	6	114227	114232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583120
2392	NC_008758	GTG	2	6	114238	114243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583120
2393	NC_008758	GGCG	2	8	114249	114256	0 %	0 %	75 %	25 %	121583120
2394	NC_008758	ATTGCG	2	12	114376	114387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121583120
2395	NC_008758	GGCT	2	8	114499	114506	0 %	25 %	50 %	25 %	121583120
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2397	NC_008758	CGC	2	6	114598	114603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2398	NC_008758	CGC	2	6	114618	114623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2399	NC_008758	CAA	2	6	114624	114629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2400	NC_008758	AAGA	2	8	114657	114664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2401	NC_008758	TTTA	2	8	114723	114730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2402	NC_008758	CCAA	2	8	114731	114738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2403	NC_008758	ATG	2	6	114747	114752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583121
2404	NC_008758	A	7	7	114753	114759	100 %	0 %	0 %	0 %	121583121
2405	NC_008758	TAA	2	6	114761	114766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121583121
2406	NC_008758	CTG	2	6	114795	114800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583121
2407	NC_008758	CGT	2	6	114883	114888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583121
2408	NC_008758	CAA	2	6	114971	114976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583121
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2434	NC_008758	TGGC	2	8	116042	116049	0 %	25 %	50 %	25 %	121583122
2435	NC_008758	GCGA	2	8	116055	116062	25 %	0 %	50 %	25 %	121583122
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2439	NC_008758	AGG	2	6	116252	116257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2440	NC_008758	CCA	2	6	116286	116291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2441	NC_008758	A	6	6	116387	116392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2442	NC_008758	TCT	2	6	116478	116483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2443	NC_008758	CAG	2	6	116524	116529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2444	NC_008758	TGCGA	2	10	116582	116591	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2445	NC_008758	TTAA	2	8	116697	116704	50 %	50 %	0 %	0 %	121583123
2446	NC_008758	TGTC	2	8	116718	116725	0 %	50 %	25 %	25 %	121583123
2447	NC_008758	T	6	6	116745	116750	0 %	100 %	0 %	0 %	121583123
2448	NC_008758	GCTGCC	2	12	116924	116935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	121583123
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2451	NC_008758	TC	3	6	117062	117067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2452	NC_008758	GGCC	2	8	117087	117094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2453	NC_008758	CGT	2	6	117219	117224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583124
2454	NC_008758	GCAG	2	8	117237	117244	25 %	0 %	50 %	25 %	121583124
2455	NC_008758	GAT	2	6	117280	117285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583124
2456	NC_008758	TCG	2	6	117323	117328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583124
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2458	NC_008758	CTTG	2	8	117453	117460	0 %	50 %	25 %	25 %	121583124
2459	NC_008758	GTC	2	6	117490	117495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583124
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2462	NC_008758	AAACTA	2	12	117690	117701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2463	NC_008758	GCC	2	6	117716	117721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583125
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2465	NC_008758	GCC	2	6	117806	117811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583125
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2467	NC_008758	GCCG	2	8	117869	117876	0 %	0 %	50 %	50 %	121583125
2468	NC_008758	GAC	2	6	117935	117940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583125
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2470	NC_008758	TCA	2	6	117988	117993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583125
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2473	NC_008758	TCG	2	6	118200	118205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583125
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2476	NC_008758	GATGCG	2	12	118361	118372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	121583125
2477	NC_008758	TCG	2	6	118533	118538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583125
2478	NC_008758	TGCCT	2	10	118548	118557	0 %	40 %	20 %	40 %	121583125
2479	NC_008758	GGGT	2	8	118560	118567	0 %	25 %	75 %	0 %	121583125
2480	NC_008758	CAT	2	6	118580	118585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583125
2481	NC_008758	TCG	2	6	118608	118613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583125
2482	NC_008758	GGT	2	6	118621	118626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583125
2483	NC_008758	ACC	2	6	118809	118814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2484	NC_008758	CAC	2	6	118886	118891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2485	NC_008758	CCA	2	6	118900	118905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2486	NC_008758	GTT	2	6	118925	118930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583125
2487	NC_008758	ACC	2	6	118965	118970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2488	NC_008758	GGC	2	6	118981	118986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583125
2489	NC_008758	GCG	2	6	119002	119007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583125
2490	NC_008758	CAGG	2	8	119041	119048	25 %	0 %	50 %	25 %	121583125
2491	NC_008758	GCAGCC	2	12	119073	119084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121583125
2492	NC_008758	CCG	2	6	119086	119091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583125
2493	NC_008758	GCGCCA	2	12	119100	119111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121583125
2494	NC_008758	TTC	2	6	119122	119127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583125
2495	NC_008758	CCA	2	6	119206	119211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583126
2496	NC_008758	CTG	2	6	119213	119218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2497	NC_008758	CAGC	2	8	119264	119271	25 %	0 %	25 %	50 %	121583126
2498	NC_008758	GCCA	2	8	119281	119288	25 %	0 %	25 %	50 %	121583126
2499	NC_008758	CTG	2	6	119292	119297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
2500	NC_008758	CAA	2	6	119349	119354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583126

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