MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14 chromosome

Total Repeats: 167639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008463	GCG	2	6	658432	658437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054315
17002	NC_008463	CAT	2	6	658485	658490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054315
17003	NC_008463	GC	3	6	658496	658501	0 %	0 %	50 %	50 %	116054315
17004	NC_008463	GCC	2	6	658515	658520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17005	NC_008463	AGA	2	6	658535	658540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054315
17006	NC_008463	CTC	3	9	658542	658550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054315
17007	NC_008463	TGGTG	2	10	658568	658577	0 %	40 %	60 %	0 %	116054315
17008	NC_008463	TCT	2	6	658598	658603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054315
17009	NC_008463	GAA	2	6	658638	658643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054315
17010	NC_008463	GCT	2	6	658730	658735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17011	NC_008463	CAG	2	6	658740	658745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17012	NC_008463	GC	4	8	658791	658798	0 %	0 %	50 %	50 %	116054315
17013	NC_008463	TTC	2	6	658851	658856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054315
17014	NC_008463	CG	3	6	658887	658892	0 %	0 %	50 %	50 %	116054315
17015	NC_008463	GCC	2	6	658908	658913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17016	NC_008463	CGT	2	6	658982	658987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17017	NC_008463	TCC	2	6	659089	659094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054315
17018	NC_008463	GTC	2	6	659115	659120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17019	NC_008463	CGC	2	6	659129	659134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17020	NC_008463	GCC	3	9	659148	659156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17021	NC_008463	GCC	2	6	659160	659165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17022	NC_008463	CGC	2	6	659168	659173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17023	NC_008463	GGGC	2	8	659179	659186	0 %	0 %	75 %	25 %	116054315
17024	NC_008463	CGG	2	6	659198	659203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054315
17025	NC_008463	TTG	2	6	659212	659217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054315
17026	NC_008463	GAC	2	6	659226	659231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17027	NC_008463	GCC	2	6	659237	659242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17028	NC_008463	CGC	2	6	659243	659248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054315
17029	NC_008463	GCA	2	6	659258	659263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17030	NC_008463	TCG	2	6	659269	659274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054315
17031	NC_008463	CCT	2	6	659342	659347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054315
17032	NC_008463	CTT	2	6	659355	659360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054315
17033	NC_008463	CTC	2	6	659456	659461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17034	NC_008463	CGGAG	2	10	659481	659490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17035	NC_008463	ACT	2	6	659550	659555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054316
17036	NC_008463	CAG	2	6	659587	659592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17037	NC_008463	CTG	2	6	659653	659658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17038	NC_008463	TCC	2	6	659660	659665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054316
17039	NC_008463	TGA	2	6	659688	659693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054316
17040	NC_008463	TCT	3	9	659724	659732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054316
17041	NC_008463	CAGC	2	8	659761	659768	25 %	0 %	25 %	50 %	116054316
17042	NC_008463	GTT	2	6	659782	659787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054316
17043	NC_008463	GGCGCG	2	12	659791	659802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17044	NC_008463	CGG	2	6	659853	659858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17045	NC_008463	TCT	2	6	659868	659873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054316
17046	NC_008463	GCG	2	6	659891	659896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17047	NC_008463	TCCTGG	2	12	659933	659944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17048	NC_008463	GCG	2	6	660054	660059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17049	NC_008463	TGA	2	6	660072	660077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054316
17050	NC_008463	CTG	2	6	660127	660132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17051	NC_008463	TCG	2	6	660245	660250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17052	NC_008463	GC	3	6	660414	660419	0 %	0 %	50 %	50 %	116054316
17053	NC_008463	GCAG	2	8	660486	660493	25 %	0 %	50 %	25 %	116054316
17054	NC_008463	GTT	2	6	660535	660540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054316
17055	NC_008463	TTG	3	9	660542	660550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054316
17056	NC_008463	ATG	2	6	660590	660595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054316
17057	NC_008463	AGGGC	2	10	660603	660612	20 %	0 %	60 %	20 %	116054316
17058	NC_008463	TGT	2	6	660630	660635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054316
17059	NC_008463	CAG	2	6	660658	660663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17060	NC_008463	CGA	2	6	660699	660704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17061	NC_008463	CGT	2	6	660762	660767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17062	NC_008463	TCC	2	6	660779	660784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054316
17063	NC_008463	GTT	2	6	660829	660834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054316
17064	NC_008463	TCG	2	6	660836	660841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17065	NC_008463	TGGCGA	2	12	660855	660866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116054316
17066	NC_008463	CGC	2	6	660918	660923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054316
17067	NC_008463	TCC	2	6	660995	661000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054316
17068	NC_008463	TCG	2	6	661019	661024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17069	NC_008463	GCG	2	6	661041	661046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17070	NC_008463	GGA	2	6	661120	661125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116054316
17071	NC_008463	CCG	3	9	661130	661138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054316
17072	NC_008463	CTT	2	6	661165	661170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054316
17073	NC_008463	CTC	2	6	661171	661176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054316
17074	NC_008463	CGA	2	6	661206	661211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054316
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17076	NC_008463	GCG	2	6	661261	661266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17077	NC_008463	TTG	2	6	661274	661279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054316
17078	NC_008463	CAG	2	6	661345	661350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054316
17079	NC_008463	CGG	3	9	661356	661364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054316
17080	NC_008463	TGTCT	2	10	661375	661384	0 %	60 %	20 %	20 %	116054316
17081	NC_008463	CTCG	2	8	661482	661489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17082	NC_008463	GTGCGG	2	12	661517	661528	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17083	NC_008463	G	7	7	661527	661533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_008463	GCCA	2	8	661536	661543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17085	NC_008463	GTTC	2	8	661680	661687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17086	NC_008463	GAA	2	6	661702	661707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17087	NC_008463	GA	3	6	661712	661717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17088	NC_008463	T	7	7	661726	661732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_008463	GCG	2	6	661742	661747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17090	NC_008463	CGC	2	6	661763	661768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054317
17091	NC_008463	GCC	2	6	661809	661814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054317
17092	NC_008463	CTG	2	6	661842	661847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054317
17093	NC_008463	GGC	3	9	661857	661865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054317
17094	NC_008463	CTGG	2	8	661869	661876	0 %	25 %	50 %	25 %	116054317
17095	NC_008463	ACC	3	9	661894	661902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054317
17096	NC_008463	CGG	3	9	661919	661927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054317
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17098	NC_008463	GGC	2	6	662140	662145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054318
17099	NC_008463	GC	4	8	662157	662164	0 %	0 %	50 %	50 %	116054318
17100	NC_008463	CGC	2	6	662193	662198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054318
17101	NC_008463	CAG	2	6	662209	662214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17102	NC_008463	CG	3	6	662222	662227	0 %	0 %	50 %	50 %	116054318
17103	NC_008463	TCG	2	6	662267	662272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17104	NC_008463	GCC	2	6	662288	662293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054318
17105	NC_008463	GAT	2	6	662305	662310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054318
17106	NC_008463	CGC	2	6	662316	662321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054318
17107	NC_008463	GCG	2	6	662364	662369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054318
17108	NC_008463	CCTT	2	8	662381	662388	0 %	50 %	0 %	50 %	116054318
17109	NC_008463	AGT	2	6	662439	662444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054318
17110	NC_008463	CTT	2	6	662479	662484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054318
17111	NC_008463	GTC	2	6	662542	662547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17112	NC_008463	TGCT	2	8	662554	662561	0 %	50 %	25 %	25 %	116054318
17113	NC_008463	GC	3	6	662573	662578	0 %	0 %	50 %	50 %	116054318
17114	NC_008463	G	6	6	662606	662611	0 %	0 %	100 %	0 %	116054318
17115	NC_008463	GTT	2	6	662640	662645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054318
17116	NC_008463	CGT	2	6	662646	662651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17117	NC_008463	GCA	2	6	662655	662660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17118	NC_008463	CTT	2	6	662734	662739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054318
17119	NC_008463	CAG	2	6	662767	662772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17120	NC_008463	ACC	2	6	662801	662806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054318
17121	NC_008463	CAG	2	6	662920	662925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054318
17122	NC_008463	TGC	2	6	663074	663079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054319
17123	NC_008463	GT	3	6	663115	663120	0 %	50 %	50 %	0 %	116054319
17124	NC_008463	GC	3	6	663122	663127	0 %	0 %	50 %	50 %	116054319
17125	NC_008463	GCCGTC	2	12	663186	663197	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116054319
17126	NC_008463	TGA	2	6	663200	663205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054319
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17128	NC_008463	AGGCGA	2	12	663266	663277	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116054319
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17131	NC_008463	ACC	2	6	663571	663576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054320
17132	NC_008463	GGC	2	6	663610	663615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054320
17133	NC_008463	GCG	2	6	663659	663664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054320
17134	NC_008463	CGC	2	6	663749	663754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054320
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17139	NC_008463	TGT	2	6	663860	663865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054320
17140	NC_008463	CGC	2	6	663896	663901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054320
17141	NC_008463	CCA	2	6	663905	663910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054320
17142	NC_008463	CAG	2	6	664041	664046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054320
17143	NC_008463	CAG	2	6	664083	664088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054320
17144	NC_008463	ATGG	2	8	664107	664114	25 %	25 %	50 %	0 %	116054320
17145	NC_008463	GGA	2	6	664118	664123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116054320
17146	NC_008463	GC	4	8	664173	664180	0 %	0 %	50 %	50 %	116054320
17147	NC_008463	CCG	2	6	664312	664317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17148	NC_008463	CAG	2	6	664319	664324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054321
17149	NC_008463	GCC	2	6	664331	664336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054321
17150	NC_008463	GAT	2	6	664435	664440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054321
17151	NC_008463	CGG	2	6	664464	664469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054321
17152	NC_008463	CGGC	2	8	664569	664576	0 %	0 %	50 %	50 %	116054321
17153	NC_008463	GGA	2	6	664743	664748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116054321
17154	NC_008463	GC	3	6	664750	664755	0 %	0 %	50 %	50 %	116054321
17155	NC_008463	TCG	2	6	664772	664777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054321
17156	NC_008463	GGTG	2	8	664809	664816	0 %	25 %	75 %	0 %	116054321
17157	NC_008463	CAT	2	6	664852	664857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054321
17158	NC_008463	CAC	2	6	664858	664863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054321
17159	NC_008463	CGGTG	2	10	664948	664957	0 %	20 %	60 %	20 %	116054321
17160	NC_008463	ATC	2	6	664958	664963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054321
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17164	NC_008463	GGC	2	6	665122	665127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054321
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17166	NC_008463	TGGCGA	2	12	665196	665207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116054321
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17168	NC_008463	TCG	2	6	665326	665331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17169	NC_008463	TCG	2	6	665362	665367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17170	NC_008463	CTG	2	6	665397	665402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17171	NC_008463	GCT	2	6	665418	665423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17172	NC_008463	TCA	2	6	665513	665518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054322
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17174	NC_008463	TGC	2	6	665747	665752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17175	NC_008463	CGC	2	6	665753	665758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054322
17176	NC_008463	GAT	2	6	665778	665783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054322
17177	NC_008463	GCC	2	6	665787	665792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054322
17178	NC_008463	GGC	2	6	665868	665873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054322
17179	NC_008463	CGC	2	6	665891	665896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054322
17180	NC_008463	GCCG	2	8	665913	665920	0 %	0 %	50 %	50 %	116054322
17181	NC_008463	GCT	2	6	665963	665968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17182	NC_008463	GCCT	2	8	665983	665990	0 %	25 %	25 %	50 %	116054322
17183	NC_008463	GCG	2	6	665992	665997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054322
17184	NC_008463	CGAGG	2	10	666090	666099	20 %	0 %	60 %	20 %	116054322
17185	NC_008463	CCT	2	6	666110	666115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054322
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17188	NC_008463	CTG	3	9	666333	666341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
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17190	NC_008463	CTG	2	6	666372	666377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17191	NC_008463	GCG	2	6	666401	666406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054322
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17194	NC_008463	CGA	2	6	666491	666496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054322
17195	NC_008463	TGC	2	6	666543	666548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054322
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17199	NC_008463	CAG	3	9	666770	666778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054323
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17202	NC_008463	TGA	2	6	666900	666905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054323
17203	NC_008463	GTC	2	6	666907	666912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
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17213	NC_008463	CGT	2	6	667770	667775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
17214	NC_008463	TCGA	2	8	667804	667811	25 %	25 %	25 %	25 %	116054323
17215	NC_008463	CGAA	2	8	667814	667821	50 %	0 %	25 %	25 %	116054323
17216	NC_008463	GGT	3	9	667915	667923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054323
17217	NC_008463	GTTG	2	8	667992	667999	0 %	50 %	50 %	0 %	116054323
17218	NC_008463	ACGT	2	8	668000	668007	25 %	25 %	25 %	25 %	116054323
17219	NC_008463	TGC	2	6	668010	668015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
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17221	NC_008463	GGT	2	6	668107	668112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054323
17222	NC_008463	CAGC	2	8	668128	668135	25 %	0 %	25 %	50 %	116054323
17223	NC_008463	GCT	2	6	668212	668217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
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17225	NC_008463	CGT	2	6	668289	668294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
17226	NC_008463	AGT	2	6	668313	668318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054323
17227	NC_008463	TGC	2	6	668352	668357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
17228	NC_008463	CGG	2	6	668365	668370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054323
17229	NC_008463	GGC	2	6	668385	668390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054323
17230	NC_008463	GTC	2	6	668392	668397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
17231	NC_008463	GTT	2	6	668500	668505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054323
17232	NC_008463	TGC	2	6	668526	668531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
17233	NC_008463	ATG	3	9	668567	668575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054323
17234	NC_008463	GC	3	6	668601	668606	0 %	0 %	50 %	50 %	116054323
17235	NC_008463	ACC	2	6	668696	668701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054323
17236	NC_008463	CGC	2	6	668742	668747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054323
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17238	NC_008463	TGC	2	6	668793	668798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
17239	NC_008463	TCG	2	6	668888	668893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054323
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17353	NC_008463	CTT	2	6	673032	673037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17354	NC_008463	TTCC	2	8	673097	673104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17355	NC_008463	CGT	2	6	673142	673147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054328
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17473	NC_008463	T	6	6	677470	677475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17475	NC_008463	CT	3	6	677521	677526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17476	NC_008463	GCCG	2	8	677528	677535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17500	NC_008463	GA	3	6	678757	678762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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