MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14 chromosome

Total Repeats: 167639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008463	GAC	2	6	484100	484105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054152
12502	NC_008463	GGC	2	6	484178	484183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054152
12503	NC_008463	TGC	2	6	484224	484229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054152
12504	NC_008463	CGG	2	6	484309	484314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054152
12505	NC_008463	TCG	2	6	484324	484329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054152
12506	NC_008463	CGG	2	6	484351	484356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054152
12507	NC_008463	GC	3	6	484498	484503	0 %	0 %	50 %	50 %	116054152
12508	NC_008463	GCCA	2	8	484505	484512	25 %	0 %	25 %	50 %	116054152
12509	NC_008463	GC	3	6	484554	484559	0 %	0 %	50 %	50 %	116054152
12510	NC_008463	TGG	2	6	484563	484568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054152
12511	NC_008463	CGA	2	6	484593	484598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054152
12512	NC_008463	CGG	2	6	484600	484605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054152
12513	NC_008463	GAA	3	9	484609	484617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054152
12514	NC_008463	GATT	2	8	484646	484653	25 %	50 %	25 %	0 %	116054152
12515	NC_008463	CGCCGG	2	12	484659	484670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_008463	T	6	6	484716	484721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_008463	GC	3	6	484893	484898	0 %	0 %	50 %	50 %	116054153
12518	NC_008463	TGG	2	6	484899	484904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054153
12519	NC_008463	GGCCTG	2	12	484919	484930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116054153
12520	NC_008463	ACC	2	6	484965	484970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054153
12521	NC_008463	CTG	2	6	485003	485008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054153
12522	NC_008463	CTG	2	6	485018	485023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054153
12523	NC_008463	CGC	3	9	485052	485060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054153
12524	NC_008463	GCT	3	9	485128	485136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054153
12525	NC_008463	TCG	2	6	485145	485150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054153
12526	NC_008463	CCG	2	6	485169	485174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054153
12527	NC_008463	CCTGG	2	10	485272	485281	0 %	20 %	40 %	40 %	116054153
12528	NC_008463	TGG	2	6	485286	485291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054153
12529	NC_008463	TCC	2	6	485301	485306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054153
12530	NC_008463	GCC	2	6	485315	485320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054153
12531	NC_008463	TCG	2	6	485334	485339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054153
12532	NC_008463	CGACC	2	10	485344	485353	20 %	0 %	20 %	60 %	116054153
12533	NC_008463	TCG	2	6	485375	485380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054153
12534	NC_008463	CAA	2	6	485387	485392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116054153
12535	NC_008463	GAA	2	6	485418	485423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054154
12536	NC_008463	CCG	2	6	485462	485467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054154
12537	NC_008463	AAGG	2	8	485500	485507	50 %	0 %	50 %	0 %	116054154
12538	NC_008463	GCTG	2	8	485552	485559	0 %	25 %	50 %	25 %	116054154
12539	NC_008463	CGA	2	6	485598	485603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054154
12540	NC_008463	GAA	2	6	485604	485609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054154
12541	NC_008463	CAAGGT	2	12	485622	485633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116054154
12542	NC_008463	ACCA	2	8	485659	485666	50 %	0 %	0 %	50 %	116054154
12543	NC_008463	CGA	2	6	485847	485852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054154
12544	NC_008463	GGC	2	6	485860	485865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054154
12545	NC_008463	GCT	3	9	485955	485963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054154
12546	NC_008463	GAG	2	6	486096	486101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116054155
12547	NC_008463	TCC	2	6	486121	486126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054155
12548	NC_008463	AAC	2	6	486142	486147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116054155
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12550	NC_008463	TGG	2	6	486184	486189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054155
12551	NC_008463	TCG	2	6	486202	486207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054155
12552	NC_008463	CGG	2	6	486253	486258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054155
12553	NC_008463	TTC	2	6	486266	486271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054155
12554	NC_008463	GTT	2	6	486353	486358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116054155
12555	NC_008463	CGGG	2	8	486386	486393	0 %	0 %	75 %	25 %	116054155
12556	NC_008463	GCTC	2	8	486419	486426	0 %	25 %	25 %	50 %	116054155
12557	NC_008463	TGCC	2	8	486704	486711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12558	NC_008463	TTC	2	6	486712	486717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_008463	AACG	2	8	486779	486786	50 %	0 %	25 %	25 %	116054156
12560	NC_008463	CTG	2	6	486814	486819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054156
12561	NC_008463	GCC	3	9	486861	486869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054156
12562	NC_008463	GCCGG	2	10	486936	486945	0 %	0 %	60 %	40 %	116054156
12563	NC_008463	CAT	2	6	486990	486995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054156
12564	NC_008463	AAGG	2	8	487012	487019	50 %	0 %	50 %	0 %	116054156
12565	NC_008463	GCA	2	6	487038	487043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054156
12566	NC_008463	GCT	2	6	487137	487142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054156
12567	NC_008463	AGCA	2	8	487162	487169	50 %	0 %	25 %	25 %	116054156
12568	NC_008463	GCC	2	6	487189	487194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054156
12569	NC_008463	GGC	2	6	487209	487214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054156
12570	NC_008463	GGCCA	2	10	487318	487327	20 %	0 %	40 %	40 %	116054156
12571	NC_008463	CTG	2	6	487393	487398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054156
12572	NC_008463	GC	3	6	487434	487439	0 %	0 %	50 %	50 %	116054156
12573	NC_008463	GGA	2	6	487473	487478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116054156
12574	NC_008463	GCC	2	6	487502	487507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054156
12575	NC_008463	CGA	2	6	487530	487535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054156
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12578	NC_008463	GTTC	2	8	487602	487609	0 %	50 %	25 %	25 %	116054156
12579	NC_008463	GCA	2	6	487656	487661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054156
12580	NC_008463	TGG	2	6	487700	487705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054156
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12582	NC_008463	CGC	2	6	487893	487898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054156
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12584	NC_008463	CCG	2	6	488059	488064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054157
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12586	NC_008463	GCA	2	6	488198	488203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12587	NC_008463	CCAGGT	2	12	488250	488261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12588	NC_008463	GCT	2	6	488289	488294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12589	NC_008463	GAA	2	6	488340	488345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054157
12590	NC_008463	TGG	2	6	488354	488359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054157
12591	NC_008463	GCA	2	6	488381	488386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12592	NC_008463	AGC	2	6	488551	488556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12593	NC_008463	TCC	2	6	488584	488589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054157
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12598	NC_008463	GGC	2	6	488752	488757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054157
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12601	NC_008463	GGT	2	6	488934	488939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054157
12602	NC_008463	GGCGA	2	10	488974	488983	20 %	0 %	60 %	20 %	116054157
12603	NC_008463	TCC	2	6	488984	488989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054157
12604	NC_008463	GGT	2	6	489060	489065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054157
12605	NC_008463	GCT	2	6	489066	489071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12606	NC_008463	CGC	2	6	489090	489095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054157
12607	NC_008463	TGG	2	6	489155	489160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054157
12608	NC_008463	ACG	2	6	489161	489166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12609	NC_008463	GTG	3	9	489172	489180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054157
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12611	NC_008463	GC	3	6	489232	489237	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12612	NC_008463	GC	3	6	489260	489265	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12613	NC_008463	CGG	2	6	489290	489295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054157
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12615	NC_008463	GGC	2	6	489319	489324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054157
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12617	NC_008463	CCA	2	6	489506	489511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054157
12618	NC_008463	GGCGT	2	10	489529	489538	0 %	20 %	60 %	20 %	116054157
12619	NC_008463	CG	3	6	489553	489558	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12620	NC_008463	CTG	2	6	489565	489570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12621	NC_008463	GTG	2	6	489577	489582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054157
12622	NC_008463	GAT	2	6	489594	489599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054157
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12624	NC_008463	CGA	2	6	489636	489641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12625	NC_008463	CCG	2	6	489676	489681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054157
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12627	NC_008463	CTG	2	6	489733	489738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12628	NC_008463	GCCG	2	8	489793	489800	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12629	NC_008463	TCA	2	6	489824	489829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054157
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12632	NC_008463	CTT	2	6	489903	489908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054157
12633	NC_008463	CGC	2	6	489941	489946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054157
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12636	NC_008463	GC	3	6	490033	490038	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12637	NC_008463	CGC	2	6	490056	490061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054157
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12639	NC_008463	CGA	3	9	490131	490139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
12640	NC_008463	GCAGG	2	10	490257	490266	20 %	0 %	60 %	20 %	116054157
12641	NC_008463	CG	3	6	490272	490277	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12642	NC_008463	GAC	2	6	490288	490293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
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12645	NC_008463	GAG	2	6	490531	490536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116054157
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12648	NC_008463	GGC	2	6	490602	490607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054157
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12650	NC_008463	GC	3	6	490670	490675	0 %	0 %	50 %	50 %	116054157
12651	NC_008463	ACG	2	6	490706	490711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054157
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12663	NC_008463	CGTC	2	8	491060	491067	0 %	25 %	25 %	50 %	116054157
12664	NC_008463	TCCT	2	8	491093	491100	0 %	50 %	0 %	50 %	116054158
12665	NC_008463	GCT	2	6	491133	491138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054158
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12690	NC_008463	TTC	2	6	492020	492025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054158
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12695	NC_008463	CG	4	8	492256	492263	0 %	0 %	50 %	50 %	116054158
12696	NC_008463	CGA	2	6	492313	492318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054158
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12699	NC_008463	GCA	3	9	492406	492414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054158
12700	NC_008463	ACCG	2	8	492422	492429	25 %	0 %	25 %	50 %	116054158
12701	NC_008463	CGG	3	9	492472	492480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054158
12702	NC_008463	CAG	2	6	492488	492493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054158
12703	NC_008463	CAG	3	9	492503	492511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054158
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12705	NC_008463	T	7	7	492585	492591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12706	NC_008463	CGG	2	6	492606	492611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12707	NC_008463	CAG	2	6	492652	492657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054159
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12710	NC_008463	CGG	2	6	492705	492710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054159
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12713	NC_008463	GGC	2	6	492762	492767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054159
12714	NC_008463	GCT	2	6	492771	492776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054159
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12717	NC_008463	GC	3	6	492863	492868	0 %	0 %	50 %	50 %	116054159
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12721	NC_008463	CTG	2	6	492970	492975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12722	NC_008463	CTG	2	6	492997	493002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12723	NC_008463	GCGTCC	2	12	493012	493023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116054159
12724	NC_008463	GTC	3	9	493084	493092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12725	NC_008463	GCT	2	6	493176	493181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12726	NC_008463	GGCC	2	8	493188	493195	0 %	0 %	50 %	50 %	116054159
12727	NC_008463	CGG	2	6	493226	493231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054159
12728	NC_008463	GCCG	2	8	493237	493244	0 %	0 %	50 %	50 %	116054159
12729	NC_008463	GCT	2	6	493324	493329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12730	NC_008463	CGCGG	2	10	493344	493353	0 %	0 %	60 %	40 %	116054159
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12732	NC_008463	GCA	2	6	493398	493403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12733	NC_008463	TCT	2	6	493458	493463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116054159
12734	NC_008463	AGC	2	6	493475	493480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054159
12735	NC_008463	CCA	2	6	493497	493502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116054159
12736	NC_008463	TCGCC	2	10	493509	493518	0 %	20 %	20 %	60 %	116054159
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12858	NC_008463	GGC	4	12	498576	498587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054163
12859	NC_008463	GCT	2	6	498719	498724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054163
12860	NC_008463	GCG	2	6	498738	498743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054163
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12866	NC_008463	GC	3	6	498940	498945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12867	NC_008463	AGGCCT	2	12	498962	498973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12870	NC_008463	CGC	2	6	499074	499079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12874	NC_008463	CGCAG	2	10	499120	499129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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12886	NC_008463	CGCC	2	8	499597	499604	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12887	NC_008463	CGC	2	6	499655	499660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12941	NC_008463	CGC	2	6	501846	501851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054165
12942	NC_008463	TAC	2	6	501854	501859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054165
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12945	NC_008463	TACCTG	2	12	501927	501938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116054166
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12947	NC_008463	GCT	2	6	501961	501966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12948	NC_008463	CTG	2	6	501969	501974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
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12952	NC_008463	GACG	2	8	502188	502195	25 %	0 %	50 %	25 %	116054166
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12961	NC_008463	GCG	2	6	502501	502506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054166
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12973	NC_008463	CTG	3	9	502944	502952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12974	NC_008463	CGG	2	6	502954	502959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054166
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12976	NC_008463	CTG	2	6	502995	503000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12977	NC_008463	GCG	2	6	503001	503006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054166
12978	NC_008463	CG	3	6	503010	503015	0 %	0 %	50 %	50 %	116054166
12979	NC_008463	CTG	2	6	503016	503021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12980	NC_008463	TAC	2	6	503070	503075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054166
12981	NC_008463	CG	3	6	503077	503082	0 %	0 %	50 %	50 %	116054166
12982	NC_008463	ATG	2	6	503094	503099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116054166
12983	NC_008463	GCG	2	6	503111	503116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054166
12984	NC_008463	CGA	2	6	503141	503146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12985	NC_008463	GCG	2	6	503182	503187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054166
12986	NC_008463	GGT	2	6	503189	503194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054166
12987	NC_008463	CGA	2	6	503204	503209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12988	NC_008463	GCTG	2	8	503227	503234	0 %	25 %	50 %	25 %	116054166
12989	NC_008463	GCT	2	6	503267	503272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12990	NC_008463	CGG	2	6	503318	503323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116054166
12991	NC_008463	TGG	2	6	503326	503331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116054166
12992	NC_008463	GCT	2	6	503344	503349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116054166
12993	NC_008463	GCC	2	6	503374	503379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054166
12994	NC_008463	CGC	2	6	503424	503429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12995	NC_008463	CA	4	8	503486	503493	50 %	0 %	0 %	50 %	116054167
12996	NC_008463	CCG	3	9	503504	503512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054167
12997	NC_008463	GCC	2	6	503535	503540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116054167
12998	NC_008463	GAA	2	6	503595	503600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116054167
12999	NC_008463	ACT	3	9	503626	503634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116054167
13000	NC_008463	TCC	2	6	503665	503670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116054167

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