MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas sp. JS666 plasmid 2

Total Repeats: 6956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007950	GTTTC	2	10	60	69	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007950	CATG	2	8	100	107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007950	TGC	2	6	126	131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007950	CAAA	2	8	170	177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007950	TGC	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791059
6	NC_007950	GCT	2	6	472	477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791059
7	NC_007950	CCG	2	6	493	498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791059
8	NC_007950	GCAGC	2	10	595	604	20 %	0 %	40 %	40 %	91791059
9	NC_007950	CGCT	2	8	665	672	0 %	25 %	25 %	50 %	91791059
10	NC_007950	GCCCT	2	10	683	692	0 %	20 %	20 %	60 %	91791059
11	NC_007950	ACCGC	2	10	747	756	20 %	0 %	20 %	60 %	91791059
12	NC_007950	ATC	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791059
13	NC_007950	GAGC	2	8	787	794	25 %	0 %	50 %	25 %	91791059
14	NC_007950	ACG	2	6	824	829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791059
15	NC_007950	TGC	2	6	861	866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791059
16	NC_007950	GGC	2	6	888	893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791059
17	NC_007950	GCGCC	2	10	904	913	0 %	0 %	40 %	60 %	91791059
18	NC_007950	GC	3	6	962	967	0 %	0 %	50 %	50 %	91791059
19	NC_007950	GGTCAG	2	12	979	990	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91791059
20	NC_007950	ATC	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791059
21	NC_007950	TGG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791059
22	NC_007950	ACT	2	6	1205	1210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791059
23	NC_007950	AAC	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791060
24	NC_007950	ACG	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791060
25	NC_007950	TCA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791060
26	NC_007950	TGG	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791060
27	NC_007950	GCC	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791060
28	NC_007950	CCCG	2	8	1456	1463	0 %	0 %	25 %	75 %	91791060
29	NC_007950	ACA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91791060
30	NC_007950	CGC	2	6	1516	1521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791060
31	NC_007950	CTATGC	2	12	1531	1542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91791060
32	NC_007950	CGG	2	6	1543	1548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791060
33	NC_007950	GCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791060
34	NC_007950	CGA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791060
35	NC_007950	TGC	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791060
36	NC_007950	GC	3	6	1720	1725	0 %	0 %	50 %	50 %	91791060
37	NC_007950	GGCA	2	8	1764	1771	25 %	0 %	50 %	25 %	91791060
38	NC_007950	GGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791060
39	NC_007950	GC	3	6	1872	1877	0 %	0 %	50 %	50 %	91791060
40	NC_007950	CAT	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791060
41	NC_007950	CCCA	2	8	1963	1970	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_007950	CTG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007950	C	6	6	2026	2031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_007950	ATG	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007950	GTC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007950	CAA	2	6	2144	2149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007950	TCA	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007950	TCG	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007950	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007950	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007950	GCA	2	6	2375	2380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007950	CGA	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007950	GCA	2	6	2399	2404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007950	GTT	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791061
55	NC_007950	CGT	3	9	2508	2516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791061
56	NC_007950	TCG	2	6	2558	2563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791061
57	NC_007950	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791061
58	NC_007950	GC	4	8	2584	2591	0 %	0 %	50 %	50 %	91791061
59	NC_007950	CCGG	3	12	2648	2659	0 %	0 %	50 %	50 %	91791061
60	NC_007950	CG	3	6	2660	2665	0 %	0 %	50 %	50 %	91791061
61	NC_007950	GGTGCC	2	12	2683	2694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91791061
62	NC_007950	GC	3	6	2744	2749	0 %	0 %	50 %	50 %	91791061
63	NC_007950	GGC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791061
64	NC_007950	GCC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
65	NC_007950	CGC	2	6	2975	2980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
66	NC_007950	CAG	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791062
67	NC_007950	CCG	3	9	3046	3054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
68	NC_007950	CGC	2	6	3119	3124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
69	NC_007950	CAG	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791062
70	NC_007950	GGC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791062
71	NC_007950	CCG	3	9	3385	3393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
72	NC_007950	TCGA	2	8	3460	3467	25 %	25 %	25 %	25 %	91791062
73	NC_007950	TGG	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791062
74	NC_007950	CCG	2	6	3488	3493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
75	NC_007950	GCC	2	6	3502	3507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
76	NC_007950	GCT	2	6	3539	3544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791062
77	NC_007950	GGT	2	6	3549	3554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791062
78	NC_007950	GCC	2	6	3580	3585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
79	NC_007950	GCC	2	6	3594	3599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
80	NC_007950	CGG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791062
81	NC_007950	GCC	2	6	3653	3658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
82	NC_007950	CGGC	2	8	3724	3731	0 %	0 %	50 %	50 %	91791062
83	NC_007950	CGC	2	6	3744	3749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
84	NC_007950	GCC	2	6	3777	3782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791062
85	NC_007950	CGG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791062
86	NC_007950	CAG	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791062
87	NC_007950	CCA	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91791062
88	NC_007950	CGA	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791062
89	NC_007950	T	6	6	4035	4040	0 %	100 %	0 %	0 %	91791062
90	NC_007950	TTC	2	6	4071	4076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007950	GGTG	2	8	4191	4198	0 %	25 %	75 %	0 %	91791063
92	NC_007950	GTC	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791063
93	NC_007950	GCT	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91791063
94	NC_007950	CG	3	6	4329	4334	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
95	NC_007950	CGG	2	6	4367	4372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791063
96	NC_007950	GCA	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791063
97	NC_007950	CTCGAC	2	12	4407	4418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	91791063
98	NC_007950	CGC	2	6	4433	4438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791063
99	NC_007950	GAT	3	9	4443	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791063
100	NC_007950	CCGG	2	8	4461	4468	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
101	NC_007950	GC	3	6	4497	4502	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
102	NC_007950	ATC	2	6	4530	4535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91791063
103	NC_007950	CCT	2	6	4604	4609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91791063
104	NC_007950	CGA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791063
105	NC_007950	GC	3	6	4786	4791	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
106	NC_007950	GC	3	6	4814	4819	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
107	NC_007950	GAT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791063
108	NC_007950	GCC	2	6	4903	4908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791063
109	NC_007950	GCA	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791063
110	NC_007950	CA	3	6	5059	5064	50 %	0 %	0 %	50 %	91791063
111	NC_007950	CGA	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791063
112	NC_007950	GC	3	6	5135	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
113	NC_007950	GGT	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91791063
114	NC_007950	GGC	2	6	5201	5206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791063
115	NC_007950	GCG	2	6	5250	5255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791063
116	NC_007950	CGC	2	6	5291	5296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791063
117	NC_007950	GCA	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791063
118	NC_007950	CG	3	6	5378	5383	0 %	0 %	50 %	50 %	91791063
119	NC_007950	GCAG	2	8	5480	5487	25 %	0 %	50 %	25 %	91791063
120	NC_007950	CCA	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91791063
121	NC_007950	GCC	2	6	5563	5568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791063
122	NC_007950	GCA	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791063
123	NC_007950	GGTC	2	8	5648	5655	0 %	25 %	50 %	25 %	91791063
124	NC_007950	GGC	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791063
125	NC_007950	TTG	2	6	5713	5718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791063
126	NC_007950	GCC	2	6	5727	5732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791063
127	NC_007950	TTG	2	6	5742	5747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791063
128	NC_007950	TGT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91791063
129	NC_007950	CG	3	6	5979	5984	0 %	0 %	50 %	50 %	91791064
130	NC_007950	CGG	2	6	5989	5994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791064
131	NC_007950	GC	3	6	6042	6047	0 %	0 %	50 %	50 %	91791064
132	NC_007950	GC	3	6	6055	6060	0 %	0 %	50 %	50 %	91791064
133	NC_007950	GCC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791064
134	NC_007950	GCGT	2	8	6108	6115	0 %	25 %	50 %	25 %	91791064
135	NC_007950	GAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791064
136	NC_007950	CAG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91791064
137	NC_007950	GAT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91791064
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387	NC_007950	CGG	2	6	15274	15279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791073
388	NC_007950	GGAT	2	8	15330	15337	25 %	25 %	50 %	0 %	91791073
389	NC_007950	GCG	2	6	15351	15356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791073
390	NC_007950	CG	3	6	15355	15360	0 %	0 %	50 %	50 %	91791073
391	NC_007950	GC	3	6	15395	15400	0 %	0 %	50 %	50 %	91791073
392	NC_007950	CGC	2	6	15476	15481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791073
393	NC_007950	GCG	2	6	15500	15505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91791073
394	NC_007950	CG	3	6	15504	15509	0 %	0 %	50 %	50 %	91791073
395	NC_007950	GGCA	2	8	15523	15530	25 %	0 %	50 %	25 %	91791073
396	NC_007950	CGC	2	6	15535	15540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91791073
397	NC_007950	TG	3	6	15575	15580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
398	NC_007950	GCGTT	2	10	15591	15600	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
399	NC_007950	GAA	2	6	15639	15644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91791074
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401	NC_007950	TCCT	2	8	15663	15670	0 %	50 %	0 %	50 %	91791074
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