MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A large plasmid

Total Repeats: 2336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007274	CGG	2	6	34	39	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007274	AC	3	6	92	97	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007274	TTC	2	6	195	200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725177
4	NC_007274	C	7	7	233	239	0 %	0 %	0 %	100 %	71725177
5	NC_007274	CTG	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725177
6	NC_007274	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725266
7	NC_007274	CG	3	6	453	458	0 %	0 %	50 %	50 %	71725266
8	NC_007274	CGA	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725266
9	NC_007274	CTGG	2	8	552	559	0 %	25 %	50 %	25 %	71725266
10	NC_007274	TGCCG	2	10	666	675	0 %	20 %	40 %	40 %	71725266
11	NC_007274	CAC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725266
12	NC_007274	TGC	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725266
13	NC_007274	TGG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725266
14	NC_007274	GAC	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725266
15	NC_007274	GTCA	2	8	919	926	25 %	25 %	25 %	25 %	71725266
16	NC_007274	CGCGAG	2	12	985	996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	71725266
17	NC_007274	GTTC	2	8	1001	1008	0 %	50 %	25 %	25 %	71725266
18	NC_007274	GCTC	2	8	1022	1029	0 %	25 %	25 %	50 %	71725266
19	NC_007274	ATGCGT	2	12	1031	1042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71725266
20	NC_007274	GTC	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725266
21	NC_007274	GGC	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725266
22	NC_007274	CCGCG	2	10	1272	1281	0 %	0 %	40 %	60 %	71725266
23	NC_007274	GCAG	2	8	1283	1290	25 %	0 %	50 %	25 %	71725266
24	NC_007274	ACC	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725266
25	NC_007274	CTG	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725266
26	NC_007274	ATG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725266
27	NC_007274	ATG	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725266
28	NC_007274	ATC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007274	TGC	2	6	1910	1915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007274	ACC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007274	CTG	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007274	TG	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007274	AGGT	2	8	1982	1989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007274	T	6	6	2047	2052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007274	TCT	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007274	CCA	2	6	2129	2134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007274	GCG	3	9	2184	2192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007274	CAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007274	GCC	2	6	2253	2258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007274	GCC	2	6	2311	2316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007274	GCC	2	6	2355	2360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007274	CGC	2	6	2405	2410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007274	GGC	2	6	2413	2418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007274	GCC	2	6	2435	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007274	AGC	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007274	AGA	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007274	GCC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007274	CTC	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007274	GAG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007274	GT	3	6	2576	2581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007274	AGC	3	9	2599	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007274	ATG	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007274	CTG	2	6	2672	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007274	ATG	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007274	CGC	2	6	2890	2895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725226
56	NC_007274	ATG	2	6	2928	2933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725226
57	NC_007274	GATC	2	8	2959	2966	25 %	25 %	25 %	25 %	71725226
58	NC_007274	TGC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725263
59	NC_007274	GGT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725263
60	NC_007274	GAT	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725263
61	NC_007274	AGCGC	2	10	3073	3082	20 %	0 %	40 %	40 %	71725263
62	NC_007274	CCT	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71725263
63	NC_007274	AGG	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71725263
64	NC_007274	TGG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725263
65	NC_007274	TGG	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007274	GCT	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007274	CAC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725178
68	NC_007274	TTG	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725178
69	NC_007274	TGGGT	2	10	3613	3622	0 %	40 %	60 %	0 %	71725178
70	NC_007274	TGA	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725178
71	NC_007274	GTC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725178
72	NC_007274	CCG	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
73	NC_007274	GCAT	2	8	3832	3839	25 %	25 %	25 %	25 %	71725178
74	NC_007274	CTG	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725178
75	NC_007274	CGC	2	6	3964	3969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
76	NC_007274	TAG	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725178
77	NC_007274	GGC	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725178
78	NC_007274	CAG	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725178
79	NC_007274	TG	3	6	4117	4122	0 %	50 %	50 %	0 %	71725178
80	NC_007274	TTC	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725178
81	NC_007274	GTCA	2	8	4292	4299	25 %	25 %	25 %	25 %	71725178
82	NC_007274	C	6	6	4355	4360	0 %	0 %	0 %	100 %	71725178
83	NC_007274	TCT	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725178
84	NC_007274	CCA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725178
85	NC_007274	CGC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
86	NC_007274	ATCA	2	8	4484	4491	50 %	25 %	0 %	25 %	71725178
87	NC_007274	CGC	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
88	NC_007274	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	71725178
89	NC_007274	TCG	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725178
90	NC_007274	CGG	2	6	4738	4743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725178
91	NC_007274	ACT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725178
92	NC_007274	GCC	2	6	4923	4928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
93	NC_007274	CGC	2	6	5018	5023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
94	NC_007274	CCTA	2	8	5054	5061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007274	T	6	6	5062	5067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007274	ATGA	2	8	5092	5099	50 %	25 %	25 %	0 %	71725190
97	NC_007274	AAC	2	6	5209	5214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007274	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007274	CT	3	6	5293	5298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007274	ATTG	2	8	5300	5307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007274	GCC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725161
102	NC_007274	AGT	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725161
103	NC_007274	ATGC	2	8	5547	5554	25 %	25 %	25 %	25 %	71725161
104	NC_007274	TTGG	2	8	5659	5666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007274	CCA	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007274	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007274	G	10	10	5745	5754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007274	C	6	6	5780	5785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_007274	GCC	2	6	5860	5865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007274	CTC	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007274	CG	3	6	5915	5920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007274	GTC	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007274	CG	3	6	5957	5962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007274	TCC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007274	CTG	2	6	6152	6157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007274	TCT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007274	A	9	9	6240	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007274	AAT	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007274	ATT	3	9	6284	6292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007274	T	6	6	6357	6362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007274	G	7	7	6415	6421	0 %	0 %	100 %	0 %	71725191
122	NC_007274	TC	3	6	6475	6480	0 %	50 %	0 %	50 %	71725191
123	NC_007274	TGC	2	6	6518	6523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725191
124	NC_007274	GTCC	2	8	6539	6546	0 %	25 %	25 %	50 %	71725191
125	NC_007274	CGC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725191
126	NC_007274	CGA	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725191
127	NC_007274	CTG	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725191
128	NC_007274	CGA	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725191
129	NC_007274	CGG	2	6	6652	6657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725191
130	NC_007274	GAAT	2	8	6658	6665	50 %	25 %	25 %	0 %	71725191
131	NC_007274	TC	3	6	6709	6714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007274	GTG	2	6	6743	6748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007274	CAGC	2	8	6836	6843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007274	GCGA	2	8	6899	6906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007274	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007274	GT	3	6	7018	7023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007274	GTG	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007274	GTCT	2	8	7070	7077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007274	CA	3	6	7102	7107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007274	CAACA	2	10	7168	7177	60 %	0 %	0 %	40 %	71725170
141	NC_007274	ATTTCA	2	12	7368	7379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71725170
142	NC_007274	TCTG	2	8	7418	7425	0 %	50 %	25 %	25 %	71725170
143	NC_007274	TAA	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71725170
144	NC_007274	C	6	6	7572	7577	0 %	0 %	0 %	100 %	71725170
145	NC_007274	TCT	2	6	7597	7602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725170
146	NC_007274	TC	3	6	7641	7646	0 %	50 %	0 %	50 %	71725170
147	NC_007274	GGTC	2	8	7742	7749	0 %	25 %	50 %	25 %	71725170
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150	NC_007274	TCG	2	6	7960	7965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725170
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152	NC_007274	TTGA	2	8	8059	8066	25 %	50 %	25 %	0 %	71725170
153	NC_007274	GGC	2	6	8077	8082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725170
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160	NC_007274	CAG	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725170
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166	NC_007274	AAT	2	6	8539	8544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71725170
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172	NC_007274	CAATC	2	10	8916	8925	40 %	20 %	0 %	40 %	71725170
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179	NC_007274	GCC	2	6	9552	9557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725175
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266	NC_007274	ATG	2	6	14470	14475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_007274	AGG	2	6	14816	14821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_007274	A	7	7	15244	15250	100 %	0 %	0 %	0 %	71725235
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281	NC_007274	ATT	2	6	15303	15308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71725235
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295	NC_007274	A	8	8	15814	15821	100 %	0 %	0 %	0 %	71725235
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416	NC_007274	A	6	6	22449	22454	100 %	0 %	0 %	0 %	71725260
417	NC_007274	CGG	2	6	22519	22524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725260
418	NC_007274	GTG	2	6	22551	22556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725260
419	NC_007274	CCTC	2	8	22565	22572	0 %	25 %	0 %	75 %	71725260
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421	NC_007274	CGG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_007274	CGG	2	6	22977	22982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725247
423	NC_007274	ACTG	2	8	23195	23202	25 %	25 %	25 %	25 %	71725247
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451	NC_007274	GC	4	8	24633	24640	0 %	0 %	50 %	50 %	71725247
452	NC_007274	GCA	2	6	24794	24799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725247
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454	NC_007274	T	7	7	24851	24857	0 %	100 %	0 %	0 %	71725247
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457	NC_007274	TAAT	2	8	24964	24971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_007274	GC	3	6	25001	25006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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463	NC_007274	GAT	2	6	25165	25170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725255
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477	NC_007274	ACCG	2	8	26021	26028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_007274	TAT	2	6	26298	26303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_007274	CCT	2	6	26334	26339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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