MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23003	NC_007005	GAT	2	6	1142612	1142617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044260
23004	NC_007005	GTC	2	6	1142618	1142623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044260
23005	NC_007005	CAC	2	6	1142639	1142644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044260
23006	NC_007005	ATG	2	6	1142697	1142702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044260
23007	NC_007005	GCG	2	6	1142714	1142719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044260
23008	NC_007005	GC	3	6	1142749	1142754	0 %	0 %	50 %	50 %	66044260
23009	NC_007005	AGC	2	6	1142757	1142762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044260
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23119	NC_007005	T	7	7	1148669	1148675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23120	NC_007005	CGTG	2	8	1148728	1148735	0 %	25 %	50 %	25 %	66044268
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23235	NC_007005	GA	3	6	1154197	1154202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23236	NC_007005	CGA	2	6	1154255	1154260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044276
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23357	NC_007005	GCC	2	6	1160718	1160723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044282
23358	NC_007005	CGA	2	6	1160757	1160762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044282
23359	NC_007005	GCT	2	6	1160833	1160838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044282
23360	NC_007005	CAT	2	6	1160861	1160866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044282
23361	NC_007005	TTC	2	6	1160880	1160885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044282
23362	NC_007005	GC	3	6	1160906	1160911	0 %	0 %	50 %	50 %	66044282
23363	NC_007005	CGT	2	6	1160926	1160931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044282
23364	NC_007005	GC	3	6	1160949	1160954	0 %	0 %	50 %	50 %	66044282
23365	NC_007005	CGG	2	6	1161021	1161026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044282
23366	NC_007005	CTG	2	6	1161065	1161070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044282
23367	NC_007005	TTCG	2	8	1161095	1161102	0 %	50 %	25 %	25 %	66044282
23368	NC_007005	GCCGG	2	10	1161171	1161180	0 %	0 %	60 %	40 %	66044282
23369	NC_007005	GAA	2	6	1161219	1161224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044282
23370	NC_007005	CAG	2	6	1161242	1161247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044282
23371	NC_007005	GCT	2	6	1161276	1161281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23372	NC_007005	GCA	2	6	1161348	1161353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23373	NC_007005	GCGG	2	8	1161396	1161403	0 %	0 %	75 %	25 %	66044283
23374	NC_007005	CAG	2	6	1161439	1161444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23375	NC_007005	CAG	2	6	1161457	1161462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23376	NC_007005	CAG	2	6	1161469	1161474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23377	NC_007005	CTGG	2	8	1161482	1161489	0 %	25 %	50 %	25 %	66044283
23378	NC_007005	ACC	2	6	1161506	1161511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044283
23379	NC_007005	CGA	2	6	1161531	1161536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23380	NC_007005	CTG	2	6	1161592	1161597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
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23382	NC_007005	GGC	2	6	1161639	1161644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044283
23383	NC_007005	CATT	2	8	1161651	1161658	25 %	50 %	0 %	25 %	66044283
23384	NC_007005	GCAG	2	8	1161681	1161688	25 %	0 %	50 %	25 %	66044283
23385	NC_007005	TGT	2	6	1161708	1161713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044283
23386	NC_007005	TCG	2	6	1161788	1161793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23387	NC_007005	AGCC	2	8	1161794	1161801	25 %	0 %	25 %	50 %	66044283
23388	NC_007005	TCAG	2	8	1161848	1161855	25 %	25 %	25 %	25 %	66044283
23389	NC_007005	TCG	2	6	1161872	1161877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23390	NC_007005	ACA	2	6	1161894	1161899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044283
23391	NC_007005	CGG	2	6	1161914	1161919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044283
23392	NC_007005	CCA	2	6	1161999	1162004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044283
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23394	NC_007005	TGC	2	6	1162085	1162090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23395	NC_007005	GGT	2	6	1162105	1162110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044283
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23399	NC_007005	GGT	2	6	1162183	1162188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044283
23400	NC_007005	CAG	2	6	1162249	1162254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23401	NC_007005	ATG	2	6	1162277	1162282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044283
23402	NC_007005	CAC	2	6	1162297	1162302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044283
23403	NC_007005	CAG	2	6	1162321	1162326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23404	NC_007005	GC	3	6	1162396	1162401	0 %	0 %	50 %	50 %	66044283
23405	NC_007005	GAA	2	6	1162435	1162440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044283
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23408	NC_007005	CG	3	6	1162565	1162570	0 %	0 %	50 %	50 %	66044283
23409	NC_007005	CGT	2	6	1162575	1162580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23410	NC_007005	CTGGTT	2	12	1162612	1162623	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	66044283
23411	NC_007005	GTCA	2	8	1162690	1162697	25 %	25 %	25 %	25 %	66044283
23412	NC_007005	ACC	2	6	1162709	1162714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044283
23413	NC_007005	GCA	2	6	1162860	1162865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23414	NC_007005	TCT	2	6	1162914	1162919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044283
23415	NC_007005	GCG	2	6	1163014	1163019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044283
23416	NC_007005	CGA	2	6	1163070	1163075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23417	NC_007005	ATC	2	6	1163120	1163125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044283
23418	NC_007005	CGT	2	6	1163136	1163141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23419	NC_007005	CCAG	2	8	1163145	1163152	25 %	0 %	25 %	50 %	66044283
23420	NC_007005	GCT	2	6	1163175	1163180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23421	NC_007005	CAGT	2	8	1163205	1163212	25 %	25 %	25 %	25 %	66044283
23422	NC_007005	CGG	2	6	1163229	1163234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044283
23423	NC_007005	GAT	2	6	1163305	1163310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044283
23424	NC_007005	TCG	2	6	1163325	1163330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044283
23425	NC_007005	GTA	2	6	1163347	1163352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044283
23426	NC_007005	GCCA	2	8	1163357	1163364	25 %	0 %	25 %	50 %	66044283
23427	NC_007005	GCG	2	6	1163390	1163395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23428	NC_007005	GCCA	2	8	1163428	1163435	25 %	0 %	25 %	50 %	66044284
23429	NC_007005	GCCG	2	8	1163461	1163468	0 %	0 %	50 %	50 %	66044284
23430	NC_007005	CAG	2	6	1163479	1163484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23431	NC_007005	TCC	3	9	1163519	1163527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66044284
23432	NC_007005	ATC	2	6	1163531	1163536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044284
23433	NC_007005	CAGC	2	8	1163586	1163593	25 %	0 %	25 %	50 %	66044284
23434	NC_007005	GCG	2	6	1163597	1163602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23435	NC_007005	CAG	2	6	1163614	1163619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23436	NC_007005	AGCG	2	8	1163654	1163661	25 %	0 %	50 %	25 %	66044284
23437	NC_007005	GCC	2	6	1163680	1163685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23438	NC_007005	GGT	2	6	1163712	1163717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044284
23439	NC_007005	AGC	2	6	1163735	1163740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23440	NC_007005	CAG	2	6	1163761	1163766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23441	NC_007005	GCT	2	6	1163776	1163781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23442	NC_007005	CGCTGA	2	12	1163868	1163879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23443	NC_007005	GC	3	6	1163885	1163890	0 %	0 %	50 %	50 %	66044284
23444	NC_007005	GCG	2	6	1163892	1163897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23445	NC_007005	GCT	2	6	1163938	1163943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23446	NC_007005	GCC	2	6	1164002	1164007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23447	NC_007005	GCG	2	6	1164087	1164092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23448	NC_007005	GCC	2	6	1164152	1164157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23449	NC_007005	TCTT	2	8	1164191	1164198	0 %	75 %	0 %	25 %	66044284
23450	NC_007005	AAC	2	6	1164245	1164250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044284
23451	NC_007005	CGG	2	6	1164259	1164264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23452	NC_007005	GGC	2	6	1164283	1164288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23453	NC_007005	ATC	2	6	1164299	1164304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044284
23454	NC_007005	GCC	2	6	1164400	1164405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23455	NC_007005	GGC	2	6	1164448	1164453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23456	NC_007005	TTC	2	6	1164454	1164459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044284
23457	NC_007005	GC	3	6	1164481	1164486	0 %	0 %	50 %	50 %	66044284
23458	NC_007005	TTG	2	6	1164524	1164529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044284
23459	NC_007005	ATC	2	6	1164545	1164550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044284
23460	NC_007005	AGC	2	6	1164551	1164556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23461	NC_007005	GC	3	6	1164555	1164560	0 %	0 %	50 %	50 %	66044284
23462	NC_007005	CAG	2	6	1164568	1164573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23463	NC_007005	GGC	2	6	1164608	1164613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23464	NC_007005	GCC	2	6	1164653	1164658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23465	NC_007005	CGT	2	6	1164702	1164707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23466	NC_007005	CCG	2	6	1164795	1164800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23467	NC_007005	CCG	2	6	1164864	1164869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044284
23468	NC_007005	GGC	2	6	1164970	1164975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23469	NC_007005	CAG	2	6	1165012	1165017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23470	NC_007005	CTGG	2	8	1165066	1165073	0 %	25 %	50 %	25 %	66044284
23471	NC_007005	GT	3	6	1165095	1165100	0 %	50 %	50 %	0 %	66044284
23472	NC_007005	CG	3	6	1165129	1165134	0 %	0 %	50 %	50 %	66044284
23473	NC_007005	CGA	2	6	1165165	1165170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23474	NC_007005	TTC	2	6	1165249	1165254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044284
23475	NC_007005	CAG	3	9	1165294	1165302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23476	NC_007005	CGGC	2	8	1165310	1165317	0 %	0 %	50 %	50 %	66044284
23477	NC_007005	GGCA	2	8	1165375	1165382	25 %	0 %	50 %	25 %	66044284
23478	NC_007005	CGG	2	6	1165400	1165405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044284
23479	NC_007005	GAT	2	6	1165423	1165428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044284
23480	NC_007005	CGAT	2	8	1165433	1165440	25 %	25 %	25 %	25 %	66044284
23481	NC_007005	CAG	2	6	1165552	1165557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044284
23482	NC_007005	T	7	7	1165744	1165750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23483	NC_007005	CGA	2	6	1165922	1165927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044285
23484	NC_007005	CAT	2	6	1165991	1165996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044285
23485	NC_007005	ATG	2	6	1166023	1166028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044285
23486	NC_007005	CGTC	2	8	1166030	1166037	0 %	25 %	25 %	50 %	66044285
23487	NC_007005	CCA	2	6	1166045	1166050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044285
23488	NC_007005	CGC	2	6	1166064	1166069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044285
23489	NC_007005	CTT	2	6	1166132	1166137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044285
23490	NC_007005	ACGA	2	8	1166191	1166198	50 %	0 %	25 %	25 %	66044285
23491	NC_007005	CGA	2	6	1166374	1166379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044285
23492	NC_007005	CAC	2	6	1166388	1166393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044285
23493	NC_007005	ACGA	2	8	1166515	1166522	50 %	0 %	25 %	25 %	66044285
23494	NC_007005	GCG	2	6	1166553	1166558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044285
23495	NC_007005	CGG	2	6	1166564	1166569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044285
23496	NC_007005	ACG	2	6	1166607	1166612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044285
23497	NC_007005	GCC	2	6	1166707	1166712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044285
23498	NC_007005	CGC	2	6	1166784	1166789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044285
23499	NC_007005	CATCA	2	10	1166832	1166841	40 %	20 %	0 %	40 %	66044285
23500	NC_007005	GCA	2	6	1166885	1166890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044285

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