MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_007005	CGA	2	6	1094724	1094729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044214
22003	NC_007005	ACG	2	6	1094772	1094777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044214
22004	NC_007005	CAGC	2	8	1094818	1094825	25 %	0 %	25 %	50 %	66044214
22005	NC_007005	TGA	2	6	1094829	1094834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044214
22006	NC_007005	GCC	2	6	1094932	1094937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044214
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22009	NC_007005	CATC	2	8	1095058	1095065	25 %	25 %	0 %	50 %	66044214
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22011	NC_007005	GC	3	6	1095131	1095136	0 %	0 %	50 %	50 %	66044214
22012	NC_007005	TTC	2	6	1095139	1095144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044214
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22119	NC_007005	TGG	2	6	1100694	1100699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044220
22120	NC_007005	TGG	2	6	1100716	1100721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044220
22121	NC_007005	GCA	2	6	1100738	1100743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044220
22122	NC_007005	A	6	6	1100751	1100756	100 %	0 %	0 %	0 %	66044220
22123	NC_007005	AAG	2	6	1100847	1100852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044220
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22125	NC_007005	GTG	2	6	1100925	1100930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044220
22126	NC_007005	TGC	2	6	1100962	1100967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044220
22127	NC_007005	TGG	2	6	1101004	1101009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044220
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22131	NC_007005	GAC	2	6	1101123	1101128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044220
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22133	NC_007005	CCG	2	6	1101145	1101150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044220
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22135	NC_007005	CGG	3	9	1101190	1101198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044220
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22139	NC_007005	G	6	6	1101422	1101427	0 %	0 %	100 %	0 %	66044220
22140	NC_007005	ACG	2	6	1101457	1101462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044220
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22142	NC_007005	TGC	2	6	1101522	1101527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22143	NC_007005	GTG	3	9	1101538	1101546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22144	NC_007005	ATC	2	6	1101711	1101716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044221
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22148	NC_007005	GCA	2	6	1101940	1101945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044221
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22151	NC_007005	GCA	2	6	1102001	1102006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044221
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22153	NC_007005	GGGC	2	8	1102128	1102135	0 %	0 %	75 %	25 %	66044221
22154	NC_007005	GGT	2	6	1102155	1102160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044221
22155	NC_007005	CGC	2	6	1102244	1102249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044221
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22162	NC_007005	GAT	2	6	1102596	1102601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044221
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22171	NC_007005	GC	3	6	1102922	1102927	0 %	0 %	50 %	50 %	66044221
22172	NC_007005	CTG	2	6	1102965	1102970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044221
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22185	NC_007005	CGG	2	6	1103484	1103489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044222
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22187	NC_007005	CGGCG	2	10	1103556	1103565	0 %	0 %	60 %	40 %	66044222
22188	NC_007005	ACTG	2	8	1103670	1103677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22189	NC_007005	GC	3	6	1103921	1103926	0 %	0 %	50 %	50 %	66044223
22190	NC_007005	GGC	2	6	1103980	1103985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044223
22191	NC_007005	GCT	2	6	1104003	1104008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044223
22192	NC_007005	ACGCG	2	10	1104047	1104056	20 %	0 %	40 %	40 %	66044223
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22194	NC_007005	GGC	2	6	1104076	1104081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044223
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22199	NC_007005	CTTCGG	2	12	1104312	1104323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044223
22200	NC_007005	TGC	2	6	1104351	1104356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044223
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22203	NC_007005	TGT	2	6	1104488	1104493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044224
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22209	NC_007005	CATC	2	8	1104728	1104735	25 %	25 %	0 %	50 %	66044224
22210	NC_007005	ATG	2	6	1104794	1104799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044224
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22212	NC_007005	TGC	2	6	1104860	1104865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044224
22213	NC_007005	CAC	2	6	1104930	1104935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044224
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22215	NC_007005	GCCC	2	8	1104981	1104988	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22216	NC_007005	CTG	2	6	1105006	1105011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22217	NC_007005	AAG	2	6	1105033	1105038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044225
22218	NC_007005	ATG	2	6	1105100	1105105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044225
22219	NC_007005	TTC	2	6	1105183	1105188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044225
22220	NC_007005	AC	3	6	1105392	1105397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22221	NC_007005	CAA	2	6	1105659	1105664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044226
22222	NC_007005	CCG	2	6	1105697	1105702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044226
22223	NC_007005	TGGT	2	8	1105822	1105829	0 %	50 %	50 %	0 %	66044226
22224	NC_007005	CGG	2	6	1105833	1105838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044226
22225	NC_007005	AGA	2	6	1105877	1105882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044226
22226	NC_007005	GAT	2	6	1105941	1105946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044226
22227	NC_007005	CCG	2	6	1106006	1106011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044226
22228	NC_007005	CAG	2	6	1106073	1106078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044226
22229	NC_007005	GCT	2	6	1106133	1106138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044226
22230	NC_007005	GCGCC	2	10	1106216	1106225	0 %	0 %	40 %	60 %	66044226
22231	NC_007005	GAT	2	6	1106283	1106288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044226
22232	NC_007005	GAA	2	6	1106313	1106318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044226
22233	NC_007005	CCAG	2	8	1106342	1106349	25 %	0 %	25 %	50 %	66044226
22234	NC_007005	TTC	2	6	1106582	1106587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044227
22235	NC_007005	CGCC	2	8	1106599	1106606	0 %	0 %	25 %	75 %	66044227
22236	NC_007005	CGTTGT	2	12	1106713	1106724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	66044227
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22357	NC_007005	GCA	2	6	1112960	1112965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044233
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22464	NC_007005	A	6	6	1118950	1118955	100 %	0 %	0 %	0 %	66044241
22465	NC_007005	GGC	2	6	1118957	1118962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044241
22466	NC_007005	CGT	2	6	1119100	1119105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22467	NC_007005	AGG	2	6	1119220	1119225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22468	NC_007005	GCGCC	2	10	1119261	1119270	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22469	NC_007005	GGT	3	9	1119421	1119429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044242
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22471	NC_007005	TCGGC	2	10	1119483	1119492	0 %	20 %	40 %	40 %	66044242
22472	NC_007005	GCT	2	6	1119517	1119522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044242
22473	NC_007005	GC	3	6	1119619	1119624	0 %	0 %	50 %	50 %	66044242
22474	NC_007005	GCACG	2	10	1119678	1119687	20 %	0 %	40 %	40 %	66044242
22475	NC_007005	TTC	2	6	1119743	1119748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044242
22476	NC_007005	GTG	2	6	1119764	1119769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044242
22477	NC_007005	CTG	2	6	1119788	1119793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044242
22478	NC_007005	CGG	2	6	1119831	1119836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044242
22479	NC_007005	TCTG	2	8	1119843	1119850	0 %	50 %	25 %	25 %	66044242
22480	NC_007005	GC	3	6	1119880	1119885	0 %	0 %	50 %	50 %	66044242
22481	NC_007005	CG	3	6	1119892	1119897	0 %	0 %	50 %	50 %	66044242
22482	NC_007005	GCG	2	6	1119927	1119932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044242
22483	NC_007005	CGC	2	6	1119995	1120000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22484	NC_007005	GCA	2	6	1120014	1120019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22485	NC_007005	ATC	2	6	1120061	1120066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22486	NC_007005	TTC	2	6	1120165	1120170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044243
22487	NC_007005	CGCC	2	8	1120171	1120178	0 %	0 %	25 %	75 %	66044243
22488	NC_007005	CTG	2	6	1120215	1120220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044243
22489	NC_007005	CG	3	6	1120246	1120251	0 %	0 %	50 %	50 %	66044243
22490	NC_007005	ATC	2	6	1120254	1120259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044243
22491	NC_007005	AACG	2	8	1120296	1120303	50 %	0 %	25 %	25 %	66044243
22492	NC_007005	GCC	2	6	1120309	1120314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044243
22493	NC_007005	GCG	2	6	1120332	1120337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044243
22494	NC_007005	GAT	2	6	1120415	1120420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044243
22495	NC_007005	CGA	2	6	1120490	1120495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044243
22496	NC_007005	CTGGTG	2	12	1120500	1120511	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	66044243
22497	NC_007005	CTG	2	6	1120641	1120646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044243
22498	NC_007005	GCG	2	6	1120647	1120652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044243
22499	NC_007005	CGA	2	6	1120682	1120687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044243
22500	NC_007005	CCA	2	6	1120699	1120704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044243

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