MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_007005	CAT	2	6	1041711	1041716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21002	NC_007005	TAGAC	2	10	1041847	1041856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21003	NC_007005	TCA	2	6	1042026	1042031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21004	NC_007005	GCC	2	6	1042120	1042125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044172
21005	NC_007005	GAT	2	6	1042139	1042144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044172
21006	NC_007005	TC	3	6	1042184	1042189	0 %	50 %	0 %	50 %	66044172
21007	NC_007005	ACA	2	6	1042222	1042227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044172
21008	NC_007005	ATC	2	6	1042287	1042292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044172
21009	NC_007005	TGA	2	6	1042330	1042335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044172
21010	NC_007005	AGA	2	6	1042336	1042341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044172
21011	NC_007005	TGT	2	6	1042405	1042410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044172
21012	NC_007005	CTG	2	6	1042422	1042427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044172
21013	NC_007005	TGT	2	6	1042465	1042470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044172
21014	NC_007005	CTG	2	6	1042578	1042583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044172
21015	NC_007005	CAT	2	6	1042625	1042630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044172
21016	NC_007005	GCT	2	6	1042755	1042760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044172
21017	NC_007005	GCG	2	6	1042797	1042802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044172
21018	NC_007005	TGG	2	6	1042810	1042815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044172
21019	NC_007005	TCGC	2	8	1042890	1042897	0 %	25 %	25 %	50 %	66044173
21020	NC_007005	CCAAG	2	10	1042914	1042923	40 %	0 %	20 %	40 %	66044173
21021	NC_007005	TCGA	2	8	1042958	1042965	25 %	25 %	25 %	25 %	66044173
21022	NC_007005	GCT	2	6	1043017	1043022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044173
21023	NC_007005	GAT	2	6	1043026	1043031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044173
21024	NC_007005	GCC	2	6	1043150	1043155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044173
21025	NC_007005	TGA	2	6	1043197	1043202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044173
21026	NC_007005	CGA	2	6	1043236	1043241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044173
21027	NC_007005	ATTG	2	8	1043533	1043540	25 %	50 %	25 %	0 %	66044173
21028	NC_007005	TGC	2	6	1043647	1043652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044173
21029	NC_007005	TGTC	2	8	1043673	1043680	0 %	50 %	25 %	25 %	66044173
21030	NC_007005	TCA	2	6	1043751	1043756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044173
21031	NC_007005	GAG	2	6	1043829	1043834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66044173
21032	NC_007005	CA	3	6	1043906	1043911	50 %	0 %	0 %	50 %	66044173
21033	NC_007005	GTTGG	2	10	1043996	1044005	0 %	40 %	60 %	0 %	66044173
21034	NC_007005	GCC	2	6	1044013	1044018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044173
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21037	NC_007005	TTCCT	2	10	1044119	1044128	0 %	60 %	0 %	40 %	66044174
21038	NC_007005	GTG	2	6	1044185	1044190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044174
21039	NC_007005	GTTG	2	8	1044396	1044403	0 %	50 %	50 %	0 %	66044174
21040	NC_007005	TGG	2	6	1044473	1044478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044174
21041	NC_007005	CTGA	2	8	1044544	1044551	25 %	25 %	25 %	25 %	66044174
21042	NC_007005	GCT	2	6	1044576	1044581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044174
21043	NC_007005	TGC	2	6	1044638	1044643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044174
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21045	NC_007005	TGCG	2	8	1044875	1044882	0 %	25 %	50 %	25 %	66044174
21046	NC_007005	TGCG	2	8	1044971	1044978	0 %	25 %	50 %	25 %	66044174
21047	NC_007005	TGC	2	6	1044993	1044998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044174
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21050	NC_007005	TGC	2	6	1045089	1045094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044174
21051	NC_007005	CT	3	6	1045120	1045125	0 %	50 %	0 %	50 %	66044174
21052	NC_007005	GCAAG	2	10	1045137	1045146	40 %	0 %	40 %	20 %	66044174
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21054	NC_007005	CG	3	6	1045238	1045243	0 %	0 %	50 %	50 %	66044174
21055	NC_007005	AAG	2	6	1045265	1045270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044174
21056	NC_007005	ATGA	2	8	1045285	1045292	50 %	25 %	25 %	0 %	66044174
21057	NC_007005	GC	3	6	1045300	1045305	0 %	0 %	50 %	50 %	66044174
21058	NC_007005	TGAA	2	8	1045307	1045314	50 %	25 %	25 %	0 %	66044174
21059	NC_007005	GCA	2	6	1045359	1045364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044174
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21061	NC_007005	CAT	2	6	1045552	1045557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044174
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21063	NC_007005	TAG	2	6	1045608	1045613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044174
21064	NC_007005	ACGC	2	8	1045755	1045762	25 %	0 %	25 %	50 %	66044174
21065	NC_007005	T	6	6	1045794	1045799	0 %	100 %	0 %	0 %	66044174
21066	NC_007005	ATT	2	6	1045834	1045839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66044174
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21072	NC_007005	GAT	2	6	1046583	1046588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044175
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21074	NC_007005	GAA	2	6	1046678	1046683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044175
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21077	NC_007005	GCAA	2	8	1046754	1046761	50 %	0 %	25 %	25 %	66044175
21078	NC_007005	CAG	2	6	1046772	1046777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044175
21079	NC_007005	GCT	2	6	1046786	1046791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044175
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21083	NC_007005	CGA	2	6	1047005	1047010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044175
21084	NC_007005	TCGG	2	8	1047030	1047037	0 %	25 %	50 %	25 %	66044175
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21087	NC_007005	TCG	2	6	1047180	1047185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044175
21088	NC_007005	TGC	2	6	1047188	1047193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044175
21089	NC_007005	CCTG	2	8	1047206	1047213	0 %	25 %	25 %	50 %	66044175
21090	NC_007005	GTT	2	6	1047335	1047340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044175
21091	NC_007005	CGT	2	6	1047392	1047397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044175
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21100	NC_007005	GAT	2	6	1047909	1047914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044175
21101	NC_007005	CT	3	6	1048002	1048007	0 %	50 %	0 %	50 %	66044175
21102	NC_007005	TCG	2	6	1048054	1048059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044175
21103	NC_007005	GGCT	2	8	1048068	1048075	0 %	25 %	50 %	25 %	66044175
21104	NC_007005	CTGG	2	8	1048133	1048140	0 %	25 %	50 %	25 %	66044175
21105	NC_007005	TGA	2	6	1048151	1048156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044175
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21108	NC_007005	GCT	2	6	1048239	1048244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044175
21109	NC_007005	GAT	2	6	1048259	1048264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044175
21110	NC_007005	AG	3	6	1048287	1048292	50 %	0 %	50 %	0 %	66044175
21111	NC_007005	GAC	2	6	1048380	1048385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044175
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21114	NC_007005	TGC	2	6	1048566	1048571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21115	NC_007005	TTGC	2	8	1048647	1048654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21116	NC_007005	TCC	2	6	1048676	1048681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21117	NC_007005	AGC	2	6	1048753	1048758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044176
21118	NC_007005	GAA	2	6	1048778	1048783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044176
21119	NC_007005	TCCT	2	8	1048837	1048844	0 %	50 %	0 %	50 %	66044176
21120	NC_007005	TCG	2	6	1048847	1048852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044176
21121	NC_007005	GAT	2	6	1048941	1048946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044176
21122	NC_007005	TGC	2	6	1048950	1048955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044176
21123	NC_007005	TGA	2	6	1048970	1048975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044176
21124	NC_007005	GGCA	2	8	1049007	1049014	25 %	0 %	50 %	25 %	66044176
21125	NC_007005	ATCT	2	8	1049038	1049045	25 %	50 %	0 %	25 %	66044176
21126	NC_007005	CTG	2	6	1049077	1049082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044176
21127	NC_007005	TG	3	6	1049132	1049137	0 %	50 %	50 %	0 %	66044176
21128	NC_007005	ATT	2	6	1049162	1049167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66044176
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21130	NC_007005	T	8	8	1049255	1049262	0 %	100 %	0 %	0 %	66044177
21131	NC_007005	AGGC	2	8	1049276	1049283	25 %	0 %	50 %	25 %	66044177
21132	NC_007005	AACGT	2	10	1049284	1049293	40 %	20 %	20 %	20 %	66044177
21133	NC_007005	CAG	2	6	1049352	1049357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044177
21134	NC_007005	TCAT	2	8	1049478	1049485	25 %	50 %	0 %	25 %	66044177
21135	NC_007005	ATGG	2	8	1049503	1049510	25 %	25 %	50 %	0 %	66044177
21136	NC_007005	GTCA	2	8	1049638	1049645	25 %	25 %	25 %	25 %	66044177
21137	NC_007005	GCA	2	6	1049647	1049652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044177
21138	NC_007005	GCC	2	6	1049659	1049664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044177
21139	NC_007005	TAC	2	6	1049697	1049702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044177
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21141	NC_007005	GTGG	2	8	1049761	1049768	0 %	25 %	75 %	0 %	66044177
21142	NC_007005	TTC	2	6	1049776	1049781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044177
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21144	NC_007005	CTG	2	6	1049951	1049956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044177
21145	NC_007005	GT	3	6	1050049	1050054	0 %	50 %	50 %	0 %	66044177
21146	NC_007005	TTA	2	6	1050148	1050153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66044178
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21149	NC_007005	TCT	2	6	1050403	1050408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044178
21150	NC_007005	CTG	2	6	1050429	1050434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044178
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21152	NC_007005	GCCT	2	8	1050468	1050475	0 %	25 %	25 %	50 %	66044178
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21155	NC_007005	TCT	2	6	1050874	1050879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044178
21156	NC_007005	ATT	2	6	1050963	1050968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66044178
21157	NC_007005	TTA	2	6	1051039	1051044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66044178
21158	NC_007005	ATC	2	6	1051110	1051115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044178
21159	NC_007005	TTC	2	6	1051148	1051153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044178
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21164	NC_007005	A	6	6	1051518	1051523	100 %	0 %	0 %	0 %	66044178
21165	NC_007005	CAG	2	6	1051573	1051578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21168	NC_007005	CAG	2	6	1051846	1051851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044179
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21189	NC_007005	GCA	2	6	1052794	1052799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044180
21190	NC_007005	GATA	2	8	1052807	1052814	50 %	25 %	25 %	0 %	66044180
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21198	NC_007005	GCTC	2	8	1053236	1053243	0 %	25 %	25 %	50 %	66044180
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21203	NC_007005	CAG	3	9	1053441	1053449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044180
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21205	NC_007005	GC	3	6	1053617	1053622	0 %	0 %	50 %	50 %	66044181
21206	NC_007005	ATCG	2	8	1053623	1053630	25 %	25 %	25 %	25 %	66044181
21207	NC_007005	GCG	2	6	1053635	1053640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044181
21208	NC_007005	TCT	2	6	1053706	1053711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044181
21209	NC_007005	TGA	2	6	1053715	1053720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044181
21210	NC_007005	CG	3	6	1053726	1053731	0 %	0 %	50 %	50 %	66044181
21211	NC_007005	GCG	3	9	1053729	1053737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044181
21212	NC_007005	CGATAT	2	12	1053775	1053786	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	66044181
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21221	NC_007005	CGA	2	6	1054267	1054272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044181
21222	NC_007005	CAC	2	6	1054325	1054330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044181
21223	NC_007005	GCA	2	6	1054371	1054376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044181
21224	NC_007005	TGC	2	6	1054404	1054409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044181
21225	NC_007005	CAC	2	6	1054497	1054502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044181
21226	NC_007005	AAATA	2	10	1054609	1054618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21227	NC_007005	A	6	6	1054652	1054657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21228	NC_007005	GCT	2	6	1054704	1054709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21229	NC_007005	A	7	7	1054711	1054717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21230	NC_007005	T	7	7	1054790	1054796	0 %	100 %	0 %	0 %	66044182
21231	NC_007005	TTG	2	6	1054839	1054844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044182
21232	NC_007005	CCA	2	6	1054864	1054869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044182
21233	NC_007005	ATG	2	6	1054957	1054962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044182
21234	NC_007005	GAAT	2	8	1054987	1054994	50 %	25 %	25 %	0 %	66044182
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21236	NC_007005	ATTT	2	8	1055057	1055064	25 %	75 %	0 %	0 %	66044182
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21358	NC_007005	GGTG	2	8	1060458	1060465	0 %	25 %	75 %	0 %	66044184
21359	NC_007005	TGC	2	6	1060474	1060479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044184
21360	NC_007005	CGT	2	6	1060499	1060504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044184
21361	NC_007005	CAG	2	6	1060507	1060512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044184
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21381	NC_007005	GCA	2	6	1061827	1061832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044185
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21389	NC_007005	CAGT	2	8	1062246	1062253	25 %	25 %	25 %	25 %	66044185
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21462	NC_007005	TGAT	2	8	1066375	1066382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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21471	NC_007005	TC	3	6	1066815	1066820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21477	NC_007005	T	6	6	1067241	1067246	0 %	100 %	0 %	0 %	66044188
21478	NC_007005	TGG	2	6	1067335	1067340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044188
21479	NC_007005	ACC	2	6	1067356	1067361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044188
21480	NC_007005	TCT	2	6	1067414	1067419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044188
21481	NC_007005	TCA	2	6	1067630	1067635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044188
21482	NC_007005	TGA	2	6	1067650	1067655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044188
21483	NC_007005	GC	3	6	1067733	1067738	0 %	0 %	50 %	50 %	66044188
21484	NC_007005	CCG	2	6	1067850	1067855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044188
21485	NC_007005	GCA	2	6	1067934	1067939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044188
21486	NC_007005	ACGGT	2	10	1067989	1067998	20 %	20 %	40 %	20 %	66044188
21487	NC_007005	GCA	2	6	1068091	1068096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044188
21488	NC_007005	GGC	2	6	1068149	1068154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044188
21489	NC_007005	GC	3	6	1068153	1068158	0 %	0 %	50 %	50 %	66044188
21490	NC_007005	CTAT	2	8	1068274	1068281	25 %	50 %	0 %	25 %	66044188
21491	NC_007005	GC	3	6	1068341	1068346	0 %	0 %	50 %	50 %	66044188
21492	NC_007005	GC	3	6	1068475	1068480	0 %	0 %	50 %	50 %	66044188
21493	NC_007005	GCA	2	6	1068524	1068529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044188
21494	NC_007005	ATGA	2	8	1068600	1068607	50 %	25 %	25 %	0 %	66044189
21495	NC_007005	ACGC	2	8	1068634	1068641	25 %	0 %	25 %	50 %	66044189
21496	NC_007005	GAC	2	6	1068886	1068891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044189
21497	NC_007005	CCAGG	2	10	1068942	1068951	20 %	0 %	40 %	40 %	66044189
21498	NC_007005	GC	3	6	1068963	1068968	0 %	0 %	50 %	50 %	66044189
21499	NC_007005	CGA	2	6	1068975	1068980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044189
21500	NC_007005	AGC	2	6	1069130	1069135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044189

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