MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_007005	CTC	2	6	941011	941016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19002	NC_007005	CCG	2	6	941043	941048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19003	NC_007005	TTG	2	6	941108	941113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_007005	TTC	2	6	941114	941119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_007005	GCA	2	6	941186	941191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_007005	CA	3	6	941205	941210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19007	NC_007005	A	6	6	941210	941215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_007005	GC	3	6	941407	941412	0 %	0 %	50 %	50 %	66044086
19009	NC_007005	CGG	2	6	941487	941492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044086
19010	NC_007005	CGA	2	6	941503	941508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19011	NC_007005	TCG	2	6	941546	941551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19012	NC_007005	TCGATG	2	12	941570	941581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	66044086
19013	NC_007005	CAG	2	6	941584	941589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19014	NC_007005	CGT	2	6	941697	941702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19015	NC_007005	GTC	2	6	941716	941721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19016	NC_007005	ACCGA	2	10	941927	941936	40 %	0 %	20 %	40 %	66044086
19017	NC_007005	GCA	2	6	941967	941972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19018	NC_007005	CAG	2	6	942033	942038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19019	NC_007005	ATC	2	6	942149	942154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044086
19020	NC_007005	GCG	2	6	942166	942171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044086
19021	NC_007005	GGGC	2	8	942289	942296	0 %	0 %	75 %	25 %	66044086
19022	NC_007005	GAT	2	6	942304	942309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044086
19023	NC_007005	GCT	2	6	942352	942357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19024	NC_007005	ATCGA	2	10	942491	942500	40 %	20 %	20 %	20 %	66044086
19025	NC_007005	ACG	2	6	942618	942623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19026	NC_007005	CGA	2	6	942732	942737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044086
19027	NC_007005	TC	3	6	942763	942768	0 %	50 %	0 %	50 %	66044086
19028	NC_007005	CGTCG	2	10	942791	942800	0 %	20 %	40 %	40 %	66044086
19029	NC_007005	GCT	3	9	942838	942846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19030	NC_007005	TGG	2	6	942946	942951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044087
19031	NC_007005	GAA	2	6	942953	942958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044087
19032	NC_007005	CGA	2	6	943012	943017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19033	NC_007005	CTGC	2	8	943065	943072	0 %	25 %	25 %	50 %	66044087
19034	NC_007005	CAG	2	6	943205	943210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19035	NC_007005	CCA	2	6	943228	943233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044087
19036	NC_007005	TCG	2	6	943251	943256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19037	NC_007005	TGA	2	6	943263	943268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044087
19038	NC_007005	TCA	2	6	943288	943293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044087
19039	NC_007005	GCT	2	6	943340	943345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19040	NC_007005	TCT	2	6	943365	943370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044087
19041	NC_007005	TTC	2	6	943376	943381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044087
19042	NC_007005	AGGC	2	8	943398	943405	25 %	0 %	50 %	25 %	66044087
19043	NC_007005	CGG	2	6	943444	943449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19044	NC_007005	GGC	2	6	943453	943458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19045	NC_007005	CAC	2	6	943532	943537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044087
19046	NC_007005	CAG	2	6	943667	943672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19047	NC_007005	CGA	2	6	943726	943731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19048	NC_007005	TTC	2	6	943742	943747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044087
19049	NC_007005	GGT	2	6	943828	943833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044087
19050	NC_007005	CGG	2	6	943855	943860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19051	NC_007005	ATGT	2	8	943910	943917	25 %	50 %	25 %	0 %	66044087
19052	NC_007005	CCA	2	6	943966	943971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044087
19053	NC_007005	GGC	2	6	944032	944037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19054	NC_007005	GCG	2	6	944051	944056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19055	NC_007005	TCG	2	6	944058	944063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19056	NC_007005	CCT	2	6	944098	944103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66044087
19057	NC_007005	GCG	2	6	944155	944160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19058	NC_007005	CGG	2	6	944218	944223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19059	NC_007005	CTT	2	6	944230	944235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044087
19060	NC_007005	GGC	2	6	944285	944290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19061	NC_007005	GTC	2	6	944324	944329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19062	NC_007005	CAG	2	6	944426	944431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19063	NC_007005	CGA	2	6	944518	944523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19064	NC_007005	CTG	2	6	944543	944548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19065	NC_007005	GAT	2	6	944585	944590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044087
19066	NC_007005	CGT	2	6	944607	944612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19067	NC_007005	CAGC	2	8	944621	944628	25 %	0 %	25 %	50 %	66044087
19068	NC_007005	CGG	2	6	944644	944649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044087
19069	NC_007005	GCA	2	6	944665	944670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
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19071	NC_007005	GAT	2	6	944714	944719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044087
19072	NC_007005	GCC	2	6	944730	944735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044087
19073	NC_007005	CCG	2	6	944742	944747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044087
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19078	NC_007005	GAA	2	6	944984	944989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044087
19079	NC_007005	CAG	3	9	944993	945001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19080	NC_007005	GCGAG	2	10	945037	945046	20 %	0 %	60 %	20 %	66044087
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19087	NC_007005	GGT	2	6	945365	945370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044087
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19089	NC_007005	TGA	2	6	945422	945427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044087
19090	NC_007005	AGC	2	6	945465	945470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
19091	NC_007005	GAG	2	6	945479	945484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66044087
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19093	NC_007005	CAG	2	6	945674	945679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044087
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19098	NC_007005	ATG	2	6	945826	945831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044088
19099	NC_007005	GA	3	6	945836	945841	50 %	0 %	50 %	0 %	66044088
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19101	NC_007005	AACC	2	8	945870	945877	50 %	0 %	0 %	50 %	66044088
19102	NC_007005	GAG	2	6	945914	945919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19104	NC_007005	GC	3	6	946119	946124	0 %	0 %	50 %	50 %	66044089
19105	NC_007005	GCA	3	9	946132	946140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044089
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19108	NC_007005	CAG	2	6	946253	946258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044089
19109	NC_007005	G	6	6	946279	946284	0 %	0 %	100 %	0 %	66044089
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19247	NC_007005	GC	3	6	952864	952869	0 %	0 %	50 %	50 %	66044096
19248	NC_007005	CGGC	2	8	952886	952893	0 %	0 %	50 %	50 %	66044096
19249	NC_007005	ACTG	2	8	952991	952998	25 %	25 %	25 %	25 %	66044096
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19343	NC_007005	CCAC	2	8	957699	957706	25 %	0 %	0 %	75 %	66044100
19344	NC_007005	CTGG	2	8	957724	957731	0 %	25 %	50 %	25 %	66044100
19345	NC_007005	GC	3	6	957732	957737	0 %	0 %	50 %	50 %	66044100
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19349	NC_007005	CTTGA	2	10	957881	957890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19350	NC_007005	G	7	7	957892	957898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19351	NC_007005	CAA	2	6	957904	957909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19352	NC_007005	TGGG	2	8	958014	958021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19353	NC_007005	TCAG	2	8	958059	958066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19354	NC_007005	ACC	2	6	958084	958089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19357	NC_007005	GTC	2	6	958199	958204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044101
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19367	NC_007005	A	6	6	958703	958708	100 %	0 %	0 %	0 %	66044101
19368	NC_007005	CGG	2	6	958731	958736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044101
19369	NC_007005	TGC	2	6	958776	958781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044101
19370	NC_007005	GGC	2	6	958783	958788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044101
19371	NC_007005	TCG	2	6	958932	958937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044101
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19385	NC_007005	CAA	2	6	959596	959601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044101
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19423	NC_007005	CGC	2	6	961576	961581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19462	NC_007005	TGA	2	6	964379	964384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19464	NC_007005	GC	3	6	964488	964493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19466	NC_007005	GGC	2	6	964722	964727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19469	NC_007005	GCG	2	6	964782	964787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19470	NC_007005	CGA	2	6	964957	964962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19475	NC_007005	GGA	2	6	965126	965131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19476	NC_007005	CAG	2	6	965199	965204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19481	NC_007005	ACC	2	6	965414	965419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19485	NC_007005	TCGTG	2	10	965750	965759	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19486	NC_007005	TGG	2	6	965819	965824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19487	NC_007005	GGA	2	6	965855	965860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19488	NC_007005	TCA	2	6	965880	965885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19489	NC_007005	AC	3	6	965906	965911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19490	NC_007005	AC	3	6	966075	966080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19491	NC_007005	GGA	2	6	966135	966140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19492	NC_007005	CCT	2	6	966216	966221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19493	NC_007005	CGA	2	6	966226	966231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19494	NC_007005	GAA	2	6	966275	966280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19495	NC_007005	AGC	2	6	966291	966296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19496	NC_007005	CCA	2	6	966418	966423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19497	NC_007005	TG	3	6	966428	966433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19498	NC_007005	GCCT	2	8	966479	966486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19499	NC_007005	AGG	2	6	966494	966499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_007005	CCA	2	6	966524	966529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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