MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_007005	GGT	2	6	895169	895174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044043
18002	NC_007005	ATG	3	9	895179	895187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044043
18003	NC_007005	CTT	2	6	895211	895216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044043
18004	NC_007005	TGA	2	6	895267	895272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044043
18005	NC_007005	CGT	2	6	895336	895341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044043
18006	NC_007005	CGA	2	6	895366	895371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044043
18007	NC_007005	GCT	2	6	895382	895387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044043
18008	NC_007005	TCG	2	6	895392	895397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044043
18009	NC_007005	ACC	2	6	895398	895403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044043
18010	NC_007005	CTG	2	6	895457	895462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18011	NC_007005	TGC	2	6	895463	895468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18012	NC_007005	TCG	2	6	895497	895502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18013	NC_007005	GTAG	2	8	895508	895515	25 %	25 %	50 %	0 %	66044044
18014	NC_007005	GC	3	6	895523	895528	0 %	0 %	50 %	50 %	66044044
18015	NC_007005	TCG	2	6	895560	895565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18016	NC_007005	TGCA	2	8	895592	895599	25 %	25 %	25 %	25 %	66044044
18017	NC_007005	TGT	2	6	895609	895614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044044
18018	NC_007005	TCG	2	6	895683	895688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18019	NC_007005	CGG	2	6	895720	895725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044044
18020	NC_007005	GAC	2	6	895735	895740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18021	NC_007005	GTT	2	6	895856	895861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044044
18022	NC_007005	GAT	2	6	895862	895867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044044
18023	NC_007005	CTG	2	6	895886	895891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18024	NC_007005	CCA	2	6	895936	895941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044044
18025	NC_007005	CGC	2	6	895973	895978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044044
18026	NC_007005	CAG	2	6	896000	896005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18027	NC_007005	CGC	2	6	896024	896029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044044
18028	NC_007005	CGG	2	6	896035	896040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044044
18029	NC_007005	ACA	2	6	896164	896169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044044
18030	NC_007005	TGC	2	6	896217	896222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18031	NC_007005	CTG	2	6	896300	896305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18032	NC_007005	GAG	2	6	896348	896353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66044044
18033	NC_007005	GCT	2	6	896387	896392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18034	NC_007005	TGG	2	6	896409	896414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044044
18035	NC_007005	CGGCG	2	10	896434	896443	0 %	0 %	60 %	40 %	66044044
18036	NC_007005	GCGG	2	8	896462	896469	0 %	0 %	75 %	25 %	66044044
18037	NC_007005	CAG	2	6	896498	896503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18038	NC_007005	GCA	2	6	896505	896510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044044
18039	NC_007005	CCA	2	6	896515	896520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044044
18040	NC_007005	TGAG	2	8	896581	896588	25 %	25 %	50 %	0 %	66044044
18041	NC_007005	GAT	2	6	896605	896610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044044
18042	NC_007005	ACT	2	6	896624	896629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044044
18043	NC_007005	CAT	2	6	896642	896647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044044
18044	NC_007005	GC	3	6	896698	896703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_007005	TCCG	2	8	896736	896743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18046	NC_007005	CGC	2	6	896885	896890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18047	NC_007005	ACG	2	6	896942	896947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_007005	ACG	2	6	896988	896993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_007005	CGC	2	6	896999	897004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18050	NC_007005	ACG	2	6	897054	897059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_007005	CGT	2	6	897065	897070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18052	NC_007005	AGG	2	6	897075	897080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_007005	CGC	2	6	897112	897117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18054	NC_007005	GAT	2	6	897129	897134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_007005	TGC	2	6	897241	897246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044045
18056	NC_007005	CAGCAT	2	12	897248	897259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	66044045
18057	NC_007005	GCCA	2	8	897327	897334	25 %	0 %	25 %	50 %	66044045
18058	NC_007005	CTG	2	6	897491	897496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044045
18059	NC_007005	GGC	2	6	897500	897505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044045
18060	NC_007005	GC	3	6	897510	897515	0 %	0 %	50 %	50 %	66044045
18061	NC_007005	CGGT	2	8	897528	897535	0 %	25 %	50 %	25 %	66044045
18062	NC_007005	GCA	2	6	897607	897612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044045
18063	NC_007005	TGAT	2	8	897621	897628	25 %	50 %	25 %	0 %	66044045
18064	NC_007005	GCC	2	6	897684	897689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044045
18065	NC_007005	ACTG	2	8	897755	897762	25 %	25 %	25 %	25 %	66044045
18066	NC_007005	GC	3	6	897814	897819	0 %	0 %	50 %	50 %	66044045
18067	NC_007005	GCC	2	6	897912	897917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044045
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18069	NC_007005	GC	3	6	898000	898005	0 %	0 %	50 %	50 %	66044045
18070	NC_007005	GC	3	6	898026	898031	0 %	0 %	50 %	50 %	66044045
18071	NC_007005	TGG	2	6	898129	898134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044045
18072	NC_007005	TGC	2	6	898135	898140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044045
18073	NC_007005	GGC	2	6	898231	898236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044045
18074	NC_007005	CTGAAA	2	12	898268	898279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	66044045
18075	NC_007005	GTT	2	6	898280	898285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044045
18076	NC_007005	G	6	6	898528	898533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_007005	TCA	2	6	898591	898596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18078	NC_007005	AC	3	6	898664	898669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18079	NC_007005	CGGG	2	8	898728	898735	0 %	0 %	75 %	25 %	66044046
18080	NC_007005	G	6	6	898733	898738	0 %	0 %	100 %	0 %	66044046
18081	NC_007005	GAT	2	6	898790	898795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044046
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18083	NC_007005	GCT	2	6	898867	898872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044046
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18087	NC_007005	CG	3	6	899018	899023	0 %	0 %	50 %	50 %	66044046
18088	NC_007005	CGGGC	2	10	899090	899099	0 %	0 %	60 %	40 %	66044046
18089	NC_007005	ACG	2	6	899129	899134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044046
18090	NC_007005	ACGC	2	8	899180	899187	25 %	0 %	25 %	50 %	66044046
18091	NC_007005	CAG	2	6	899225	899230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044046
18092	NC_007005	CCA	2	6	899349	899354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044047
18093	NC_007005	AACG	2	8	899360	899367	50 %	0 %	25 %	25 %	66044047
18094	NC_007005	TCGG	2	8	899387	899394	0 %	25 %	50 %	25 %	66044047
18095	NC_007005	GCCC	2	8	899460	899467	0 %	0 %	25 %	75 %	66044047
18096	NC_007005	TGG	2	6	899493	899498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044047
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18099	NC_007005	TCG	3	9	899602	899610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044047
18100	NC_007005	CTC	2	6	899617	899622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66044047
18101	NC_007005	CGC	2	6	899642	899647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044047
18102	NC_007005	CGG	2	6	899701	899706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044047
18103	NC_007005	GAAA	2	8	899810	899817	75 %	0 %	25 %	0 %	66044047
18104	NC_007005	T	6	6	899944	899949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_007005	GCT	2	6	899977	899982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044048
18106	NC_007005	CTG	3	9	900019	900027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044048
18107	NC_007005	TGC	2	6	900032	900037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044048
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18109	NC_007005	AAC	2	6	900121	900126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044048
18110	NC_007005	CTG	2	6	900139	900144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044048
18111	NC_007005	CGCA	2	8	900147	900154	25 %	0 %	25 %	50 %	66044048
18112	NC_007005	CGC	2	6	900162	900167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044048
18113	NC_007005	GCC	2	6	900181	900186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044048
18114	NC_007005	CAT	2	6	900261	900266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044048
18115	NC_007005	GTCA	2	8	900403	900410	25 %	25 %	25 %	25 %	66044048
18116	NC_007005	GCA	2	6	900411	900416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044048
18117	NC_007005	CGT	2	6	900477	900482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_007005	GAGC	2	8	900485	900492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18119	NC_007005	AAC	2	6	900626	900631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044049
18120	NC_007005	TTC	2	6	900667	900672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044049
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18122	NC_007005	ACGG	2	8	900720	900727	25 %	0 %	50 %	25 %	66044049
18123	NC_007005	GCTG	2	8	900733	900740	0 %	25 %	50 %	25 %	66044049
18124	NC_007005	TTGG	2	8	900786	900793	0 %	50 %	50 %	0 %	66044049
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18135	NC_007005	GCT	2	6	901160	901165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044050
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18215	NC_007005	A	6	6	904775	904780	100 %	0 %	0 %	0 %	66044053
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18220	NC_007005	CTG	2	6	905114	905119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044053
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18222	NC_007005	AGTA	2	8	905144	905151	50 %	25 %	25 %	0 %	66044053
18223	NC_007005	ACC	2	6	905207	905212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18224	NC_007005	TG	3	6	905225	905230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18225	NC_007005	TGC	2	6	905252	905257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18227	NC_007005	CAC	2	6	905397	905402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18230	NC_007005	CTG	2	6	905580	905585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044054
18231	NC_007005	GTT	2	6	905708	905713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044054
18232	NC_007005	CTA	2	6	905721	905726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044054
18233	NC_007005	TGA	2	6	905854	905859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18234	NC_007005	T	6	6	905985	905990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18235	NC_007005	GTC	2	6	906000	906005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18237	NC_007005	CCT	3	9	906062	906070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66044055
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18241	NC_007005	A	6	6	906113	906118	100 %	0 %	0 %	0 %	66044055
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18365	NC_007005	CCA	2	6	911746	911751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044060
18366	NC_007005	GAA	2	6	911856	911861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044060
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18373	NC_007005	GC	3	6	912176	912181	0 %	0 %	50 %	50 %	66044061
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18384	NC_007005	CAT	2	6	912778	912783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044061
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18386	NC_007005	GAT	2	6	912868	912873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044061
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18477	NC_007005	CGG	2	6	918154	918159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044068
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18479	NC_007005	CAA	2	6	918217	918222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18480	NC_007005	T	6	6	918248	918253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18481	NC_007005	AGTTC	2	10	918296	918305	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18482	NC_007005	ATGC	2	8	918346	918353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18483	NC_007005	CGC	2	6	918363	918368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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