MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_007005	CAGTGG	2	12	869919	869930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66044018
17503	NC_007005	ACG	2	6	869959	869964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044018
17504	NC_007005	CTT	2	6	870062	870067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044018
17505	NC_007005	CGA	2	6	870140	870145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044018
17506	NC_007005	CG	3	6	870150	870155	0 %	0 %	50 %	50 %	66044018
17507	NC_007005	CTG	2	6	870216	870221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044018
17508	NC_007005	GAGCA	2	10	870225	870234	40 %	0 %	40 %	20 %	66044018
17509	NC_007005	CGA	2	6	870254	870259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044018
17510	NC_007005	GGT	2	6	870552	870557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044018
17511	NC_007005	TG	3	6	870620	870625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17512	NC_007005	TCA	2	6	870702	870707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044019
17513	NC_007005	TTG	2	6	870725	870730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044019
17514	NC_007005	GCC	2	6	870794	870799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044019
17515	NC_007005	CAG	2	6	870805	870810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044019
17516	NC_007005	CTG	2	6	870828	870833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044019
17517	NC_007005	CCTT	2	8	870851	870858	0 %	50 %	0 %	50 %	66044019
17518	NC_007005	GCT	3	9	870859	870867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044019
17519	NC_007005	ATG	2	6	870974	870979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044019
17520	NC_007005	CTT	2	6	870991	870996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66044019
17521	NC_007005	AGC	2	6	871037	871042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044019
17522	NC_007005	AGGCC	2	10	871059	871068	20 %	0 %	40 %	40 %	66044019
17523	NC_007005	GT	3	6	871089	871094	0 %	50 %	50 %	0 %	66044019
17524	NC_007005	GCC	2	6	871162	871167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044019
17525	NC_007005	AG	3	6	871215	871220	50 %	0 %	50 %	0 %	66044019
17526	NC_007005	CGC	2	6	871221	871226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044019
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17529	NC_007005	TGCC	2	8	871426	871433	0 %	25 %	25 %	50 %	66044019
17530	NC_007005	GCT	2	6	871435	871440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044019
17531	NC_007005	TTG	2	6	871445	871450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044019
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17533	NC_007005	G	6	6	871545	871550	0 %	0 %	100 %	0 %	66044019
17534	NC_007005	CTG	2	6	871617	871622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044019
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17537	NC_007005	TGA	2	6	871772	871777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044020
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17539	NC_007005	GGT	2	6	871911	871916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044020
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17541	NC_007005	GCA	2	6	871997	872002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044020
17542	NC_007005	GCG	2	6	872051	872056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044020
17543	NC_007005	GGC	2	6	872096	872101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044020
17544	NC_007005	GGC	2	6	872250	872255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044020
17545	NC_007005	GC	3	6	872336	872341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17546	NC_007005	CAGC	2	8	872366	872373	25 %	0 %	25 %	50 %	66044021
17547	NC_007005	GCT	2	6	872374	872379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044021
17548	NC_007005	CCG	2	6	872387	872392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044021
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17550	NC_007005	AGGC	2	8	872452	872459	25 %	0 %	50 %	25 %	66044021
17551	NC_007005	GCG	2	6	872470	872475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044021
17552	NC_007005	ATG	2	6	872496	872501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044021
17553	NC_007005	GCG	2	6	872556	872561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044021
17554	NC_007005	CG	3	6	872560	872565	0 %	0 %	50 %	50 %	66044021
17555	NC_007005	GAA	2	6	872600	872605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044021
17556	NC_007005	TGG	2	6	872619	872624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044021
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17558	NC_007005	TGA	2	6	872770	872775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044021
17559	NC_007005	GCG	2	6	872811	872816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044021
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17561	NC_007005	ATTT	2	8	872919	872926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_007005	A	7	7	872959	872965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17572	NC_007005	GGCA	2	8	873232	873239	25 %	0 %	50 %	25 %	66044022
17573	NC_007005	TGC	2	6	873288	873293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044022
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17583	NC_007005	CTG	2	6	873596	873601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044022
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17587	NC_007005	GTC	2	6	873874	873879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044022
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17589	NC_007005	A	6	6	874091	874096	100 %	0 %	0 %	0 %	66044023
17590	NC_007005	GAA	2	6	874124	874129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044023
17591	NC_007005	GAT	2	6	874187	874192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044023
17592	NC_007005	GCTG	2	8	874247	874254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17593	NC_007005	TC	3	6	874441	874446	0 %	50 %	0 %	50 %	66044024
17594	NC_007005	GC	3	6	874538	874543	0 %	0 %	50 %	50 %	66044024
17595	NC_007005	CT	3	6	874544	874549	0 %	50 %	0 %	50 %	66044024
17596	NC_007005	CGA	2	6	874579	874584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044024
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17599	NC_007005	ATC	2	6	874706	874711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044024
17600	NC_007005	CAG	2	6	874715	874720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044024
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17602	NC_007005	GCG	2	6	874790	874795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044024
17603	NC_007005	GCT	3	9	874836	874844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044024
17604	NC_007005	TC	3	6	874871	874876	0 %	50 %	0 %	50 %	66044025
17605	NC_007005	TCGA	2	8	875066	875073	25 %	25 %	25 %	25 %	66044025
17606	NC_007005	CGA	2	6	875097	875102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044025
17607	NC_007005	AAAC	2	8	875245	875252	75 %	0 %	0 %	25 %	66044025
17608	NC_007005	GCT	2	6	875322	875327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044025
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17610	NC_007005	TCA	2	6	875384	875389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17611	NC_007005	TTA	2	6	875440	875445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_007005	GCT	2	6	875516	875521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17613	NC_007005	CGA	2	6	875558	875563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17616	NC_007005	TCG	2	6	875864	875869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044026
17617	NC_007005	ATCA	2	8	875893	875900	50 %	25 %	0 %	25 %	66044026
17618	NC_007005	GCT	2	6	875917	875922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044026
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17620	NC_007005	GTC	2	6	875940	875945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044026
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17989	NC_007005	GCT	2	6	894349	894354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044041
17990	NC_007005	AGC	2	6	894417	894422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044041
17991	NC_007005	CGA	2	6	894484	894489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044041
17992	NC_007005	TGCGC	2	10	894549	894558	0 %	20 %	40 %	40 %	66044041
17993	NC_007005	AGG	2	6	894609	894614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66044041
17994	NC_007005	TCC	2	6	894618	894623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66044041
17995	NC_007005	CTG	2	6	894662	894667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044041
17996	NC_007005	GATC	2	8	894704	894711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17997	NC_007005	CAC	2	6	894744	894749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044042
17998	NC_007005	CAG	2	6	894849	894854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044042
17999	NC_007005	GGC	2	6	894939	894944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044042
18000	NC_007005	GAC	2	6	895109	895114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044043

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