MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_007005	AAGT	2	8	843557	843564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_007005	GAT	2	6	843588	843593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_007005	TCG	2	6	843820	843825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_007005	CGC	2	6	843880	843885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17005	NC_007005	GCC	2	6	843960	843965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17006	NC_007005	CGT	2	6	844093	844098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_007005	GAC	2	6	844168	844173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_007005	AAT	2	6	844226	844231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_007005	TGA	2	6	844244	844249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_007005	TGG	2	6	844258	844263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_007005	ATC	2	6	844272	844277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_007005	GTT	2	6	844334	844339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_007005	GGT	2	6	844369	844374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_007005	GTG	2	6	844379	844384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_007005	GCT	2	6	844436	844441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_007005	CTC	2	6	844526	844531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17017	NC_007005	TCCG	2	8	844608	844615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17018	NC_007005	AGC	2	6	844618	844623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_007005	ATGT	2	8	844653	844660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_007005	CAC	2	6	844702	844707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17021	NC_007005	TTG	2	6	844743	844748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_007005	GGCA	2	8	844765	844772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17023	NC_007005	GCG	2	6	844814	844819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_007005	CTGG	2	8	844864	844871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17025	NC_007005	TGT	2	6	844993	844998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_007005	TCG	2	6	845048	845053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044000
17027	NC_007005	C	6	6	845060	845065	0 %	0 %	0 %	100 %	66044000
17028	NC_007005	ACCA	2	8	845095	845102	50 %	0 %	0 %	50 %	66044000
17029	NC_007005	AGCA	2	8	845114	845121	50 %	0 %	25 %	25 %	66044000
17030	NC_007005	AAG	2	6	845170	845175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66044000
17031	NC_007005	GCGT	2	8	845197	845204	0 %	25 %	50 %	25 %	66044000
17032	NC_007005	GC	3	6	845280	845285	0 %	0 %	50 %	50 %	66044000
17033	NC_007005	GTC	2	6	845305	845310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044000
17034	NC_007005	CG	3	6	845363	845368	0 %	0 %	50 %	50 %	66044000
17035	NC_007005	GCG	2	6	845396	845401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044000
17036	NC_007005	GCC	2	6	845440	845445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044000
17037	NC_007005	GCG	2	6	845503	845508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044000
17038	NC_007005	TGA	2	6	845529	845534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044000
17039	NC_007005	TTG	2	6	845547	845552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044000
17040	NC_007005	TCG	2	6	845760	845765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044001
17041	NC_007005	ACG	2	6	845917	845922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044001
17042	NC_007005	CGAG	2	8	845931	845938	25 %	0 %	50 %	25 %	66044001
17043	NC_007005	CACC	2	8	845984	845991	25 %	0 %	0 %	75 %	66044001
17044	NC_007005	ATC	2	6	846020	846025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044001
17045	NC_007005	GCCC	2	8	846054	846061	0 %	0 %	25 %	75 %	66044001
17046	NC_007005	GAG	2	6	846065	846070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66044001
17047	NC_007005	AGGTG	2	10	846233	846242	20 %	20 %	60 %	0 %	66044001
17048	NC_007005	GTG	2	6	846252	846257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66044001
17049	NC_007005	CAT	2	6	846322	846327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044001
17050	NC_007005	A	7	7	846338	846344	100 %	0 %	0 %	0 %	66044001
17051	NC_007005	ACC	2	6	846369	846374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044001
17052	NC_007005	CTG	2	6	846410	846415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044001
17053	NC_007005	TTG	2	6	846459	846464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044001
17054	NC_007005	TC	3	6	846583	846588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17055	NC_007005	GAC	2	6	846607	846612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_007005	CAG	2	6	846677	846682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17057	NC_007005	TC	3	6	846777	846782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17058	NC_007005	GC	3	6	846797	846802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17059	NC_007005	GC	3	6	846806	846811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17060	NC_007005	GCT	2	6	846899	846904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17061	NC_007005	CCT	2	6	846948	846953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17062	NC_007005	GC	3	6	847033	847038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17063	NC_007005	GAA	3	9	847117	847125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17064	NC_007005	TG	3	6	847126	847131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_007005	TTA	2	6	847231	847236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_007005	CTG	2	6	847309	847314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17068	NC_007005	TTG	2	6	847498	847503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17069	NC_007005	GAA	2	6	847518	847523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_007005	GCC	2	6	847587	847592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17071	NC_007005	ATC	2	6	847596	847601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17072	NC_007005	ACA	2	6	847678	847683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17073	NC_007005	GCT	2	6	847684	847689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17074	NC_007005	ACTG	2	8	847700	847707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17075	NC_007005	AAC	2	6	847788	847793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17076	NC_007005	TCA	2	6	848044	848049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17077	NC_007005	AGTG	2	8	848158	848165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_007005	GCGT	2	8	848188	848195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17079	NC_007005	GCTTTT	2	12	848227	848238	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17080	NC_007005	TCGG	2	8	848241	848248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17081	NC_007005	CGC	2	6	848288	848293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17082	NC_007005	TCT	2	6	848431	848436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17083	NC_007005	GT	3	6	848464	848469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_007005	GCC	2	6	848511	848516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17085	NC_007005	GC	3	6	848520	848525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17086	NC_007005	AGCA	2	8	848587	848594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17087	NC_007005	GCC	2	6	848649	848654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044002
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17091	NC_007005	GC	3	6	848914	848919	0 %	0 %	50 %	50 %	66044002
17092	NC_007005	CTGC	2	8	849132	849139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17093	NC_007005	GCT	2	6	849225	849230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17094	NC_007005	AGT	3	9	849397	849405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17096	NC_007005	AAT	2	6	849426	849431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_007005	GTC	2	6	849445	849450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17098	NC_007005	AGTC	2	8	849469	849476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17099	NC_007005	AG	3	6	849487	849492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17100	NC_007005	TAT	2	6	849531	849536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_007005	CGG	2	6	849557	849562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044003
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17103	NC_007005	TGAGAT	2	12	849579	849590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044003
17104	NC_007005	CAG	2	6	849609	849614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044003
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17107	NC_007005	A	6	6	849723	849728	100 %	0 %	0 %	0 %	66044003
17108	NC_007005	GAT	2	6	849779	849784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044003
17109	NC_007005	CAAG	2	8	849848	849855	50 %	0 %	25 %	25 %	66044003
17110	NC_007005	CGC	2	6	849887	849892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044003
17111	NC_007005	CGC	2	6	849921	849926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044003
17112	NC_007005	TGC	2	6	849993	849998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044003
17113	NC_007005	CCG	3	9	850040	850048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044003
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17115	NC_007005	AAC	2	6	850141	850146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66044003
17116	NC_007005	TCC	2	6	850188	850193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66044003
17117	NC_007005	ACC	2	6	850265	850270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66044003
17118	NC_007005	AGGC	2	8	850300	850307	25 %	0 %	50 %	25 %	66044003
17119	NC_007005	TA	3	6	850356	850361	50 %	50 %	0 %	0 %	66044003
17120	NC_007005	CTG	2	6	850368	850373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044003
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17125	NC_007005	G	6	6	850604	850609	0 %	0 %	100 %	0 %	66044003
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17267	NC_007005	CATG	2	8	857924	857931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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17269	NC_007005	ATC	2	6	858006	858011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17357	NC_007005	AG	3	6	863045	863050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17358	NC_007005	T	7	7	863055	863061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17359	NC_007005	GGA	2	6	863094	863099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66044013
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17363	NC_007005	GCTGAA	2	12	863193	863204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	66044013
17364	NC_007005	TGT	2	6	863272	863277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66044013
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17366	NC_007005	GTA	2	6	863361	863366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66044013
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17371	NC_007005	G	6	6	863855	863860	0 %	0 %	100 %	0 %	66044013
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17373	NC_007005	GCA	2	6	863993	863998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66044013
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17375	NC_007005	ATC	2	6	864079	864084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044013
17376	NC_007005	GCG	2	6	864092	864097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044013
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17378	NC_007005	TCG	2	6	864181	864186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66044013
17379	NC_007005	CA	3	6	864239	864244	50 %	0 %	0 %	50 %	66044013
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17496	NC_007005	CGC	2	6	869648	869653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66044018
17497	NC_007005	CTGG	2	8	869732	869739	0 %	25 %	50 %	25 %	66044018
17498	NC_007005	ACT	2	6	869815	869820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66044018
17499	NC_007005	GCG	2	6	869857	869862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66044018
17500	NC_007005	CCAA	2	8	869896	869903	50 %	0 %	0 %	50 %	66044018

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