MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_007005	TGG	3	9	818033	818041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043978
16502	NC_007005	CTCCAA	2	12	818055	818066	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	66043978
16503	NC_007005	CAA	2	6	818134	818139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043978
16504	NC_007005	GCG	2	6	818207	818212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043978
16505	NC_007005	GCCG	2	8	818260	818267	0 %	0 %	50 %	50 %	66043978
16506	NC_007005	GAG	2	6	818269	818274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043978
16507	NC_007005	GCT	2	6	818316	818321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043978
16508	NC_007005	CA	3	6	818337	818342	50 %	0 %	0 %	50 %	66043979
16509	NC_007005	CCGG	2	8	818381	818388	0 %	0 %	50 %	50 %	66043979
16510	NC_007005	TGC	2	6	818529	818534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043979
16511	NC_007005	TCG	2	6	818567	818572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043979
16512	NC_007005	CCA	2	6	818778	818783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043979
16513	NC_007005	ACG	2	6	818789	818794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043979
16514	NC_007005	AAT	2	6	818798	818803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043979
16515	NC_007005	TCC	2	6	818839	818844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16516	NC_007005	CCG	2	6	818852	818857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16517	NC_007005	TCG	2	6	818878	818883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16518	NC_007005	AAC	2	6	818890	818895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_007005	GCG	2	6	818921	818926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_007005	TGC	2	6	818928	818933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16521	NC_007005	TGG	2	6	819019	819024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043980
16522	NC_007005	GGC	2	6	819032	819037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043980
16523	NC_007005	TCCA	2	8	819063	819070	25 %	25 %	0 %	50 %	66043980
16524	NC_007005	CAA	2	6	819074	819079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043980
16525	NC_007005	GAC	2	6	819227	819232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043980
16526	NC_007005	GGC	2	6	819254	819259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043980
16527	NC_007005	AGC	2	6	819264	819269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043980
16528	NC_007005	TGG	2	6	819280	819285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043980
16529	NC_007005	CAA	2	6	819314	819319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043980
16530	NC_007005	GCG	2	6	819345	819350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043980
16531	NC_007005	GTCT	2	8	819396	819403	0 %	50 %	25 %	25 %	66043980
16532	NC_007005	GCT	2	6	819430	819435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043980
16533	NC_007005	CTG	2	6	819518	819523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043981
16534	NC_007005	GCG	2	6	819527	819532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043981
16535	NC_007005	CCAG	2	8	819579	819586	25 %	0 %	25 %	50 %	66043981
16536	NC_007005	ATG	2	6	819608	819613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043981
16537	NC_007005	AG	4	8	819779	819786	50 %	0 %	50 %	0 %	66043981
16538	NC_007005	GCA	2	6	819795	819800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043981
16539	NC_007005	TGG	2	6	819989	819994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043982
16540	NC_007005	TGG	2	6	820010	820015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043982
16541	NC_007005	AGG	2	6	820091	820096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043982
16542	NC_007005	CTG	2	6	820108	820113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043982
16543	NC_007005	GACGCT	2	12	820248	820259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043982
16544	NC_007005	CCG	2	6	820265	820270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043982
16545	NC_007005	CTG	2	6	820358	820363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043982
16546	NC_007005	G	6	6	820440	820445	0 %	0 %	100 %	0 %	66043982
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16549	NC_007005	CTG	4	12	820752	820763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043983
16550	NC_007005	GCT	2	6	820766	820771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043983
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16552	NC_007005	CTGC	2	8	820924	820931	0 %	25 %	25 %	50 %	66043983
16553	NC_007005	CCG	2	6	820935	820940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043983
16554	NC_007005	GTT	2	6	821012	821017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043983
16555	NC_007005	GTG	2	6	821171	821176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043984
16556	NC_007005	GC	3	6	821195	821200	0 %	0 %	50 %	50 %	66043984
16557	NC_007005	TTG	2	6	821257	821262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043984
16558	NC_007005	CGG	2	6	821270	821275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043984
16559	NC_007005	TGC	2	6	821291	821296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16560	NC_007005	TCG	2	6	821297	821302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16561	NC_007005	ACA	2	6	821321	821326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043984
16562	NC_007005	CTA	2	6	821376	821381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043984
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16564	NC_007005	GGTG	2	8	821460	821467	0 %	25 %	75 %	0 %	66043984
16565	NC_007005	GGCG	2	8	821515	821522	0 %	0 %	75 %	25 %	66043984
16566	NC_007005	CCGG	2	8	821569	821576	0 %	0 %	50 %	50 %	66043984
16567	NC_007005	GTCC	2	8	821629	821636	0 %	25 %	25 %	50 %	66043984
16568	NC_007005	CAA	2	6	821730	821735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043984
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16572	NC_007005	CTCG	2	8	822137	822144	0 %	25 %	25 %	50 %	66043984
16573	NC_007005	CGGG	2	8	822278	822285	0 %	0 %	75 %	25 %	66043984
16574	NC_007005	GCG	2	6	822385	822390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043984
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16577	NC_007005	GC	3	6	822626	822631	0 %	0 %	50 %	50 %	66043984
16578	NC_007005	GAC	2	6	822639	822644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043984
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16580	NC_007005	CGA	2	6	822710	822715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16581	NC_007005	CCAA	2	8	822778	822785	50 %	0 %	0 %	50 %	66043984
16582	NC_007005	GCT	2	6	822855	822860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043984
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16585	NC_007005	ACC	2	6	822934	822939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043984
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16588	NC_007005	TCA	2	6	823019	823024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043984
16589	NC_007005	GGC	2	6	823201	823206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043984
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16592	NC_007005	CAA	2	6	823323	823328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043984
16593	NC_007005	TGG	2	6	823388	823393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043984
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16595	NC_007005	TTC	2	6	823515	823520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043984
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16599	NC_007005	GC	3	6	823646	823651	0 %	0 %	50 %	50 %	66043984
16600	NC_007005	GTT	2	6	823653	823658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043984
16601	NC_007005	CG	3	6	823667	823672	0 %	0 %	50 %	50 %	66043984
16602	NC_007005	CCAA	2	8	823676	823683	50 %	0 %	0 %	50 %	66043984
16603	NC_007005	ATC	2	6	823712	823717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043984
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16605	NC_007005	CAGGCG	2	12	823855	823866	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	66043984
16606	NC_007005	ACC	2	6	823894	823899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043984
16607	NC_007005	CAAC	2	8	823913	823920	50 %	0 %	0 %	50 %	66043984
16608	NC_007005	GTCA	2	8	823932	823939	25 %	25 %	25 %	25 %	66043984
16609	NC_007005	ATC	2	6	824026	824031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043984
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16611	NC_007005	ACCGGT	2	12	824074	824085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16612	NC_007005	TGC	2	6	824103	824108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16613	NC_007005	GCA	2	6	824114	824119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16614	NC_007005	GCG	2	6	824147	824152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043984
16615	NC_007005	GTC	2	6	824212	824217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043984
16616	NC_007005	CAT	2	6	824334	824339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043984
16617	NC_007005	GCGA	2	8	824372	824379	25 %	0 %	50 %	25 %	66043985
16618	NC_007005	TCG	2	6	824413	824418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043985
16619	NC_007005	GGC	2	6	824438	824443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043985
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16621	NC_007005	TGG	2	6	824582	824587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043985
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16743	NC_007005	TCA	2	6	830747	830752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043991
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16993	NC_007005	ATC	2	6	843160	843165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043999
16994	NC_007005	TCG	2	6	843171	843176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043999
16995	NC_007005	GCC	2	6	843185	843190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043999
16996	NC_007005	AAT	2	6	843219	843224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043999
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16998	NC_007005	CTTC	2	8	843458	843465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16999	NC_007005	CAT	2	6	843493	843498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17000	NC_007005	CGCTT	2	10	843510	843519	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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