MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007005	CTT	2	6	694645	694650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043871
14002	NC_007005	CAC	2	6	694654	694659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043871
14003	NC_007005	CCAGC	2	10	694753	694762	20 %	0 %	20 %	60 %	66043871
14004	NC_007005	CG	3	6	694817	694822	0 %	0 %	50 %	50 %	66043871
14005	NC_007005	TGC	2	6	694860	694865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043871
14006	NC_007005	TGC	2	6	694875	694880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043871
14007	NC_007005	CCG	2	6	694925	694930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043871
14008	NC_007005	TGTCGT	2	12	694950	694961	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	66043871
14009	NC_007005	CGG	2	6	694980	694985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043871
14010	NC_007005	GC	3	6	695034	695039	0 %	0 %	50 %	50 %	66043871
14011	NC_007005	GCG	2	6	695108	695113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043871
14012	NC_007005	GGC	2	6	695179	695184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043871
14013	NC_007005	CTTC	2	8	695190	695197	0 %	50 %	0 %	50 %	66043871
14014	NC_007005	GC	3	6	695215	695220	0 %	0 %	50 %	50 %	66043871
14015	NC_007005	ACG	2	6	695221	695226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043871
14016	NC_007005	TGA	2	6	695255	695260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043871
14017	NC_007005	GTC	2	6	695281	695286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043871
14018	NC_007005	CGT	2	6	695506	695511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043871
14019	NC_007005	GGC	2	6	695543	695548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_007005	CGG	2	6	695588	695593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_007005	TCCGG	2	10	695660	695669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14022	NC_007005	CGA	2	6	695693	695698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043872
14023	NC_007005	GCG	2	6	695728	695733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043872
14024	NC_007005	CAG	2	6	695808	695813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043872
14025	NC_007005	GTC	2	6	695898	695903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043872
14026	NC_007005	CG	3	6	695932	695937	0 %	0 %	50 %	50 %	66043872
14027	NC_007005	ACC	2	6	696099	696104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043872
14028	NC_007005	CCG	2	6	696113	696118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043872
14029	NC_007005	GTC	4	12	696291	696302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043872
14030	NC_007005	GGC	2	6	696360	696365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043872
14031	NC_007005	GGC	2	6	696405	696410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043872
14032	NC_007005	AGC	2	6	696418	696423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043872
14033	NC_007005	GCC	2	6	696438	696443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043872
14034	NC_007005	TCA	2	6	696446	696451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043872
14035	NC_007005	TGC	2	6	696519	696524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043872
14036	NC_007005	TCG	2	6	696582	696587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043873
14037	NC_007005	CAG	2	6	696620	696625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043873
14038	NC_007005	CG	3	6	696835	696840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_007005	GCG	2	6	696873	696878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_007005	GCA	2	6	696982	696987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043874
14041	NC_007005	GTT	2	6	697015	697020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043874
14042	NC_007005	ACC	2	6	697046	697051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043874
14043	NC_007005	CATG	2	8	697270	697277	25 %	25 %	25 %	25 %	66043874
14044	NC_007005	GC	3	6	697283	697288	0 %	0 %	50 %	50 %	66043874
14045	NC_007005	CAC	2	6	697303	697308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043874
14046	NC_007005	GCA	2	6	697309	697314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043874
14047	NC_007005	TCG	2	6	697326	697331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043874
14048	NC_007005	CGG	2	6	697351	697356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043874
14049	NC_007005	GGT	2	6	697391	697396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043874
14050	NC_007005	CAT	2	6	697409	697414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043874
14051	NC_007005	GGCC	2	8	697426	697433	0 %	0 %	50 %	50 %	66043874
14052	NC_007005	CCAGCG	2	12	697471	697482	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	66043874
14053	NC_007005	CAGC	2	8	697519	697526	25 %	0 %	25 %	50 %	66043874
14054	NC_007005	GGGC	2	8	697558	697565	0 %	0 %	75 %	25 %	66043874
14055	NC_007005	CA	3	6	697570	697575	50 %	0 %	0 %	50 %	66043874
14056	NC_007005	ATC	2	6	697611	697616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043874
14057	NC_007005	CAGG	2	8	697814	697821	25 %	0 %	50 %	25 %	66043874
14058	NC_007005	GTG	2	6	697917	697922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043874
14059	NC_007005	ACG	2	6	697980	697985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043874
14060	NC_007005	CTGT	2	8	698214	698221	0 %	50 %	25 %	25 %	66043875
14061	NC_007005	AGCG	2	8	698263	698270	25 %	0 %	50 %	25 %	66043875
14062	NC_007005	CGA	2	6	698285	698290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043875
14063	NC_007005	TCG	2	6	698293	698298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043875
14064	NC_007005	CAG	2	6	698466	698471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043875
14065	NC_007005	GCC	2	6	698490	698495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043875
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14068	NC_007005	CCA	2	6	698627	698632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043875
14069	NC_007005	AT	3	6	698648	698653	50 %	50 %	0 %	0 %	66043875
14070	NC_007005	CGGC	2	8	698660	698667	0 %	0 %	50 %	50 %	66043875
14071	NC_007005	TGGC	2	8	698696	698703	0 %	25 %	50 %	25 %	66043875
14072	NC_007005	ACC	2	6	698762	698767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043875
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14075	NC_007005	TCT	2	6	698881	698886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043875
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14077	NC_007005	CTGG	2	8	698951	698958	0 %	25 %	50 %	25 %	66043875
14078	NC_007005	GTG	2	6	698959	698964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043875
14079	NC_007005	ACC	2	6	698989	698994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043875
14080	NC_007005	CTG	2	6	699090	699095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043875
14081	NC_007005	TCA	2	6	699124	699129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043875
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14083	NC_007005	GAA	2	6	699229	699234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_007005	GTT	2	6	699237	699242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_007005	TTAT	2	8	699376	699383	25 %	75 %	0 %	0 %	66043876
14086	NC_007005	CTT	2	6	699423	699428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043876
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14089	NC_007005	TCT	2	6	699485	699490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043876
14090	NC_007005	CCG	2	6	699740	699745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043876
14091	NC_007005	TTCGG	2	10	699793	699802	0 %	40 %	40 %	20 %	66043876
14092	NC_007005	CGG	2	6	699813	699818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043876
14093	NC_007005	CAG	2	6	699850	699855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043876
14094	NC_007005	CAG	2	6	700021	700026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043876
14095	NC_007005	GT	3	6	700117	700122	0 %	50 %	50 %	0 %	66043876
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14099	NC_007005	GAG	2	6	700219	700224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_007005	CGT	2	6	700400	700405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_007005	AGA	2	6	700428	700433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_007005	GCA	2	6	700446	700451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_007005	CT	4	8	700498	700505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14104	NC_007005	TGA	2	6	700559	700564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043877
14105	NC_007005	TCA	2	6	700592	700597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043877
14106	NC_007005	AGT	2	6	700708	700713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043877
14107	NC_007005	GTT	2	6	700876	700881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043877
14108	NC_007005	TCA	2	6	700909	700914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043877
14109	NC_007005	CGG	2	6	700929	700934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043877
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14116	NC_007005	CGT	2	6	701315	701320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043878
14117	NC_007005	GAA	2	6	701378	701383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043878
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14119	NC_007005	TTG	2	6	701520	701525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043878
14120	NC_007005	GGGT	2	8	701605	701612	0 %	25 %	75 %	0 %	66043878
14121	NC_007005	ACGA	2	8	701875	701882	50 %	0 %	25 %	25 %	66043878
14122	NC_007005	ATG	2	6	701889	701894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043878
14123	NC_007005	AGA	2	6	701936	701941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043878
14124	NC_007005	TGA	2	6	701986	701991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043878
14125	NC_007005	TTA	2	6	702002	702007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043878
14126	NC_007005	GGCCGG	2	12	702101	702112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043879
14127	NC_007005	TTGCGG	2	12	702121	702132	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	66043879
14128	NC_007005	GAT	2	6	702176	702181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043879
14129	NC_007005	TCG	2	6	702307	702312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043879
14130	NC_007005	CGG	2	6	702317	702322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043879
14131	NC_007005	GCA	2	6	702354	702359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043879
14132	NC_007005	CGA	2	6	702371	702376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043879
14133	NC_007005	CAGC	2	8	702377	702384	25 %	0 %	25 %	50 %	66043879
14134	NC_007005	TGA	2	6	702388	702393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043879
14135	NC_007005	GCA	2	6	702525	702530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043879
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14141	NC_007005	GCAG	3	12	702808	702819	25 %	0 %	50 %	25 %	66043879
14142	NC_007005	ATC	2	6	702847	702852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043880
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14146	NC_007005	TCA	2	6	703181	703186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043880
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14150	NC_007005	GCA	2	6	703371	703376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043880
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14153	NC_007005	GCC	2	6	703569	703574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043881
14154	NC_007005	ACG	2	6	703593	703598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043881
14155	NC_007005	TCA	2	6	703668	703673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043881
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14157	NC_007005	TCA	2	6	703751	703756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043881
14158	NC_007005	ATG	2	6	703820	703825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043881
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14170	NC_007005	GC	3	6	704536	704541	0 %	0 %	50 %	50 %	66043882
14171	NC_007005	A	7	7	704576	704582	100 %	0 %	0 %	0 %	66043882
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14182	NC_007005	CTG	3	9	705395	705403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043884
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14186	NC_007005	CTG	2	6	705686	705691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043884
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14189	NC_007005	AAG	2	6	705779	705784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043884
14190	NC_007005	CCG	2	6	705874	705879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043884
14191	NC_007005	TGA	2	6	705900	705905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043884
14192	NC_007005	TTC	2	6	705920	705925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043884
14193	NC_007005	CTG	2	6	705998	706003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043884
14194	NC_007005	GCACC	2	10	706009	706018	20 %	0 %	20 %	60 %	66043884
14195	NC_007005	GACCG	2	10	706064	706073	20 %	0 %	40 %	40 %	66043884
14196	NC_007005	ACA	2	6	706101	706106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043884
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14198	NC_007005	GCT	2	6	706294	706299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043884
14199	NC_007005	TCTG	2	8	706393	706400	0 %	50 %	25 %	25 %	66043884
14200	NC_007005	CGG	2	6	706458	706463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043884
14201	NC_007005	GATC	2	8	706516	706523	25 %	25 %	25 %	25 %	66043884
14202	NC_007005	CAG	2	6	706532	706537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043884
14203	NC_007005	CAG	2	6	706751	706756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043884
14204	NC_007005	ACT	2	6	706761	706766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043884
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14206	NC_007005	TCT	2	6	706777	706782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043884
14207	NC_007005	GT	3	6	706815	706820	0 %	50 %	50 %	0 %	66043884
14208	NC_007005	TCT	2	6	706839	706844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043884
14209	NC_007005	TCG	2	6	706931	706936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043885
14210	NC_007005	AGCCCC	2	12	706948	706959	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	66043885
14211	NC_007005	TCA	2	6	706965	706970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043885
14212	NC_007005	TGAT	2	8	707030	707037	25 %	50 %	25 %	0 %	66043885
14213	NC_007005	GGA	2	6	707103	707108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043885
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14216	NC_007005	GCGAAA	2	12	707277	707288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	66043885
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14219	NC_007005	CGTTC	2	10	707386	707395	0 %	40 %	20 %	40 %	66043885
14220	NC_007005	ATC	2	6	707716	707721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043886
14221	NC_007005	GAT	2	6	707782	707787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043886
14222	NC_007005	TCG	2	6	707798	707803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043886
14223	NC_007005	TGC	2	6	707837	707842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043886
14224	NC_007005	GC	3	6	707895	707900	0 %	0 %	50 %	50 %	66043886
14225	NC_007005	TGA	2	6	707946	707951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043886
14226	NC_007005	ACG	2	6	707998	708003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043886
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14228	NC_007005	AT	3	6	708044	708049	50 %	50 %	0 %	0 %	66043886
14229	NC_007005	CG	3	6	708180	708185	0 %	0 %	50 %	50 %	66043886
14230	NC_007005	GCC	2	6	708371	708376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043886
14231	NC_007005	GAC	2	6	708384	708389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043886
14232	NC_007005	GC	3	6	708457	708462	0 %	0 %	50 %	50 %	66043886
14233	NC_007005	TCAA	2	8	708470	708477	50 %	25 %	0 %	25 %	66043886
14234	NC_007005	CTG	2	6	708481	708486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043886
14235	NC_007005	CCTG	2	8	708488	708495	0 %	25 %	25 %	50 %	66043886
14236	NC_007005	TGG	2	6	708505	708510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043886
14237	NC_007005	ATA	2	6	708676	708681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14238	NC_007005	CGC	2	6	708715	708720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14239	NC_007005	TG	3	6	708728	708733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14240	NC_007005	T	7	7	708746	708752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14241	NC_007005	GAAT	2	8	708795	708802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14242	NC_007005	ATGGCT	2	12	708840	708851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	66043887
14243	NC_007005	CTG	2	6	708856	708861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043887
14244	NC_007005	AGCG	2	8	708909	708916	25 %	0 %	50 %	25 %	66043887
14245	NC_007005	GCAGT	2	10	708961	708970	20 %	20 %	40 %	20 %	66043887
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14248	NC_007005	GCT	2	6	709308	709313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043887
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14257	NC_007005	GCA	2	6	709654	709659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043887
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14342	NC_007005	ACAG	2	8	714328	714335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14355	NC_007005	GCCAG	2	10	714814	714823	20 %	0 %	40 %	40 %	66043892
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14485	NC_007005	ATCC	2	8	721201	721208	25 %	25 %	0 %	50 %	66043897
14486	NC_007005	GAC	2	6	721209	721214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043897
14487	NC_007005	GCT	2	6	721247	721252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043897
14488	NC_007005	GGCA	2	8	721289	721296	25 %	0 %	50 %	25 %	66043897
14489	NC_007005	CGT	2	6	721434	721439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043897
14490	NC_007005	GCG	2	6	721485	721490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043897
14491	NC_007005	ATG	2	6	721529	721534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043897
14492	NC_007005	CCA	2	6	721562	721567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043897
14493	NC_007005	AAG	2	6	721585	721590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043897
14494	NC_007005	GTC	2	6	721615	721620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043897
14495	NC_007005	GC	3	6	721649	721654	0 %	0 %	50 %	50 %	66043897
14496	NC_007005	GGT	2	6	721695	721700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043897
14497	NC_007005	C	6	6	721711	721716	0 %	0 %	0 %	100 %	66043897
14498	NC_007005	CTGGG	2	10	721720	721729	0 %	20 %	60 %	20 %	66043897
14499	NC_007005	GGC	2	6	721734	721739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043897
14500	NC_007005	ATC	2	6	721792	721797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043897

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