MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_007005	CAG	2	6	669174	669179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13502	NC_007005	TGC	2	6	669181	669186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13503	NC_007005	CTCA	2	8	669219	669226	25 %	25 %	0 %	50 %	66043853
13504	NC_007005	TGA	2	6	669260	669265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043853
13505	NC_007005	CGT	2	6	669305	669310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13506	NC_007005	GCA	2	6	669323	669328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13507	NC_007005	TCA	2	6	669347	669352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043853
13508	NC_007005	TGCTT	2	10	669459	669468	0 %	60 %	20 %	20 %	66043853
13509	NC_007005	CGGGC	2	10	669477	669486	0 %	0 %	60 %	40 %	66043853
13510	NC_007005	TTC	2	6	669538	669543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043853
13511	NC_007005	CTG	2	6	669561	669566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13512	NC_007005	CGT	2	6	669617	669622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13513	NC_007005	GGC	2	6	669635	669640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043853
13514	NC_007005	TTG	2	6	669649	669654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043853
13515	NC_007005	TCG	2	6	669754	669759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13516	NC_007005	GC	3	6	669869	669874	0 %	0 %	50 %	50 %	66043853
13517	NC_007005	CAT	2	6	669977	669982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043853
13518	NC_007005	CTG	2	6	669984	669989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043853
13519	NC_007005	GC	3	6	669999	670004	0 %	0 %	50 %	50 %	66043853
13520	NC_007005	TAA	2	6	670033	670038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043853
13521	NC_007005	GC	3	6	670195	670200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13522	NC_007005	A	6	6	670247	670252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_007005	GAA	2	6	670391	670396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043854
13524	NC_007005	CAT	3	9	670426	670434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043854
13525	NC_007005	ATC	2	6	670481	670486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043854
13526	NC_007005	GTC	2	6	670488	670493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13527	NC_007005	ATC	2	6	670523	670528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043854
13528	NC_007005	GAC	2	6	670553	670558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13529	NC_007005	GAT	2	6	670618	670623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043854
13530	NC_007005	GGC	2	6	670676	670681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043854
13531	NC_007005	CAGC	2	8	670720	670727	25 %	0 %	25 %	50 %	66043854
13532	NC_007005	GGC	2	6	670766	670771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043854
13533	NC_007005	ACT	2	6	670806	670811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043854
13534	NC_007005	CTG	2	6	670862	670867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13535	NC_007005	TCG	2	6	670966	670971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13536	NC_007005	CGC	2	6	670977	670982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043854
13537	NC_007005	ATC	2	6	671039	671044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043854
13538	NC_007005	GGT	2	6	671128	671133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043854
13539	NC_007005	ACG	2	6	671208	671213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13540	NC_007005	TGC	2	6	671241	671246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13541	NC_007005	AACC	2	8	671254	671261	50 %	0 %	0 %	50 %	66043854
13542	NC_007005	CG	3	6	671273	671278	0 %	0 %	50 %	50 %	66043854
13543	NC_007005	CCG	2	6	671318	671323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043854
13544	NC_007005	GAA	2	6	671342	671347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043854
13545	NC_007005	CG	4	8	671374	671381	0 %	0 %	50 %	50 %	66043854
13546	NC_007005	CAT	2	6	671446	671451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043854
13547	NC_007005	GCT	2	6	671457	671462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13548	NC_007005	CGG	2	6	671464	671469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043854
13549	NC_007005	GGGC	2	8	671599	671606	0 %	0 %	75 %	25 %	66043854
13550	NC_007005	ATCGC	2	10	671622	671631	20 %	20 %	20 %	40 %	66043854
13551	NC_007005	TCG	2	6	671717	671722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13552	NC_007005	GC	4	8	671744	671751	0 %	0 %	50 %	50 %	66043854
13553	NC_007005	CAC	2	6	671843	671848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043854
13554	NC_007005	GGT	2	6	671852	671857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043854
13555	NC_007005	AC	3	6	671878	671883	50 %	0 %	0 %	50 %	66043854
13556	NC_007005	GAT	2	6	671905	671910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043854
13557	NC_007005	CGC	2	6	672007	672012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043854
13558	NC_007005	CAC	2	6	672022	672027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043854
13559	NC_007005	ATG	2	6	672038	672043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043854
13560	NC_007005	GGCCAC	2	12	672115	672126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	66043854
13561	NC_007005	CGT	2	6	672212	672217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13562	NC_007005	TGC	2	6	672264	672269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13563	NC_007005	CGGGC	2	10	672307	672316	0 %	0 %	60 %	40 %	66043854
13564	NC_007005	GC	3	6	672368	672373	0 %	0 %	50 %	50 %	66043854
13565	NC_007005	CGG	2	6	672390	672395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043854
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13567	NC_007005	GCA	2	6	672477	672482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043854
13568	NC_007005	GCC	2	6	672515	672520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043854
13569	NC_007005	GC	3	6	672524	672529	0 %	0 %	50 %	50 %	66043854
13570	NC_007005	GCC	2	6	672539	672544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043854
13571	NC_007005	CAAAGG	2	12	672565	672576	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	66043854
13572	NC_007005	GGT	2	6	672601	672606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043854
13573	NC_007005	CATA	2	8	672661	672668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13574	NC_007005	ATC	2	6	672812	672817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_007005	CAC	2	6	672866	672871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13576	NC_007005	CGC	2	6	672911	672916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13577	NC_007005	TTC	2	6	672923	672928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_007005	C	6	6	672930	672935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13579	NC_007005	TTA	2	6	672964	672969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_007005	CGGC	2	8	672996	673003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13581	NC_007005	TGC	2	6	673014	673019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_007005	AGG	2	6	673112	673117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_007005	CG	3	6	673172	673177	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
13584	NC_007005	GCC	2	6	673214	673219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043855
13585	NC_007005	CCTG	2	8	673258	673265	0 %	25 %	25 %	50 %	66043855
13586	NC_007005	TCA	2	6	673275	673280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043855
13587	NC_007005	GCA	2	6	673285	673290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13588	NC_007005	CTT	2	6	673399	673404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043855
13589	NC_007005	AGC	2	6	673452	673457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13590	NC_007005	GCT	2	6	673678	673683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13591	NC_007005	CTG	2	6	673691	673696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13592	NC_007005	GGC	2	6	673711	673716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043855
13593	NC_007005	GC	3	6	673715	673720	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
13594	NC_007005	CGG	2	6	673923	673928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043855
13595	NC_007005	GTCG	2	8	673981	673988	0 %	25 %	50 %	25 %	66043855
13596	NC_007005	CG	3	6	674007	674012	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
13597	NC_007005	CTG	2	6	674081	674086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13598	NC_007005	CGA	2	6	674089	674094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13599	NC_007005	GCG	2	6	674112	674117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043855
13600	NC_007005	CGA	2	6	674137	674142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13601	NC_007005	CCG	2	6	674166	674171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043855
13602	NC_007005	CCG	2	6	674199	674204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043855
13603	NC_007005	CGC	2	6	674235	674240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043855
13604	NC_007005	GGGCA	2	10	674258	674267	20 %	0 %	60 %	20 %	66043855
13605	NC_007005	AAT	2	6	674345	674350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043855
13606	NC_007005	CTA	2	6	674479	674484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043855
13607	NC_007005	GC	3	6	674558	674563	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
13608	NC_007005	GAT	2	6	674596	674601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043855
13609	NC_007005	GGC	2	6	674749	674754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043855
13610	NC_007005	TTCA	2	8	674765	674772	25 %	50 %	0 %	25 %	66043855
13611	NC_007005	CGAC	2	8	674775	674782	25 %	0 %	25 %	50 %	66043855
13612	NC_007005	GC	4	8	674860	674867	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
13613	NC_007005	CGA	2	6	674875	674880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043855
13614	NC_007005	TG	3	6	674910	674915	0 %	50 %	50 %	0 %	66043855
13615	NC_007005	GC	3	6	674921	674926	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
13616	NC_007005	GGC	2	6	674931	674936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043855
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13622	NC_007005	GC	3	6	675176	675181	0 %	0 %	50 %	50 %	66043855
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13988	NC_007005	CGC	2	6	693995	694000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043871
13989	NC_007005	CG	3	6	694065	694070	0 %	0 %	50 %	50 %	66043871
13990	NC_007005	CTG	2	6	694080	694085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043871
13991	NC_007005	TCA	2	6	694149	694154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043871
13992	NC_007005	CCA	2	6	694224	694229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043871
13993	NC_007005	CGT	2	6	694278	694283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043871
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13996	NC_007005	GCC	2	6	694364	694369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043871
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13999	NC_007005	GATCG	2	10	694609	694618	20 %	20 %	40 %	20 %	66043871
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