MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007005	TCT	2	6	619282	619287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043813
12502	NC_007005	GTG	2	6	619359	619364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043813
12503	NC_007005	AGTGA	2	10	619473	619482	40 %	20 %	40 %	0 %	66043813
12504	NC_007005	CGG	2	6	619686	619691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043814
12505	NC_007005	CGG	2	6	619819	619824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043814
12506	NC_007005	GTTC	2	8	619852	619859	0 %	50 %	25 %	25 %	66043814
12507	NC_007005	ACG	2	6	619863	619868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043814
12508	NC_007005	TGC	2	6	619878	619883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043814
12509	NC_007005	GTG	2	6	619907	619912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043814
12510	NC_007005	CAA	2	6	619951	619956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043814
12511	NC_007005	AGC	2	6	620001	620006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043814
12512	NC_007005	GAA	2	6	620009	620014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043814
12513	NC_007005	GGA	3	9	620032	620040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043814
12514	NC_007005	CGA	2	6	620104	620109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043814
12515	NC_007005	GTTC	2	8	620110	620117	0 %	50 %	25 %	25 %	66043814
12516	NC_007005	GCA	2	6	620136	620141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043814
12517	NC_007005	GCGG	2	8	620150	620157	0 %	0 %	75 %	25 %	66043814
12518	NC_007005	CGA	2	6	620259	620264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043814
12519	NC_007005	TGGC	2	8	620279	620286	0 %	25 %	50 %	25 %	66043814
12520	NC_007005	TGCG	2	8	620370	620377	0 %	25 %	50 %	25 %	66043815
12521	NC_007005	CG	3	6	620388	620393	0 %	0 %	50 %	50 %	66043815
12522	NC_007005	CGC	2	6	620437	620442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043815
12523	NC_007005	ACC	3	9	620512	620520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043815
12524	NC_007005	ACG	2	6	620588	620593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043815
12525	NC_007005	CCAG	2	8	620673	620680	25 %	0 %	25 %	50 %	66043815
12526	NC_007005	AC	3	6	620777	620782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12527	NC_007005	CCCG	2	8	620859	620866	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12528	NC_007005	CT	3	6	620895	620900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_007005	TCG	2	6	620930	620935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12530	NC_007005	TTG	2	6	620993	620998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043816
12531	NC_007005	AGC	2	6	621051	621056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12532	NC_007005	CA	3	6	621057	621062	50 %	0 %	0 %	50 %	66043816
12533	NC_007005	GCG	2	6	621081	621086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043816
12534	NC_007005	TCG	2	6	621127	621132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12535	NC_007005	GCGG	2	8	621138	621145	0 %	0 %	75 %	25 %	66043816
12536	NC_007005	GC	3	6	621158	621163	0 %	0 %	50 %	50 %	66043816
12537	NC_007005	ACG	2	6	621180	621185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12538	NC_007005	GCA	2	6	621211	621216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12539	NC_007005	GCT	2	6	621223	621228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12540	NC_007005	TGG	2	6	621237	621242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043816
12541	NC_007005	GCT	2	6	621265	621270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12542	NC_007005	CGG	2	6	621276	621281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043816
12543	NC_007005	CAT	2	6	621362	621367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043816
12544	NC_007005	CTG	2	6	621539	621544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12545	NC_007005	GCTG	2	8	621621	621628	0 %	25 %	50 %	25 %	66043816
12546	NC_007005	ACG	2	6	621636	621641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043816
12547	NC_007005	CGG	2	6	621700	621705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043816
12548	NC_007005	AC	3	6	621817	621822	50 %	0 %	0 %	50 %	66043817
12549	NC_007005	TCAGC	2	10	621878	621887	20 %	20 %	20 %	40 %	66043817
12550	NC_007005	GC	3	6	621886	621891	0 %	0 %	50 %	50 %	66043817
12551	NC_007005	TGA	2	6	621892	621897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043817
12552	NC_007005	CGG	2	6	622022	622027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043817
12553	NC_007005	CTA	2	6	622028	622033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043817
12554	NC_007005	CGC	2	6	622207	622212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043817
12555	NC_007005	GCA	2	6	622220	622225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043817
12556	NC_007005	TCG	2	6	622268	622273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043817
12557	NC_007005	GGCG	2	8	622313	622320	0 %	0 %	75 %	25 %	66043817
12558	NC_007005	CTG	2	6	622362	622367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043817
12559	NC_007005	AGA	2	6	622399	622404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043817
12560	NC_007005	ACC	2	6	622610	622615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043818
12561	NC_007005	ACA	2	6	622634	622639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043818
12562	NC_007005	CGA	2	6	622644	622649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12563	NC_007005	GGCC	2	8	622656	622663	0 %	0 %	50 %	50 %	66043818
12564	NC_007005	CG	3	6	622665	622670	0 %	0 %	50 %	50 %	66043818
12565	NC_007005	CGA	2	6	622716	622721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12566	NC_007005	GAA	2	6	622753	622758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043818
12567	NC_007005	GGC	2	6	622801	622806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12568	NC_007005	CAA	2	6	622815	622820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043818
12569	NC_007005	CGG	2	6	622836	622841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12570	NC_007005	GTC	2	6	622966	622971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12571	NC_007005	CAAGGC	2	12	623076	623087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12572	NC_007005	CTG	2	6	623104	623109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12573	NC_007005	GCG	2	6	623132	623137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12574	NC_007005	GGC	2	6	623338	623343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12575	NC_007005	GTG	2	6	623420	623425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043818
12576	NC_007005	GTC	2	6	623523	623528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12577	NC_007005	GCG	3	9	623536	623544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12578	NC_007005	CAA	2	6	623631	623636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043818
12579	NC_007005	AGCGCA	2	12	623672	623683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12580	NC_007005	GCTG	2	8	623712	623719	0 %	25 %	50 %	25 %	66043818
12581	NC_007005	GC	3	6	623740	623745	0 %	0 %	50 %	50 %	66043818
12582	NC_007005	CGG	2	6	623778	623783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12583	NC_007005	GGC	2	6	623866	623871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043818
12584	NC_007005	GCT	2	6	624012	624017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12585	NC_007005	GCA	2	6	624033	624038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043818
12586	NC_007005	GTTG	2	8	624048	624055	0 %	50 %	50 %	0 %	66043818
12587	NC_007005	GCC	2	6	624081	624086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043818
12588	NC_007005	CTA	2	6	624117	624122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043818
12589	NC_007005	CGC	2	6	624230	624235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043818
12590	NC_007005	ACC	2	6	624247	624252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043818
12591	NC_007005	GAT	2	6	624292	624297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043818
12592	NC_007005	ATG	2	6	624316	624321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043818
12593	NC_007005	AAG	2	6	624337	624342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043818
12594	NC_007005	CGC	2	6	624419	624424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043819
12595	NC_007005	CCTGAT	2	12	624425	624436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	66043819
12596	NC_007005	GAC	2	6	624498	624503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043819
12597	NC_007005	GAC	2	6	624570	624575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043819
12598	NC_007005	CAT	2	6	624627	624632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043819
12599	NC_007005	CGG	2	6	624707	624712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043819
12600	NC_007005	CTGG	2	8	624818	624825	0 %	25 %	50 %	25 %	66043819
12601	NC_007005	TGG	2	6	624841	624846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043819
12602	NC_007005	CTGG	2	8	624929	624936	0 %	25 %	50 %	25 %	66043819
12603	NC_007005	TGG	2	6	624964	624969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043819
12604	NC_007005	TGC	2	6	625012	625017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043819
12605	NC_007005	GCC	2	6	625043	625048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043819
12606	NC_007005	GCA	2	6	625057	625062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043819
12607	NC_007005	CGTCG	2	10	625210	625219	0 %	20 %	40 %	40 %	66043819
12608	NC_007005	TGG	3	9	625252	625260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043819
12609	NC_007005	AAT	2	6	625290	625295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043819
12610	NC_007005	GTGC	2	8	625302	625309	0 %	25 %	50 %	25 %	66043819
12611	NC_007005	GC	3	6	625399	625404	0 %	0 %	50 %	50 %	66043820
12612	NC_007005	TGA	2	6	625416	625421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043820
12613	NC_007005	GGC	2	6	625432	625437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043820
12614	NC_007005	GCA	2	6	625483	625488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043820
12615	NC_007005	TA	3	6	625529	625534	50 %	50 %	0 %	0 %	66043820
12616	NC_007005	GGCA	2	8	625546	625553	25 %	0 %	50 %	25 %	66043820
12617	NC_007005	CGGTCA	2	12	625686	625697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043820
12618	NC_007005	TGG	2	6	625785	625790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043820
12619	NC_007005	TGC	2	6	625815	625820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043820
12620	NC_007005	AAC	2	6	625839	625844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043820
12621	NC_007005	CA	3	6	625852	625857	50 %	0 %	0 %	50 %	66043820
12622	NC_007005	GGC	2	6	625862	625867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043820
12623	NC_007005	TGC	3	9	625872	625880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043820
12624	NC_007005	ATG	2	6	625894	625899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043820
12625	NC_007005	ACT	2	6	625987	625992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043821
12626	NC_007005	CAT	2	6	626060	626065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043821
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12630	NC_007005	GAT	2	6	626256	626261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043821
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12633	NC_007005	CTG	2	6	626511	626516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043821
12634	NC_007005	CCGA	2	8	626574	626581	25 %	0 %	25 %	50 %	66043821
12635	NC_007005	ATC	2	6	626589	626594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043821
12636	NC_007005	CGC	2	6	626596	626601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043821
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12662	NC_007005	ATT	2	6	628142	628147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043821
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12678	NC_007005	TTG	2	6	629081	629086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12684	NC_007005	TCG	2	6	629516	629521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043823
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12728	NC_007005	GCGCA	2	10	632024	632033	20 %	0 %	40 %	40 %	66043824
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12734	NC_007005	GCT	2	6	632437	632442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043825
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12739	NC_007005	TGC	2	6	632502	632507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043825
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12984	NC_007005	CGC	2	6	643521	643526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043833
12985	NC_007005	CAGG	2	8	643542	643549	25 %	0 %	50 %	25 %	66043833
12986	NC_007005	AAGA	2	8	643623	643630	75 %	0 %	25 %	0 %	66043833
12987	NC_007005	CCAGC	2	10	643677	643686	20 %	0 %	20 %	60 %	66043833
12988	NC_007005	GC	3	6	643721	643726	0 %	0 %	50 %	50 %	66043833
12989	NC_007005	CTG	2	6	643764	643769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043833
12990	NC_007005	TGC	2	6	643786	643791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043833
12991	NC_007005	TGC	2	6	643964	643969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043833
12992	NC_007005	TTGA	2	8	644101	644108	25 %	50 %	25 %	0 %	66043833
12993	NC_007005	GGC	2	6	644118	644123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043833
12994	NC_007005	ATC	2	6	644127	644132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043833
12995	NC_007005	CAG	2	6	644147	644152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043833
12996	NC_007005	AG	3	6	644170	644175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12997	NC_007005	TGC	2	6	644335	644340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043834
12998	NC_007005	AAC	2	6	644421	644426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043834
12999	NC_007005	TGG	2	6	644443	644448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043834
13000	NC_007005	TGC	2	6	644522	644527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043834

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