MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_007005	CGG	2	6	593419	593424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043794
12003	NC_007005	AGC	2	6	593492	593497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12004	NC_007005	CGCT	2	8	593522	593529	0 %	25 %	25 %	50 %	66043794
12005	NC_007005	CAG	2	6	593575	593580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12006	NC_007005	GCT	2	6	593589	593594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12007	NC_007005	GC	3	6	593723	593728	0 %	0 %	50 %	50 %	66043794
12008	NC_007005	TCG	2	6	593783	593788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12009	NC_007005	CGGG	2	8	593896	593903	0 %	0 %	75 %	25 %	66043794
12010	NC_007005	AGC	2	6	593924	593929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12011	NC_007005	GCA	2	6	593973	593978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12012	NC_007005	GTGTCG	2	12	593984	593995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	66043794
12013	NC_007005	CTG	2	6	594010	594015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043794
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12015	NC_007005	CAG	2	6	594085	594090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12016	NC_007005	CTG	2	6	594124	594129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043794
12017	NC_007005	CGC	2	6	594160	594165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043794
12018	NC_007005	CGC	2	6	594223	594228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043794
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12020	NC_007005	GTTG	2	8	594276	594283	0 %	50 %	50 %	0 %	66043794
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12051	NC_007005	GCC	2	6	595829	595834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_007005	TGCA	2	8	595950	595957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12053	NC_007005	AGC	2	6	596058	596063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043795
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12056	NC_007005	TCTG	2	8	596132	596139	0 %	50 %	25 %	25 %	66043795
12057	NC_007005	GCAG	2	8	596142	596149	25 %	0 %	50 %	25 %	66043795
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12100	NC_007005	CAGC	2	8	598399	598406	25 %	0 %	25 %	50 %	66043796
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12103	NC_007005	CTG	2	6	598577	598582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043796
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12120	NC_007005	GCT	2	6	599463	599468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043797
12121	NC_007005	TCGGT	2	10	599471	599480	0 %	40 %	40 %	20 %	66043797
12122	NC_007005	CGG	2	6	599565	599570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043797
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12124	NC_007005	CTG	2	6	599814	599819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043798
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12126	NC_007005	TGG	2	6	599844	599849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043798
12127	NC_007005	GT	3	6	599868	599873	0 %	50 %	50 %	0 %	66043798
12128	NC_007005	ATC	2	6	599905	599910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043798
12129	NC_007005	TGC	2	6	599948	599953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043798
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12131	NC_007005	CGA	2	6	600026	600031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043798
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12133	NC_007005	CAG	2	6	600123	600128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043798
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12152	NC_007005	CGT	2	6	601026	601031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043798
12153	NC_007005	GTC	2	6	601063	601068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043798
12154	NC_007005	TTC	2	6	601095	601100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043798
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12157	NC_007005	CAG	2	6	601154	601159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12201	NC_007005	AG	3	6	603464	603469	50 %	0 %	50 %	0 %	66043801
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12209	NC_007005	GC	3	6	603966	603971	0 %	0 %	50 %	50 %	66043801
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12214	NC_007005	A	7	7	604107	604113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12215	NC_007005	AAGG	2	8	604214	604221	50 %	0 %	50 %	0 %	66043802
12216	NC_007005	CAG	2	6	604238	604243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043802
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12223	NC_007005	ACG	2	6	604892	604897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043802
12224	NC_007005	TGT	2	6	604957	604962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043803
12225	NC_007005	CAT	2	6	605000	605005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043803
12226	NC_007005	TCG	2	6	605062	605067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043803
12227	NC_007005	GCT	2	6	605147	605152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043803
12228	NC_007005	GGGCT	2	10	605178	605187	0 %	20 %	60 %	20 %	66043803
12229	NC_007005	CAA	2	6	605258	605263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043803
12230	NC_007005	GCT	2	6	605264	605269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043803
12231	NC_007005	TGC	2	6	605272	605277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043803
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12233	NC_007005	GTG	2	6	605400	605405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043803
12234	NC_007005	ATCT	2	8	605415	605422	25 %	50 %	0 %	25 %	66043803
12235	NC_007005	TGA	3	9	605425	605433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043803
12236	NC_007005	AAG	2	6	605523	605528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043803
12237	NC_007005	GC	3	6	605625	605630	0 %	0 %	50 %	50 %	66043803
12238	NC_007005	CAGCAA	2	12	605642	605653	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	66043803
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12240	NC_007005	TGC	2	6	605704	605709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043803
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12351	NC_007005	CGCC	2	8	611439	611446	0 %	0 %	25 %	75 %	66043808
12352	NC_007005	CATGCC	2	12	611452	611463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	66043808
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12356	NC_007005	ATGCCC	2	12	611528	611539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	66043808
12357	NC_007005	GTG	2	6	611675	611680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043808
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12359	NC_007005	TGCG	2	8	611867	611874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12361	NC_007005	CGC	3	9	611985	611993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043809
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12482	NC_007005	GCT	2	6	618342	618347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043812
12483	NC_007005	CTG	2	6	618355	618360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043812
12484	NC_007005	TGT	2	6	618416	618421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043812
12485	NC_007005	CGT	2	6	618552	618557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043812
12486	NC_007005	CTG	2	6	618628	618633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043812
12487	NC_007005	CGG	2	6	618642	618647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043812
12488	NC_007005	ACC	2	6	618659	618664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043812
12489	NC_007005	CTG	2	6	618733	618738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043812
12490	NC_007005	CGG	2	6	618741	618746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043812
12491	NC_007005	TTCA	2	8	618941	618948	25 %	50 %	0 %	25 %	66043813
12492	NC_007005	CCAG	2	8	618961	618968	25 %	0 %	25 %	50 %	66043813
12493	NC_007005	TGG	2	6	618972	618977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043813
12494	NC_007005	GAT	2	6	619019	619024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043813
12495	NC_007005	CTG	3	9	619049	619057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043813
12496	NC_007005	TGA	2	6	619069	619074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043813
12497	NC_007005	CCG	2	6	619101	619106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043813
12498	NC_007005	TGC	2	6	619149	619154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043813
12499	NC_007005	GCT	2	6	619250	619255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043813
12500	NC_007005	GCA	2	6	619273	619278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043813

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